SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI TAJUK TUJUAN : MENGUKUR DIVERSITI GENETIK : Untuk mengkaji dan mengukur diversiti genetik.

Pengenalan : Diversiti genetik bermaksud variasi dalam dan antara populasi spesis. Ia diukur dalam bentuk variasi antara gen atau DNA atau jujukan asid amino. Genetik merupakan bidang sains yang mengkaji fenomena pewarisan dan variasi dalam kesemua makhluk hidup sama ada manusia mahupun bakteria. !romosom adalah satu molekul makro DNA dan merupakan unit asas DNA dalam satu sel. !romosom terdiri daripada kumpulan gen"gen dan ekspresi luar gen #individu fenotip$ boleh mempunyai perbe%aan yang besar. Ini kerana gen"gen mempunyai bentuk alternatif yang dikenali sebagai alel dan perbe%aan yang diperhatikan adalah disebabkan variasi di mana alel hadir di dalam pembentukan genetik individu. &el"sel hidup yang menghasilkan generasi sel"sel anak memindahkan maklumat genetiknya melalui kromosom dengan bilangan yang sama ke'uali sel gamet. (entuk dan kromosom adalah berlainan mengikut organisma tertentu. )aklumat genetik perlu berinteraksi bersama faktor luaran yang lain seperti permakanan dan persekitaran untuk menentukan faktor fi%ikal dan perlakuan organisma se'ara keseluruhan. Gen adalah linear DNA yang merupakan unit berfungsi pada kromosom atau plasmid. !eseluruhan maklumat bagi struktur dan fungsi sesuatu organisma dikodkan dalam gennya. (agi sesetengah maklumat yang dikodkan oleh gen menentukan hanya satu 'iri tetapi sesetengah lokus bagi gen yang sama boleh membawa maklumat yang berlainan. Gen yang mempunyai maklumat yang berlainan pada lokus yang sama dinamakan alel. *Gene pool* spesies adalah himpunan alel"alel daripada gen"gen di dalam sesebuah spesies. Alel terbentuk kerana adanya perbe%aan ke'il #variasi$ pada satu atau sejumlah urutan tertentu. +okus yang memiliki alel dalam suatu Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI populasi dikatakan bersifat polimorfik dan sebaliknya dikatakan

bersifat monomorfik #satu bentuk$ apabila tidak memiliki variasi. Disebabkan gen atau segmen DNA dapat diekspresikan menjadi suatu fenotip tertentu adanya alel dapat mengakibatkan perbe%aan penampilan di antara individu"individu dalam suatu populasi. ,ariasi merupakan perbe%aan di kalangan organisma yang sama spesies dari segi fenotip dan genotip. -enotip merupakan suatu 'iri fi%ikal yang boleh dilihat seperti rupa warna kulit dan lain"lain. -enotip dipengaruhi oleh genotip dan persekitaran. Genotip merupakan kandungan genetik di dalam sesuatu organisma. Genotip tidak dapat dilihat dengan mata kasar. Dan bergantung kepada pewarisan gen daripada induk"induk organisma.

Tugasan

Anda bertugas untuk sebuah agensi pemuliharaan dan berdepan dengan satu krisis: sebuah kawasan dengan enam jenis tanah lembap yang berbe%a yang diketahui hanya tanah bagi dua jenis orkid liar yang sedang dibangunkan menjadi kawasan perindustrian..rganisasi anda hanya mampu membeli dan menjaga empat tanah sahaja. )ana satukah antara keenam"enam tanah yang harus dijaga/ Dua daripadanya ialah tanah lembap tiga lagi adalah paya bersama dengan populasi Pterostylis isozymus. 0iga jenis paya yang lain merupakan satu"satunya populasi yang paling berkait rapat tetapi spesies yang jauh Pterostylis polyzymous tinggal.Anda menghantar sampel daun ke sebuah kolej untuk analisa genetik dan menerima data seperti di bawah iaitu di dalam bentuk gel protien elektroforesis untuk satu lokus allo%yme yang polimorfik bagi kedua"dua spesies. +okus tersebut mempunyai dua alel. *1epat* dan *2elahan* kerana mereka bergerak pada kadar yang berbe%a merentasi gel tersebut di mana alel yang 'epat berada di bawah alel yang perlahan.

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI Langkah 1 : Untuk mengukur bagaimana variasi genetik tersebar di antara poulasi frekuensi alel perlu dikenalpasti di dalam setiap populasi. +okus alo%yme mempunyai dua bentuk. Identiti bagi setiap alel di dalam setiap individu ditunjukkan melalui banding pattern yang ada di dalam gel. &ebagai 'ontoh individu pertama di baris pertama di dalam gel pertama adalah hetero%ygous di mana dua alel tersebut adalah berbe%a dan diwakili oleh simbol #3$ bagi kedua"dua *'epat* dan *pelahan*. &ebaliknya individu di baris kedua ialah homo%ygous yang mempunyai satu band mewakili dua alel perlahan. 0entukan frekuansi alel di dalam setiap populasi bagi alel 'epat #p$ dan alel perlahan #4$ dengan megira bilangan alel bagi individu di dalam setiap populasi #homo%ygote mempunyai dua alel yang sama oleh itu anda perlu mengira 3 dua kali ganda dan jumlah bagi alel bagi 56 individu tersebut ialah 7 8 56 9 :;$. (ahagikan jumlah tersebut dengan jumlah alel yang hadir dalam populasi tersebut#sentiasa sama dengan dua kali ganda bilangan individu$

Pterostylis isozymus 5 2elahan + 1epat + 7 + : + < + 6 + = +

2opulasi 5#individu 5 hingga 56 dari kiri ke kanan$ > + ? + @ + 5; + + 5 5 5 7 + 5 : + + 5< + + 56 + Aumlah 7: >

Pterostylis isozymus 5 2elahan + 1epat 7 + : + + < + 6 + + = +

2opulasi 7#individu 5 hingga 56 dari kiri ke kanan$ > + + ? + @ + + 5; + + 5 5 + 5 7 + + 5 : + + 5< + + 56 + Aumlah 57 5?

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI Pterostylis isozymus 5 7 : < + < + 6 + 6 + + = 2opulasi :#individu 5 hingga 56 dari kiri ke kanan$ > ? @ 5; 5 5 5 7 5 : 5< 56 Aumlah

2elahan + 1epat + + + Pterostylis polyzymus 5 2elahan + 1epat 7 + : + +

+ + < + + + + + + + + + 7= 2opulasi 5#individu 5 hingga 56 dari kiri ke kanan$ = + > + + ? + @ + + 5; + + 5 5 + 5 7 + + 5 : + + 5< + + 56 + Aumlah 57 5?

Pterostylis polyzymus 5 2elahan + 1epat + 7 + : + < + 6 + + = +

2opulasi 7#individu 5 hingga 56 dari kiri ke kanan$ > + + ? + @ + 5; + + 5 5 + 5 7 + + 5 : + + 5< + + 56 Aumlah 5< 5=

Pterostylis polyzymus 5 2elahan + 1epat 7 + : + < + 6 + + = +

2opulasi :#individu 5 hingga 56 dari kiri ke kanan$ > + ? + @ + + 5; + 5 5 + 5 7 + 5 : + + 5< + + 56 + Aumlah ? 77

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI

Langkah 2 : Anda perlu mengukur perbe%aan genetik diantara populasi tersebut. (iasanya Wright`s Fixation Index or Fst digunakan dari julat ; yang mewakili tiada perbe%aan antara populasi tersebut meningkat menandakan kenaikan perbe%aan. Untuk menentukan -st hetero%ygousity perlu dikira bagi setiap spesies #Bs$ dengan menggandakan 7p4 bagi setiap satu populasi dan mengira nilai purata bagi ketiga" tiga populasi untuk setiap spesies. -rekuensi alel bagi Pterostylis isozymus Alel 'epat p >C:; ;.7: 5?C:; 7=C:; ;.=; ;.?> Alel perlahan q 7:C:; ;.>> 57C:; <C:; ;.<; ;.5: 2urata 7xpxq 7 #;.7:$ #;.>>$ 9 ;.:6 7 #;.=;$ #;.<;$ 9 ;.<? 7 #;.?>$ #;.5:$ 9 ;.7: ;.:6 3 ;.<? 3 ;.7: : #Bs$ -rekuensi alel bagi Pterostylis polyzymus Alel 'epat p 5?C:; ;.=; 5=C:; 77C:; ;.6: ;.>: Alel perlahan q 57C:; ;.<; 5<C:; ?C:; ;.<> ;.7> 7xpxq 7 #;.=;$ #;.<;$ 9 ;.<? 7 #;.6:$ #;.<>$ 9 ;.6; 7 #;.>:$ #;.7>$ 0 !"

2opulasi 5 2opulasi 7 2opulasi :

2opulasi 5 2opulasi 7 2opulasi :

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI 9 ;.7: ;.<? 3 ;.6; 3 ;.7: : #Bs$ Langkah ! : !ira hetero%ygositi jika ketiga"tiga populasi meneruskan pembiakan #B t$. +akukan kiraan dengan men'ari purata bagi p dan 4 ke atas ketiga"tiga populasi bagi setiap speseis digandakan dengan 7 8 purata p 8 purata 4. Aangkaan frekuensi hetero%igot di dalam populasi ini dikatakan mempunyai kawasan pembiakan yang besar dengan tiadanya perbe%aan genetik pada tahap populasi biasa. Aangkaan hetero%igositi #Bt$ bagi Pterostylis isozymus 2opulasi 5 2opulasi 7 2opulasi : 2urata frekuensi alel #Bt$ 9 7 8 purata p 8 purata 4 9 7 8 ;.6> 8 ;.<: & 0 #' Alel 'epat >C:; 5?C:; 7=C:; p ;.7: ;.=; ;.?> 5.>;C: 90 "% Alel perlahan 4 7:C:; ;.>> 57C:; ;.<; <C:; ;.5: 5.:;C: 90 #! 0 #$

2urata

Aangkaan hetero%igositi #Bt$ bagi Pterostylis polyzymus 2opulasi 5 2opulasi 7 2opulasi : 2urata frekuensi alel #Bt$ 9 7 8 purata p 8 purata 4 9 7 8 ;.=7 8 ;.:? 9 0 #% Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

Alel 'epat 5?C:; 5=C:; 77C:;

p ;.=; ;.6: ;.>: 5.?=C: 9 0 $2

Alel perlahan 4 7:C:; ;.<; 5<C:; ;.<> ?C:; ;.7> 5.5<C: 9 0 !(

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI

Langkah # : Anda perlu mengira jumlah *lo'al* dengan variasi populasi. -rekuensi sisihan bagi hetero%igot di dalam populasi yang berasingan #B s$ perlu di'ari jika mereka adalah dari populasi besar yang sama #Bt$ sertakan indeks jumlah variasi genetik yang ditemui di dalam satu populasi *lo'al*. .leh itu - st 9 #Bt D Bs $ C Bt di mana nilai -st E ;.5 menunjukkan nilai divergen yang besar di dalam populasi # iaitu populasi yang berbe%a dari segi genetik antara satu sama lain$. Nilai antaranya menunjukkan beberapa divergen genetik.

RUMUSAN Pterostylis isozymus -st 9 # Bt D Bs $ C Bt 9 ;.<@ D ;.:6 C ;.<@ 9 0 2' - st F ;.5 menunjukkan divergen yang besar di antara populasi Pterostylis isozymus Pterostylis polyzymus -st 9 # Bt D Bs $ C Bt 9 ;.<> D ;.<= C ;.<> 9 0 02 )s* + 0 1 ,enun-ukkan *.a/a /.0e1gen /. an*a1a 232ulas. Pterostylis polyzymus 2opulasi 2terostylis iso%ymous adalah le4.h /.0e1gen daripada populasi 2terostylis poly%ymous. .leh itu 2terostylis poly%ymous adalah sama se'ara genetik antara satu sama lain.

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI

PER5IN6ANGAN 1 A/akah 232ulas. 4ag. se*.a2 s2es.es a/alah 4e14e7a an*a1a sa*u sa,a la.n8 A/akah sesua*u s2es.es ,e,2un9a. le4.h /.0e1s.*. an*a1a 232ulas. /a1.2a/a 9ang la.n8 :ang ,ana sa*u8

2opulasi bagi setiap spesis adalah berbe%a antara satu sama lain. Nilai -st yang besar adalah menggambarkan bahawa kepelbagaiannya adalah tinggi berbanding dengan nilai yang rendah. Nilai -st yang dikumpul mestilah melebihi ;.5 di mana ia menunjukkan divergen yang besar antara populasi. (erdasarkan data yang telah dikumpul populasi 2terostylis Iso%ymus adalah lebih divergen daripada populasi 2terostylis 2oly%ymus. Nilai -st bagi 2terostylis Iso%ymus adalah ;.7@. manakala nilai -st bagi 2terostylis 2oly%ymus pula adalah ;.;7.

2 5aga.,anakah an/a 2e1un*ukkan /ana 9ang *e1ha/ 4ag. 2e,e13lehan *anah le,4a28 Jelaskan /engan ;a-a1 ke2u*usan an/a /. /ala, k3n*eks ,e,el.ha1a -u,lah gene*.k /.0e1s.*. 9ang ,aks.,u, 9ang ,engga,4a1kan ke/ua</ua s2es.es

2eruntukan dana tersebut perlu digunakan untuk memulihara tanah lembab yang mempunyai diversiti genetik yang tinggi bagi mendapatkan populasi yang lebih baik. (erdasarkan data yang telah dikumpul populasi 2terostylis Iso%ymus mempunyai kepelbagaian genetik yang lebih banyak berbanding 2terostylis 2oly%ymus. .leh itu tanah lembab yang mengandungi populasi 2terostylis Iso%ymus perlulah diberikan keutamaan.

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI

! A2akah 2e1*.,4angan sela.n gene*.k 9ang akan ,e,2enga1uh. 2.l.han an/a8

&elain genetik faktor lain yang mempengaruhi pilihan saya ialah faktor spesis teran'am. &pesis yang teran'am dan yang mempunyai bilangan yang sedikit di dalam persekitaran perlulah dipelihara bagi mengelakkan berlakunya kepupusan terhadap spesis tersebut. &elain itu saya akan memberi pertimbangan terhadap kualiti persekitaran habitat spesis tersebut. Babitat yang mempunyai kualiti yang tinggi iaitu kepelbagaian tumbuhan yang lain akan menjadi pilihan untuk diambil alih. Bal ini kerana ekosistem yang seimbang dengan pelbagai unsur biotik dan abiotik akan memberi suasana yang sesuai untuk pertumbuhan spesis yang perlu dipulihara. 0ahap pen'emaran juga perlu diberi perhatian kerana tahap pen'emaran yang tinggi menandakan kawasan tersebut tidak sesuai untuk pertumbuhan yang optimum.

# D.4e1. 4aha;a ke/ua</ua alel 2a/a l3kus 9ang /.ka-. /.*e,u. 4ag. se*.a2 s2es.es Menga2akah le4.h /a1.2a/a sa*u 232ulas. akan ;u-u/ 4ag. se*.a2 s2es.es 9ang /.l.n/ung.8

+ebih daripada satu spesis dilindungi adalah sebagai langkah berjaga"jaga supaya sesuatu populasi tidak pupus. Aika hanya satu spesis sahaja yang dilindungi kebarangkalian bagi spesis itu untuk dilanda penyakit atau dian'am makhluk perosak lain adalah tinggi. Ini akan mengakibatkan spesis tersebut pupus. 2opulasi dengan variasi genetik yang tinggi menunjukkan bahawa semakin tinggi peluang populasi tersebut untuk hidup. Ini adalah kerana spesis lebih berdaya tahan akibat kepelbagaian variasi genetik yang dimiliki.

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB

SCE3107 EKOSISTEM DAN BIODIVERSITI " Melalu. 2e,4a=aan 3leh El/1./ge >1''(? 9ang 4e1*a-uk @T13u4le .n Pa1a/.se@A 4aga.,anakah sa.n*.s ,e,aks.,akan /.0e1s.*. gene*.k 4ag. 2engenalan se,ula s2es.es8 Menga2akah ,e1eka *./ak ,e,.l.h han9a se-en.s ha.;an /a1. 2ulau *e1se4u*8

(erdasarkan pemba'aan yang telah dilakukan saintis memaksimakan diversiti genetik bagi re-introduce population dengan memilih haiwan daripada spesis yang sama tetapi berbe%a persekitaran #pulau$ akan dapat membentuk populasi yang pelbagai. Baiwan daripada satu pulau sahaja akan mempunyai profil identiti yang sama dan seterusnya akan mengalami kekurangan variasi genetik. .leh itu apabila mengadapi an'aman penyakit ia akan mati disebabkan oleh daya tahan penyakit yang rendah bagi spesis tersebut.

5.4l.3g1aB.

5. Gan Gat Heat. #7;57$. Eksplorasi Biologi Tingkatan . &elangor: .8ford -ajar &dn. (hd.

7. Geneti' Diversity. #.gos :; 7;57$. Diakses pada &eptember 7 7;5: daripada Gikipedia: http:CCen.wikipedia.orgCwikiCGeneti'diversity

Amali 6 KHAIRIEYATUL AIZA BINTI AZIS (2012271360108) PPG AMBILAN FEB 2012 SCEB