Avogadro

Avogadro adalah software kimia gratis, open source, tersedia dalam berbagai paltform sistem operasi
merupakan editor molekul yang dirancang untuk digunakan secara fleksibel dalam kimia komputasi,
pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya. Avogadro yang tersedia
dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X. Kode sumber sumber tersedia di
bawah GPL GNU. Menurut saya aplikasi ini sangat bagus dengan kelebihan ukuran filenya sangat
kecil (tidak lebih dari 10 MB). Tampilan yang bagus dan sudah bisa dihandle oleh perangkat keras
kebanyakan sekarang.
Apa yang dapat dilakukan Avogadro?
Dapat melakukan pengunduhan secara langsung dari PDB (protein data bank) atau PubChem
(database dari molekul kimia dan aktivitasnya terhadap uji biologis)
Inovatif auto-optimation, alat yang memungkinkan Anda untuk terus membangun dan
memodifikasi, selama optimasi mekanika molekular.
Antarmuka untuk banyak paket komputasi umum.
Plugin yang memungkinkan Avogadro untuk diperpanjang dan disesuaikan.
Embedded interpreter Python.
Terjemahan tersedia dalam 19 bahasa lebih, termasuk antar muka juga sudah bisa berbahasa
Indonesia, tersisa hanya beberapa bagian saja yang belum dialihbahasakan.
Cross-Platform: Molekul pembangun / editor untuk Windows, Linux, dan Mac OS X.
Intuitif: Dibangun untuk dapat digunakan dengan mudah bagi mahasiswa dan peneliti lebioh lanjut.
Cepat: Mendukung multi-threaded rendering dan komputasi.
Extensible: Plugin arsitektur bagi pengembang, termasuk rendering, tool interaktif, perintah, dan
skrip Python.
Fleksibel: Fitur OpenBable yang dapat digunakan untuk impor file-file kimia lain, input untuk
beberapa paket kimia komputasi, kristalografi, dan biomolekul.
Avogadro adalah editor molekuler canggih yang dirancang untuk digunakan dalam kimia
komputasi, pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait. Menawarkan
kerangka render yang fleksibel dan plugin arsitektur yang kuat.

Fitur-fitur:

Lintas Platform: Pembangun molekuler untuk Windows, Linux, dan Mac.
Gratis, Open Source: Mudah untuk mengintal dan semua kode tersedia (GNU GPL).
Internasional: Terjemahan dalam bahasa Cina, Jerman, Prancis, Itali, Spanyol, Rusia,
dan masih banyak lagi.
Intuitif: Dibangun untuk digunakan dengan mudah oleh mahasiswa dan peneliti maju.
Cepat: Mendukung rendering multi-threated dan perhitungan.
Diperluas: Plugin arsitektur untuk pengembang, termasuk rendering, alat interaktif,
perintah, dan skrip python.
Fleksibel: Fitur termasuk membuka impor Babel dari file kimia, paket komputasi ganda,
kristal, biomolekul, dll.

File size: 10.3MB
Requirements: Windows (All Version)
License: Open Source


rate my photos
Molekul Graphics Sistem
Molekul Grafis dan Sistem Pemodelan
Avogadro adalah grafis molekul dan sistem pemodelan ditargetkan pada molekul dan
biomolekul. Hal ini dapat memvisualisasikan sifat seperti orbital molekul atau
elektrostatik potensi dan fitur pembangun molekul intuitif.
Fitur termasuk:
Molekul modeller dengan otomatis gaya-bidang optimasi geometri berbasis
Mekanika Molekul termasuk kendala dan pencarian conformer
Visualisasi orbital molekul dan isosurfaces (permukaan iso) umum
Visualisasi getaran dan merencanakan spektrum getaran
Dukungan untuk sel unit kristalografi
Masukan generasi untuk Gaussian, GAMESS dan MOLPRO kimia kuantum
paket
Fleksibel Plugin arsitektur dan Python scripting
hal-hal yang dapat dilihat pada avogadro adalah
sel unit cristalograpik

penyumbang terdepan dari tabung nano karbon

pita protein

struktur kedua protein

orbital molekul Benzena dari perhitungan Gaussian

komputasi elektrostatik permukaan potensial

gambar interaktif dari jaringan ikatan hidrogen

Kelebihan pogram avogadro adalah Format file Avogadro dapat membaca termasuk
PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, serta Gaussian, GAMESS dan output MOLPRO.
Cara menginstal Avogadro dapat digunakan 2 cara, yaitu dengan melalui Terminal
dan melalui Synaptic
1. Penginstalan Avogadro melalui terminal dapat dilakukan dengan arahan sudo apt-
get update [Enter]
2. Setelah masuk pada admin pengguna, dapat mengetik sudo apt-get install
Avogadro[Enter]
3. Selalu ingat untuk menghubungkan pada internet / LAN jika akan menginstal
aplikasi pada Linux
4. dan jadilah aplikasi Avogadro menjadi milik anda
Penginstalan pada Synaptic dapat dilakukan dengan memilih menu Synaptic Package
Manager atau menu Synaptic pada Desktop
1. Cari program Avogadro pada menu search
2. Pada menu program Avogadro, jika belum berwarna hijau, maka Avogadro
anda belum aktif, untuk itu harus diaktifkan dengan cara memilih menu mark
all upgrades untuk menginstal semua aplikasi didalam Avogadro.
3. Lalu pilih menu apply untuk menginstal program
4. Tunggu sampai file semua terinstal
5. Program Avogadro telah menjadi milik anda.