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Biologa m...
Bases Nitr...
Antes se pensaban que slo estaban los nucletidos y ahora se sabe q los cidos molculares son la
molcula esencial que transmite la informacin.
Acidos nuclcios (funciones); no solo sirven para transmitir informacin gentica. (3 o 5 en ex)
Actividad cataltica (enzime-like o riozimas) RNAasa, spliceosoma, ribosoma (se regulan a ellos mismos)
Autocataltica: Intrones
Ribonucleotido o
Pentosa + base
Cofactores enzimticos: NADH, FAD
Desoxiribonucleotido (la diferencia nitrogenada (1 prima)
Transporte: tRNA
es en pentosa en la regin 2 prima
+ grupo fosfato (5
Neurotransmisores: adenosina
que el desoxi tiene un H y el ribosa prima de la pentosa)
2os mensajero: AMPc
tiene
un
OH-hidroxilo)
Replicacin-telomerasa-retrotrasposicin, Inactivacin (XIST)
Transductores de energa: ATP GTP
Ac. Nucleico: azcar(pentosa), fosfatos (unidos al azcar), bases nitrogenadas
(pirimidas y purinas)
Adenina y Guanina
G-C
A-T/U
Los fosfatos que unen el nucletido unen 5 prima donde se ubica original con 3 prima y el
enlace se llama fosfodiester. Direccin de 5 - 3.
El RNA sufre cambios postranscripcional y genera RNA de transferencia y ribosomales y algunos otros
como los nucleares/nucleolares (rompen a la molcula de RNA y forman el RNAm) o citoslicos.
La primera molcula de RNA que se llama heterogneo nuclear (tiene intrones y exones) y sufre un
procesamiento y cortes para formar los RNA de varios tipos y de ah se van a los ribosomas para formar
las protenas.
Algunas protenas necesitan modificaciones postraduccionales para que puedan ejercer su funcin; ejemplo se les
agregan carbohidratos o otras necesitan enlaces disulfuro; si no ocurren me da una enfermedad etc, ejemplo:
osteognesis imperfecta -> "nios de cristal" la colgena no tiene su estructura normal por falta de enlaces disulfuro
en las protenas de la colgena, tambin tienen talla baja, sordera etc. Ocurre en error de replicacin de DNA
.t RNA
.r RNA
.sn RNA (nucleares/nucleolares)->forman parte del spliceosoma son autocatalticos
.sc RNA (citoslicos)- regulan formacin de protenas.
La replicacin del DNA es semiconservativa. La replicacin se da por regiones donde inicia pero se
replica por completo el DNA , los lugares donde se inicia la replicacin son los replicones. El total del
genoma humano se replica totalmente en 6-8 horas por DNA polimerasa con un margen de error de
ETAPAS BSICAS
La replicacin del DNA es semiconservativa. La replicacin se da por regiones donde inicia pero se
replica por completo el DNA , los lugares donde se inicia la replicacin son los replicones. El total del
genoma humano se replica totalmente en 6-8 horas por DNA polimerasa con un margen de error de
ETAPAS BSICAS
Replicacin
Transcripcin
Traduccin
Iniciacin
Extensin
terminacin
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Partidor>
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Replicaci%C3%B3n_de_ADN>
Existen 5 DNA polimerasas: la alfa forma una cadena discontinua (fragmentos de okasaki) y la delta
forma cadena continua
Acondroplasia: Es una de las tallas bajas mas comn (existen 100 patologas de
talla baja) su error ocurre en espermatognesis comnmente en edad avanzada.
Es una patologa de replicacin. Esta mutada una protena que regula la divisin de
los condrocitos; y se inhibe. Este error es desde del inicio de la replicacin no por
modificaciones postraduccionales como la osteognesis imperfecta.
En la mayora de las patologas autosmicas dominantes son errores en espermatognesis y se
atriubuyen a la edad avanzada.
La direccin de la replicacin y transcripcin es de 5-3
Maso menos 10,000 regiones donde inicia la replicacin del DNA y se les llaman replicones; por lo tanto
hay 10,000 cebadores. Tarda 8 horas en replicarse. Se incorporan de 60-90 nucletidos por minuto.
(dato cultural).
Alfa
Delta
Continua
psilon Repara
Beta
Repara
Gamma Sntesis mitocondrial, solo es una porque solo hay un replicn y una sola cadena porque es
circular.
HELICASAS
Dirigen enzimticamente la apertura de dsDNA (DNA bicatenario) con gasto de ATP o dATP
Desdoblan el DNA (helicasas) y mantienen separadas las dos cadenas.
Protena SSB (De unin a cadena sencilla) mantiene las dos cadenas separadas mas o menos 50
nucletidos, son como burbujas para que se de la replicacin con la direccin 5 -3.
El cebador se tiene que eliminar y el espacio que queda entre DNA y DNA lo corrigen las ligasas
que introducen nuevos nucletidos y se unen por enlaces fosfodiester, entre los de okasaki y
entre los replicones.
Un promotor es una secuencia de DNA que no codifica pero que se le unen diversas
protenas para regular los procesos de replicacin y transcripcin, dan las seales para
decir que gen se debe de transcribir en los diferentes tejidos.
La diferencia entre un cebador y un promotor es que un cebador es una secuencia de RNA y el promotor
es de DNA.
Hay 3 RNA polimerasas, la mas importante es la POL II que genera RNAm, la que forman RNAm, y t y los
nucleolares es la POL III (los nucleolares sirven para el splicing) y los otros 3 RNA que forman los
ribosomas (3 RNA + protenas = ribosoma) son generados por POL I.
Factores cis y trans: Un factor cis se encuentra dentro de la cadena de DNA, es decir son "secuencias de
DNA". Un ejemplo es el promotor u otro es el enhacer (promueven la transcripcin pero se pueden
encontrar lejos de la regin promotora). Y los trans son protenas que se unen a los cis que pueden
favorecer o inhibir la transcripcin.
EJEMPLO: enfermedad gentica dnde se altera la "transcripcin" porque el gen codifica un factor
transcripcional "sndrome de Waardenburg" que en este caso los factor transcripcional promueve a
otras genes como los de la formacin de melanocitos, de neuronas ganglionares (sordera) y algunos
genes que forman la cara ; sus caractersticas son un mechn blanco, tabique nasal alto y ojos
separados a veces labio paladar hendido. Se debe al gen PAX-3, normalmente forma 2 RNA y de ah
formar las protenas en conjunto que codifican para lo afectado en este sndrome, forma una
formar las protenas en conjunto que codifican para lo afectado en este sndrome, forma una
protena normal pero con la mitad de la dosis. Es haploinsuficiencia dominante porque es la mitad
de informacin y dominante porque con solo la mitad (un alelo) de informacin causa enfermedad.
Una situacin en la cual la protena producida por una sola copia de un gen normal, no es suficiente para
garantizar una funcin normal.
Haploinsuficiencia es un trmino que se emplea cuando el producto de un gen es la mitad del nivel normal. Esto
puede presentarse debido a un nmero de problemas, el ms comn siendo el que una de las dos copias de un
gen falte como producto de una delecin. En otros casos lo que se produce es una mutacin en el gen, que
altera su estabilidad a nivel de ARN mensajero afectando la produccin del mensaje de ese gen que codifica
para la protena en las clulas.
Pegado de <http://www.conocimientosweb.net/portal/term1501.html>
Distrofina: Protena que se forma a partir de un gen que es para el msculo. Pero varia dependiendo el
msculo en donde se produzca; el mismo gen que produce la distrofina varia y forma diferentes
distrofinas segn el musculo en donde se produce. -> ejemplo de splicing
Usualmente las primeras 2 letras de los codones son fijas y la que cambia sin haber una alteracin es la
ltima, pero en algunos casos si puede causar un cambio de a.a.
Un ejemplo de patologa en splicing es la ATROFIA MUSCULOESPINAL TIPO I; los nios tienen hipotona
y falla en msculos respiratorios, fallecen el primer ao de va, es autosmica recesiva. Los papas tienen
un alelo mutado que al unirse de ambos padres causa la enfermedad. Debera de tener dos genes smn1
formar mi heterogeneo nuclear luego mi RNAm con splicing y formar la protenas necesarias para las
motoneuronas, en esta patologa estos genes no producen la protenas que regula el splicing de otros
genes (no de el mismo) y al no tenerlo no tengo el RNM adecuado de los genes de las motoneuronas.
El RNAm se lee por tripletas (codon) y se van colocando los a.a por el RNMt que tiene forma de trbol
donde en un extremo esta el a.a y del otro estn 3 bases nitrogenadas (anticodon) que si son
complementarias al codn se deja el a.a.
Enfermedad de x frgil: 1-4000 es la segunda enfermedad con retraso mental mas frecuente, tiene cara
alargada y orejas grandes. Los afectados son varones porque esta ligada al x, aunque las mujer lo
pueden transmitir. El gen FMRP1 produce una protena que regula la traduccin de otros genes sobre
todo a nivel de neuronas.
PRESENTACIONES
Ejemplos de splicing alternativo:
POMC: propiomelanocortina
VLDLR: Receptor de proteasn de muy baja densidad miembro de las lipoprotenas que
por splicing alternativo genera 3 isoformas: en la 1) 3 y 16 a.a 2) 3 3) 16. El mismo gen
codifica varias isoformas
Osteognesis imperfecta: Enf. Congnita por el defecto de un gen que codifica para
colgeno tipo 1. Es autonmica dominante (con un solo gen afectado tiene enfermedad), hay
50% de probabilidad que el hijo la desarrolle. Tienen fracturas seas, perdida temprana de
la audicin, articulaciones flexibles y pie plano, escoliosis, brazos y piernas arqueadas,
cifosis y esclertica azul. La ms grave de tipo 2. Son 3 cadenas y necesita mutaciones en
dos genes que codifiquen para dos de las cadenas tricatenarias. Tratamiento: bifosfonatos.
Ejemplo de modificacin postraduccional.
Acondroplacia:Es un trastorno autosmico dominante que se vincula con la edad paterna
avanzada (50% de posibilidades). Es una displasia fisiaria (el remodelada sea falla a nivel
de la epfisis- el hueso es corto pero grueso) hay dos formas de pasarse; por herencia-10%
y mutacin de novo-90%: Talla baja desproporcionada con miembros cortos,
megaloencefalia, hiperlordosis lumbar, mano con forma de tridente, Pelvis estrecha,
hipotona moderada, genovaro, agujero magno pequeo etc. Mutacin en el que codifica para
el receptor 3 del factor de crecimiento fibroblasticosen el cromosoma 4. La mutacin de
G1138A es la mutacin ms frecuente en el ser humano, en vez de ser guanina se cambia
por adenina. 98% de los casos en acondroplacia.
Micro RNA: Monocateriano, 21-25 nucletidos, regula la expresin utilizando la ruta de la
ribointerferencia (regula la expresin gnica, es un complementario de una parte del mRNA
y as ejerce sus efectos inhibitorios). Es una molcula de RNA transcrita a partir de genes
de DNA pero sin ser traducida a protenas. Es regulada por promotores especficos y
muchos de los cnceres son provocados por mutaciones de micro RNA.
Presentaciones:
agonzalezdelanhel@yahoo.com.mx grupo 301 la
salle
Herencia Mendeliana
jueves, 02 de febrero de 2012
09:08 a.m.
Chicharos-pisum sativum ->Gregorio Mendel, tena caracteres bicotmicos (ej. o grandes o chicas)
Primer experimento: cruzamiento monohbrido-> flor blanca y morada y todas salieron moradas (f1) y si
entrecruzas individuos de f1 1/4 sale blanco (f2).
-Para sus experimentos uso chicharos por su variedad de caractersticas observables.
LA RAZON 1:2:1
1. Existen determinantes hereditarios de naturaleza particulada
(genes).
2. Cada planta adulta contiene en cada clula una pareja gnica para
cada carcter estudiado.
3. Los miembros de la pareja gnica se distribuyen de forma igualitaria,
entre los gametos.
4. Cada gameto contiene nicamente un miembro de la pareja gnica.
5. La unin de un gameto de cada parental se produce al azar.
Primera ley de Mendel: Los dos miembros de una pareja gnica se distribuyen
separadamente entre los gametos (segregan), de forma que la mitad de los gametos llevan
un miembro de la pareja y la otra mitad llevan el otro miembro de la pareja gnica.
"DISTRIBUCIN IGUALITARIA"
GENTICA CLNICA
CLASIFICACIN DE LA PATOLOGA GENTICA
Cromosmica: Sx. Down, Sx. Turner, Sx. Kriduchat
Monognica: cambios en la secuencia o mutaciones en un solo gen.
Multifactorial: Enfermedades cuya causa es una combinacin de susceptibilidad
gentica del individuo y del contexto donde se encuentre y su interaccin;
hipertensin, diabetes, psoriasis, cncer, labio paladar hendido.
Mutacin; alelo que causa enfermedad. Polimorfismo: alelo presente en al menos 1% de la poblacin.
Codominante: Ambos alelos diferentes de un mismo locus se expresan. EJ. Sistema ABO.
Doble heterocigoto: individuo que es heterocigoto en dos loci diferentes.
Heterocigoto compuesto: individuo con dos mutaciones diferentes en el mismo locus.
Heterogeneidad gentica: Expresin de fenotipos similares determinados por genotipos diferentes:
ALLICA (Alelos diferentes de un mismo gen causan el mismo fenotipo -la misma enfermedad- o
alelos diferentes de un mismo gen causan un fenotipo diferente). DE LOCUS: Mutaciones en genes
distintos en loci diferentes causan un fenotipo similar.
Expresividad: Cuando el cuadro ocasionado por un gen comprende rasgos que aparecen
con intensidad variable o a edades variables Ej: Enfermedad de Huntington
La expresividad se mide en una persona solamente.
Penetrancia: Es el porcentaje de una poblacin que expresa el fenotipo de un
determinado gen. Puede ser completo (100%) o incompleto
Se mide el porcentaje en una POBLACION.
Pegado de <http://www.mancia.org/foro/genetica/25675-expresividad-penetrancia.html>
Autosmica recesiva: un dato es que si son consanguneos es probable que sea recesivo si se
esta expresando.
Cuando algunos de los individuos con el genotipo apropiado no muestran en absoluto es decir
el 100% del fenotipo correspondiente decimos que el gen muestra una penetrancia
reducida; la penetrancia es un concepto de todo o nada. Cundo la gravedad de la
enfermedad difiere en personas con el mismo genotipo, decimos que el fenotipo muestra un
expresividad variable.
Rett syndrome is a brain disorder that occurs almost exclusively in girls (Los
hombre no sobreviven) The most common form of the condition is known as
classic Rett syndrome. After birth, girls with classic Rett syndrome have 6 to 18
months of apparently normal development before developing severe problems
with communication and language, learning, coordination, and other brain
functions.
Pegado de <http://ghr.nlm.nih.gov/condition/rett-syndrome>
ACONDROPLASIA
(enfermedad autosmica dominante)
Displasia sea mas comn
Prevalencia 1/26, 000
Gen: FGFR3 (PROTEINA QUE SE EXPRESA EN HUESOS CON CRECIMIENTO ENDOCONDRAL- crneo,
mandbula, clavculas (1er hueso en osificarse)
Locus: 4p16.3,
Protena: Receptor del factor de crecimiento de fibroblastos 3
La mutacin ms frecuente se deben es en G1138A (95%), la mayor parte son mutaciones de novo (80-90%) y
en < por edad paterna avanzada (> de 45 aos)
Mutacin con ganancia de funcin: Produce actividad inhibitoria constante del receptor sobre el cartlago del
crecimiento. HIPERMORFA
Penetrancia al 100%
Expresividad variable (limitada)
Si hay un padre afectado hay 50% de que se pase y hay <de 1% de que sea de ambos padres sanos que les
vuelva a nacer un segundo hijo afectado (padres con hijo afectado). Ambos padres afectados es de 75% en
cada embarazo.
Riesgo elevado de morbi-mortalidad.
Normalmente 50% de transmisin
Diagnostico clnico:
Talla baja desproporcionada (SS/SI >1)
Acortamiento rizomlico
Macrocefalica
Trax estrecho
Hiperlordosis lumbar
Dedos en tridente
Frente prominente
Puente nasal deprimido
Hipoplasia medio facial
Talla media: 1.32 (hombre) 1.27 (mujeres) pero va de 125-145cm
Diagnstico radiolgico
Se pueden diagnosticar en etapa prenatal (20-24 semanas)
TAC (tomografa axial conmutada) de base de crneo y agujero magno.
Serie sea completa: AP (anteroposterior) y lateral crneo. AP y lateral columna completa, huesos
largos, comparativa de manos y pies.
Crneo: Desproporcin crneo-cara, base del crneo pequea, foramen magno estrecho y comprensin de
unin cervico-medular.
Trax: ligeramente estrecho
Pelvis: iliacos cuadrados y acetbulo plano.
Columna: Disminucin en la distancia interpedicular a nivel lumbar, cuerpos vertebrales cortos, xifosis
toracolumbar leve y lordosis marcada.
Huesos largos: Cortos y delgados, metfisis ensachadas, falanges medias y proximales cortas y cuello
femoral corto y angular.
Manejo
Crecimiento y alimentacin (tienden a obesidad)-> grficas especiales de peso, talla y PC.
Respiratorio (por el cuello puede restringirla): Tienen va area estrecha, ronquido, hipersomnolencia
por no dormir bien.
Musculo esqueltico: Hipermovilidad articular e hiperlaxos. Hiperlordosis, vigilar parestesias o
disestesias que indiquen comprensin nerviosa, genu varu
Dental (la estructura del crneo tiene un paladar muy alto y tienden a tener diente muy chuecos).
Paladar ojival, valoracin por ortodoncia.
Desarrollo y conducta: Desarrollo cognitivo normal, 10% retraso mental y tienen limitaciones fsicas,
darles terapia fsica para fortaleza msculos de la espalda.
Audicin (por el crneo puede tener las tubas auditivas en mala posicin), a veces por eso tiene
alteraciones del lenguaje porque no escuchan bien. Disfuncin de odo medio- (hipoacusia- alteraciones
del lenguaje)
Neurolgico (para asegurarse que no halla comprensin y la sensibilidad): a veces hay hidrocefalia.
EVITAR movimientos bruscos de cabeza y cuello.
Anestesia y embarazo (va a area difcil de entubar)
Herencia
Mendeliana
Grabacin de audio iniciada: 09:27 a.m. jueves, 09 de febrero de 2012
Proximal- rizo
Medio- meso
Distal- acro
Diagnostico diferencial
Acondroplasia homocigota (pareja de dos acondroplsico)- ms grave
Sx SADDAN
Acondroplasia-hipocondroplasia
Displasia tanatofrica (mucho ms severo, trax restrictivo)
ENFERMEDAD DE HUNGTINTON
(autosmico dominante)
Aqu dos alelos mutados no te agrava la enfermedad como en la acondroplasia
Si se presenta antes se debe al tamao del repetido
Prevalencia en poblaciones de origen europeo 3-7/100,000 (Venezuela)
En Venezuela es muy frecuente y en japoneses muy poco frecuente
Gen HTT se localiza en 4p16.3 (es una casualidad que sea en el mismo que acondroplasia)
La protena es esencial para mantener la integridad neuronal en los ganglios basales, sus funciones no se
comprenden completamente. Esta protena es de mucha importancia en el desarrollo.
Protena llamada hungtintina con funcin desconocida
Mutaciones
Por expansin del trinucleotido CAG localizado en la regin 5 prima del gen.
Riesgo de expansin y de tener hijos afectados:29-35 repetidos (6-8% de casos sin historia familiar)
NORMAL <36 repetidos
PENETRANCIA REDUCIDA:36-39 repetidos
PENETRANCIA COMPLETA: >40 repetidos
Correlacin genotipo-fenotipo
45 repetidos- 50 aos
55 repetidos- 30 aos
74 repetidos- 20 aos
La distona es un trastorno del movimiento que causa
Manifestaciones clnicas
contracciones involuntarias de los msculos
Alteraciones del movimiento:
COREA
Distona
Espasticidad
Rigidez
Bradicinesia
Alteraciones cognitivas
Disfuncin ejecutiva
Perseveracin psicomotora
Dficit visoespecial y perceptual
Aprendizaje y memoria alterados
Demencia
Alteraciones psiquitricas
Depresin
Irritabilidad
Ansiedad
Riesgo suicida
Apata
Agitacin
Comportamiento OC
Hipersexualidad
Psicosis
Otras manifestaciones: alteraciones en la comunicacin, dificultad para deglutir, nutricin (baja, por la energa que
se consume en los movimientos desgastantes y aparte no degluten bien), sueo y crisis convulsivas.
Manejo
Medidas de apoyo
Tratamiento sintomtico
Anemia hemoltica
Manifestaciones inmunolgicas
Manifestaciones infecciosas.
Aumenta hemoglobina F
Tratamiento
Principalmente para las crisis de dolor
Mucha hidratacin
Suplemento con cido flico y hierro
Trasplante de mdula sea.
FIBROSIS QUSTICA
(autosmica recesiva)
En caucsicos 1/2500
En Mxico se calcula que es 1/5000
Es una de las enfermedades ms frecuentes
Mutacin en gen de canal de cloro
Frecuencia de portadores caucsicos: 1/25
Gen CFTR, ubicado en 7q31
Codifica para un canal membranal que conduce Cloro
Existen ms de 1500 mutaciones descritas para ste gen (heterogeniedad allica)
Es la mas comn a nivel mundial 70% de mutaciones son en F508
Tienen distintos efectos funcionales y con diferentes formas porque son 1500
diferentes mutaciones: puede que no este por completo el canal porque codifique a
codn de paro, o que halla bloqueos en la regulacin en donde si llegue a la membrana
apical pero no tiene como abrirse o cerrar, conductancia alterada que no permite que
pase el cloro adecuada (menos grave) o de sntesis reducida (la menos grave, solo hay
menor proporcin de canales)
Mueren generalmente en la primera dcada de vida, en EU hasta 30
Triada de la fibrosis qustica
Cloruros en sudor elevados (>60meq)
Insuficiencia pancretica
Enfermedad pulmonar crnica
Datos de sospecha:
Ileo meconial, peritonitis meconial, screening positivo, ictericia, pancreatitis, clculos
Hay que hacer estudio en sudor (>60)-si (<40)->no
Afeccin pulmonar
Primera causa de morbi-mortalidad en pacientes con FQ.
Afeccin intestinal:
Ileo meconial: falta de secrecin de cloro y de agua en el lumen intestinal + moco
patolgico.
Afeccin pancretica
Progresivo
Volumen de fluido pancretico disminuido
Otras manifestaciones: azoospermia, cirrosis, litiasis biliar, neumotrax espontneo, opasificacin de
los senos paranasales.
Tratamiento
Causal: ensayos de terapia gnica
HEMOFILIA A
Recesiva ligada al X
La hemofilia A es causada por un rasgo hereditario recesivo ligado al cromosoma X, con el
gen defectuoso localizado en dicho cromosoma. Las mujeres tienen dos copias del
cromosoma X, de modo que si el gen del factor VIII en uno de los cromosomas no
funciona, el gen en el otro cromosoma puede hacer el trabajo de producir suficiente
factor VIII. Los hombres, sin embargo, tienen nicamente un cromosoma X, de tal
forma que si el gen del factor VIII en ese cromosoma es defectuoso, tendrn
hemofilia A. Por esto, la mayora de las personas con hemofilia A son hombres y las
mujeres son portadoras
Deficiencia de la coagulacin
Gen F8 localizado en Xq28
Codifica para el facto VIII de la cascada de coagulacin
2/3 partes mam portadora, 1/3 parte mutacin de novo.
Heterogeneidad gentica: 45%- hemofilia severa por inversin en el intrn 22 y
40% deleciones.
Mutacin puntual c.70T>A (transversin)
Diagnstico
Cuadro clnico
Pruebas de coagulacin
Actividad de la coagulacin del factor 8
Molecular: Presencia de la mutacin de DN
Portadoras
Aproximadamente el 10% de las portadoras tiene actividad de coagulacin del factor VIII
menor al 35% por lo que se encuentran en riesgo de presentar hemorragias. Para hacer el
diagnstico se determina la actividad del factor VIII y la mutacin.
Tratamiento
Infusin de concentrado de FVIII
Manejo de embarazo
DDAVP (duplica la actividad del factor 8)
Diagnstico diferencial
Enfermedad de Von Willebrand
Hemofilia B
Deficiencia de factor XI (judos)
Alteraciones de fibringeno
Alteraciones en la funcin plaquetaria.
Duchenne
Recesivo ligada al x
DELECCIN DEL 45-48
rbol genealgico
jueves, 02 de febrero de 2012
}11:05 p.m.
Modo de transmisin
Claves
Factores confusos
Ejemplos
Autosmico
dominante
Transmisin hombre-hombre
Condicin en generaciones sucesivas
Mujeres y hombres afectados.
Variabilidad en la severidad de la enfermedad
Homocigotos estn ms afectados y puede llegar a ser
letal.
Penetrancia reducida
Su expresin leve en algunos
relativos puede fallar el diagnostico.
Nuevas mutaciones pueden fallarse
por familias pequeas y puede ser
diagnosticado como espordico
Hipercolesterolemia,
neurofibromastosis, marfan,
cancer de mama y de ovario,
huntington.
Autosmico
recesivo
Fibrosis cstica,
hemocromatosis, anemia, Sx.
tay-sachs
Familias pequeas
Ligada a X
Grados de parentesco:
1er grado: papas, hermanos e hijos; comparto con ellos 50% de informacin gentica.
2do grado: abuelos, to, sobrinos y nietos: comparto con ellos 25% de informacin gentica
3er grado: primos hermanos.
NOMENCLATURA
Distrofia de Duchenne,
Hemofilia A, sndrome de X
frgil
arbol
genetic
Genoma
jueves, 09 de febrero de 2012
07:19 a.m.
Nucleares:
22 moleculas dsDNA: AUTOSOMAS
1 molecula dsdna: cromosoma X
1 molecula dsDNA: cromosoma Y
CARIOTIPO HUMANO
Las cromatides se pegan en el centrmero; las cromatides con respecto a su hermano
cromatide son unas copias fieles es decir son iguales pero entre ambos cromosomas son
diferentes. "diferencias alelicas" porque cada cromosoma viene de una combinacin entre
las cromatides de nuestros padres. Tambin las X y Y tienen dos cromatides.
Para verlo siempre lo tenemos que ver en metafase (porque es cuando se compacta el
DNA)
Cromosoma 2
GENOMA HUMANO
Genoma nuclear (3,300Millones de pb por genoma haploide)
DNA no-codificante
El exceso de DNA no codificante se puede explicar por la ventaja de que si hay una mutacin hay slo el 2% de probabilidad de que sea en una regin
codificante que nos afecte.
es el 99.9995% del genoma humano y la > son genes interrumpidos (es decir intrones y
exones etc), hay sus excepciones como los genes que codifican para las histonas o para el
SRY son continuos, no tiene intrones.
GENOMA MITOCONDRIAL:
16, 569 pb de dsDNA circular con un segmento adicional de tsDNA en D-loop, miles de copias por clula
Comprende < 0.5% de DNA total de una clula somtica
Contiene 37 genes, 28 localizados en la G y 9 en la L (ligera)
Herencia materna exclusivamente (porque el espermatozoide pierde las mitocondrias)
0.0005% del genoma humano
93% de la secuencia codificante (Contrario al nuclear)
44% de G+C
Cdigo gentico diferente al nuclear (nos comprueba la teora de que la mitocondria era una bacteria que se
introdujo a la clula; tiene las caractersticas de un DNA bacteriano; no hay intrones y exones y casi todo el
DNA es funcional)
Densidad gnica de 1 gen c/0.45 kb (mucho ms pesado que el nuclear)
13 genes sin intrones para polipptidos; es decir el DNA mitocondria va a codificar para protenas que le
sirven para el mismo
22 genes de t RNA
2 genes de r RNA
37 GENES
No tiene histonas
Hay algunos genes nucleares (50 genes; la mayora) que tambin codifican para formar protenas que
necesita la mitocondria.
Herencia uniparental (solo la madre)
DENSIDAD GNICA
EUCROMATINA
HETEROCROMATINA
FAMILIAS MULTIGNICAS:
Secuencias codificantes con alto grado de homologa
Existen numerosos pseudogenes
Codifican para RNAs o polipptidos (superfamilias de Igs, genes de dessarrollo,
superfamilia de Rc olfatorios).
Una familia gnica o familia
TIPOS: Repeticin en tandem ("clusters"- DNA t) de genes de una misma familia o de
multignica es un grupo
genes en diferentes loci.
de loci cromosmicos
Los genes ms abundantes (0.44 del genoma total)
cuya secuencia de nucletidos es
Organizacin en tandem de genes de 45 kb
similar y que derivan de
Ubicacin en cromosomas acrocntricos (250 genes pre-rRNA por cromosoma),
una secuencia comn ancestral .
Genes del 5s r RNA organizadas en cluster localizados en cromosoma 1, es decir hay 5
genes que codifican para el RNA ribosomal porque es muy importante.
Pegado de
Existen de 10-100 copias para cada tipo de t RNA (porque son muy importantes son de
<http://es.wikipedia.org/wiki/Familia_g%C3%
A9nica>
las copias de lo que mas hay) en clster en cromosoma 1 y 6.
snRNA (RNA pequeos- small nucelar): Componentes de spliceosoma
, en biologa o gentica, es
Clster
de
genes
snoRNA: (RNA-small nucleolar): para procesamiento y maduracin
un conjunto de genes que codifican para la
misma protena.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Cluster>
Genes:
Sin intrones: SRY
Varias copias: RNA ribosomal, histonas
TIPOS DE MUTACIONES
Es un cambo en la secuencia nucletida de un cromosoma y es heredable
Diversidad gentica
Es un mecanismo
de evolucin
Puede generar
enfermedad
Seleccin natural
Clasificaciones:
Tipo de cambio que ocurre en el DNA
Inserciones/duplicaciones
Translocaciones/inversiones
Puntuales: Cambio una sola letra en un nucletido, es la ms frecuente
Deleciones: Perder una parte de la secuencia. De 1 a varios miles de pares. EJ
en Sx de Duchen.
Posicin de la mutacin
Regin codificante
Regin no codificante
Efecto fenotpico
Amorfos: alelos inactivos que actan bloqueando la ruta biosinttica normal. Puede tratarse realmente de un alelo
inoperante o de la ausencia (delecin) de un gen.
Hipomorfos: alelos que funcionan imperfectamente en comparacin con los alelos normales.
Hipermorfos: alelos que producen por su accin primaria, un exceso de producto final en comparacin con los
normales.
Neomorfos: alelos cuya accin difiere cualitativamente de la de los alelos normales y generalmente, en heterocigosis
se manifiestan los dos productos allicos (codominancia).
Pegado de <http://html.rincondelvago.com/genetica_13.html>
Un nico gen anmalo o un par de genes dan lugar a efecto fenotpicos mltiples y
diversos y determinan los rganos, sistemas afectados, signos, sntomas y el
momento de aparicin y se en estas circunstancias se dice que la expresin del
defecto gentico es pleiotrpica.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Pleiotrop%C3%ADa>
TIPOS DE MUTACIONES PUNTUALES:
En el cambio de un nucletido por otro
Transversiones: Pirimidina(C, T y U) por purina(G y A) (son mas
severas)
Transiciones: purina por purina y pirmidina por pirimidina y son las ms
comunes/frecuentes.
Por el efecto que ejerce en la secuencia codificante:
Sentido errneo (missense): cambia un aminoacido por otro- (G1138A9
Sin sentido: (non sense) un codn que codificaba para un aminocido codifica para un
codn de paro (UAA, UAG y UGA). En fibrosis qustica o Duchene
Mutacin silente. No afecta el aminocido. (CGT->CGC: arginina)-> transicin, el
AUG= metionina-> codn de inicio
cambio codifica para el mismo aminocido y en la protena no hay un cambio. (Se podra
decir que es un polimorfismo porque no da enfermedad la mutacin).
Un trastorno monognico es el que esta determinado principalmente por los alelos localizados en un nico locus.
Persona homocigota: alelos idnticos en un nico locus y cundo son diferentes decimos que es heterocigoto o portadora.
Un heterocigoto compuesto se usa para describir un genotipo en el que estn presentes dos alelos mutantes diferentes del mismo gen.
TIPOS DE MUTACIONES:
Codificantes
No codificantes: es malo cuando son en parte de intrones que son los sitios crticos
de splicing, -se saltan los intrones.
Lo que est antes del gen es el promotor, el codn de inicio es AUG (metionina). Se nos
marca el inicio y el final del intron. Al final esta la seas de poliadenilacin. Cola AAAA Rergion 5 prima UTR y 3 prima UTR, a fuera del gen al principio y al final.
Cromosoma mitocondrial:
Los genes mitocondriales se heredan solo por va materna, hay mutaciones en genes
mitocondriales en tastarnos de herencia materna.
Los polimorfismos de insercin-delecin pueden ser simples porque solo tienen dos
alelos o multiallicos, pues poseen un nmero variable de un segmento de DNA que se
repite en tndem en una localizacin; esto se dividen en:
- Microsatelites: Segmentos de DNA que consisten en unidades de 2, 3 o 4 nucletidos
que se repiten entre una y unas pocas docenas de veces.
- Minisatlites: Provienen de la insercin en tndem de un nmero variable de copias de
una secuencia de DNA de 10 a 100 pares
Polimorfismos en el nmero de copias.
La MHC o complejo mayo de histocompatibilidad y el sistema ABO ejemplos de
polimorfismos.
Mutacin
Expresividad variable (papa 20 manchas y nio 10) y pleiotrismo (papa manchas y nio
manchas y tumor)
Mutacin
Pleiotropismo
Condicin en la cual la mutacin en un solo gen afecta a mltiples caractersticas fenotpicas. Ej.
En anemia falciforme ocurre una sustitucin de una base en el gen que codifica para la cadena
beta de la hemoglobina formndose un triplete mis-sense. La incorporacin de un nuevo
aminocido en esta posicin es responsable de la aparicin de mltiples alteraciones fenotpicas
en el individuo.
Pegado de <http://glosarios.servidor-alicante.com/genetica/pleiotropismo>
Algunas personas son resistentes a paludismo cuando son heterocigotos para anemia
falciformes. La fibrosis qustica se hereda autosmica recesiva.
Evolucin
Diversidad gentica
Los espermatozoides son los que ms mutan: se estima que q de cada 10 espermatozoides
porta una nueva mutacin deletrea; esto se da por que en la espermatognesis hay muchas
divisiones para llegar al espermatozoide y en el ovulo no (ah hay principalmente mutaciones
referentes al sexo)
Enfermedad
Hay genes que mutan ms; que son la mayora de las enfermedades como acondroplasia,
duchene, hemofilia A.
Anlisis:
La gentica sirve para
Diagnstico:
a) Certero en pacientes
b) De portadores
c) Pre-sintomtico
d) Prenatal
Correlacin de fenotipo-genotipo (pronstico-tratamiento)
Mecanismos de herencia (asesoramiento gentico)
Las muestras de DNA las tomo de cualquier lado que tenga clulas con ncleo: sangre,
saliva, orina, uas, bulbos pilosos, derrames pleural, liquido cefalorraqudeo, tejidos
embebidos en parafina, biopsias, hueso, cabellos (DNA mitocondrial no tiene genmico slo
que venga con el bulbo porque las clulas del cabello no tienen ncleo slo citoplasma) , uas
etc
Un ejemplo de mutacin neomorfa (autosmica recesiva) es la deficiencia de a1antitripsina, esta enzima inhibe a las proteasas en los alveolos para que no halla destruccin
pulmonar, al haber su deficiencia o su mutacin no las inhiben y causan alteraciones en los
alveolos. Esta mutacin es por el cambio de a.a por otros en el hgado (ah se produce),
principalmente dos, hay 70 mutaciones de las cuales 30 tienen relevancia clnica; como nota
el tabaco causa una destruccin de la a1-antitripsina causando el mismo efecto-> enfisema
pulmonar y EPOC. Cambio de metionina por arginina en el 358 es la neomorfa pero hay
otras, la mutacin ms comn es la Piss -60%(cambio de glutamato por lysina)
-> Gel de agarosa en un campo elctrico: sirve para hacer muestras y juntar fragmentos de
DNA. Al pasar las molculas, las ms pesadas quedan arriba porque se van atorando en las
agarosas y las de bajo peso quedan abajo. Aparte arriba tenemos el polo negativo y abajo el
polo positivo. (la ms cercana al polo positivo es la que menos peso tiene).
Mutacin
Ejemplo: para acondroplasia la enzima hace cortes en normal es una raya en heterocigoto 3
rayas (1 normal y dos de corte) y un homocigote (2 rayas aunque son 2 cortes pero cortan
en el mismo peso molecular)
01/03/2012 07:14 a.m.
Herencia multifactorial
jueves, 16 de febrero de 2012
09:21 a.m.
Es el resultado de complejas interacciones entre factores de predisposicin (mltiples loci dentro del
genoma) y exposiciones ambientales que desencadenan enfermedades
Responsable de un grupo de trastornos del desarrollo, de malformaciones congnitas y
enfermedades de la vida adulta.
5% poblacin peditrica y 60% poblacin en general .
Hay factores comunes que tienen que ver con el ambiente y otros que slo son genticos.
Enfermedades comunes:
1. LPH
6. DM2
7. Enfermedades Autoinmunes
Monognico: 1 gen
Gen modificador: gen cuya expresin puede ser influenciada por otro locus.
Concordancia: Frecuencia de manifestarse una misma caracterstica entre parientes, siendo
concordantes para ese trastorno, cuanto ms cercanos son dos parientes ms alelos comparten.
3
Contribucin Genes
Penetrancia completa
2.5
Penetrancia incompleta
2
1.5
Herencia polignica
Multifactorial
Ambiental
0.5
0
0
Tipo
Cromosmicas
1.8 /1000
2/1000
3.8/1000
16.4/1000
20/1000
Multifactorial
600/1000
646.4/1000
46.4/1000
Talla familiar: sumas talla de mama y la de papa y la divides entre dos, luego le
restas 6 si es mujer y se los sumas si es hombre. La talla es un ejemplo de
concordancia ya que tiene 95% en gemelos monocigotos.
0.5
1
1.5
2
Efecto Ambiental
2.5
Esta tabla nos muestra que las enfermedades ms comnmente son por herencia
multifactorial
El efecto
fenotpico: la
predisposicin
gentica + el
componente
ambiental
alcanzan un
umbral.
1.
2.
3.
4.
Heredabilidad (h2)
Es una fraccin de la varianza fenotpica global de un rasgo cuantitativo que es causada
por genes.
Porcentaje o medida de lo que aportan los factores genticos en relacin con factores
A mayor h2 =
1. El riesgo de recurrencia:
2. Severidad
El riesgo de la familia es mayor mientras ms severa sea la enfermedad.
Cada uno de los individuos que se acercan al lado de la curva delimitado por la lnea vertical
tiene una mayor probabilidad de tener el defecto.
En el extremo derecho de la curva se encuentra el genotipo ms afectado, que se corresponde
con el defecto ms severo. Mientras ms severo sea el defecto es mayor la probabilidad de que
este recurra, por asociarse a un genotipo ms afectado.
4. Sexo afectado
El riesgo de recurrencia es mayor si el caso ndice es del sexo menos frecuentemente afectado.
Estenosis pilrica
Luxacin congnita de cadera
Enf. de Hirschprung
Pie Equino Varo
Artritis reumatoide
EJEMPLOS
Estenosis pilrica:
5 veces ms frecuente en hombres.
Hijos de varones: 5.5%
Hijas: 2.4%
Hijos de mujeres: 19%
Hijas: 7%
Defecto de tubo neural
Falla para el cierre del tubo neural, que ocurre del 18-28 dias.
1: 1000 RNV
Mxico:
8-10/ 1000 RNV
Puebla, EdoMex, Veracruz, Oaxaca y SLP
Anencefalia: 11.9/ 10,000
DTN:
Familiar
Riesgo Recurrencia
Hijo
5%
2 Hijos
12%
1%
8.5% Encefalocele
Ms frecuente en las mujeres 3:1
Un padre
4%
ANENCEFALIA
Holo-anencefalia
65%
80% asociado a raquisquisis
Columna cervical en retroflexin
Apertura del foramen occipital
Orbitas hundidas
Proptosis
NC hipoplsicos
Malformaciones acompaantes:
G.I: 1-16%
Renales: 1-6%
Cardiacas: 16%
Polihidramnios
48hrs de vida
ESPINA BIFIDA
Protusin del tejido neuronal a travs de los arcos vertebrales defectuosos.
Falla en el cierre del neuroporo posterior
Factores asociados
Parlisis
Perdida de la sensibilidad por debajo de la lesin
Deficiencia de Zinc
Diabetes materna
Incontinencia urinaria
Estreimiento
Hay defectos cerrados:
Menos severos
Hipertermia
Genticos
ENFERMEDADES MULTIFACTORIALES
Las malformaciones congnitas y las enfermedades del adulto son las ms
representativas de factores multifactoriales.
Los gemelos son tiles para estudiar enfermedades multifactoriales separndolos
desde el nacimiento y exponindolos a diferentes ambientes.
Psoriasis: Es una enfermedad inflamatoria crnica de la piel que produce lesiones escamosas
engrosadas e inflamadas, con una amplia variabilidad clnica y evolutiva.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Psoriasis>
1.
2.
3.
4.
5.
Estudios Poblacionales
Estudios Familiares
Estudios de Adopcin
Estudios de Asociacin (GWAS); es decir que la poblacin tenga un fenotipo (enfermedad) en comn.
Modelos Animales
Estudios de Asociacin (GWAS); es decir que la poblacin tenga un fenotipo (enfermedad) en comn.
Modelos Animales
Aislada.
50% PH Aislado
Incidencia de 1: 700 RNV
70 % se presenta en hombres
Ms frecuente en mujeres
80 % es unilateral y 20 % es bilateral
70 % es izquierdo
El espectro fenotpico es amplio; puede haber desde un fenotipo muy marcada hasta
ligeros rasgos que slo al examinar meticulosamente se notan, como la vula bfida en
paladar o el labio superior ligeramente levantado.
Estudios en gemelos y familias han demostrado que hay factores genticos y los factores
cido Valprico: PH
Alcoholismo Materno:
Dosis Elevadas en un perodo corto de tiempo
RIESGOS DE RECURRENCIA
Alcoholismo Materno:
Dosis Elevadas en un perodo corto de tiempo
RIESGOS DE RECURRENCIA
Hipertermia
Obesidad
Radiacin Ionizante
Infecciones.
acetbulo.
Factores multifactoriales
Presentacin plvica
Historia familiar
Mujeres
Oligohidramnios
Primigesta
Estrgenos (laxitud)
Inestabilidad
Pliegues asimtricos
Anormalidades en marcha
USG
Normal
Alcoholismo
Obesidad
Ingesta sal
Alcoholismo
Estrs
Ingesta sal
Raza negra
Otros factores
Estrs
Edad
Raza negra
Edad
Nivel SE bajo
Ejercicio
Hipertensin embarazo
Obesidad
Nivel SE bajo
Ejercicio
Hipertensin embarazo
Alcoholismo
Ingesta sal
Riesgo de recurrencia
Estrs
Raza negra
Edad
Frecuencia
Nivel SE bajo
1 padre 28.3%
Ejercicio
2 padres 45.4%
Hipertensin embarazo
OBESIDAD
Hipertensin embarazo
OBESIDAD
El hipotlamo (VM, PV, arcuato) produce dos proteinas AGRP y NPY (hormonas orexignicas)
Estudios de Adopcin
Leptina: hormona que acta como el principal indicador del estado nutricional y saciedad.
Ambiente obesognico
Leptina: Regulador energtico que acta sobre la ingesta de alimentos, gasto energtico,
bajos.
3% de las formas severas de obesidad. (LEP o LEPR)
OBESIDAD EN MXICO
50% de los hombre y 65% mujeres tienen sobrepeso
Avances
Prader, Labhart y Willi describen el primer sndrome con obesidad.
de obesidad.
Despus se realizo un estudio del gen de la leptina y su tratamiento sustitutivo.
predispocin gentica.
1. LEP
2. LEPR
3. Prohormona convertasa 1
4. POMC
PCR
1.
2.
3.
PASOS
1) Para iniciar aumento la temperatura a 95C para romper y separar las cadenas de DNA.
2) Agrego los primers que se unen a los 3 prima de las cadenas separadas para hacer su
replicacin de 5 prima a 3 prima. Bajas la temperatura a 70-72 C
3) Fase de extensin: Agregas la Taq Pol (es de las primeras enzimas de la DNA
polimerasa resistentes a temperaturas, se obtienen de una bacteria que resiste altas
temperaturas). Se van a agregando las bases nitrogenadas.
PCR mltiple: se duplican varias secuencias., un
ejemplo para usar PCR mltiple seria la DMD
porque tiene mutaciones en varios lugares y la
infertilidad masculina (si la azospermia es por la
perdida de genes se recomiendo in vitro o
adopcin)
VE VIDEO
http://www.youtube.com/watch?v=o_0dFor_syw
Taq-Man (PCR en tiempo real): se llama as porque puedes ir viendo como se va duplicando tu regin de intros, en la PCR normal necesitas minimo de 25 a 30 ciclos para notar
la mutacin real y aqu no porque un programa te lo va diciendo por una sonda (sonda con dos molculas pegadas una quencher y una reportera), la sonda reconoce su
secuencia complementaria y la Q y la R estn juntos, cuando hay corte aqu se dividen estas dos y da una seal fluorescente al romperse. Esta prueba es ms certera que la
normal porque aqu lo puedes cuantificar.
Enfermo por duplicacin, pero no se usa para esto se detecta por otras
cosas es solo ejemplo.
Cantidad de
DNA
En una PCR normal estudias la secuencia de la meseta (hay limite porque se te acaban los
primers etc,) en la de tiempo real estudias la elevacin. En la de tiempo real tenemos un
punto llamado CT (es donde empieza la fase exponencial), estos estudios son para
mutaciones en duplicaciones (el mutado es el que llega ms rpido a CT es el portador) o
delecciones (el ltimo en llegar a CT es el portador, porque tienen menor cantidad de
informacin gentica que estas multiplicando por PCR); se ponen y grafican un exn
normal y uno que sabes que puede tener la mutacin. Si llegan al mismo tiempo estan
sanas, si estn desfasados son portadoras y tienen el 50% de heredar la enfermedad a
su hijo. Si la secuencia que se quiere multiplicar es de un individuo enfermo no hay
duplicacin de nada porque no existen ninguna secuencia por la deleccin y en ambos esta
delectado para las enzimas que metiste no se usa para enfermos solo para detectar
portadores., detectas dosis gnica. Si es por duplicacin en un enfermo la curva alcanza
la CTP mucho antes y hacia la izquierda.
Ciclos de la PCR
Sana
Portadora
DNA templete: es que el utiliza la DNApolimersa es como tu DNA molde para que de ah
empieces a pegar tus bases nitrogenadas.
Despus de que la secuencia fue amplificada el gen puede ser secuenciado o analizado por
hibridacin ASO con facilidad.
X frgil: Se duplican repetidos GGG y dan retraso mental.
Caso 1:
FIBROSIS QUISTICA
Autosmico recesivo
Gen CFTR mutado
Gen muy grande como 27 exones
Mas de 1000 mutaciones reportadas en este gen
Tiene 12 mutaciones ms frecuentes en la poblacin hispana.
Para dx se buscan en estas 12 mutaciones y si no estn aqu se recurren a otras pruebas.
Fibrosis quistica
1 (mama)
2(papa)
PM
3(Afectado)
4 (normal)
800
600
Biologa Molecular pgina 27
Heterocigoto compuesto:
Los dos alelos estn mutados pero con mutaciones diferentes. -> en el mismo loci
El 1 y 2 son portadores y hay un sitio de corte y por eso hay dos el afectado hay corte pero
estn juntos y se ven muy gruesos.
1000
Tengo mi DNA bien pero cuando hay un cambio en una base pueden crear un
sitio de restriccin o un sitio de corte.
PM
1000
800
600
400
200
CASO 2:
Hipercolesterolemia familiar
Autosmico dominante
Hombres y mujeres, generaciones contiguas, heterocigotos afectados
Hijos con 50% de probabilidades
Si son homocigotos, son mas graves y tienen ms resistencia al tratamiento
Se estudia el gen LDLR: Q12X o c.97C>T
CASO 3:
SINDROME DE MUENKE
1 gen y 1 mutacin para todos
Cranosinostosis coronal (Se cierran las suturas de los huesos del crneo a manera temprana), fusin de
huesos del carpo o tarso, hipoacusia, retraso mental, ,retraso de crecimiento etc.
Hay otros sndromes que cruzan con cranosinostosis por eso hay que hacer dx diferencial con pruebas
moleculares.
Gen FGFR3 Pro250Arg - > mismo gen que acondroplasia pero diferente mutacin
Autosmico dominante
50% de recurrencia en cada embarazo
Al padre no se le indica estudio porque viene de rama materna (caso)
CASO 4:
ACONDROPLASIA
Displasia sea
Macrocrneo, acortamiento rizomelico, etc (rara vez se confunde)
Rara vez se hace estudio molecular porque es muy obvio.
Si hay parejas de acondroplasicos si se recomienda hacer estudio molecular porque
hay probabilidades de 1/4 de que sea homocigoto.
Si es estado homocigoto es letal
Gen FGFR3 : c.1138G>A
CASO 5:
SINDROME DE RETT
Sx de regresin
Nias que nacen normal y despus empiezan a perder habilidades. (agarran mamila,
dicen dos palabras, se sientan etc y de repente lo dejan de hacer)
X dominante
Los hombres no son viables no se estudian
La mayora son casos espordicos es decir de novo porque usualmente la madre no
alcanza a vivir. No es muy comn que sea heredado.
Gen MECP2 -> R270x Se buscan 4 mutaciones frecuentes.
La mutacin elimina el sitio de restriccin
CASO 6
ENFERMEDAD DE POMPE
Debilidad muscular, dolor abdominal
Glucogenolisis tipo 2
Autosmico recesivo
PCR-ARMS -> dos genes arriba y abajo y al mismo tiempo se le ponen cebadores y
primers provocando que la mutacin se amplifique ya que no reconoce los cebadores
que se le agregan.
Los dos casos portadores y identificas la mutacin que aporto cada padre al enfermo,
si tiene otra hija sana y no supieras una de las mutaciones de uno de los padres
tendras que investigar a la hija porque no sabes si presenta la mutacin del otro
padre
CASO 7:
GALACTOSEMIA
Autosmico recesivo
PCR-ARMS
Gen GALT
Vomito, ictericia, intolerancia a alimentos, no crece bien, enzima baja
190 nucleotidos,mayora en caucasicos
Mas frecuente en pQ188R, p.N314D, IVS2-2 A>G (71%)
En esta tcnica de PCR tiene la caracterstica de que si no tiene la mutacin en el
lugar donde la estamos buscando los puede identificar como normal.
Si importa el tipo de mutacin porque depende del tipo repercute en el fenotipo, unos
dan un cuadro leve y otras un cuadro severo
CASO 8:
FACTOR V LEIDEN TROMBOSIS VENOSA
Es raro
Es raro
Gen FV c.1691G>A (mutacin puntual de sentido errneo).
PCR restriccin
Autosmico dominante
CASO 9:
DISTROFIA MUSCULAR DE DUCHENNE
PCR-mltiple (nos permite estudiar muchas secciones en una misma corrida, la tcnica
se puede hacer por que los exones todos pesan diferente y los podemos diferenciar
por eso podemos estudiar todos los exones al mismo tiempo)
Gen DMD, delecciones. (gen distrofina muy grande)
Para dar un diagnstico certero
Recesiva ligada al X (hombres afectados, mujeres portadoras)
CASO 10
ANEMIA DE CELULAS FALCIFORMES O DREPANOCITICA
Debilidad, no crece bien,
En el cultivo hay trepanocitos (eritrocitos en forma de hoz), esta deformacin es por
una alteracin en la cadena b-globina
Para que estn afectados tienen que estar en estado homocigoto
Los heterocigotos, es decir los portadores no se contagian de malaria.
Gen de la b globina humana
PCR
CASO 11
DMD
PCR en tiempo real
Los pacientes con duchenne estn ligados al X, necesito usar PCR en tiempo real para
ver si es portadora, la PCR mltiple si identifica los afectados de duchenne pero no
para identificar portadores.
Normalmente son por delecciones pero hay unas pocas que son por duplicacin
CASO 12
ENFERMEDAD DE CHARCOT-MARIE-TOOTH TIPOA 1A
Neuropata hereditaria ms frecuente
Gen PMP22
Duplicacin de un fragmento del gen
PCR en tiempo real/ dosis gnicas.
Adelgazamiento de la piernas "patas de cigea", dedos de martillo, alteraciones
sensitivas y motoras, parestesias, disestesias etc.
70-80% de los casos tienen duplicacin en este gen
Autosmico dominante
Se puede usar como gen de control otro cromosoma como en este caso se usa el gen
beta globina contra el PMP22 para ver la dosis gnica.
CASO 13
Hunter
Secuenciacin
Mucopolisacaridosis tipo 2
A los dos aos se les va poniendo la cara tosca, piel gruesa, manos en garra, giva en la
columna, van teniendo retraso, se les obstruye la va area, opacidad corneal.
Ligada al X.
CASO 14
Secuenciacin
jueves, 15 de marzo de 2012
07:16 a.m.
Se utilizan cuando no sabemos la mutacin determinada de esta enfermedad, no es una buscada dirigida.
Sntesis in vitro del DNA.
Necesitamos: DNA polimerasa, oligos, primers (promotor no porque ese es parte del gen, es la secuencia que
codifica para la iniciacin) y un dideoxinucleotido (tiene 2 hidrgenos en lugar de un hidroxilo en el 2 prima)
Una vez que esta el dideoxinucleotido (para adenina, citosina, guanina y timina) ya no hay cadena 3 libre y ya
no se puede seguir sintetizando, este dideoxinucleotido es colocado por azar por el aparato y me quedan
cadenas de diferentes tamao. Si le agregas desoxinucleotidos (adenina, timina, citosina y guanina) continua la
sntesis normal.
Cuando hay dos picos empalmados en el electroferograma hay un cambio de estado heterocigoto normalmente
sale como N.
Cuando tengo deleciones o inserciones pequeas en el electroferograma las cadenas estn desfasadas y se ven
sobrepuestas como si fueran heterocigotos pero se ven sobrelapadas muchas, aunque por si solo no puedes
determinar si es por delecin o por insercin, necesitas ver la secuencia normal
RT- PCR O reverso transcriptasa, primero de un RNAm (usada como molcula inicial)se
genera un cDNA por medio de una transcriptasa reversa y una vez con esa cadena molde y a
lo amplificas como PCR normal, esta es mucho ms sensible que una PCR normal, se usa para
identificar el riesgo de recaer en paciente con leucemia.
Oligonucletido:
Sonda:
PCR cuantitativa:
Determina en tiempo real el incremento en la cantidad del producto PCR generado durante
PCR.
Duchenne
La sonda de eleccin a utilizar para la deteccin de una mutacin que afecta una sola
base, o bien que resulte en una pequea insercin o delecin, es un oligonucletido
sinttico, debido a que su menos longitud lo hace mas sensible para detectar el cambio
de una sola base y slo presentar hibridacin con la secuencia complementaria
normal, pero no con la imperfecta; de la misma manera un ASO creado para
corresponder a la secuencia de un gen mutante presenta hibridacin nicamente con la
secuencia complementaria mutante pero no con la normal.
nicamente las sonda ASO pequeas tienen la capacidad para detectar fiablemente
modificaciones en nucletidos nicos.
Para la tcnica de ASO se tiene que tener cuidado porque el que el ASO no hibride no
significa necesariamente que el gen es normal si no que puede ser que la mutacin no
sea la especifica del ASO utilizado.
Secuenciacin
Este mtodo aprovecha ciertos anlogos qumicos de los 4 nucletidos
conocidos como dideoxinucelotidos debido a que carecen de un grupo
hidroxilo 3 terminal en su desoxirribosa; si este se incorpora a una cadena
creciente de DNA no permitirn que la DNA polimerasa se una a la
siguiente base complementaria.
Polimorfismos moleculares
jueves, 22 de marzo de 2012
08:55 a.m.
Son cambios en la secuencia de DNA pero que no estrictamente implican padecimientos, o pueden
predisponer para otros.
Clasificacin de polimorfismos:
Fenotpicos: coloracin de piel y anexos, rasgos raciales, anatmicos (wormianos)
Bioqumico/serolgicos: ABO, Rh, variantes electroforticas de apolipoprotenas.
Citogenticos:-> a nivel de cromosmicas. Regiones heterocromaticas y regiones con
satlites (bisatelites, trisatelites)
Polimorfismos moleculares: el 30% de nuestros genes son polimrficos, 10-20% de
nuestros loci en estado heterocigoto-> esto no necesariamente implica enfermedad.->
ejemplo la MHL (complejo mayor de histocompatibilidad) es una de las regiones que
presenta mas polimorfismos. Se calcula que cada 300-500 pares de bases hay un
polimorfismo.
MARCADOR
NUM.
LOCI
CARACTERISTICAS
EJEMPLOS
DNA RFLPs
>105
DNA VNTRs
>104
(repetidos en tandem
de numero variable)
minisatelites
DNA STRs
>105
(repetidos en tandem
cortos)
microsatelites
DNA SNPs
(polimorfismos de
nucletido nico)
>107
DNA minisatelites
Dr. Jeffreys
Acua el termino "huella gnica" -> porque hay tanta variacin de minisatlites que
todos tenemos diferentes.
Los uso para reconocer casos de homicidio
Describe regiones peculiares de DNA, altamente repetitivas y polimrficas
"secuencias minisatlites"
Ahora-> Son secuencias hipervaribales de tamao moderado organizadas en tandem
+/- 1,000 de repetidos en tandem que abarcan desde 0.1-20 kb
Abundantes en regiones peritelomricas y algunas en regiones intersticiales
cromosmicas
1er VNTR caracterizado: insulina 11p15.6 y el primero utilizado para diagnstico
DNA microsatelite
Cambian hasta en 3
Puede encontrarlos en cualquier regin de mi genoma
PCR y un gen para su identificacin por que lo que tienes
que ver es que si en ese primer hay 2, 3 o 4 copias
Para determinar parentesco los hijos deben de tener
"secuencias minisatlites"
Ahora-> Son secuencias hipervaribales de tamao moderado organizadas en tandem
+/- 1,000 de repetidos en tandem que abarcan desde 0.1-20 kb
Abundantes en regiones peritelomricas y algunas en regiones intersticiales
cromosmicas
1er VNTR caracterizado: insulina 11p15.6 y el primero utilizado para diagnstico
presintomtico alfa-globina.
Si hago PCR y lo hago por tamaos, la de mayor peso molecular es la que tiene mas
repeticiones en tandem
Identificacin de paternidad, usando una PCR en un gen, a minisatelites (diapo)
Generalmente son heterocigotos pero pueden ser homo
DNA microsatelite
Cambian hasta en 3
Puede encontrarlos en cualquier regin de mi genoma
PCR y un gen para su identificacin por que lo que tienes
que ver es que si en ese primer hay 2, 3 o 4 copias
Para determinar parentesco los hijos deben de tener
cuando menos un repetido (de corte heredado del padre).
Si se cuentan los primer 80 (+ numero de repetidos)-> as
te das cuenta de que tamao tiene cuando sale en PCR;
todos tienen 80 pero varan en su numero de repetidos.
Aplicaciones: identificacin de individuos sospechosos,
paternidad.
A las mutaciones que les llamamos silentes en realidad son "polimorfismos sinnimos", si
fueran suficiente para darme enfermedad se llamara mutacin.
Tecnologa de microarreglos
Variantes genticas:
Segmentos que se repiten de mas de 1000 bases nitrogenadas que se repiten varias
veces.
Esquizofrenia, hay variantes en el numero de copias que la favorecen
Segmentos de mas de 1kb.
Son mas grandes que los minisatelites.
Se reconocen con MLPA (deleciones o duplicaciones grandes)
Parkinson, variante en el DNA mitocondrial que la favorece
Factores epigenticos
Susceptibilidad o proteccin de padecimientos
Variabilidad bilgica
Seleccin natural
Mutaciones de baja penetrancia
Un prin o prion1 es una protena patgena que tiene alterada su estructura terciaria,
teniendo un incorrecto plegamiento.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Prion#Enfermedades_pri.C3.B3nicas>
Medicina genmica
jueves, 29 de marzo de 2012
07:10 a.m.
Estudios de asociacin
Co-ocurrencia de alelos o fenotipos
Alelo A se asocia a la enfermedad si la frecuencia del alelo A en poblacin enferma es mayor que en
poblacin sana ejem. HLA-DR4 presente en 78% de pacientes con AR y slo en 36% de la poblacin
normal.
Hay grupos tnicos que tienen variantes que favorecen a una enfermedad y se les considera un
grupo de riesgo y por lo tanto hay que poner atencin a los factores ambientales que pueden
colaborar a la aparicin de la enfermedad.
Ejemplo labio paladar hendido esta asociado a desnutricin, y deficiencia de acido flico (esto es
porque el metabolismo de acido flico ayuda a metilar el DNA) -> pobreza
Se propone que algunos genes participan en la etiologa de la enfermedad
Se propone que las enfermedades multifactoriales se asocian a variantes comunes con efecto
pequeos.
Se calculan 11 millones de SNPs en el genoma
Alzheimer tardo familiar (70 aos), representa el 25% de los casos de Alzheimer, asociado a
apolipoprotena E alelos 4.
El Alzheimer slo se puede diagnosticar con certeza post -morten por las placas -amiloides que se
forman; antes se puede confundir con otros tipos de demencia. Pero si se sospecha de Alzheimer y
presentan el alelo 4 hay un 97% de que si sea Alzheimer.
La raza de la que provengas tambin influye en el padecimiento de una enfermedad ejemplo los
japoneses presentan mayor riesgo.
El alelo DR3 y DR4 estn asociados a la diabetes y codifican para el MHC
Haplotipo= conjunto de variantes que se heredan juntos, estn en un mismo cromosoma. "se heredan
en bloque"-> Se heredan en conjunto porque estn muy juntos entre ellos en el ADN.
Gen de insulina-> tiene un repetido VNTR de 14 pares de bases
Metabolmica
Anlisis de metabolitos
Enfermedades complejas
Diabetes
Obesidad
Alcoholismo
Paladar hendido (cuando no es sindrmico)
Estudios
Se buscan genes candidatos: en cromosomas en dnde se hereda el gen
GWAS: Estudio molecular a gran escala; se usan muchos individuos y mapeaban todo el genoma por
SNPs y veas las SNPs que se ligaban con la enfermedad.
Estudios no direccionados: GWAS, secuenciar el blanco subgenmico, secuencia el genoma completo,
secuencia del genoma completo, secuenciacin de nueva generacin
Poblacin de estudio
Estudios de familiares: Se eligen cuando estn varios afectados y que se tiene acceso a ellos, puede
haber portador, pueden desarrollar enfermedades de penetrancia incompleta, no se puede comparar
con otra familia
Estudios y controles: Se puede comparar con otros grupos tnicos, tienes que comparar muchos, los
casos son limitados , pueden ser pareados es decir que los controles se semejan mucho a el individuo
estudiado. 5 controles contra un caso
Estudios prospectivos de asociacin allica.
Tamao de la muestra: grandes y controlables para poderlos comparar con otros grupos tnicos.
Caractersticas de la poblacin
Origen tnico o mezclas de orgenes
Complejidad del fenotipo:
Fenotipificacin
Las mutaciones de polimorfismos a veces pueden ser muy pequeas pero se pueden ir sumando a
otras y dar una enfermedad muy compleja.
Heredabilidad= 1(gentico) 0 (ambiental)
Medicina genmica: aplicar los conocimientos obtenidos de la estructura y funcin del genoma
humano y sus derivados y crear medicina personalizada.
Estudios de asociacin: Se comparan grupos sanos y enfermos (porque todos tienen polimorfismos).
Alzheimer: hay una lipoprotena E: la variante epsilon 4 (la diferencia es que en lugar de
cistena hay arginina)-> esta variante es la ms asociada a alzhimer; me predispone ms.
Para estos estudios se tienen que manejar entre familias que ya hallan desarrollado la
enfermedad algn familiar.
Gentica y cncer
jueves, 12 de abril de 2012
07:34 a.m.
Las clulas cancerosas son miembros de una clona de clulas somticas que han sufrido una o ms mutaciones.
No necesariamente hereditaria; es gentica pero puede ser adquirida; ejemplo si te expones mucho a rayos UV. 90% de
las personas con cncer son patologas transmitidas; es decir no lo transmiten el 10% que lo transmiten tienen herencia
mendeliana.
El sx de down si tiene predisposicin a cncer.
Los 3 grupos de genes que si se alteran predisponen a cncer: Protoncogenes, genes supresores de tumor y apoptosis y
genes de reparacin de DNA
En las adquiridas se calcula que hay que ir acumulando de 8 a 12 mutaciones que condicionan el desarrollo de neoplasias.
Es ms comn en adultos porque se tienen que ir acumulando mutaciones.
Proto-oncogenes
Promueven de manera positiva la proliferacin celular
Cuando existe una mutacin se denominan oncogenes
Los oncogenes se encuentran activos en forma excesiva o inapropiada (mutaciones hipermorfas o con ganancia de
funcin).
Es suficiente la mutacin en un alelo para afectar el fenotipo celular.
Tienen una funcin anormal excesiva.
Mecanismos de activacin de proto-oncogenes (hay ms)
Amplificacin:
FISH: se hace en clulas en interfase (se meten sondas con floruros que se pegan a las mutaciones) -> normalmente
hay dos secuencias y tendramos que ver dos luminosidades si ves ms quiere decir que hay mas mutaciones que
predisponen a cncer(ejemplo el HER-2/neu que su amplificacin predispone a cncer de mama)-> se genero un
medicamento que inhibe la accin de este oncogen sobrexpresado "hersertina" -> es como quimioterapia dirigida. ->
slo 30% de los cnceres de mama se tratan as porque son los que tienen mutaciones en estos genes.
En algunos casos se correlaciona con mal pronstico.
Mutaciones puntuales: cambios de bases nitrogenadas que causan una mutacin hipermorfa.
Genes RAS que codifican protenas denominadas p21 que participan en la va de transduccrin de seales y adems
tienen funcin de GTPasa
RAS: Es un transductor de seales de membrana al ncleo que indican divisin celular, cundo transmite la seal lo
hace controlada con GTP.
Ras unido a GTP favorece divisin celular y si hay GDP no hay divisin. Si nunca se hidroliza GTP por mutacin
puntual en el gen de RAS hay divisin descontrolada-> cncer de vejiga.
Tumores en el colon tambin tienen mutaciones en RAS y sirven para marcadores para toma de desciones en
tratamiento; cundo se ven estas mutaciones en RAS usan un tx especfico "cetuximab" y esto es porque son
insensibles a los Ab inhibidores del EGFR
Si tomas un anlisis de bilis para detectar mutaciones de RAS tiene 50-67% de detectar colangiocarcionoma y de
80-95% de detectar cncer de pncreas.
Translocaciones
Sobre todo ocurren en leucemias.
Estas translocaciones en leucemias las detectamos por RT-PCR (se detectan en RNA porque en DNA estaran muy
grandes)-> detectamos tambin si el tx dirigido est teniendo resultados. Puede detectar una clula cancerosa en
107 genes
La leucemia mieloctica crnica-> translocacin en el cromosoma filadelfia (t(9;22)(q34;q11); se unen dos genes que
no deberan de estar juntos (BCR/ABL).
Tx: "imatimid"
En linfoma de Burkit: es un gen quimrico anormal, no hay tx especfico. Se dg por PCR tiempo real o RT -PCR
Retinoblastoma:
Responsable del cncer de ojo ms comn en nios: hay formas hereditarias y no hereditarias; en las hereditarias
adems desarrollan ms neoplasias a lo largo de su vida.
Autosmico dominante
Penetrancia incompleta: es cuando no ocurre la segunda mutacin; si hay una mutacin presenta hay 90% de posibilidad
de que realice la segunda mutacin.
Hereditario: Inicio temprano, bilateral 85%, progenie afectada, alto riesgo de otras neoplasias
No hereditario: inicio tarda >1 ao, unilateral (100%), progenie normal y sin riesgo de otras neoplasias.
Una manera de distinguir entre hereditario y no hereditario es si encuentras las mutacin en cualquier clula del cuerpo
(la mutacin inicial es en clulas germinales) es hereditario y si slo esta la mutacin en clulas del tumor (clulas
somticas) no es hereditario.
Es ms temprano el hereditario porque ya llevas una primera mutacin.
Los retinoplastomas se ven en nios muy pequeos porque se da en la maduracin de la retina.
Cncer de mama
De todos los cncer de mama 10% son hereditarios y en los otros tienen de 8-10 genes mutados con poco riesgo de
heredarlos.
Hereditario: ocurre ms jvenes con varios familiares con cncer de mama y de ovarios; si es el primer caso lo mas
probable es que no sea hereditario; le ofreces estudio gentico si sospecha de hereditario.
BRCA1 y BRCA2 -> pacientes con cncer de mama que sospechas de heredarlo le haces estos estudios. Si es multifocal y
bilateral, con familiares con cncer de mama y de ovarios; es uno de los genes con mas polimorfismos pero no es mutacin
y ese polimorfismo no quiere decir que hay predisposicin a cncer solo si hay mutacin.
Secuenciacin, autoexploracin mensual, ultrasonidos o marcadores CA-125.
Proto-oncogen RET: a los 10 aos tienen cncer de tiroides (tireidoctomia), lo suplementas con T3, se nota por que tienen
labios gruesos y pequeos tumores en la lengua. Estudio de RET por secuenciacin. -> --"eoplasia endrcina mltiples" ->
tiroides, suprarrenales,
Oncogenes
Tipo de
mutacion
Amplificaciones, puntuales,
translocaciones
Deleciones, puntuales y
translocaciones
Expresin
celular
Sobre-expresin dominante
Somtica o germinal
Gnesis
Adquirida o heredada
Adquirida
Farmacogentica
jueves, 19 de abril de 2012
07:25 a.m.
Relevancia de la farmacogentica
Medicamentes raramente son 100% efectivos en los pacientes
15-35% de pacientes ninguna o inadecuada respuesta B-bloqueadores
9-23% responden inadecuadamente a los inhibidores de recaptura de serotonina.
20-50% responden inadecuadamente a antidepresivos tricclicos
La farmacogentica inicia en 1909 con Garrod; propona que las variaciones en el metabolismo se
hederaban.
1940: Ford defini el polimorfismo gentico
1959: Freerich Vogel: uso por primera vez el trmino farmacogentica:"el estudio del papel que
juega la variacin de los genes individuales en la respuesta a medicamentos"
1962: Kallow escribi la primera monografa sobre esta disciplina
1991: Vogel, Motulsky y Meyer: distinguieron entre los fenotipos raros y comunes
1998: Aparece el trmino de farmacogenmica
2003: Secuenciacin del cdigo gentico humano
Farmacogentica
Cualquier variacin gentica determinada por la respuesta frente a los frmacos en lo relativo a su
eficacia y a su toxicidad.
Metabolizadores:
Rpidos, Lentos y Normales
Ultrarrpidos: al administrar el frmaco le tienes que dar ms dosis que asimila muy
rpido, la duracin es ms corta pero tambin se va a ir acumulando el frmaco porque lo
asimila muy rpido pero no lo puede excretar rpido y hay acumulacin "toxicidad"
Ultralentos: al administrar el frmaco se va a acumular y causa toxicidad. Aunque subas la
dosis no lo puedes asimilar.
Los frmacos se disean para los metabolizadores normales (metabolismo normal).
Ingesta
Absorcin
Distribucin
Interaccin clula-frmaco
Degradacin
Excrecin
Si no somos asimiladores del frmaco podemos pasar directo de distribucin a excrecin y
no asimilamos nada del frmaco.
Conocer esto en cada paciente nos sirve para tener un rango de ndice teraputico y de
toxicidad. Estos se pueden sobrelapar.
Efectos adversos de frmacos: Toxicidad, algunos condicionan cncer, hay algunos
medicamentos que solo 1 de 4 px tiene un efecto benfico con su uso, 15% de los medicamentos
se asocian a efectos adversos graves.
-> Si nunca nos sometemos a probar cierto tipo de frmacos nunca sabremos si tenemos
sensibilidad con ese tipo de frmacos. Si no hay exposicin al frmaco puede ser que nunca se
detecte.
La variacin en la secuencia de DNA tambin influye en la respuesta a frmacos; podemos
tener polimorfismo pero tambin podemos tener la enzima inhibida por mutaciones que no
solo son polimorfismos, podemos tener deleciones, inserciones que cambian nuestro marco
de lectora y no producimos las protenas y enzimas para degradar los frmacos.
Variaciones de las protenas blanco: receptores y algunas enzimas
Unimodal: con una sola moda. No puedes saber si son rpidos o lentos
Dimodal: dos modas (se pueden sobrelapar) ; puedes distinguir entre los rpidos (se refiere
a normales- mayora de la poblacin) y los lentos. Herencia recesivos. No se puede ver bien
que se tiene porque todos los monocigotos en el estudio son iguales..
Trimodal: 3 modas;
Trimodal: 3 modas;
Ejemplos:
Alelos polimrficos que existen en el sistema del citocromo P450 (todo una familia),
hace que la codena sea ineficaz o incrementa la posibilidad de hemorragia al
administrar warfarina (anticoagulante).
CYP2D6 (polimorfismos genticos de 80 alelos diferentes, duplicaciones ) ->
estos nos da un montn de posibilidades.
Enzima normal con cantidad normal (metabolizador normal)
Enzima normal en cantidad disminuida:
Metabolizador lento
Enzima inactiva o pobremente activa
Cantidades masivas de la enzima
El frmaco se metaboliza muy rpido porque tengo mucha enzima
Chopo -> prueba gentica de la sensibilidad a warfarina (informacin til
para ajustar las dosis)
CYP2C9: warfarina
CYP2D19
BKORCO: para vitamina K
Contados son los frmacos que ya tienen este tipo de pruebas.
CYP2D6
Farmacogenmica
Desarrollar nuevos frmacos a travs de los conocimientos de las variantes en los
SNPs y dar un esquema teraputico individualizado.
Actualmente se pueden analizar los polimorfismos por un chip (ampichips) por
microarreglos y vemos varios SNPs, no estn an muy disponibles pero cuestan
mucho-> analiza los principales genes que codifican las principales protenas del
metabolismo. 4
Metabolismo de fase II
Genes polimrficos e introducen variabilidad adicional
Ej:
Polimorfismo de la glucoronidacin y toxicidad por irinotecn
Glucoronidacin por la UDP-glucosil transferasa para la excrecin de la bilirrubina en la
bilis
Polimorfismo de la N-acetil transferasa y tratamiento de la tuberculosis con isoniazida
Su falta causa neuropata perifrica y supresin de la mdula sea
En exceso puede dar lupus eritematoso
Polimorfismo en la eficacia de la tipurina metil transferasa y de 6-mercaptopurina
Utilizados en el tx de leucemias infantiles e inmunosupresin
Estos son desintoxicados por su unin a un grupo metilo por efecto de la TPMT (tiopurina
metil transfersa)
Su deficiencia parcial reduce el metabolismo y puede incrementar la eficacia del
medicamento o incrementar su toxicidad.
Polimorfismo de la colinesterasa y prolongacin de la parlisis muscular anestsica en el
postoperatorio.
TAMIZ
Es una prueba que se encarga de examinar a toda la poblacin, funciona como filtro para no
investigar a todo la poblacin y me quedo con toda la poblacin que tienen mayores riesgos.
Empleando marcadores especficos.
Evita prueba invasivos, es una prueba de rutina
Los marcadores empleados deben de identificar una gran proporcin afectada con un mnimo de
margen de error:
Deben ofrecer un 75% de tasa de deteccin con un 5% de tasa de falsos positivos.
Deben de tener 75% mnimo porque entre mas alto sea el % obtengo la mayor parte de
las personas en riesgo y tengo menos probabilidades que una persona con riesgo se
valla y no la revise.
Deben de ser seguidos por una prueba diagnstica y manejo.
Debe de realizarse en toda mujer embarazada
Los avances del tamiz han hecho posible ofrecen a todas las mujeres embarazada un tamizaje no
invasivo para determinar el riesgo del feto
regresan las asas al abdomen -> puede estar relacionado a trisoma 18)
Gastrocticis (salida completa de las asas y estn expuestas al lquido)
Megavejiga
Arterias umbilicales nicas (trisoma 18, alteraciones cardiacas o renales)
Marcadores bioqumicos
Doble marcador ombotex (2 elementos)
B-hcG (fraccin B de la gonadotropina corinica humana):
Elevada para Sx de dawn
PAPP (Protena A plasmtica asociada al embarazo)
Disminuida para Sx de down
Los dos son secretados por la placenta.
Mtodo de invasivo para diagnstico
Biopsia de vellosidades coriales
11 a 12 semanas de gestacin
Transvaginal o transabdominal
Picas corion y obtienes las muestras
Cultivos de 1 y 7 das
Cariotipo/Fish (en el momento) -> cariotipo molecular con sondas de colores
complementarias en ciertas regiones cromosmicas.
Las sondas se mandan principalmente a 18, 13, 21, 3 X y Y
1-2% de falsos positivos -> porque las vellosidades coriales se forman por una
divisin ms temprana y esta formado principalmente por trofoblasto que es una
divisin muy temprana y si no la ves es porque era un mosaico y la mutacin se dio
despus y por lo tanto no lo puedes identificar; pero si tienes todo lo dems
positivo ya no piensas en mosaico porque hay muchas cosas que lo sustentan.
Riesgo de perder el embarazo es de 1:100 (se ofrece a mayores de 45 aos
porque a esta edad tienen mas riesgo de tenerlo un nio con down 1:50)
Se hace un cariotipo (se obtienen cromosomas rompiendo el ncleo), el cariotipo
es lo mejor porque se identifican ms cosas, hasta alteraciones estructurales.
Segundo trimestre
Marcadores bioqumicos (semana 15-20 "19.6")
.fetoprotena
Elevado en defectos de tubo neural abierto (mielomeningocele)
Si la acetilcolinesterasa esta elevada tambin es un defecto de tubo neural
Elevada en efectos de pared abdominal (gastroctisis)
Triple marcador-> ms comn
AFP (a-fetoprotena)
HGC (hormona gonadotropina corinica completa)
Eus (Estriol no conjugado)
Cudruple-> ms completo
Agregas Inhibina A aparte de los de arriba
En esta ya tienes tasa de deteccin de 80%
Identificas: Turner, trisoma 13 casi no la ves, trisomas, molas (no son viables)
Molas:
Completas: 46 cromosomas, pero su aporte slo es paterno. (el aporte paterno
contribuye principalmente del aporte paterno; es grande con crecimiento
hidatiforme y no hay feto porque no hay contribucin materna)
Parciales: 69 cromosomas (triploides) hay dos casos:
Ovulo haploide (23 cromosomas) y dos espermatozoides de 23 -> diandra
"triploidia tipo 1"
HGC elevado
AFP elevada
Ovulo con 46 cromosomas y un solo espermatozoide - " triploidea 2" ->
Diginia (si hay componente fetal en los otros no)
HGC bajo
AFP bajo
Ultrasonografa
USG estructural (todas las mujeres se o deberan de realizar) -> se ve todo
Se usan marcadores (soft markers) -> porque ninguno es lo suficientemente fuerte
para establecer un dx claro como la tranlucencia nucal
Alteraciones del SNC
Alteraciones cardiacas
Focos ecognicos:
Foco que tiene una densidad ultrasonogrfica similar a la del hueso (manchas
blancas que se ven) -> en corazn puede ser cardiopata etc Focos ecognicos intestinales pensamos en:
Hemorragias intestinales
Infeccines (torch)
Fibrosis qustica.
Grosor del pliege nucal (continuacin de la translucencia nucal aumentada)
Ventriculomegalia
Leves
Severas -> infeccin
Quistes de plexo coroides (50% asociado a trisomia 18)
Pilectasia (inflamacin de vas renales)
Fmur y humero
Incrementan los otros riesgos
Humero corto le sigue a riesgo de la translucencia nucal
Fmur y humero corto tiene mayor riesgo para Down
Mtodo invasivo para dx prenatal
Amniocentesis
Se usa a partir de la semana 15 o 16
Riesgo de 1-200 (menos a la biopsia)
OTROS:
Coriosintesis
Puncionar directamente el cordn umbilical y obtener sangre fetal directa
Requiere de mucha ms experiencia porque entras ms cerca del feto
Se requiere para un dx certero y hay escases de lquido o en un dx de anemias
(hemolticas, por infeccin por toxoplasma etc)
Cada vez esta ms en desuso porque ahora miden el flujo de la arteria cerebral
media en el bebe y establecen si est anmico.
Biopsia placentaria (no se hacen mucho en Mxico)
Dx preimplantacin
Cuerpo polar
Meten a la mujer a una hiperestimulacin ovrica y cundo ovula se quedan con el
cuerpo polar y ven como estn los cromosomas.
Asesoramiento gentico
Conclusin
Aplicaciones en oncologa
jueves, 26 de abril de 2012
09:07 a.m.
Retinoblastoma
Fallas en un gen tumor supresor
Se comprueba la teora del doble gen "se requieren dos mutaciones en los dos alelos para que se presenta la enfermedad"
Hay formas hereditarias y no hereditarias
Hereditarias son ms tempranas y multifocales
La mayora de los casos ya tienen el primer hit de nacimiento y necesitan una mutacin somtica extra para perder el otro hit. Y por eso se presentan ms temprano, porque
necesita menos tiempo para conseguir los dos hits.
Gen APC:
Causa cncer de colon familiar con polipos
Lo causan mutaciones puntuales en este gen (gen tumor supresor)
Sx de Linch:
"genes de reparacin" -> Genes MMR
Este tipo de cncer se da por fallas en genes que codifican para protenas de reparacin de DNA.
Cuando fallan los mecanismos de reparacin se le llama "inestabilidad de microsatlites"
Microsatelites: repetidos pequeos, secuencia de 3 o 4(recuerda -> los minisatelites son ms grandes). Se hace con PCR "anlisis de microsatlites o de microarreglos"
Cuando hay diferentes resultados en la clula de un px; es decir que algunas de las clulas por estos estudios te das cuenta que los genes pesan ms quiere decir que
hay microsatelites.
Perfil de expresin -> conocer que genes se expresan ms y que genes menos
Microarreglos de alta densidad y perfiles de expresin en cncer con valor pronstico.
Buscan perfiles transcripcionales que permitan identificar sub-categoras entre enfermedades muy similares.
Con esto pueden clasificar si el pronostico es mejor o peor en los diferentes pacientes y de esta manera si sabes que a los q ue presentan una mayor densidad en sus
genes tienen peor pronstico inicias con una terapia ms fuerte desde antes.
Gentica y forense
jueves, 03 de mayo de 2012
07:27 a.m.
Primer caso de doble homicidio y violacin resuelto por perfil de DNA en 1986
"huella gnica" -> cdigo de barras particular
Dr. A. Jeffreys -> estudios mediante anlisis serolgicos y fueron excluyendo, pero quedaron 500 sospechosos que no
se pudieron distinguir de estos anlisis y finalmente se logro descubrir al asesino, siendo la primera vez que se uso
DNA.
Fuentes de DNA en gentica forense
Volantes de automviles
Huellas dactilares
Pelo de mascotas en ropa
Aplicadores-laminillas y ms
Saliva que se quede en el cigarrillo, en chicles etc.
Polimorfismos: Usamos principalmente estos dos:
STRs -> microsatelites (1,2 o 3 bases nitrogenadas que se repiten varias veces)
Localizados en el cromosoma Y, para cuando se sospecha de homicidios varones.
Los puedo estudiar por PCR y su producto lo coloco en un gel vertical (electroforesis) y por la diferencia de peso
molecular puedo ver los fragmentos y ver si son homocigotos y el nmero de repetidos de la variante, si no hay
barras en un mismo nivel (mismo peso molecular) se podra decir que no son familiares por no tener secuencias
parecidas.
16 STR y que en todos halla alelos parecidos
Se estudian en alelos muy polimrficos para mayor seguridad.
SNPS -> cambio de una base por otra (biallicos; es decir o A o C)
Podemos usarlos de DNA somtico o de DNA mitocondrial (principalmente para tipo evolutivo).
Los puedo estudiar por PCR- restriccin (si dan un sitio de corte) si no lo dan, se estudian por secuenciacin
Para decir que es tu familiar tienes que estudiar 16 variantes.
CODIS: Dice en las diferentes poblaciones cual es la frecuencia de determinadas variantes. Me va diciendo las variantes
genticas o allicas que hay en las poblaciones y cuales son los STRs mas polimrficos descritos en las diferentes
poblaciones.
Se eligen los mas polimrficos.
Hay diversas pginas que te pueden proporcionar esta informacin
Escoger estos polimorfismos tiene como funcin que por coincidencia al azar seas parecido a otra persona.
Se escoge los mejores STR
Se usan reacciones de PCR y se ponen en anlisis de geles verticales y por el tamao de fragmento sabes si son homocigotos
o heterocigotos y ver si comparten polimorfismo.
TIENEN QUE COMPARTIR ALELIS CON EL MISMO PESO Y COMPROBARLO 16 VECES.
Casi siempre se toma la muestra de sangre o de mucosa oral
Estudio de perfil de DNA -> 99.9% prcticamente 100%
Entre hermanos compartes 50% de compatibilidad
A veces se puede solicitar la muestra de la madre como control.
Con uno que no sea compatible se sugiere que no es el padre pero se requieren dos.
Con uno no porque los polimorfismos tambin tienen cambios o mutaciones pero son muy raros.
A veces se puede hacer por PCR mltiple donde podemos identificar varios, pero cuando se hace el PCR individual es
por que los alelos tienen pesos moleculares parecidos y hay que investigarlos por separados para ver bien la
diferencia.
Casos en donde se confunden muestras en los laboratorio como en cncer de mama, para no volver a tomar la muestra
porque es peligros, es que comparas las muestras con la persona. Duda si la biopsia era de la seora. Se hacen para saber si
la muestra es suya.
Otro caso es cundo a dos hijos les mandan un tejido de su padre por secuestro y se quieren asegurar que el tejido es de
su padre.
No puedo decir si dos personas son hermanos si no tengo muestras paternas o maternas por el 50% de variabilidad.
Si se usa un secuenciador, es ms rpido el resultado (ya no se usa el gel), el fundamento es el mismo. Los resultados los
ves en picos. El aparato detecta las fluorescencias por peso molecular en un gel interno.
Anlisis de PCR en secuenciacin automtica-> no ves base or base como en una secuenciacin normal; el que ves
primero es el de menor peso molecular.
Si es homocigoto se ve un pico sobrelapado.
Biologa Molecular pgina 45
Gentica y
forense
Grabacin de audio iniciada: 07:31 a.m.
jueves, 03 de mayo de 2012
Se revisan muchas variantes pera estar muy seguro de que no hay errores, se ve la frecuencia de cada variante en
poblacin general; probabilidad de que sean iguales en tantas variables es de <1 en 1013 ,->probabilidad de coincidencia al
azar en poblaciones.
Esccuhar (bao) -> Tambin sirve para identificar si la persona muerta son sus hijos bilgicos.
Ejemplo -> para ver si es su nieto si muestra del padre; lo hacen con to y abuelo por medio del Y porque si no, no es seguro.
Casi siempre usamos STR y a veces usamos los SNPs
Si estudiamos SNPs tenemos que usar 40 variables (se tiene que estudiar un mayor nmero de loci)
Pero tienen menos mutaciones despus
Posibilidad de inferir etnia
Se usa secuenciacin
Son ms caros los estudios.
Genoma mitocondrial:
SNPs no sirven para determinar paternidad
Perfil de DNA por STRs en perro y gato
Sirven para identificar los criminales
Para homicidios y ver quien es el dueo, agresin de animales
DNA recombinante
jueves, 03 de mayo de 2012
09:06 a.m.
ENZIMAS DE RESTRICCIN
Protenas con actividad enzimtica que van a restringir
Defensa contra fagos en bacterias
Generalmente reconocen y cortan en secuencia palidrmicas de 4 a 8 pb.
Los cortes generan un par de extremos cohesivos o romos (iguales).
Maquinaria que uso para cortar el DNA de manera precisa
En este caso se realizan de manera sinttica a partir de las bacterias
Ejemplo:
Eco R5 -> viene de la E. coli que reconoce la secuencia R5
Cada enzima tiene su propia secuencia que va a reconocer.
Son endonucleasas tipo II -> son especificas y reconocen solo una secuencia; las de tipo I no son especficas.
La secuencia palindrmica solo me sirve para reconocer en donde voy a cortar.
VECTORES:
Elementos que transportan el DNA
Este vector tiene que tener extremos complementarios a mi secuencia de DNA (en sus extremos romos o cohesivos)
El plsmido se someta a la misma enzima que el DNA para dejar los extremos exactamente complementarios a los extremos del DNA y se puedan
unir.
Usas un vector en funcin al tamao del producto que ests usando.
Capacidad de sntesis independiente
Tienen 4 caractersticas:
Replicacin independiente junto con el segmento de DNA que transporta.
Debe contener sitios de corte para enzimas de restriccin
Debe de tener algn marcador de seleccin (confirmar que se inserta de manera correcta a mi clula) -> para distinguir las clulas husped que
transportan al vector las que no lo contienen
Fcil de recuperar (porque mi fin es obtener mltiples copias de esto)
Plsmido:
DNA circular bacteriana de doble cadena
Necesita un sitio ori (indica el inicio del sitio de replicacin)
Seleccin: un gen de resistencia a ampicilina y a tetraciclinas y si al meterlo a ampicilina sobrevive quiere decir que mi seleccin fue exitosa.
5000 pares de bases
Bacterifago:
Los virus la usan para insertan su material gentico en una bacteria y usar la maquinaria de una bacteria para aumentar su potencial infeccioso
Insertan fragmento de 30, 000 pares de bases (es lo que cambia mi seleccin entre usar plsmido o bacterifago)
Gen COS:
Gen que le confiere mayor capacidad de regulacin
podemos trabajar con secuencias de 50, 000 a 70, 000 pares de bases
Construccin molecular:
Gen SRY (Brazo corto del cromosoma Y) -> identificar sexo, permite la expresin de otros genes que conducen la diferenciacin de la gnada.
Lo amplifico por PCR, purifico el producto de DNA y lo insertamos en un vector (P-traget); tiene un promotor, un gen de resistencia a la
ampicilina y mi secuencia de DNA insertada.
Si lo insertamos a un ratn en vida fetal con una o dos divisiones para que todas las clulas tengan esta variante, tendr XX, pero su fenotipo y
funcionalidad ser de un XY.
Sx de varn XX
Transfeccin: Insertar mi construccin a una clula eucarionte.
Animales transgnicos:
Se hace en las etapas iniciales del cigoto cundo estn en proncleo para que todas las divisiones contengan mi material insertado.
KO -> Ej-> mi ratn Knock out le quito su transportador de colesterol -> se ven fenotpicamente o si le insertas para la hormona el crecimiento ese
ratn de la misma camada crece ms
Las medusas en su genoma tienen una protena verde fluorescente (VEDFLUORECENTE) -> gen GFP, lo obtuvieron, la purificaron por PCR y la
podemos insertar en un vector y tengo mi construccin molecular con el vector elegido; lo inserto en un modelo de un ratn y los vuelvo
fluorescentes. (1986).
Ej -> WNT4 -> se inserta en un plsmido que adems tiene un GFP, lo sumamos porque se crea que la WNT4 era para la creacin del rin, al meterlo
juntos se expresan en el mismo lugar y al meterlo el rin fluores y se dieron cuenta que si serva para el desarrollo del rin.
Plantas transgnicas:
Protegen a los cultivos de parasitos.
No se ha usado por que no se ha confirmado que no causa daos a los humanos al comrsela.
Protena C humana
Protena del plasma
Factor regulador de la coagulacin sangunea
Existen pacientes con deficiencia competa de la protena
Tx -> protena C exgena
DNA
recombina...
Grabacin de audio
iniciada: 09:09 a.m. jueves,
03 de mayo de 2012
Proceso:
Metes plsmidos ya con tu DNA insertado y te aseguras de que halla una mayor proporcin para que te asegures de que rodean a la clula, aumentas
calor para crear poro en la membrana celular y que por azar se introduzcan algunos plsmidos, despus nutres a la clula y se corrigen a los poros y
ya adentro los plsmidos usan la maquinaria de la clula para replicarse y formar protenas en el citoplasma y se empiezan a acumular y despus los
libera.
Producto de RNA recombinante:
Anticoagulantes
Factores sanguneos
Factores de crecimiento
Insulina
Eritropoyetina
Anticuerpos monoclonales
Superxido dismutasa
Vacunas
Factores estimuladores de colonias
Interferones
Ventajas:
Eliminar infecciones
Evitar formacin de anticuerpos.
Obtencin en mayor cantidad de un producto
Costo menor que otros mtodos para purificacin de protenas
Biblioteca de DNA
Genoma
Cromosoma
Genes transcripcionalmente activos
Almacenas genomas de una especie en peligros de extincin
Disear un cromosoma artificial bacteriano para meterle mucho ms informacin hasta 300Kb.
Si le quiero meter ms informacin me voy a ala levadura que tiene un genoma mayor (1000-2000 kb)
BACS y YACS-> Cromosomas artificiales bacterianos (BACs) y de levaduras (YACs)
Desarrollo a finales de 90s
BACs: similares a plsmidos pero con insertos de hasta 300kb, usados en construccin de mapas de alta resolucin del genoma humano
YACs: son los vectores con la mayor capacidad de clonacin y asilamiento de fragmentos de 1000-2000 kb
Oveja dolly (hay mas animales clonados)
Biologa
molecular ...
Biopsias
Cutneas, linfonodos, heptica)
LCR (ejemplo un bebe con infeccin que presente sntomas que indican que se encuentra en el LCR, como vmito en
proyectil)
Muestras por exfoliacin
Sangre
Derrames pleural, pericrdico; ascitis
Lquido amnitico
Esputo/quimo
Heces fecales/orina
Exudados farngeos
Lavas bronquioalveolares.
Microorganismos:
Genoma con DNA o RNA (algunos virus); si se sospecha de virus se analiza el RNA
Pruebas dx:
PCR y variantes
PCR en tiempo real: cuantificacin carga viral, diagnstica.
RT-PCR: cuantificacin carga vira, diagnstica. A partir de RNA
PCR anidado: diagnstico, genotipificacin (serotipos, resistencias)
Es muy sensible que detecta una clula cancerosa en 1000 normales, se usa en oncologa para detectar clulas cancerosas. Pones PCR normal
con oligos y ese producto obtenido de la PCR le vuelvo hacer una PCR para hacerlo ms especfico
PCR mltiple: Diagnstica y genotipificacin
Tipificar varios virus a la vez; como en papiloma que hay varios, los ms representativos es 17 y 18; los oligos que uso me deben permitir
diferenciar uno de otro por peso molecular.
PCR y restriccin: Diagnstica y genotipificacin
Se usa para ver si son sensibles o no a un medicamento
PCR y SSCP: Deteccin de nuevos genotipos, resistencia.
No examen
PCR - secuenciacin automatizada: Genotipificacin, resistencia, ribotipificacin.
Todo el genoma de un microorganismo. Ver si cambio o se modifico (mut), ver si es resistente a nuevos medicamentos
Consideraciones en el dx
Sensibilidad de la prueba -> # de organismos o molculas blanco insuficientes para deteccin
Buscas la prueba que te de 100% de deteccin, las de 50% no funcionan
Contaminacin -> falsos positivos
Buscar un laboratorio seguro, evitar que la misma flora sea la que estas multiplicando
Equipo y reas especiales
Validacin de la prueba dx en cada zona
Calidad de la muestra: purificacin diferencial
Deteccin de agentes causales de uretritis no gonocccica y EPI
Neisseria gonorrhoeae
Chlamydia: trachomatis, psittaci, pneumoniae
Mycoplasma: hominie
Ureoplasma
Distingues no de otro porque tienes oligos especiales
Extraccin de DNA -> PCR (Con 4 pares de primers representantes de los microorganismos sospechosos; puede haber
- - - - fragmento control
Ciclo de VIH
Se usa mucho.
Monitoreas el VIH a travs de tiempo real o RT-PCR (ven carga viral)
Para ver todo el genoma usas secuenciacin (no usas GWAS porque es muy cara y el genoma del VIH es muy chico)
Esta sustituyendo a ELISA porque es ms sensible e incluso mas barato, ELISA tiene ms falsos-positivos
Puedo detectar el nmero de copias del DNA viral (es muy sensible detecta desde 1 copia)
Extraccin de RNA -> RT-PCR en tiempo real
Amplicones y sondas para:
InfA: Genrico de influenza
SW-1: Influenza "porcina"
SW-H1: gen hemaglutinina epidmico
RNAasa: control endgeno humano
SNPS -> sondas en alelos 1 y 2 y veo si flourese o no fluorese, los distingues por la 3ra sonda.
Puedes monitorear se ya hay cepas resistentes y a que son resistentes.
Neuroinfecciones: (meningoencefalitis)
Verdadera urgencia mdica
Origen: bacteriana o viral
Datos clnicos: A veces no puedes distinguir entre los microorganismos para empezar con tx especfico.
Antes se llegaba a hacer hasta biopsia cerebral
Se usa PCR- mltiple para detectar entre los tipos de agentes que causan neuroinfecciones.
Px con sepsis ya hay kits que incluyen bacterias y hongos para saber que agente es.
- - - - - fragmento control
- Mycoplasma
Gonorrhea
Diagnstico
prenatal m...
Grabacin de audio iniciada: 07:53 a.m. jueves, 24 de mayo de 2012
Ventajas:
Desventajas:
Prdida fetal
Infecciones
Malformaciones
Posibilidad elevada de contaminacin con DNA materno decidual en la biopsia de vellosidades coriales porque puedes obtener DNA de la madre.
Mosaicismo necesitan confirmarse por amniocentesis.
Casi siempre cuando se hacen los estudios moleculares es porque hay antecedentes
Se usa la PCR y sus variantes
Sx de Down- 1 de cada 700 nacidos
Por eso el estudio molecular esta ms enfocado a esto que a enfermedades mendelianas que son ms raras.
El 89% de productos con cromosomopata que llegan a trmino, esta conformado por las trisomas 13, 18 y 21.
Resuelve ansiedad materna (resultados en 48 horas)
Se usa electroforesis capilar donde no necesitas cultivar las clulas y por eso el resultado lo obtienes en dos das y no en 15 para esperar el cultivo.
Se amplifica por PCR un porcin polimrfica. (DNA microsatlite)
Si tengo 3 picos sobrelapados -> "Trisoma 21"
El Fish y tcnicas de DNA microsatelite solo analiza las trisomas 21, 13 y 18 por eso esperas al cariotipo para ver todos los cromosomas.
Obtienes lquido amnitico, haces PCR mltiple usando oligos; 11 STRs para 11, 13 y 21, el producto de la PCR se separa en un capilar y se pasan por un laser donde
identificas tu producto porque se separa por tamao y dan fluorescencia.
Si tengo dos picos en el gen que esta en el X significa que es una mujer; si fuera hombre se vera uno nadamas.
Si es patolgico se ven 3 picos.
Tambin lo puedes ver en PCR tiempo real; si tienes un triple dosis se tiene una elevacin exponencial antes. Mi punto CT esta adelantado.
Se compara los cromosomas 18, 21 y 13, todas tienen que estar sobrelapadas en la curva de PCR tiempo real porque tienen la misma cantidad gnica, si una se separa es que
hay trisoma o monosoma dependiendo de donde estn.
Indicacin absoluta:
Historia familiar de trastorno monogentico
Directo:
Caracterizar la mutacin y sexo del producto
Mtodo con certeza diagnstica prcticamente del 100%
Si ya hay antecedentes, ya se que estudio se le puede ofrecer.
Atrofias musculo-espinales -> si lo dx prenatal no se niega la interrupcin del embarazo porque el bebe se la va a pasar hospitalizado y no sobreviven ms de 1 ao.
Son hipotnicos, las neuronas de las hasta anteriores tienen apoptosis.
98% es perdida de informacin del exn 7 y 8
Identificas PCR y restriccin, porque hay un pseudogen (distingues entre gen y pseudogen)
PCR real para ver portadores
Nio con delecin de exn 7 y 8 observas el pseudogen
Enfermedad puntual
Secuenciacin de todo el gen para encontrar la mutacin responsable; ya que lo encontr solo amplifico veo la parte mutada.
Si a partir de un punto hay dos pico sobrelapados es heterocigoto se debe a delecin e insercin
Esclerosis tuberosa:
Expresividad variable
Autosmica dominante
Si hay mucha variabilidad usamos Secuenciacin
Slo hay dos genes responsables
Duchenne
Delecin -> estudio de PCR para definir sexo porque solo se afectan hombres y despus PCR mltiple
Lo ms comn es diagnstico en cromosomas y a veces en mendelianas.
Para paternidad -> PCR y electroforesis.
Terapia Gnica
jueves, 24 de mayo de 2012
09:05 a.m.
Terapia
Gnica
Modificacin gentica directa de la clula del paciente para lograr un objetivo teraputico
Generalidades:
Conocimiento insuficiente acerca del tratamiento de las enfermedades genticas debido a factores:
1. Genes no identificados o desconocidos de la patogenia
Locus desconocido y genes con mecanismo fisiopatolgico inadecuado
2. Afectacin FETAL previa al diagnstico
Se puede prever en familiares con antecedentes y con pruebas de tamizaje en parejas con riesgo
3. Fenotipos graves son menos susceptibles de respuesta al tratamiento
Por ausencia de protena codificada, protena alterada sin actividad residual
Padecimientos menos graves -> protena residual en grado suficiente para conseguir efecto teraputico.
In vivo
Tejidos que no son posibles cultivar clulas de receptor en cantidad suficiente
Vector directo al tejido blanco o IV
xito: depende de eficiencia de transferencia y expresin gnica.
Diseo de vectores:
Integracin cromosmica:
Expresin gnica prolongada
Gen en cromosoma de clula husped
Replicacin de vector con divisin celular
Integracin aleatoria en diferentes clulas
Expresin vector impredecible
Activacin otros genes
Episomas extracromosmicos
Partcula gentica que existe de manea autnoma en el citoplasma de clula o bacteria
Duracin de expresin limitada
Dilucin con crecimiento de poblacin celular
Tx repetidos.
Hay dos tipos:
No virales:
Liposomas
Inyeccin directa y bombardeo de partculas
Endocitosis mediada por receptor
Virales
Adenovirus
Vaccina virus
Retro virus
Pox virus
Virus asociado a adenovirus
NO VIRALES
Liposomas:
Vesculas sintticas (lpidos + sol acuosa). Ej: fosfolpidos
DNA se empaca in vitro con liposomas
Se utiliza para transferencia gnica a tejido in vivo
Poseen carga
Catines: sup (+) y enlazan DNA exterior
Aninicos: sup (-) y enlazan DNA interior
Ventajas:
Fcil de preparas DNA/lpido
No lmite de tamao de DNA
Desventajas:
Baja eficiencia transferencia
DNA diseada no se integra al cromosmico
Expresin transitorios de genes
Inyeccin directa /bombardeo de partculas
Inyeccin directa DNA con jeringas directamente en el msculo
Ej: DMD (murinos)
Bombardeo de partculas "pistola de genes"
Pelotitas de metal cubiertas con DNA -> disparo dentro de clulas
til en tejidos que no proliferan
Mala eficacia de transferencia gnica y no se integran de forma estable el DNA inyecta
Todo en modelos murinos
Endocitosis mediada por receptor
DNA acoplado a una molcula blanco que se enlaza a receptor celular e induce endocitosis -> Transferencia DNA al interior de la clula
Ej: clulas hematopoyeticas y receptor de trasnferinas
Transferencia gnica alta
No diseado para la integracin de genes transferidos
VIRALES
Oncorretrovirales
Virus RNA/Transcriptasa reversa
Complejo de preintegracin
Transferir DNA al interior de la clula
Slo pueden infectar clulas en divisin
No en neuronas
Si para tx cncer
Habilidad para transformar clulas
Mutageneis insercional
Capacidad de DNA baja de 8kb -> no sirven mucho
Adenovirus:
Virus DNA
Ventaja:
Ttulos altos de expresin y transduccin eficiente a clulas en divisin y sin divisin
Desventaja
Inmunogenecidad:
En 1999 JESSE Gelsinger muri dos das despus de recibir AV por inyeccin intraheptica en estudio de tx gnica para OTC (tu bo reaccin inmune)
Expresin gnica corto tiempo -> repetir administracin -> exacerba respuesta inmune
Capacidad de 35 kb
Virus adenorrelacionados (AAV)
Mas usados en protocolos
Virus DNA cadena nica no patgenos
Dependen de coinfeccin por virus colaborador para replicarse
Avv humano no modificado se integra en DNA cromosmico
VENTAJAS:
Expresin a largo plazo
Sin Rx mutagneis insercional (problema retrovirus)
Infecta clulas divisin / quiescentes
Desventajas:
Ttulo vrico muy bajo
Limitacin de 4.5 kb
Lentivirus
Casi no se usan
Retrovirus que infecta clulas que no se dividen
Integracin en cromosoma en forma aleatoria
Ventaja:
Expresin gnica a largo plazo
Desventaja:
Mutagneis insercional
HIV es la base de la mayor parte de vectores lentivirales
Rx de replicacin del virus
Se elimino genes innecesarios
Conserva capacidad de infectar clulas que no se dividen
Virus herpes simple
Trpicos para SNC
DNA doble cadena (80 genes)
Infx lactante en ganglios sensoriales
Elementos extracoromosmicos no integrados
Expresin a largo plazo (diseminacin red sinptica)
Aporte de genes al interior de neuronas -> tx Parkinson y tumores SNC
Requisitos esenciales
Identidad del defecto molculas:
Conocer el gen afectado o al menos fundamento bioqumico
Copia funcional del gen
Clon del DNA complementario (Cdna) del gen o el propio gen
Si el gen es grande -> versin funcional (eliminacin de los componentes no esenciales para disminuir el tamao)
Conocer mecanismo fisiopatologico
Para que la trasferencia del gen: corregir proceso patolgico, prevenir, retrasar o revertir las alteraciones fenotipicas.
Mutaciones con perdida funcional: sustitucin del gen funcional
Dominantes negativas: Inactivacin gen mutante o sis productos
Consciente riesgo-beneficio favorable:
Favorable tx alternativo
Diana celular aprobada:
Clula diana debe tener una sobrevida prolongada o una buena potencia de replicacin in vivo y que es accesible para introduc cin directa del gen, es decir copias
suficientes para tener efecto teraputico
Evidencia de eficacia y seguridad:
Demostracin que el vector y la construccin teraputica
Efectivos y seguros (Animales)
Aprobacin de la normativa
Fibrosis qustica
Estrategias actuales:
Ologonucleotidos antisentidos
Ncleotidos modificados de RNA o DNA que hibridan con una secuencia de DNA o RNA blanco
Estos pueden unirse a ciertos exones y excitar el splicing en el RNAm
Estrategias para evitar la accin de la H-RNA -asa
Hemofilia B
Deficiencia del factor IX
Enfermedad ligada al X recesiva
Por delecin o mutacin en gen del factor IX coagulacin
Tx: medico: infusin de protena del factor IX -> no efectivo completamente por desarrollo de anticuerpos
Tx gnico: Vectores con AAV diseados:
Expresar gen del factor IX
Inyeccin directa del vector del msculo o arteria heptica
IM: Se ha demostrado evidencia clara sin toxicidad pero con resultado mnimo con niveles subterapeuticos del factor IX
Terapia de cncer
El 64% de la investigacin en terapia gnica se realiza en cncer
Genes suicidas: genes que tiene prodroga que no es txica pero cuando se convierte a droga es txica y destruye la clula
Hay dos:
Terapia con blanco inmunolgico
Genes inmunoestimulantes
Genes de citocinas
Vacunas
Vacunas celulares
Manipulacin ex vivo de clulas presentadoras de antgenos
Vacunas gnicas
Inyeccin directa de genes que codifican antgenos
Terapia con blanco molecular
Genes suicidas
Antioncogenes
Genes supresor de tumores