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Biologa molecular

jueves, 26 de enero de 2012


07:07 a.m.

Dr. Ariadna Gonzlez del ngel

8:30a.m-1:00pm consulta enf. Genticas. Laboratorio diario

Biologa m...

2 parciales y un final que valen lo mismo


Son acumulativos
NO EXENTOS
Participacin y trabajos >10%

Bases Nitr...

Antes se pensaban que slo estaban los nucletidos y ahora se sabe q los cidos molculares son la
molcula esencial que transmite la informacin.

La purina o la pirimidina (base


nitrogenada) se une en la regin 1 prima.

Acidos nuclcios (funciones); no solo sirven para transmitir informacin gentica. (3 o 5 en ex)

Autocataltica: ella misma tiene la capacidad de cambiar


su estructura para tener su funcin

Actividad cataltica (enzime-like o riozimas) RNAasa, spliceosoma, ribosoma (se regulan a ellos mismos)
Autocataltica: Intrones
Ribonucleotido o
Pentosa + base
Cofactores enzimticos: NADH, FAD
Desoxiribonucleotido (la diferencia nitrogenada (1 prima)
Transporte: tRNA
es en pentosa en la regin 2 prima
+ grupo fosfato (5
Neurotransmisores: adenosina
que el desoxi tiene un H y el ribosa prima de la pentosa)
2os mensajero: AMPc
tiene
un
OH-hidroxilo)
Replicacin-telomerasa-retrotrasposicin, Inactivacin (XIST)
Transductores de energa: ATP GTP
Ac. Nucleico: azcar(pentosa), fosfatos (unidos al azcar), bases nitrogenadas
(pirimidas y purinas)

XIST: Es un gen clave en la inactivacin del cromosoma X (17 y 18)


y esto es para la determinacin sexual en mamferos en el
cromosoma X en el que se active inactivare el gen (en la madre)

Bases pricas (2 anillos)

Adenina y Guanina

Bases pirimdicas (1 anillo) Timina, uracilo (RNA) y citosina

G-C
A-T/U

El Ribonucleotido o Desoxiribonucleotido es el monmero y formaran polinucletidos (cido nuclico)

Los fosfatos que unen el nucletido unen 5 prima donde se ubica original con 3 prima y el
enlace se llama fosfodiester. Direccin de 5 - 3.

Composicin qumica DNA


Polidesoxirribonuclotido (DOS CADENAS QUE GIRAN A LA DERECHA)
Ninguna actividad cataltica (no favorece ciertas reacciones como autoromperse)
Molcula altamente flexible (superenrrollamiento)
Molcula qumicamente muy estable (para que no existan muchos cambios en el material gentico)
Capaz de formar estructuras bicatenarias (a veces pueden ser tricatenarias pero es muy raro)
Cadenas antiparalelas y complementarias
Bases nitrogenas: Puentes de H (es decir, unen cadenas)
Formas: A, B y Z. La mas comn es la B (descrita por watson y crit), cada 11 nucletidos gira a la
derecha, dicatenario con cadenas complementarias y antiparalelas. La diferencia es que la A esta
mas compacta y no estas segura que halla en vivo y la Z gira hacia la izquierda y no esta tan
apretado.
Las cadenas de DNA giran a la derecha (Dextrogira) - los giros son necesarios para protegerla.
El DNA siempre esta unido a las histonas para no sufrir errores.
DNA tiene exones e intrones y el RNA solo tiene exones.

Existen 23,000 genes, eso significa que hay millones de protenas.

Flujo de la informacn gentica


RNA->mRNA->proteina

Composicin qumica RNA


Polirribonucletido unidos por enlaces fosfodiester de 3 a 5
Presenta notable actividad cataltica (ellos mismos se pueden romper)
Molcula moderadamente flexible (bucles)
Molcula qumicamente poco estable
Molcula lineal que es capaz de formar bucles bicatenarios ( cuando
los forma es para evitar que se sigan formando protenas, es una delas
maneras) en ciertas regiones, conservando el antiparalelismo
Bases nitrogenadas: Puentes de h (hidorfbicas)
Diversas especies.
La mayora de los RNA son una sola cadena
La base nitrogenada esta unida a 1 y en la parte 2 tenemos unido un
hidroxilo

El RNA sufre cambios postranscripcional y genera RNA de transferencia y ribosomales y algunos otros
como los nucleares/nucleolares (rompen a la molcula de RNA y forman el RNAm) o citoslicos.
La primera molcula de RNA que se llama heterogneo nuclear (tiene intrones y exones) y sufre un
procesamiento y cortes para formar los RNA de varios tipos y de ah se van a los ribosomas para formar
las protenas.

Algunas protenas necesitan modificaciones postraduccionales para que puedan ejercer su funcin; ejemplo se les
agregan carbohidratos o otras necesitan enlaces disulfuro; si no ocurren me da una enfermedad etc, ejemplo:
osteognesis imperfecta -> "nios de cristal" la colgena no tiene su estructura normal por falta de enlaces disulfuro
en las protenas de la colgena, tambin tienen talla baja, sordera etc. Ocurre en error de replicacin de DNA

.t RNA
.r RNA
.sn RNA (nucleares/nucleolares)->forman parte del spliceosoma son autocatalticos
.sc RNA (citoslicos)- regulan formacin de protenas.

tambin se les llama microRNA

Una aplicacin de los microRNA sera ponerlos al cuerpo en


enfermedades dnde hay un exceso de produccin de protenas para
que regulen su formacin

La replicacin del DNA es semiconservativa. La replicacin se da por regiones donde inicia pero se
replica por completo el DNA , los lugares donde se inicia la replicacin son los replicones. El total del
genoma humano se replica totalmente en 6-8 horas por DNA polimerasa con un margen de error de

ETAPAS BSICAS

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.sc RNA (citoslicos)- regulan formacin de protenas.

La replicacin del DNA es semiconservativa. La replicacin se da por regiones donde inicia pero se
replica por completo el DNA , los lugares donde se inicia la replicacin son los replicones. El total del
genoma humano se replica totalmente en 6-8 horas por DNA polimerasa con un margen de error de

ETAPAS BSICAS
Replicacin
Transcripcin
Traduccin

Iniciacin
Extensin
terminacin

Se incorporan de 60-90 nucletidos por segundo.


La replicacin se controla a nivel de la iniciacin (entrada a fase S, fenmeno de "todo o nada")
Los elementos clave son las DNA polimerasas: requiere un cebador, aade nucletidos en el extremo 3
prima libre, la cadena crece en direccin 5-3 y revisa el adecuado apareamiento de las bases.
El cebador se quita al final.
Un partidor, cebador, iniciador o primer, es una cadena de cido nucleico o de una molcula relacionada que
sirve como punto de partida para la replicacin del ADN y es necesaria para un DNA polimerasa. El
cebador es un pequeo RNA que me da el extremo 3 libre y la polimerasa hace el enlace fosfodiester,
un cebador tiene ,masomenos 10 ribonucleotidos.

Cadena continua y discontinua, fragmentos de okasaki:


Reiji Okazaki y Tsuneko Okazaki en la dcada de 1960, al descubrir que una de las nuevas
cadenas de ADN se sintetiza en forma de trozos cortos que, en su honor, se
denominan fragmentos de Okazaki.

Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Partidor>

Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Replicaci%C3%B3n_de_ADN>

Existen 5 DNA polimerasas: la alfa forma una cadena discontinua (fragmentos de okasaki) y la delta
forma cadena continua

La cadena que se sintetiza en el mismo sentido que avanza la horquilla de replicacin se


denomina hebra adelantada (en ingls, leading strand, que a veces se traduce por lder o
conductora) y se sintetiza de forma continua por la ADN polimerasa, mientras que la que se
sintetiza en sentido contrario al avance se denomina hebra rezagada o retrasada (en
ingls, lagging strand), cuya sntesis se realiza de forma discontinua teniendo que esperar a
que la horquilla de replicacin avance para disponer de una cierta longitud de ADN
molde.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Replicaci%C3%B3n_de_ADN>

Acondroplasia: Es una de las tallas bajas mas comn (existen 100 patologas de
talla baja) su error ocurre en espermatognesis comnmente en edad avanzada.
Es una patologa de replicacin. Esta mutada una protena que regula la divisin de
los condrocitos; y se inhibe. Este error es desde del inicio de la replicacin no por
modificaciones postraduccionales como la osteognesis imperfecta.
En la mayora de las patologas autosmicas dominantes son errores en espermatognesis y se
atriubuyen a la edad avanzada.
La direccin de la replicacin y transcripcin es de 5-3

Las DNA polimerasas tienen la capacidad de checar si se estn equivocando o no y


a este proceso se le llama 3-5 exonucleasa y como que se regresa y corrige. Esto
es importante porque algunas circunstancias diarias pueden alterar el DNA como
los rayos ultravioleta del sol y por eso tienen que ser capaces de corregirse. Las
DNA polimerasa y son de reparacin de DNA y las alfa y delta son de
replicacin. Hay un DNA mitocondrial que tambin se replica por medio de la
gamma.

Maso menos 10,000 regiones donde inicia la replicacin del DNA y se les llaman replicones; por lo tanto
hay 10,000 cebadores. Tarda 8 horas en replicarse. Se incorporan de 60-90 nucletidos por minuto.
(dato cultural).

Alfa

Sintetiza cadena discontinua

Delta

Continua

psilon Repara
Beta

Repara

Gamma Sntesis mitocondrial, solo es una porque solo hay un replicn y una sola cadena porque es
circular.

HELICASAS
Dirigen enzimticamente la apertura de dsDNA (DNA bicatenario) con gasto de ATP o dATP
Desdoblan el DNA (helicasas) y mantienen separadas las dos cadenas.
Protena SSB (De unin a cadena sencilla) mantiene las dos cadenas separadas mas o menos 50
nucletidos, son como burbujas para que se de la replicacin con la direccin 5 -3.
El cebador se tiene que eliminar y el espacio que queda entre DNA y DNA lo corrigen las ligasas
que introducen nuevos nucletidos y se unen por enlaces fosfodiester, entre los de okasaki y
entre los replicones.

Un promotor es una secuencia de DNA que no codifica pero que se le unen diversas
protenas para regular los procesos de replicacin y transcripcin, dan las seales para
decir que gen se debe de transcribir en los diferentes tejidos.

Estructura bsica de un gen: DNA (REGION PROMOTORA, EXONES E INTRONES)

La diferencia entre un cebador y un promotor es que un cebador es una secuencia de RNA y el promotor
es de DNA.

La direccin de formacin de RNA es 5-3, pero la cadena de DNA que me sirvi de


molde es 3-5. El primer RNA en formarse es el heterogneo nuclear (exones e
intrones). Un RNA maduro es cuando solo son puros exones. Hay una secuencia que
determina la terminacin del gen.

Hay 3 RNA polimerasas, la mas importante es la POL II que genera RNAm, la que forman RNAm, y t y los
nucleolares es la POL III (los nucleolares sirven para el splicing) y los otros 3 RNA que forman los
ribosomas (3 RNA + protenas = ribosoma) son generados por POL I.

Los genes pueden estar apagados o prendidos depende si se estn transcribiendo


o no y dependen de seales que se unen si la estructura de la cromatina esta
descondensadas pero si la estructura esta condensada no se da la transcripcin.

Factores cis y trans: Un factor cis se encuentra dentro de la cadena de DNA, es decir son "secuencias de
DNA". Un ejemplo es el promotor u otro es el enhacer (promueven la transcripcin pero se pueden
encontrar lejos de la regin promotora). Y los trans son protenas que se unen a los cis que pueden
favorecer o inhibir la transcripcin.

Dedos de zinc, helix, zipper de leucina son ejemplos de factores trans.

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TATA caja: es parte del promotor es rica en adenina y timina (la


mayora de los genes la tienen).

EJEMPLO: enfermedad gentica dnde se altera la "transcripcin" porque el gen codifica un factor
transcripcional "sndrome de Waardenburg" que en este caso los factor transcripcional promueve a
otras genes como los de la formacin de melanocitos, de neuronas ganglionares (sordera) y algunos
genes que forman la cara ; sus caractersticas son un mechn blanco, tabique nasal alto y ojos
separados a veces labio paladar hendido. Se debe al gen PAX-3, normalmente forma 2 RNA y de ah
formar las protenas en conjunto que codifican para lo afectado en este sndrome, forma una

Haploinsuficiencia 50% de la dosis

formar las protenas en conjunto que codifican para lo afectado en este sndrome, forma una
protena normal pero con la mitad de la dosis. Es haploinsuficiencia dominante porque es la mitad
de informacin y dominante porque con solo la mitad (un alelo) de informacin causa enfermedad.

Una situacin en la cual la protena producida por una sola copia de un gen normal, no es suficiente para
garantizar una funcin normal.
Haploinsuficiencia es un trmino que se emplea cuando el producto de un gen es la mitad del nivel normal. Esto
puede presentarse debido a un nmero de problemas, el ms comn siendo el que una de las dos copias de un
gen falte como producto de una delecin. En otros casos lo que se produce es una mutacin en el gen, que
altera su estabilidad a nivel de ARN mensajero afectando la produccin del mensaje de ese gen que codifica
para la protena en las clulas.

Pegado de <http://www.conocimientosweb.net/portal/term1501.html>

Se calcula que 30% de nuestros genes tiene splicing alternativo (formacin de


diferentes protenas a partir del mismo gen.

Distrofina: Protena que se forma a partir de un gen que es para el msculo. Pero varia dependiendo el
msculo en donde se produzca; el mismo gen que produce la distrofina varia y forma diferentes
distrofinas segn el musculo en donde se produce. -> ejemplo de splicing

Usualmente las primeras 2 letras de los codones son fijas y la que cambia sin haber una alteracin es la
ltima, pero en algunos casos si puede causar un cambio de a.a.

Un ejemplo de patologa en splicing es la ATROFIA MUSCULOESPINAL TIPO I; los nios tienen hipotona
y falla en msculos respiratorios, fallecen el primer ao de va, es autosmica recesiva. Los papas tienen
un alelo mutado que al unirse de ambos padres causa la enfermedad. Debera de tener dos genes smn1
formar mi heterogeneo nuclear luego mi RNAm con splicing y formar la protenas necesarias para las
motoneuronas, en esta patologa estos genes no producen la protenas que regula el splicing de otros
genes (no de el mismo) y al no tenerlo no tengo el RNM adecuado de los genes de las motoneuronas.

El RNAm se lee por tripletas (codon) y se van colocando los a.a por el RNMt que tiene forma de trbol
donde en un extremo esta el a.a y del otro estn 3 bases nitrogenadas (anticodon) que si son
complementarias al codn se deja el a.a.

Enfermedad de x frgil: 1-4000 es la segunda enfermedad con retraso mental mas frecuente, tiene cara
alargada y orejas grandes. Los afectados son varones porque esta ligada al x, aunque las mujer lo
pueden transmitir. El gen FMRP1 produce una protena que regula la traduccin de otros genes sobre
todo a nivel de neuronas.

PRESENTACIONES
Ejemplos de splicing alternativo:
POMC: propiomelanocortina
VLDLR: Receptor de proteasn de muy baja densidad miembro de las lipoprotenas que
por splicing alternativo genera 3 isoformas: en la 1) 3 y 16 a.a 2) 3 3) 16. El mismo gen
codifica varias isoformas
Osteognesis imperfecta: Enf. Congnita por el defecto de un gen que codifica para
colgeno tipo 1. Es autonmica dominante (con un solo gen afectado tiene enfermedad), hay
50% de probabilidad que el hijo la desarrolle. Tienen fracturas seas, perdida temprana de
la audicin, articulaciones flexibles y pie plano, escoliosis, brazos y piernas arqueadas,
cifosis y esclertica azul. La ms grave de tipo 2. Son 3 cadenas y necesita mutaciones en
dos genes que codifiquen para dos de las cadenas tricatenarias. Tratamiento: bifosfonatos.
Ejemplo de modificacin postraduccional.
Acondroplacia:Es un trastorno autosmico dominante que se vincula con la edad paterna
avanzada (50% de posibilidades). Es una displasia fisiaria (el remodelada sea falla a nivel
de la epfisis- el hueso es corto pero grueso) hay dos formas de pasarse; por herencia-10%
y mutacin de novo-90%: Talla baja desproporcionada con miembros cortos,
megaloencefalia, hiperlordosis lumbar, mano con forma de tridente, Pelvis estrecha,
hipotona moderada, genovaro, agujero magno pequeo etc. Mutacin en el que codifica para
el receptor 3 del factor de crecimiento fibroblasticosen el cromosoma 4. La mutacin de
G1138A es la mutacin ms frecuente en el ser humano, en vez de ser guanina se cambia
por adenina. 98% de los casos en acondroplacia.
Micro RNA: Monocateriano, 21-25 nucletidos, regula la expresin utilizando la ruta de la
ribointerferencia (regula la expresin gnica, es un complementario de una parte del mRNA
y as ejerce sus efectos inhibitorios). Es una molcula de RNA transcrita a partir de genes
de DNA pero sin ser traducida a protenas. Es regulada por promotores especficos y
muchos de los cnceres son provocados por mutaciones de micro RNA.

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GU- inicio de intron en extremo 5, es constante


AG- final de intron 3, es constante.
El RNA nucleolar (splaisosoma) es el que hace los cortes y realiza el splicing.

Calcitonina: Regulas los niveles de calcio, se produce en tiroides, en la


tiroides se realiza un splicing que produce una protena diferente que
se llama "protena similar a calcitonina" que no tiene una funcin clara.

En el ribosoma pueden estar 2 RNAt, el primero va a traer la metionina (1er


a.a) en todas las protenas en humano "AUG" (codon de inicio), es el nico
RNAt que entra directo al sitio P (peptdidico) y los dems se unen al A
(aminoasilico) y se van formando por enlaces peptdicos, hasta llegar a un
codn terminal.
En el sitio A puede haber ensayo-error.
El cdigo gentico se lee por tripletas

Presentaciones:
agonzalezdelanhel@yahoo.com.mx grupo 301 la
salle

La expresin de los genes se regula sobretodo en la transcripcin.

Herencia Mendeliana
jueves, 02 de febrero de 2012
09:08 a.m.

Chicharos-pisum sativum ->Gregorio Mendel, tena caracteres bicotmicos (ej. o grandes o chicas)
Primer experimento: cruzamiento monohbrido-> flor blanca y morada y todas salieron moradas (f1) y si
entrecruzas individuos de f1 1/4 sale blanco (f2).
-Para sus experimentos uso chicharos por su variedad de caractersticas observables.

Sus resultado de esto experimentos fueron as:

Se dio cuenta que le sala la misma proporcin 3-1

LA RAZON 1:2:1
1. Existen determinantes hereditarios de naturaleza particulada
(genes).
2. Cada planta adulta contiene en cada clula una pareja gnica para
cada carcter estudiado.
3. Los miembros de la pareja gnica se distribuyen de forma igualitaria,
entre los gametos.
4. Cada gameto contiene nicamente un miembro de la pareja gnica.
5. La unin de un gameto de cada parental se produce al azar.

Primer ley de Mendel: "Distribucin igualitaria"


Segunda ley de Mendel: "Segregacin independiente"

Un carcter tiene dos partes que lo conforman y se separan uno a cada


lado.
OMIM: http://omim.org
Tambin sirve para probar las
mutaciones, riesgo de un progenitor
afectado dominante. Si los dos
tuvieran un alelo alterado hay 75%
de probabilidades en vez de 50%.

Primera ley de Mendel: Los dos miembros de una pareja gnica se distribuyen

separadamente entre los gametos (segregan), de forma que la mitad de los gametos llevan
un miembro de la pareja y la otra mitad llevan el otro miembro de la pareja gnica.
"DISTRIBUCIN IGUALITARIA"

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Segundo experimento: "Cruzamiento dihbirdo"


Lneas puras parentales difieren en dos genes que controlan dos diferencias de caracteres distintas:
-Genotipo de color del guisante:

-Genotipo de forma del guisante:

Segunda ley de Mendel: Durante la formacin de

los gametos, la segregacin de los alelos de un gen


se produce de forma independiente de la
segregacin de los alelos de otro gen.
"SEGREGACIN INDEPENDIENTE". Hay un
ejemplo que no entra dentro de esta ley; y son los
pelirrojos que van ligados con el alelo de las
pecas.

Los humanos tenemos entre 23000 y 25000 genes.

GENTICA CLNICA
CLASIFICACIN DE LA PATOLOGA GENTICA
Cromosmica: Sx. Down, Sx. Turner, Sx. Kriduchat
Monognica: cambios en la secuencia o mutaciones en un solo gen.
Multifactorial: Enfermedades cuya causa es una combinacin de susceptibilidad
gentica del individuo y del contexto donde se encuentre y su interaccin;
hipertensin, diabetes, psoriasis, cncer, labio paladar hendido.

Ligados al cromosoma y solo representan el 0.12% casi no son


representativos para las enfermedades mendelianas.

Hay ms enfermedades que genes que pueden estar mutados porque


el gen puede mutar de diferentes maneras que te dar diferentes
efectos y por lo tanto diferentes enfermedades.

La psoriasis (AFI: [soja.sis], del griego , picor ) es una


enfermedad inflamatoria crnica de la piel que produce lesiones
escamosas engrosadas e inflamadas, con una amplia
variabilidad clnica y evolutiva. No es contagiosa, aunque si
puede ser hereditaria, es ms probable que la hereden los
hombres que las mujeres.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Psoriasis>

CONCEPTOS EN HERENCIA MENDELIANA

Genotipo: Constitucin gentica de un individuo en uno o varios loci gnicos.


Fenotipo: Apariencia u otras caractersticas del organismo que resultan de la interaccin entre su
constitucin gentica y su ambiente. / diferentes formas que puede tener un carcter.
Alelo: Una de las muchas formas alternativas de un gen ocupando un locus particular en un
cromosoma.
Mutacin/polimorfismo: Cambio permanente y heredable en la secuencia nucleotidica del DNA.

Mutacin; alelo que causa enfermedad. Polimorfismo: alelo presente en al menos 1% de la poblacin.

Homocigoto: Presencia de dos alelos idnticos en el mismo locus.


Heterocigoto: Presencia de dos alelos diferentes en un locus especifico.
Hemicigoto: Presencia de slo una copia de un gen. Ej. Varones para cromosoma X.
Dominante: Un rasgo que se expresa cuando se encuentra en estado heterocigoto. Ej. Acondroplasia.
Recesivo: Es un rasgo que solo se expresa cuando esta en estado homocigoto. Ej. Deficiencia de 21
alfa hidorxilasa
Codominante: Ambos alelos diferentes de un mismo locus se expresan. EJ. Sistema ABO.

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Codominante: Ambos alelos diferentes de un mismo locus se expresan. EJ. Sistema ABO.
Doble heterocigoto: individuo que es heterocigoto en dos loci diferentes.
Heterocigoto compuesto: individuo con dos mutaciones diferentes en el mismo locus.
Heterogeneidad gentica: Expresin de fenotipos similares determinados por genotipos diferentes:
ALLICA (Alelos diferentes de un mismo gen causan el mismo fenotipo -la misma enfermedad- o
alelos diferentes de un mismo gen causan un fenotipo diferente). DE LOCUS: Mutaciones en genes
distintos en loci diferentes causan un fenotipo similar.

Un locus (del latn locus, lugar; plural loci)


es una posicin fija sobre un cromosoma,
como la posicin de un gen o de un
biomarcador (marcador gentico). Una
variante de la secuencia de ADN en un
determinado locus se llama alelo.
Pegado de
<http://es.answers.yahoo.com/question/index?qid=
20110117161627AAoaAsh>

Afecta al metabolismo del hierro, provocando un acmulo excesivo e incorrecto de


este metal en los rganos y sistemas del organismo.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Hemocromatosis>

Herencia autosmica dominante


Las mujeres somos las nicas que podemos ser homocigotos o heterocigotos
dominantes porque tenemos doble x y los hombre solo tiene una x.
Variantes raras: cambios que estn en <del 1% de la poblacin que no causan ninguna
enfermedad.

Herencia vertical: afectados en todas las generaciones


Herencia horizontal: afectados en la misma generacin

Hemocromatosis esta en un locus aurosomico pero hay mas en hombres.

Expresin variable: grado en el que un genotipo se expresa en un individuo.


PENETRANCIA: Proporcin de individuos que portan un alelo y que lo manifiestan.

Penetrancia del 100%=100% si tengo el alelo mutado voy a presentar la enfermedad.


Mosaico germinal: significa que los padres en algunas se sus clulas
germinales tiene cierta mutacin que ellos no presentan peor la pasan a sus
hijos.
Las enfermedades ligadas al x dominante no las pasa a sus hijos solo a sus hijas porque al
tener hijos les tiene que pasar forzosamente el Y y no el X.

Expresividad: Cuando el cuadro ocasionado por un gen comprende rasgos que aparecen
con intensidad variable o a edades variables Ej: Enfermedad de Huntington
La expresividad se mide en una persona solamente.
Penetrancia: Es el porcentaje de una poblacin que expresa el fenotipo de un
determinado gen. Puede ser completo (100%) o incompleto
Se mide el porcentaje en una POBLACION.
Pegado de <http://www.mancia.org/foro/genetica/25675-expresividad-penetrancia.html>

Pleiotropismo: Un gen es responsable de diversos efectos fenotpicos en distintos tejidos

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Autosmica recesiva: un dato es que si son consanguneos es probable que sea recesivo si se
esta expresando.

Pleiotropismo: Un gen es responsable de diversos efectos fenotpicos en distintos tejidos


por la presencia del producto gnico en estos.
Anticipaciones: La severidad del fenotipo mutante aumenta conforme pasa de generacin
en generacin.

En autosmico recesivo forzosamente los dos padres


tiene que ser portadores.

Herencia autosmica recesiva

HERENCIA LIGADA AL CROMOSOMA X

X-inactivacin (tambin llamado lyonization) es un proceso por el cual una de las


dos copias del Cromosoma X presente adentro hembramamferos se hace inactivo.
El cromosoma de X inactivo es silenciado empaquetando en transcriptionally
inactivo heterochromatin. la X-inactivacin ocurre de modo que la hembra, con dos
cromosomas de X, no tenga dos veces tanto cromosoma de X productos del
gene comovarn, que poseen solamente una sola copia del cromosoma de X
(vase remuneracin de la dosificacin). La opcin de la cual el cromosoma de X ser
hecho inactivo es al azar en mamferos placentarios por ejemplo ratones y seres
humanos, pero una vez que se haga inactivo un cromosoma de X seguir siendo
inactivo a travs del curso de la vida de la clula. Desemejante de la X -inactivacin
al azar en mamferos placentarios, inactivacin adentro marsupiales se aplica
exclusivamente al cromosoma de X paternal derivado.
Pegado de <http://www.multilingualarchive.com/ma/enwiki/es/X-inactivation#Barr_bodies>

Herencia dominante ligada al X: Rett e incontinencia igmente (mortales), raquitismo

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HEMICIGOTO: Se dice del sujeto masculino cuyo cromosoma sexual X es portador


de un carcter particular. Dado que el cromosoma es nico, el sujeto no puede ser

Herencia dominante ligada al X: Rett e incontinencia igmente (mortales), raquitismo


Herencia recesiva ligada al X: (diagonal)- duchene y hemofilia

HEMICIGOTO: Se dice del sujeto masculino cuyo cromosoma sexual X es portador


de un carcter particular. Dado que el cromosoma es nico, el sujeto no puede ser
denominado homocigoto ni heterocigoto (ambas condiciones precisan un par
de cromosomas) y el carcter gentico transmitido por este cromosoma se manifiesta
siempre, aunque sea recesivo.
Pegado de <http://www.portalesmedicos.com/diccionario_medico/index.php/Hemicigoto >

Cuando algunos de los individuos con el genotipo apropiado no muestran en absoluto es decir
el 100% del fenotipo correspondiente decimos que el gen muestra una penetrancia
reducida; la penetrancia es un concepto de todo o nada. Cundo la gravedad de la
enfermedad difiere en personas con el mismo genotipo, decimos que el fenotipo muestra un
expresividad variable.

La heterogeneidad gentica puede ser el resultado de la presencia de mutaciones


diferentes en el mismo loci (herogeneidad allica) o en loci diferentes (heterogeneidad de
locus) o en ambas posibilidades.

Rett syndrome is a brain disorder that occurs almost exclusively in girls (Los
hombre no sobreviven) The most common form of the condition is known as
classic Rett syndrome. After birth, girls with classic Rett syndrome have 6 to 18
months of apparently normal development before developing severe problems
with communication and language, learning, coordination, and other brain
functions.
Pegado de <http://ghr.nlm.nih.gov/condition/rett-syndrome>

ACONDROPLASIA
(enfermedad autosmica dominante)
Displasia sea mas comn
Prevalencia 1/26, 000
Gen: FGFR3 (PROTEINA QUE SE EXPRESA EN HUESOS CON CRECIMIENTO ENDOCONDRAL- crneo,
mandbula, clavculas (1er hueso en osificarse)
Locus: 4p16.3,
Protena: Receptor del factor de crecimiento de fibroblastos 3
La mutacin ms frecuente se deben es en G1138A (95%), la mayor parte son mutaciones de novo (80-90%) y
en < por edad paterna avanzada (> de 45 aos)
Mutacin con ganancia de funcin: Produce actividad inhibitoria constante del receptor sobre el cartlago del
crecimiento. HIPERMORFA
Penetrancia al 100%
Expresividad variable (limitada)
Si hay un padre afectado hay 50% de que se pase y hay <de 1% de que sea de ambos padres sanos que les
vuelva a nacer un segundo hijo afectado (padres con hijo afectado). Ambos padres afectados es de 75% en
cada embarazo.
Riesgo elevado de morbi-mortalidad.
Normalmente 50% de transmisin
Diagnostico clnico:
Talla baja desproporcionada (SS/SI >1)
Acortamiento rizomlico
Macrocefalica
Trax estrecho
Hiperlordosis lumbar
Dedos en tridente
Frente prominente
Puente nasal deprimido
Hipoplasia medio facial
Talla media: 1.32 (hombre) 1.27 (mujeres) pero va de 125-145cm

Diagnstico radiolgico
Se pueden diagnosticar en etapa prenatal (20-24 semanas)
TAC (tomografa axial conmutada) de base de crneo y agujero magno.
Serie sea completa: AP (anteroposterior) y lateral crneo. AP y lateral columna completa, huesos
largos, comparativa de manos y pies.
Crneo: Desproporcin crneo-cara, base del crneo pequea, foramen magno estrecho y comprensin de
unin cervico-medular.
Trax: ligeramente estrecho
Pelvis: iliacos cuadrados y acetbulo plano.
Columna: Disminucin en la distancia interpedicular a nivel lumbar, cuerpos vertebrales cortos, xifosis
toracolumbar leve y lordosis marcada.
Huesos largos: Cortos y delgados, metfisis ensachadas, falanges medias y proximales cortas y cuello
femoral corto y angular.
Manejo
Crecimiento y alimentacin (tienden a obesidad)-> grficas especiales de peso, talla y PC.
Respiratorio (por el cuello puede restringirla): Tienen va area estrecha, ronquido, hipersomnolencia
por no dormir bien.
Musculo esqueltico: Hipermovilidad articular e hiperlaxos. Hiperlordosis, vigilar parestesias o
disestesias que indiquen comprensin nerviosa, genu varu
Dental (la estructura del crneo tiene un paladar muy alto y tienden a tener diente muy chuecos).
Paladar ojival, valoracin por ortodoncia.
Desarrollo y conducta: Desarrollo cognitivo normal, 10% retraso mental y tienen limitaciones fsicas,
darles terapia fsica para fortaleza msculos de la espalda.
Audicin (por el crneo puede tener las tubas auditivas en mala posicin), a veces por eso tiene
alteraciones del lenguaje porque no escuchan bien. Disfuncin de odo medio- (hipoacusia- alteraciones
del lenguaje)
Neurolgico (para asegurarse que no halla comprensin y la sensibilidad): a veces hay hidrocefalia.
EVITAR movimientos bruscos de cabeza y cuello.
Anestesia y embarazo (va a area difcil de entubar)

Biologa Molecular pgina 8

Herencia
Mendeliana
Grabacin de audio iniciada: 09:27 a.m. jueves, 09 de febrero de 2012

Displasia sea tanatofrica-> se da cuando eres homocigoto


para acondroplasia.

Hipoacnondroplasia: Acondroplasia leve, no


son mosaicos. Se podran dar, pero se dara en
mutaciones en clulas en estadios mas
avanzados del desarrollo y es muy muy poco
probable.

Proximal- rizo
Medio- meso
Distal- acro

Anestesia y embarazo (va a area difcil de entubar)

Diagnostico diferencial
Acondroplasia homocigota (pareja de dos acondroplsico)- ms grave
Sx SADDAN
Acondroplasia-hipocondroplasia
Displasia tanatofrica (mucho ms severo, trax restrictivo)

ENFERMEDAD DE HUNGTINTON
(autosmico dominante)
Aqu dos alelos mutados no te agrava la enfermedad como en la acondroplasia
Si se presenta antes se debe al tamao del repetido
Prevalencia en poblaciones de origen europeo 3-7/100,000 (Venezuela)
En Venezuela es muy frecuente y en japoneses muy poco frecuente
Gen HTT se localiza en 4p16.3 (es una casualidad que sea en el mismo que acondroplasia)
La protena es esencial para mantener la integridad neuronal en los ganglios basales, sus funciones no se
comprenden completamente. Esta protena es de mucha importancia en el desarrollo.
Protena llamada hungtintina con funcin desconocida

Mutaciones
Por expansin del trinucleotido CAG localizado en la regin 5 prima del gen.
Riesgo de expansin y de tener hijos afectados:29-35 repetidos (6-8% de casos sin historia familiar)
NORMAL <36 repetidos
PENETRANCIA REDUCIDA:36-39 repetidos
PENETRANCIA COMPLETA: >40 repetidos

Correlacin genotipo-fenotipo
45 repetidos- 50 aos
55 repetidos- 30 aos
74 repetidos- 20 aos
La distona es un trastorno del movimiento que causa
Manifestaciones clnicas
contracciones involuntarias de los msculos
Alteraciones del movimiento:
COREA
Distona
Espasticidad
Rigidez
Bradicinesia
Alteraciones cognitivas
Disfuncin ejecutiva
Perseveracin psicomotora
Dficit visoespecial y perceptual
Aprendizaje y memoria alterados
Demencia
Alteraciones psiquitricas
Depresin
Irritabilidad
Ansiedad
Riesgo suicida
Apata
Agitacin
Comportamiento OC
Hipersexualidad
Psicosis
Otras manifestaciones: alteraciones en la comunicacin, dificultad para deglutir, nutricin (baja, por la energa que
se consume en los movimientos desgastantes y aparte no degluten bien), sueo y crisis convulsivas.
Manejo
Medidas de apoyo
Tratamiento sintomtico

ANEMIA DE CLULAS FALCIFORMES


(Autosmica recesiva)
La hemoglobina es un tetrmero (4 protenas) dos cadenas y dos .
Mutacin en el gen HBB en 11p15.4
Es una hemoglobinopata, por mutacin puntual (transversin).
Mayor adherencia de los drepanocitos al endotelio vascular
Interaccin de los drepanocitos (g. rojos donde la hemoglobina tiene una alteracin) con otras clulas sanguneas
Alteracin del endotelio vascular.
Los eritrocitos no pueden pasar con facilidad por las vnulas.
Venooclusion
Ms frecuente en individuos africanos, afro-americanos.
Cuadro clnico
Enfermedad oclusiva
Infarto: por obstruccin de un adecuado suministro de oxgeno.
Sndrome de trax agudo
Anemia hemoltica
Manifestaciones inmunolgicas
Manifestaciones infecciosas.
Aumenta hemoglobina F
Tratamiento

Biologa Molecular pgina 9

Anemia hemoltica
Manifestaciones inmunolgicas
Manifestaciones infecciosas.
Aumenta hemoglobina F

Tratamiento
Principalmente para las crisis de dolor
Mucha hidratacin
Suplemento con cido flico y hierro
Trasplante de mdula sea.

FIBROSIS QUSTICA
(autosmica recesiva)
En caucsicos 1/2500
En Mxico se calcula que es 1/5000
Es una de las enfermedades ms frecuentes
Mutacin en gen de canal de cloro
Frecuencia de portadores caucsicos: 1/25
Gen CFTR, ubicado en 7q31
Codifica para un canal membranal que conduce Cloro
Existen ms de 1500 mutaciones descritas para ste gen (heterogeniedad allica)
Es la mas comn a nivel mundial 70% de mutaciones son en F508
Tienen distintos efectos funcionales y con diferentes formas porque son 1500
diferentes mutaciones: puede que no este por completo el canal porque codifique a
codn de paro, o que halla bloqueos en la regulacin en donde si llegue a la membrana
apical pero no tiene como abrirse o cerrar, conductancia alterada que no permite que
pase el cloro adecuada (menos grave) o de sntesis reducida (la menos grave, solo hay
menor proporcin de canales)
Mueren generalmente en la primera dcada de vida, en EU hasta 30
Triada de la fibrosis qustica
Cloruros en sudor elevados (>60meq)
Insuficiencia pancretica
Enfermedad pulmonar crnica
Datos de sospecha:
Ileo meconial, peritonitis meconial, screening positivo, ictericia, pancreatitis, clculos
Hay que hacer estudio en sudor (>60)-si (<40)->no
Afeccin pulmonar
Primera causa de morbi-mortalidad en pacientes con FQ.

Afeccin intestinal:
Ileo meconial: falta de secrecin de cloro y de agua en el lumen intestinal + moco
patolgico.
Afeccin pancretica
Progresivo
Volumen de fluido pancretico disminuido
Otras manifestaciones: azoospermia, cirrosis, litiasis biliar, neumotrax espontneo, opasificacin de
los senos paranasales.
Tratamiento
Causal: ensayos de terapia gnica

Pronstico reproductivo es malo:


Hombres: azoospermia
Mujeres: Restriccin pulmonar durante el embarazo.

HEMOFILIA A
Recesiva ligada al X
La hemofilia A es causada por un rasgo hereditario recesivo ligado al cromosoma X, con el
gen defectuoso localizado en dicho cromosoma. Las mujeres tienen dos copias del
cromosoma X, de modo que si el gen del factor VIII en uno de los cromosomas no
funciona, el gen en el otro cromosoma puede hacer el trabajo de producir suficiente
factor VIII. Los hombres, sin embargo, tienen nicamente un cromosoma X, de tal
forma que si el gen del factor VIII en ese cromosoma es defectuoso, tendrn
hemofilia A. Por esto, la mayora de las personas con hemofilia A son hombres y las
mujeres son portadoras
Deficiencia de la coagulacin
Gen F8 localizado en Xq28
Codifica para el facto VIII de la cascada de coagulacin
2/3 partes mam portadora, 1/3 parte mutacin de novo.
Heterogeneidad gentica: 45%- hemofilia severa por inversin en el intrn 22 y
40% deleciones.
Mutacin puntual c.70T>A (transversin)

Clasificaciones segn su funcin


Severa- <1% (edad de dx: 1er aos de vida)
Moderada- 1-5% (edad de dx: antes de 5-6 aos)
Leve- >-35% (edad de dx: vida adulta)
Evaluacin
Valoracin de articulaciones y msculos
Indicador ms importante de severidad es la actividad F VIII
Diagnstico
Cuadro clnico
Pruebas de coagulacin
Actividad de la coagulacin del factor 8

Biologa Molecular pgina 10

Diagnstico
Cuadro clnico
Pruebas de coagulacin
Actividad de la coagulacin del factor 8
Molecular: Presencia de la mutacin de DN
Portadoras
Aproximadamente el 10% de las portadoras tiene actividad de coagulacin del factor VIII
menor al 35% por lo que se encuentran en riesgo de presentar hemorragias. Para hacer el
diagnstico se determina la actividad del factor VIII y la mutacin.
Tratamiento
Infusin de concentrado de FVIII
Manejo de embarazo
DDAVP (duplica la actividad del factor 8)
Diagnstico diferencial
Enfermedad de Von Willebrand
Hemofilia B
Deficiencia de factor XI (judos)
Alteraciones de fibringeno
Alteraciones en la funcin plaquetaria.

Duchenne
Recesivo ligada al x
DELECCIN DEL 45-48

La enfermedad de von Willebrand es


causada por una deficiencia del factor de
von Willebrand, que ayuda a las plaquetas de
la sangre a amontonarse (aglutinarse) y
adherirse a las paredes de los vasos
sanguneos, lo cual es necesario para la
coagulacin normal de la sangre. Existen
varios tipos de la enfermedad de von
Willebrand.
Pegado de
<http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/ency/article/
000544.htm>

Tay sakcs. Relacionada con judos recesivo.

La enfermedad de Tay-Sachs ocurre cuando el cuerpo carece de


hexosaminidasa A, una protena que ayuda a descomponer un qumico que
se encuentra en el tejido nervioso, llamado ganglisidos. Sin esta
protena, los ganglisidos, en particular los ganglisidos GM2, se acumulan
en las clulas, especialmente las neuronas en el cerebro.
Pegado de <http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/ency/article/001417.htm>

Biologa Molecular pgina 11

rbol genealgico
jueves, 02 de febrero de 2012
}11:05 p.m.

La historia familiar es una manera de identificar el riesgo individual de enfermedades genticas.


Patrn de
herencia

Modo de transmisin

Claves

Factores confusos

Ejemplos

Autosmico
dominante

50% de riesgo a cada hijo o hija.

Transmisin hombre-hombre
Condicin en generaciones sucesivas
Mujeres y hombres afectados.
Variabilidad en la severidad de la enfermedad
Homocigotos estn ms afectados y puede llegar a ser
letal.

Penetrancia reducida
Su expresin leve en algunos
relativos puede fallar el diagnostico.
Nuevas mutaciones pueden fallarse
por familias pequeas y puede ser
diagnosticado como espordico

Hipercolesterolemia,
neurofibromastosis, marfan,
cancer de mama y de ovario,
huntington.

Autosmico
recesivo

Padres "sanos". 25% de riesgo en


cado hijo o hija

En una generacin (horizontal)


Hombres y mujeres afectados
Usualmente vistos en infantes y RN
Ms comn en grupos tnicos
Padres consanguneos.

Error y confundido con mutacin


espordica en familias pequeas.

Fibrosis cstica,
hemocromatosis, anemia, Sx.
tay-sachs

No hay transmisin hombre-hombre


Letal en hombres por lo que generalmente hay escases
de hombres con presencia de X dominante.
Muchos abortos involuntarios
Las mujeres expresan la enfermedad pero mas leve que
en los hombres

Familias pequeas

SX. Rett, pigmentacin


incongnita, Raquitismo

X dominante Mujer heterocigoto (Con


probabilidades 50% de afectar a
hijo (letal) e hija.

Ligada a X

La mujer tiene 50% de afectar al No transmisin hombre-hombre


Se puede perder si hay escases de
hijo y 50% de tener hija
mujeres en la familia.
Hombres afectados
heterocigoto. La hija heterocigoto Mujeres con posibilidades de ser afectadas y si hay
presencia sus rasgos son mas leves que en los hombres o
puede estar afectada. Los
pueden empezar con la enfermedad en una edad ms
hombres afectados no pueden
tener un hijo afectado
tarda que los hombres.

Cromosmica Aumenta el riesgo de trisomas en


madres de edad avanzada
El riesgo de que el feto sea
afectado depende de el reareglo
cromosmico-

Individuos con mas de 2 o 3 defectos de nacimiento


anomalas estructurales
con retraso motor inexplicable,
genitales ambiguos
Linfedema
Parejas con prdida de mas de 3 embarazos
Infertilidad inexplicable

Grados de parentesco:
1er grado: papas, hermanos e hijos; comparto con ellos 50% de informacin gentica.
2do grado: abuelos, to, sobrinos y nietos: comparto con ellos 25% de informacin gentica
3er grado: primos hermanos.

UTILIDAD DEL ARBOL GENEOLGICO


Ayuda al clnico al diagnstico
Permite identificar patrones de herencia y calcular el riesgo de recurrencia.
Identifica individuos en riesgo
Es una referencia de las relaciones sociales y biolgicas
EXELENTE FORMA DE DOCUMENTAR LA HISTORIA FAMILIAR.

NOMENCLATURA

Biologa Molecular pgina 12

Distrofia de Duchenne,
Hemofilia A, sndrome de X
frgil

Trisoma 21 (Down), trisoma 18,


turner (45 X) y translocaciones
robertsonianas.

Dos primos se casaron = relacin consangunea.

La enfermedad de Tay-Sachs ocurre cuando el cuerpo carece de


hexosaminidasa A, una protena que ayuda a descomponer un
qumico que se encuentra en el tejido nervioso, llamado
ganglisidos. Sin esta protena, los ganglisidos, en particular los
ganglisidos GM2, se acumulan en las clulas, especialmente las
neuronas en el cerebro.
Pegado de <http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/ency/article/001417.htm >

arbol
genetic

Biologa Molecular pgina 13

Genoma
jueves, 09 de febrero de 2012
07:19 a.m.

Es el conjunto de informacin codificada en todos los genes y secuencias intergenicas


presentes en la totalidad de los cromosomas (molculas de DNA) de un individuo.

Nucleares:
22 moleculas dsDNA: AUTOSOMAS
1 molecula dsdna: cromosoma X
1 molecula dsDNA: cromosoma Y

Histonas: Protenas en las que se enrolla el DNA Y TIENE LA


CAPACIDAD DE COMPACTARSE ENTRE ELLOS MISMOS DE
MANERA ORDENADA; a esto se le llama cromatina.

dsDNA= double-stranded DNA

1 molcula circular dsDNA: mtDNA

Niveles de compactacin de la cromatina:


(DNA enredado)
Las histonas son un conjunto de protenas que se unen formando un tetrmero
Carretes que se completan a ellos mismos de manera enredada
Metafase es la compactacin DNA por lo tanto no hay transcripcin

2 cromosomas-> 2 cromatidas (Molculas de DNA)


Cromatidas->formadas de cronomero (600nm) y a su vez estos estn formados por
asas de cromatina (fibras de 300nm)
Fibra de 30nm donde se encuentran las histonas

CARIOTIPO HUMANO
Las cromatides se pegan en el centrmero; las cromatides con respecto a su hermano
cromatide son unas copias fieles es decir son iguales pero entre ambos cromosomas son
diferentes. "diferencias alelicas" porque cada cromosoma viene de una combinacin entre
las cromatides de nuestros padres. Tambin las X y Y tienen dos cromatides.
Para verlo siempre lo tenemos que ver en metafase (porque es cuando se compacta el
DNA)

Cromosoma 2

Telomeros: estn en los extremos de los


cromosomas, no existen genes, amortiguan al DNA,
son las bases que mas se degradan, marcan el
envejecimiento.

GENOMA HUMANO
Genoma nuclear (3,300Millones de pb por genoma haploide)

20% Genes y secuencias relacionadas

80% DNA extragnico

Secuencias nicas o moderadamente repetitivas

<10% del 20% del


DNA total es DNA
codificante por lo
que en total del
DNA < DEL 2% ES
CODIFICANTE

Genoma mitocondrial 16.6 KB

70 -80% DNA nico o de bajo # de copias

DNA no-codificante

20-30% moderada a altamente repetitivo

60% agrupaciones de repetidos en


tandem

40% Repetidos dispersos


(secuencias Alu y Kpn)

Pseudogenes (mutaciones, parecidos a un gen funcional pero no da


problemas)
Fragmentos de genes
Intrones y secuencias no traducibles
Elementos enhancers/silencers y promotores (secuencias que sirven
para la regulacin de la expresin)

El exceso de DNA no codificante se puede explicar por la ventaja de que si hay una mutacin hay slo el 2% de probabilidad de que sea en una regin
codificante que nos afecte.

GENOMA NUCLEAR: Tiene herencia biparental, > abundancia de regiones peritelomricas,


es el 99.9995% del genoma humano y la > son genes interrumpidos (es decir intrones y

Biologa Molecular pgina 14

Tenemos 23,000 genes pero es muy


cambiante porque cada vez se va
depurando ms el DNA.

es el 99.9995% del genoma humano y la > son genes interrumpidos (es decir intrones y
exones etc), hay sus excepciones como los genes que codifican para las histonas o para el
SRY son continuos, no tiene intrones.

GENOMA MITOCONDRIAL:
16, 569 pb de dsDNA circular con un segmento adicional de tsDNA en D-loop, miles de copias por clula
Comprende < 0.5% de DNA total de una clula somtica
Contiene 37 genes, 28 localizados en la G y 9 en la L (ligera)
Herencia materna exclusivamente (porque el espermatozoide pierde las mitocondrias)
0.0005% del genoma humano
93% de la secuencia codificante (Contrario al nuclear)
44% de G+C
Cdigo gentico diferente al nuclear (nos comprueba la teora de que la mitocondria era una bacteria que se
introdujo a la clula; tiene las caractersticas de un DNA bacteriano; no hay intrones y exones y casi todo el
DNA es funcional)
Densidad gnica de 1 gen c/0.45 kb (mucho ms pesado que el nuclear)
13 genes sin intrones para polipptidos; es decir el DNA mitocondria va a codificar para protenas que le
sirven para el mismo
22 genes de t RNA
2 genes de r RNA
37 GENES
No tiene histonas
Hay algunos genes nucleares (50 genes; la mayora) que tambin codifican para formar protenas que
necesita la mitocondria.
Herencia uniparental (solo la madre)

DENSIDAD GNICA
EUCROMATINA
HETEROCROMATINA

Hay genes que estn duplicados o no


interrumpidos (sin intrones)->parecidos a los
genes bacterianos (37 genes del DNA, los de
las histonas, SRY, interfern etc)

Un Opern es grupo de genes estructurales cuya expresin est


regulada por los mismos elementos de control (promotor y
operador) y genes reguladores.
Pegado de <http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Operon/Operon.htm>

Operon: una misma ruta metablica esta regulada por el mismo


promotor sensible a algo; ejemplo todos los genes que codifican para
las enzimas de destruccin de lactosa estn juntos y la lactosa los
activa.
Plsmido: DNA que se puede pasar d bacteria a bacteria.

Tipos de cromosomas acrocentricos, etc

FAMILIAS MULTIGNICAS:
Secuencias codificantes con alto grado de homologa
Existen numerosos pseudogenes
Codifican para RNAs o polipptidos (superfamilias de Igs, genes de dessarrollo,
superfamilia de Rc olfatorios).
Una familia gnica o familia
TIPOS: Repeticin en tandem ("clusters"- DNA t) de genes de una misma familia o de
multignica es un grupo
genes en diferentes loci.
de loci cromosmicos
Los genes ms abundantes (0.44 del genoma total)
cuya secuencia de nucletidos es
Organizacin en tandem de genes de 45 kb
similar y que derivan de
Ubicacin en cromosomas acrocntricos (250 genes pre-rRNA por cromosoma),
una secuencia comn ancestral .
Genes del 5s r RNA organizadas en cluster localizados en cromosoma 1, es decir hay 5
genes que codifican para el RNA ribosomal porque es muy importante.
Pegado de
Existen de 10-100 copias para cada tipo de t RNA (porque son muy importantes son de
<http://es.wikipedia.org/wiki/Familia_g%C3%
A9nica>
las copias de lo que mas hay) en clster en cromosoma 1 y 6.
snRNA (RNA pequeos- small nucelar): Componentes de spliceosoma
, en biologa o gentica, es
Clster
de
genes
snoRNA: (RNA-small nucleolar): para procesamiento y maduracin
un conjunto de genes que codifican para la
misma protena.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Cluster>

CARACTERISTICAS DE LOS GENES NUCLEARES:


Numero de exones: varia mucho, desde 1 como el SRY o los que pueden tener mas de 100
Tamao del exon: la mayora miden 200 pares de bases; pero hay excepciones
Tamao de los intrones: muy variable, pero es muy relacionado con el tamao el gen.
Genes dentro de genes: Dentro del intron de un gen grande puede haber ms genes codificantes
pequeos.

Genes:
Sin intrones: SRY
Varias copias: RNA ribosomal, histonas

TIPOS DE MUTACIONES
Es un cambo en la secuencia nucletida de un cromosoma y es heredable
Diversidad gentica

Es un mecanismo
de evolucin

Puede generar
enfermedad

Seleccin natural

Clasificaciones:
Tipo de cambio que ocurre en el DNA
Inserciones/duplicaciones
Translocaciones/inversiones
Puntuales: Cambio una sola letra en un nucletido, es la ms frecuente
Deleciones: Perder una parte de la secuencia. De 1 a varios miles de pares. EJ
en Sx de Duchen.
Posicin de la mutacin
Regin codificante
Regin no codificante

Efecto fenotpico

Amorfo: Ausencia de la funcin


Hipomorfo: Disminucin de la funcin
Hipermorfo: Ganancia de la funcin. Ej. acondroplasia
Neomorfo: Adquisicin de nueva funcin:
Antimorfo: Efecto dominante negativo; es decir que aunque tengas uno alelo
normal el otro lo inhibe. A fuerzas es DOMINANTE.
Dominante o recesiva

Amorfos: alelos inactivos que actan bloqueando la ruta biosinttica normal. Puede tratarse realmente de un alelo
inoperante o de la ausencia (delecin) de un gen.

Hipomorfos: alelos que funcionan imperfectamente en comparacin con los alelos normales.
Hipermorfos: alelos que producen por su accin primaria, un exceso de producto final en comparacin con los
normales.

Antimorfos: alelos que producen una accin opuesta a la del normal.


Neomorfos: alelos cuya accin difiere cualitativamente de la de los alelos normales y generalmente, en heterocigosis

Biologa Molecular pgina 15

HLA= P21, genes que montan la respuesta inmune en contra de


antgenos extraos al cuerpo, es el MHC-complejo mayor de
histocompatibilidad; ejemplo de polimorfismo.

Neomorfos: alelos cuya accin difiere cualitativamente de la de los alelos normales y generalmente, en heterocigosis
se manifiestan los dos productos allicos (codominancia).
Pegado de <http://html.rincondelvago.com/genetica_13.html>

Un nico gen anmalo o un par de genes dan lugar a efecto fenotpicos mltiples y
diversos y determinan los rganos, sistemas afectados, signos, sntomas y el
momento de aparicin y se en estas circunstancias se dice que la expresin del
defecto gentico es pleiotrpica.

Es ms grave la insercin de una base porque recorres el marco de lectura que


meter 3 bases es decir un codn porque solo metes un a.a de ms y todo lo dems
se queda igual.
la pleiotropa (del griego pleio, "muchos", y tropo, "cambios") es el fenmeno por el
cual un solo gen es responsable de efectos fenotpicos o caracteres distintos y no
relacionados.

Ejemplo de ello es la fenilcetonuria, para la cual un nico gen vara la produccin de


una enzima, y esto produce deficiencia intelectual, problemas en la coloracin de la
piel, etc.

Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Pleiotrop%C3%ADa>
TIPOS DE MUTACIONES PUNTUALES:
En el cambio de un nucletido por otro
Transversiones: Pirimidina(C, T y U) por purina(G y A) (son mas
severas)
Transiciones: purina por purina y pirmidina por pirimidina y son las ms
comunes/frecuentes.
Por el efecto que ejerce en la secuencia codificante:
Sentido errneo (missense): cambia un aminoacido por otro- (G1138A9
Sin sentido: (non sense) un codn que codificaba para un aminocido codifica para un
codn de paro (UAA, UAG y UGA). En fibrosis qustica o Duchene
Mutacin silente. No afecta el aminocido. (CGT->CGC: arginina)-> transicin, el
AUG= metionina-> codn de inicio
cambio codifica para el mismo aminocido y en la protena no hay un cambio. (Se podra
decir que es un polimorfismo porque no da enfermedad la mutacin).

Un trastorno monognico es el que esta determinado principalmente por los alelos localizados en un nico locus.
Persona homocigota: alelos idnticos en un nico locus y cundo son diferentes decimos que es heterocigoto o portadora.
Un heterocigoto compuesto se usa para describir un genotipo en el que estn presentes dos alelos mutantes diferentes del mismo gen.

Marco de lectura: se tiene que conservar, es muy importante porque con


que inicias la traduccin una base despus cambias toda la protena. Por que
recorres las bases y el orden de los codones cambia totalmente.
ACTGAGCTTA

Cuando hay deleciones en mltiplo de 3, puede perderlo en marco de lectora y


solo pierde un a.a o fuera del marco de lectura y pierde un a.a y tiene un
aberrante hasta que regrese al marco de lectura. Esto tambin puede pasar a
inserciones; aqu hay un corrimiento del marco de lectura, si es mltiplos de 3
se van a codificar ms a.a aberrantes. En las duplicaciones se repite la
frecuencia y tambin corre el marco terico; va sintetizando la polimerasa y de
repente se regresa porque se pierde "patinaje de polimerasa" y duplica esa
parte en donde se equivoco; la cadena molde queda igual (esto no es problema
cuando se da en una clula somtica, mas bien en clulas germinales porque
entonces todo el individuo tendr esa mutacin en sus genes).

TIPOS DE MUTACIONES:
Codificantes
No codificantes: es malo cuando son en parte de intrones que son los sitios crticos
de splicing, -se saltan los intrones.

Lo que est antes del gen es el promotor, el codn de inicio es AUG (metionina). Se nos
marca el inicio y el final del intron. Al final esta la seas de poliadenilacin. Cola AAAA Rergion 5 prima UTR y 3 prima UTR, a fuera del gen al principio y al final.

Cromosoma mitocondrial:
Los genes mitocondriales se heredan solo por va materna, hay mutaciones en genes
mitocondriales en tastarnos de herencia materna.

Biologa Molecular pgina 16

Translocaciones: Ocasionado por ruptura y


reunin de segmentos gnicos.

Cada complejo de DNA con su ncleo de histonas se denomina


nucleosoma, que es la unidad estructural bsica de la cromatina.

Hay 24 aminocidos y 64 codones posibles de manera que hay


ciertos aminocidos que estn codificados por ms de un codn. La
metionina slo esta codificado por uno.
Para transcribir un genoma mitocondrial se utiliza una RNA
polimerasa especializada que contiene dos secuencia promotor
relacionadas una para cada par de genoma circular. Las cadenas se
transcriben en su totalidad.
Cuando una variante es tan comn que se encuentra en ms de 1%
de la poblacin se considera como un polimorfismo gentico; menos
a 1% son variantes raras.
Muchas de estas variantes raras no causan ningn efecto
patolgico pero algunas de estas lo suficientemente frecuentes
como para ser llamadas polimorfismo causan enfermedades.
Los polimorfismos se han convertido en un arma para el
tratamiento de enfermedades dadas por variantes polimrficas
como el cncer, y diabetes.
Los polimorfismos se han convertido en una nueva y poderosa arma
en las aplicaciones forenses como en las pruebas de identidad.

Los polimorfismo ms comunes son los de un nico cido nucletido


(SNP- single nucleotide polymorphisms). En general tienen dos alelos
que corresponden a dos bases distintas que ocupan un sitio en el
genoma. Al parecer, el efecto de los SNP frecuentes es una
modificacin sutil de la susceptibilidad a la enfermedad, ms que la
causa directa de una enfermedad grave.
Hay un grupo de SNP que se usan para marcadores en un mapa de
alta densidad del genoma.

Los polimorfismos de insercin-delecin pueden ser simples porque solo tienen dos
alelos o multiallicos, pues poseen un nmero variable de un segmento de DNA que se
repite en tndem en una localizacin; esto se dividen en:
- Microsatelites: Segmentos de DNA que consisten en unidades de 2, 3 o 4 nucletidos
que se repiten entre una y unas pocas docenas de veces.
- Minisatlites: Provienen de la insercin en tndem de un nmero variable de copias de
una secuencia de DNA de 10 a 100 pares
Polimorfismos en el nmero de copias.
La MHC o complejo mayo de histocompatibilidad y el sistema ABO ejemplos de
polimorfismos.

Biologa Molecular pgina 17

Mutacin

Expresividad variable (papa 20 manchas y nio 10) y pleiotrismo (papa manchas y nio
manchas y tumor)

jueves, 16 de febrero de 2012


07:09 a.m.

Mutacin

Pleiotropismo
Condicin en la cual la mutacin en un solo gen afecta a mltiples caractersticas fenotpicas. Ej.
En anemia falciforme ocurre una sustitucin de una base en el gen que codifica para la cadena
beta de la hemoglobina formndose un triplete mis-sense. La incorporacin de un nuevo
aminocido en esta posicin es responsable de la aparicin de mltiples alteraciones fenotpicas
en el individuo.

Expresividad variable se refiere al grado con que un gen penetrante o un


genotipo son fenotpicamente expresados.
Pegado de <http://es.scribd.com/doc/57894741/12/Expresividad-Variable>

Pegado de <http://glosarios.servidor-alicante.com/genetica/pleiotropismo>

Algunas personas son resistentes a paludismo cuando son heterocigotos para anemia
falciformes. La fibrosis qustica se hereda autosmica recesiva.

Grabacin de audio iniciada: 07:21 a.m. jueves, 16 de


febrero de 2012

Es un cambio fijo y heredable que ocurre dentro de la secuencia nuicleotdica de un


cromosoma
Cada da p.ej. 5,000 enlaces glicosdicos que sufren ruptura espontanea de purinas en el
DNA son reparados diariamente en cada clula humana.
Enfermedad: afeccin de la calidad y/o cantidad de una i ms protenas funcionales.

Evolucin
Diversidad gentica

Seleccin natural: Ej: Los que tienen anemia de clulas falciforme en


regiones donde hay paludismo sobreviven ms y por eso se da la
seleccin natural o las personas que no desarrollan el virus. Otro
ejemplo sera las personas que tienen fibrosis qustica y les da clera
les va bien porque el clera da diarrea y deshidratacin y con la
fibrosis qustica las secreciones son mas viscosas y compensa con el
clera.

EL GENMA NO ES ESTTICO= tiene cambios heredables (mutaciones)


Si se recomienda gen con pseudogen generan mutaciones y nos altera su funcin.

Los espermatozoides son los que ms mutan: se estima que q de cada 10 espermatozoides

porta una nueva mutacin deletrea; esto se da por que en la espermatognesis hay muchas
divisiones para llegar al espermatozoide y en el ovulo no (ah hay principalmente mutaciones
referentes al sexo)

La mutacin ms frecuente del ser humano es la G por la A en acondroplasia.


Las mujeres con cncer de mama son mutaciones en diversos genes, no lo heredaron y
hay un 10% donde tienes el antecedente y hay por lo menos dos genes relacionado
PRCA1 Y PRCA2 que se tienen que heredar mutados si no es por herencia son mas los
genes mutados.
GT: aceptor (inicio de)
AG: donador (terminacin)

Enfermedad

Pseudogenes: genes que en algn momento funcionaran


como genes peor que ya no sirven y no nos funcionan.
La DNA codificante es la que menos muta.

Origen de las mutaciones gnicas:


Somticas: neoplasias (ej. Cncer, neurofibromatosis segmentaria (no se trasmite)
Germinales: Acondroplasia, retinoblastoma hereditario, displasia camptomlica y
neurofibromastosis tipo 1.

Casi siempre las mutaciones son en la replicacin o en la espermatognesis.

Hay genes que mutan ms; que son la mayora de las enfermedades como acondroplasia,
duchene, hemofilia A.

La ceguera a los colores es recesiva ligada al X.

Nomenclatura de las mutaciones (Tabla de memoria en el thomson de


gentica)

Biologa Molecular pgina 18

C -> quiere decir que es DNA complementario


Se le pone 1 a la primera base nitrogenada que codifica
Si son 389 codones dan 388 a.a porque uno es de paro.
La X indica que es codn de paro
Ej: c. 135C>A p.R45R-> Mutacin silente

Clasificacin de la patologa gentica


Cromosmica 3.8- 6 *1000 individuos
Monognica- No tradicional
Multifactorial

Anlisis:
La gentica sirve para
Diagnstico:
a) Certero en pacientes
b) De portadores
c) Pre-sintomtico
d) Prenatal
Correlacin de fenotipo-genotipo (pronstico-tratamiento)
Mecanismos de herencia (asesoramiento gentico)

PCR- ivestiga y videos de Youtube


http://www.youtube.com/watch?v=Kuy4PDb6bdU

Directo: Extracto DNA del paciente y detecto el diagnstico. Se identifica la


mutacin responsable. Para ver si tengo un diagnstico seguro o para ver si puedo
tratar con terapia gnica.
Indirecto: Se identifican alelos de marcadores polimrficos que cosegregan con el
locus y mutacin responsables.

Las muestras de DNA las tomo de cualquier lado que tenga clulas con ncleo: sangre,
saliva, orina, uas, bulbos pilosos, derrames pleural, liquido cefalorraqudeo, tejidos
embebidos en parafina, biopsias, hueso, cabellos (DNA mitocondrial no tiene genmico slo
que venga con el bulbo porque las clulas del cabello no tienen ncleo slo citoplasma) , uas
etc

Un ejemplo de mutacin neomorfa (autosmica recesiva) es la deficiencia de a1antitripsina, esta enzima inhibe a las proteasas en los alveolos para que no halla destruccin
pulmonar, al haber su deficiencia o su mutacin no las inhiben y causan alteraciones en los
alveolos. Esta mutacin es por el cambio de a.a por otros en el hgado (ah se produce),
principalmente dos, hay 70 mutaciones de las cuales 30 tienen relevancia clnica; como nota
el tabaco causa una destruccin de la a1-antitripsina causando el mismo efecto-> enfisema
pulmonar y EPOC. Cambio de metionina por arginina en el 358 es la neomorfa pero hay
otras, la mutacin ms comn es la Piss -60%(cambio de glutamato por lysina)

-> Gel de agarosa en un campo elctrico: sirve para hacer muestras y juntar fragmentos de
DNA. Al pasar las molculas, las ms pesadas quedan arriba porque se van atorando en las
agarosas y las de bajo peso quedan abajo. Aparte arriba tenemos el polo negativo y abajo el
polo positivo. (la ms cercana al polo positivo es la que menos peso tiene).

ENZIMAS DE RESTRICCIN: Viene de bacterias que cortan de 6 a 8 pares de bases


que reconocen, ese fragmento es muy especfico y sus cortes pueden ser asimtricos o
rectos; las secuencias que reconocen las enzimas tiene que ser panindrmico (se lean de 5 a
3 o de 3 a 5 codificando lo mismo-> ej. Anita lava la tina).

El DNA tiene carga negativa por sus grupos fosfato.

Mutacin

Grabacin de audio iniciada: 08:41 a.m. jueves, 23 de febrero de 2012

Ejemplo: para acondroplasia la enzima hace cortes en normal es una raya en heterocigoto 3
rayas (1 normal y dos de corte) y un homocigote (2 rayas aunque son 2 cortes pero cortan
en el mismo peso molecular)
01/03/2012 07:14 a.m.

Mutacin puntual-> G380R y acondroplasia


En la PCR se usa la tacpolimerasa
Cuando cambias un aminoacido por otro es un missense
p.A250X -> nonsense . La x siempre significa codn de paro y la p. significa que es en
protena.
Fenilcetonuria y deficiencia de alfa 1 antitripsina Enfermedad autosomica recesiva

Biologa Molecular pgina 19

Para ver si una mama es portadora es dependiente de sus


dosis gnica, si es portadora slo ves 1, si es por deleccin
se ve ms claro y puedo detectar las portadoras con PCR.

El signo para checar debilidad muscular es el Gowers, si es positivo sospechara de diagnostico de SX de


Duchenne . NIO, debilidad muscular es 1/2500. sobre todo en extremidades superiores es donde se da la
debilidad, es una mutacin en la distrofina. Van usando su msculo y lo van sustituyendo por grasa, fallecen en la
segunda etapa de la vida, les dan esteroides (Deflazacart) para disminuir este acumulo de grasa porque disminuyen
la inflamacin que provoca el acumulo de grasa. Un diagnostico diferencial es el Pompei pero ah si refieren dolor.
El gen de duchene tiene 72 exones y es uno de los genes ms grandes. Tambin se llama DMD (Distrofia musculare
de Ducheme). Slo el 70% de estas mutaciones que dan DMD son por delecciones.

Biologa Molecular pgina 20

Herencia multifactorial
jueves, 16 de febrero de 2012
09:21 a.m.

Es el resultado de complejas interacciones entre factores de predisposicin (mltiples loci dentro del
genoma) y exposiciones ambientales que desencadenan enfermedades
Responsable de un grupo de trastornos del desarrollo, de malformaciones congnitas y
enfermedades de la vida adulta.
5% poblacin peditrica y 60% poblacin en general .
Hay factores comunes que tienen que ver con el ambiente y otros que slo son genticos.

Enfermedades comunes:
1. LPH

2. Dislocacin congnita de cadera


3. Defectos de Tubo Neural
4. Esquizofrenia
5. Cardiopatas

Polignico: enfermedades presentes por la interaccin de ms de 3 loci

6. DM2

Oligognico: interaccin de 3 genes

7. Enfermedades Autoinmunes

Dignico: interaccin de 2 genes

Monognico: 1 gen
Gen modificador: gen cuya expresin puede ser influenciada por otro locus.
Concordancia: Frecuencia de manifestarse una misma caracterstica entre parientes, siendo
concordantes para ese trastorno, cuanto ms cercanos son dos parientes ms alelos comparten.

Labio paladar hendido: multifactorial

3
Contribucin Genes

Penetrancia completa

2.5
Penetrancia incompleta

2
1.5

Herencia polignica

Multifactorial
Ambiental

0.5
0
0

Tipo

< 25 aos > 25 aos Frecuencia general

Cromosmicas

1.8 /1000

2/1000

3.8/1000

Desordenes monognicos 3.6 /1000

16.4/1000

20/1000

Multifactorial

600/1000

646.4/1000

46.4/1000

Talla familiar: sumas talla de mama y la de papa y la divides entre dos, luego le
restas 6 si es mujer y se los sumas si es hombre. La talla es un ejemplo de
concordancia ya que tiene 95% en gemelos monocigotos.

PORCENTAJE DE GENES COMPARTIDOS

Gemelos monocigticos: 100% genes


Gemelos dicigticos: 50% genes

0.5

1
1.5
2
Efecto Ambiental

2.5

Esta tabla nos muestra que las enfermedades ms comnmente son por herencia
multifactorial

Predisposicin a una enfermedad: ambientales y genticos

ESTUDIO DE CONCORDANCIA EN GEMELOS


Estudio para determinar si el genotipo por s solo es suficiente para producir una determinada
enfermedad.
Una concordancia menor al 100% en gemelos monocigotos: evidencia de factores no genticos.

Modelo del umbral de Falconer (Curva de Gauss)

El efecto
fenotpico: la
predisposicin
gentica + el
componente
ambiental
alcanzan un
umbral.
1.
2.
3.
4.

Riesgo de recurrencia es mayor si hay mas familiares afectados


Si afecta el sexo menor frecuentemente afectado hay ms severidad
Entre mas severidad
Entre mas factores genticos y ambientales vamos a ir desplazando al curva de gauss
y teniendo un umbral ms pequeo

Heredabilidad (h2)
Es una fraccin de la varianza fenotpica global de un rasgo cuantitativo que es causada

por genes.

Porcentaje o medida de lo que aportan los factores genticos en relacin con factores

ambientales en una enfermedad o caracterstica multifactorial.


> contribucin gentica

A mayor h2 =

Biologa Molecular pgina 21

El gen sonic Hedgehog es el gen mas importante y es el primer gen organizador


de la cascada de eventos para la formacin de los fetos. Controla cuando se
prendan y se acaben todos lo genes.

Algunas caractersticas de la herencia multifactorial son:


La transmisin no sigue un patrn mendeliano
Ambos sexos pueden estar afectados

1. El riesgo de recurrencia:

El riesgo de recurrencia es mayor si ms de un miembro de la familia est afectado


Herencia multifactorial= 3-5% de recurrencia
CIV:
1 afectado:
3%
2 hermanos afectados:
10%
Labio hendido c/s PH: 1 hijo afectado:
3-5%
2 hijos afectados:
8 -10%
1 hijo/1 padre afectados: 11-15%
1 hijo/2 padres afectados: 20-40%

2. Severidad
El riesgo de la familia es mayor mientras ms severa sea la enfermedad.

Cada uno de los individuos que se acercan al lado de la curva delimitado por la lnea vertical
tiene una mayor probabilidad de tener el defecto.
En el extremo derecho de la curva se encuentra el genotipo ms afectado, que se corresponde
con el defecto ms severo. Mientras ms severo sea el defecto es mayor la probabilidad de que
este recurra, por asociarse a un genotipo ms afectado.

3. Predisposicin por gnero

4. Sexo afectado

Hombres o Mujeres tienen mayor frecuencia.


Si la enfermedad ocurre en el sexo que menos frecuentemente se presenta, la
enfermedad tiene mayor riesgo de volverse a presentar.

El riesgo de recurrencia es mayor si el caso ndice es del sexo menos frecuentemente afectado.

Implicando que hay mayores genes/ambiente presentes en esa familia

Estenosis pilrica
Luxacin congnita de cadera
Enf. de Hirschprung
Pie Equino Varo
Artritis reumatoide

5:1 (varones vs mujeres)


1:6 (varones vs mujeres)
3:1 (varones vs mujeres)
2:1 (varones vs mujeres)
1:3 (varones vs mujeres)

EJEMPLOS
Estenosis pilrica:
5 veces ms frecuente en hombres.
Hijos de varones: 5.5%
Hijas: 2.4%
Hijos de mujeres: 19%
Hijas: 7%
Defecto de tubo neural
Falla para el cierre del tubo neural, que ocurre del 18-28 dias.
1: 1000 RNV

Mxico:
8-10/ 1000 RNV
Puebla, EdoMex, Veracruz, Oaxaca y SLP
Anencefalia: 11.9/ 10,000
DTN:

Familiar

Riesgo Recurrencia

Hijo

5%

2 Hijos

12%

50% Espina Bfida


40% Anencefalia

Familiar Segundo Grado 2%


Familiar Tercer Grado

1%

8.5% Encefalocele
Ms frecuente en las mujeres 3:1

Un padre

4%

Anomalas asociadas 20%

ANENCEFALIA
Holo-anencefalia
65%
80% asociado a raquisquisis
Columna cervical en retroflexin
Apertura del foramen occipital
Orbitas hundidas

Proptosis
NC hipoplsicos
Malformaciones acompaantes:
G.I: 1-16%
Renales: 1-6%
Cardiacas: 16%
Polihidramnios
48hrs de vida

Biologa Molecular pgina 22

Holo-anencefalia: no se cierra nada del encfalo 65% (son


ms frecuentes que las meso)
Meso-anencefalia: se cierra solo un pedazo

ESPINA BIFIDA
Protusin del tejido neuronal a travs de los arcos vertebrales defectuosos.
Falla en el cierre del neuroporo posterior

Factores asociados

Ms frecuente en la regin lumbosacra


90% mielomeningoceles

Disminucin en la ingesta de Ac. Flico


Vitamina A

Parlisis
Perdida de la sensibilidad por debajo de la lesin

Deficiencia de Zinc
Diabetes materna

Incontinencia urinaria
Estreimiento
Hay defectos cerrados:
Menos severos

Hipertermia
Genticos

Agrupados como espina bifida


Alteraciones seas importantes
Malformaciones ano-rectales
Regin lumbar o sacra

ENFERMEDADES MULTIFACTORIALES
Las malformaciones congnitas y las enfermedades del adulto son las ms
representativas de factores multifactoriales.
Los gemelos son tiles para estudiar enfermedades multifactoriales separndolos
desde el nacimiento y exponindolos a diferentes ambientes.

Psoriasis: Es una enfermedad inflamatoria crnica de la piel que produce lesiones escamosas
engrosadas e inflamadas, con una amplia variabilidad clnica y evolutiva.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Psoriasis>

POSTULADOS DE HERENCIA MULTIFACTORIAL

1.

2.
3.
4.
5.

La incidencia de la enfermedad es mayor en familiares, entre mayor el grado de parentesco


mayor el riesgo.
Nmero de Afectados, entre mayor nmero de afectos mayor riesgo de recurrencia.

Afectacin del sexo menos frecuentemente afectado, mayor riesgo.


Entre ms severo el defecto mayor el riesgo para los familiares.
Ms temprano defecto durante el desarrollo embrionario, mayor riesgo.

Riesgo de Recurrencia de los familiares de primer grado se puede calcular como:

La raz cuadrada de la incidencia en la poblacin general.


EJEMPLO

TIPOS DE ESTUDIOS DE ENFERMEDADES MULTIFACTORIALES

Estudios Poblacionales

Estudios Familiares

Estudios en Gemelos (Concordancia)

Estudios de Adopcin

Estudios de Asociacin (GWAS); es decir que la poblacin tenga un fenotipo (enfermedad) en comn.

Modelos Animales

Biologa Molecular pgina 23

Estudios de Asociacin (GWAS); es decir que la poblacin tenga un fenotipo (enfermedad) en comn.

Modelos Animales

ESTUDIOS DE ASOCIACIN DEL GENOMA COMPLETO (GWAS)


Compara el genoma completo entre un caso y un control.
Estudian muchas variantes genticas al mismo tiempo
Identificando nuevos genes de susceptibilidad
Pudiendo estudiar hasta 500 000 SNP (Polimorfismo de un solo nucletido).

GWAS en proceso para el estudio de:


Enfermedad Coronaria
DM1 y DM2
Artritis Reumatoide
Enfermedad de Crohn y CUCI
HAS

Insuficiencia velopalatina: Ronca mucho

Labio paladar hendido


1:850 en Mxico
Aproximadamente el 70% de los casos de LPH ocurren como una entidad No Sindrmica o

Aislada.
50% PH Aislado
Incidencia de 1: 700 RNV

Ms frecuente en Asiticos y Amrica: 1:500


Europeos intermedia: 1: 1000
Africanos: 1: 2500
Mxico: 1:850
Susceptibilidad vara a en las diversas poblaciones
La expresin mnima de un defecto en el paladar y la bfides de la vula.
No es frecuente en lnea media, los que la tienen es por falla en la migracin del
sistema nervioso.
Acido valprcio se usa para crisis convulsivas y aumenta al doble el riesgo de LPH
(5-10%).
El paladar es ms comn que el labio hendido.

ESTADISTICAS DE LABIO HENDIDO

ESTADISTICAS DE PALADAR HENDIDO

70 % se presenta en hombres

Ms frecuente en mujeres

80 % es unilateral y 20 % es bilateral

Por lo general la hendidura es completa

70 % es izquierdo

La presentacin submucosa es de 5-10 %

La relacin izquierdo/derecho/bilateral es de 6:3:1

68 % se asocia a labio hendido unilateral

70 % de los unilaterales se asocia a paladar hendido

86 % se asocia con labio hendido bilateral

85 % de los bilaterales se asocia a paladar hendido

Ms comn en hendiduras amplias de labio

7 a 13 % se asocia a malformaciones congnitas

Se asocia a malformaciones congnitas en 20-50 %

El espectro fenotpico es amplio; puede haber desde un fenotipo muy marcada hasta

ligeros rasgos que slo al examinar meticulosamente se notan, como la vula bfida en
paladar o el labio superior ligeramente levantado.
Estudios en gemelos y familias han demostrado que hay factores genticos y los factores

ambientales tambin estn involucrados.

Tabaquismo Materno: riesgo para LPH


Incrementa 1.3 OR
Vas Gnicas Involucradas glutathione s-transferase-1 (GSTT1) y nitric oxide synthase
3 (NOS3).

cido Valprico: PH

Alcoholismo Materno:
Dosis Elevadas en un perodo corto de tiempo

RIESGOS DE RECURRENCIA

Asociacin con variaciones en ADH1C alcohol dehydrogenase.

Biologa Molecular pgina 24

1 hijo afectado: 3-5%

Alcoholismo Materno:
Dosis Elevadas en un perodo corto de tiempo

RIESGOS DE RECURRENCIA

Asociacin con variaciones en ADH1C alcohol dehydrogenase.

Deficiencia de Folatos y Zinc

Hipertermia

Obesidad

1 hijo afectado: 3-5%


2 hijos afectados: 8-10%
1 hijo/1 padre afectados: 11-15%
1 hijo/2 padres afectados:20-40%

Radiacin Ionizante
Infecciones.

Displasia congnita de cadera


Ms frecuente en nias

Este defecto se checa con la prueba de Ortolani y Barlow

Es la alteracin congnita anatmica de la articulacin coxo-femoral consistente en:

1. Hipoplasia del techo acetabular


2. Hipoplasia del ncleo de osificiacin del femur.

3. Inestabilidad progresiva de la cabeza femoral.


(Luxacin)
Subluxacin: cabeza femoral desplazada de su posicin normal pero hace contacto con el

acetbulo.

Factores multifactoriales
Presentacin plvica

Historia familiar
Mujeres
Oligohidramnios
Primigesta
Estrgenos (laxitud)

Pueden presentar pliegues asimtricos


Otra prueba es la de Galeazzi

Inestabilidad

Pliegues asimtricos

Asimetra en longitud de miembros plvicos

Anormalidades en marcha

USG

Hipertensin arterial (HAS)


FACTORES DE RIESGO
Obesidad

Normal

Alcoholismo

Prehipertensin: 120-139 / 80-89 mmHg

Obesidad

Ingesta sal

Grado I: 140-159/ 90-99 mmHg

Alcoholismo

Estrs

Grado II S>=160 / D>=100 mmHg

Ingesta sal

Raza negra

Otros factores

Estrs

Edad

Raza negra

Historia familiar (70%)

Edad

Nivel SE bajo
Ejercicio
Hipertensin embarazo

Obesidad

Afecta a ms de un billn de personas

Historia familiar (70%)

Complicaciones de EVC, IAM, Falla cardiaca y renal.

Nivel SE bajo

El disminuir la presin previene estas complicaciones.

Ejercicio
Hipertensin embarazo

Alcoholismo
Ingesta sal

Riesgo de recurrencia

Estrs

Primer grado: 0.12- 0.34

Raza negra

Gemelos Monocigotos: 0.55- 0.72

Edad

Segundo grado 0.05- 0.06

Historia familiar (70%)

Frecuencia

Nivel SE bajo

1 padre 28.3%

Ejercicio

2 padres 45.4%

Hipertensin embarazo

OBESIDAD

Obesidad es el desequilibrio entre la ingesta alimentaria y el gasto energtico.

Biologa Molecular pgina 25

Hipertensin embarazo

OBESIDAD

Obesidad es el desequilibrio entre la ingesta alimentaria y el gasto energtico.


Se regula por un complejo sistema.

IMC con elevada heredabilidad


40-80%

El hipotlamo (VM, PV, arcuato) produce dos proteinas AGRP y NPY (hormonas orexignicas)

Estudios de Adopcin

El hipotlamo tambin produce POMC, hormona anorexignica.

Estudios de Gemelos Separados:

Los rganos endcrinos perifricos actan sobre el sistema.

Hombres 0.70 y Mujeres 0.66

Pncrea: Insulina: Anorexignica

1 de cada 3 adultos en USA son obesos (IMC 30)

Estmulo POMC y CART


Inhibe AGRP y NPY

Asocia a DM2, Hipertensin, Sndrome Metablico

Disminuye la expectativa de vida

Leptina: hormona que acta como el principal indicador del estado nutricional y saciedad.

Ambiente obesognico

Grelina:; Estmago y Duodeno


Eleva antes de comer y disminuye al terminar de comer.

La leptina es el primer regulador energtico


El POMC para obesidad en Mxico es ms consistente para obesidad en Mxico.

Prader-willi -> mucha hipotomia


La acetilasin causa un aumento de produccin en un gen.

Leptina: Regulador energtico que acta sobre la ingesta de alimentos, gasto energtico,

funcionalidad del sistema neuroendcrino e inmunidad.


La leptina regula la Hiperfagia y saciedad.
Obesidad mrbida a edad temprana puede estar dada porque los niveles de leptina estn

bajos.
3% de las formas severas de obesidad. (LEP o LEPR)

OBESIDAD EN MXICO
50% de los hombre y 65% mujeres tienen sobrepeso

25-35% son obesos


Estudios de asociacin en familias Mexicanas:
POMC
Receptor Adrenrgico 3

Avances
Prader, Labhart y Willi describen el primer sndrome con obesidad.

En estudios de gemelos y adopcin se identifican la presencia de factores genticos responsables

de obesidad.
Despus se realizo un estudio del gen de la leptina y su tratamiento sustitutivo.

Mutaciones en Receptor 4 de la Melanocortina

Obesidad: Enfermedad neuroendocrinolgica causada por factores de riesgo ambientales ms

predispocin gentica.

Leptina: Hormona de la saciedad que forma una cascada de eventos:

1. LEP
2. LEPR

3. Prohormona convertasa 1
4. POMC

Obesidad Polignica: genes con efecto pequeo sumatorio


Aproximadamente 100 genes.

FTO: Fat mass and Obesity associated gene


Variantes con efectos sumarorios.
Alelo de riesgo -> incremento de 3kg

Biologa Molecular pgina 26

PCR

Hay 3,300 millones de bases en mi estructura genmica.

jueves, 23 de febrero de 2012


07:14 a.m.

Sntesis in vitro de un secuencia de DNA en particular.


Para esto necesito varias cosas:
DNA del paciente,
DNA polimerasa (que aada nucletidos al extremo 3 prima libre),
cebadores o primers (tamao de 20 a 30 nucletidos, tienen que ser muy especficos para que slo
reconozcan un sitio en el DNA)
4. Mg
5. Buffer
6. ACTG (AC. Nucleicos)

Los cebadores o primers pueden ser DNA o RNA. En la


PCR son DNA en la sntesis en vivo son RNA.
Los cebadores estn diseados para que uno sea
complementario a una cadena de DNA en uno de los lados
de la secuencia diana y la otro en el lado opuesto de la
secuencia diana y as la DNA polimerasa sintetiza dos
nuevas cadenas usando de plantilla la secuencia entre los
cebadores.

1.
2.
3.

PASOS
1) Para iniciar aumento la temperatura a 95C para romper y separar las cadenas de DNA.
2) Agrego los primers que se unen a los 3 prima de las cadenas separadas para hacer su
replicacin de 5 prima a 3 prima. Bajas la temperatura a 70-72 C
3) Fase de extensin: Agregas la Taq Pol (es de las primeras enzimas de la DNA
polimerasa resistentes a temperaturas, se obtienen de una bacteria que resiste altas
temperaturas). Se van a agregando las bases nitrogenadas.
PCR mltiple: se duplican varias secuencias., un
ejemplo para usar PCR mltiple seria la DMD
porque tiene mutaciones en varios lugares y la
infertilidad masculina (si la azospermia es por la
perdida de genes se recomiendo in vitro o
adopcin)

VE VIDEO
http://www.youtube.com/watch?v=o_0dFor_syw

Taq-Man (PCR en tiempo real): se llama as porque puedes ir viendo como se va duplicando tu regin de intros, en la PCR normal necesitas minimo de 25 a 30 ciclos para notar
la mutacin real y aqu no porque un programa te lo va diciendo por una sonda (sonda con dos molculas pegadas una quencher y una reportera), la sonda reconoce su
secuencia complementaria y la Q y la R estn juntos, cuando hay corte aqu se dividen estas dos y da una seal fluorescente al romperse. Esta prueba es ms certera que la
normal porque aqu lo puedes cuantificar.
Enfermo por duplicacin, pero no se usa para esto se detecta por otras
cosas es solo ejemplo.
Cantidad de
DNA

En una PCR normal estudias la secuencia de la meseta (hay limite porque se te acaban los
primers etc,) en la de tiempo real estudias la elevacin. En la de tiempo real tenemos un
punto llamado CT (es donde empieza la fase exponencial), estos estudios son para
mutaciones en duplicaciones (el mutado es el que llega ms rpido a CT es el portador) o
delecciones (el ltimo en llegar a CT es el portador, porque tienen menor cantidad de
informacin gentica que estas multiplicando por PCR); se ponen y grafican un exn
normal y uno que sabes que puede tener la mutacin. Si llegan al mismo tiempo estan
sanas, si estn desfasados son portadoras y tienen el 50% de heredar la enfermedad a
su hijo. Si la secuencia que se quiere multiplicar es de un individuo enfermo no hay
duplicacin de nada porque no existen ninguna secuencia por la deleccin y en ambos esta
delectado para las enzimas que metiste no se usa para enfermos solo para detectar
portadores., detectas dosis gnica. Si es por duplicacin en un enfermo la curva alcanza
la CTP mucho antes y hacia la izquierda.

Ciclos de la PCR

Las PCR en tiempo real se usan para identificar


mutaciones de delecciones y duplicaciones para las
puntuales casi no sirven.

Sana
Portadora

DNA templete: es que el utiliza la DNApolimersa es como tu DNA molde para que de ah
empieces a pegar tus bases nitrogenadas.

Si estn encimadas quiere decir que no hay


esa enfermedad porque no hubo variacin
y es sana. (ni siquiera portadora)

Despus de que la secuencia fue amplificada el gen puede ser secuenciado o analizado por
hibridacin ASO con facilidad.
X frgil: Se duplican repetidos GGG y dan retraso mental.

Caso 1:
FIBROSIS QUISTICA
Autosmico recesivo
Gen CFTR mutado
Gen muy grande como 27 exones
Mas de 1000 mutaciones reportadas en este gen
Tiene 12 mutaciones ms frecuentes en la poblacin hispana.
Para dx se buscan en estas 12 mutaciones y si no estn aqu se recurren a otras pruebas.

Fibrosis quistica
1 (mama)
2(papa)

PM

3(Afectado)

4 (normal)

800
600
Biologa Molecular pgina 27

Heterocigoto compuesto:
Los dos alelos estn mutados pero con mutaciones diferentes. -> en el mismo loci

El 1 y 2 son portadores y hay un sitio de corte y por eso hay dos el afectado hay corte pero
estn juntos y se ven muy gruesos.

+ homocigoto mutado CSano CMuta

1000

Tengo mi DNA bien pero cuando hay un cambio en una base pueden crear un
sitio de restriccin o un sitio de corte.

ENZIMAS DE RESTRICCIN: Enzimas que reconocen secuencias


de doble cadena especficas de DNA y las escinden a nivel de los
elementos fosfodister de la doble hlice de DNA en los lugares de
reconocimiento o cerca de ste.

PM

+ homocigoto mutado CSano CMuta

1000

de doble cadena especficas de DNA y las escinden a nivel de los


elementos fosfodister de la doble hlice de DNA en los lugares de
reconocimiento o cerca de ste.

800
600
400
200

CASO 2:
Hipercolesterolemia familiar
Autosmico dominante
Hombres y mujeres, generaciones contiguas, heterocigotos afectados
Hijos con 50% de probabilidades
Si son homocigotos, son mas graves y tienen ms resistencia al tratamiento
Se estudia el gen LDLR: Q12X o c.97C>T

RT-PCR-> Es un mtodo en dnde tambin se pueden analizar pequeos pedazo


de RNA, primero se sintetiza cDNA de cadena nica y luego se realiza una PCR
comn.

CASO 3:
SINDROME DE MUENKE
1 gen y 1 mutacin para todos
Cranosinostosis coronal (Se cierran las suturas de los huesos del crneo a manera temprana), fusin de
huesos del carpo o tarso, hipoacusia, retraso mental, ,retraso de crecimiento etc.
Hay otros sndromes que cruzan con cranosinostosis por eso hay que hacer dx diferencial con pruebas
moleculares.
Gen FGFR3 Pro250Arg - > mismo gen que acondroplasia pero diferente mutacin
Autosmico dominante
50% de recurrencia en cada embarazo
Al padre no se le indica estudio porque viene de rama materna (caso)

CASO 4:
ACONDROPLASIA
Displasia sea
Macrocrneo, acortamiento rizomelico, etc (rara vez se confunde)
Rara vez se hace estudio molecular porque es muy obvio.
Si hay parejas de acondroplasicos si se recomienda hacer estudio molecular porque
hay probabilidades de 1/4 de que sea homocigoto.
Si es estado homocigoto es letal
Gen FGFR3 : c.1138G>A

CASO 5:
SINDROME DE RETT
Sx de regresin
Nias que nacen normal y despus empiezan a perder habilidades. (agarran mamila,
dicen dos palabras, se sientan etc y de repente lo dejan de hacer)
X dominante
Los hombres no son viables no se estudian
La mayora son casos espordicos es decir de novo porque usualmente la madre no
alcanza a vivir. No es muy comn que sea heredado.
Gen MECP2 -> R270x Se buscan 4 mutaciones frecuentes.
La mutacin elimina el sitio de restriccin

CASO 6
ENFERMEDAD DE POMPE
Debilidad muscular, dolor abdominal
Glucogenolisis tipo 2
Autosmico recesivo
PCR-ARMS -> dos genes arriba y abajo y al mismo tiempo se le ponen cebadores y
primers provocando que la mutacin se amplifique ya que no reconoce los cebadores
que se le agregan.
Los dos casos portadores y identificas la mutacin que aporto cada padre al enfermo,
si tiene otra hija sana y no supieras una de las mutaciones de uno de los padres
tendras que investigar a la hija porque no sabes si presenta la mutacin del otro
padre

CASO 7:
GALACTOSEMIA
Autosmico recesivo
PCR-ARMS
Gen GALT
Vomito, ictericia, intolerancia a alimentos, no crece bien, enzima baja
190 nucleotidos,mayora en caucasicos
Mas frecuente en pQ188R, p.N314D, IVS2-2 A>G (71%)
En esta tcnica de PCR tiene la caracterstica de que si no tiene la mutacin en el
lugar donde la estamos buscando los puede identificar como normal.
Si importa el tipo de mutacin porque depende del tipo repercute en el fenotipo, unos
dan un cuadro leve y otras un cuadro severo

CASO 8:
FACTOR V LEIDEN TROMBOSIS VENOSA
Es raro

Biologa Molecular pgina 28

Es raro
Gen FV c.1691G>A (mutacin puntual de sentido errneo).
PCR restriccin
Autosmico dominante

CASO 9:
DISTROFIA MUSCULAR DE DUCHENNE
PCR-mltiple (nos permite estudiar muchas secciones en una misma corrida, la tcnica
se puede hacer por que los exones todos pesan diferente y los podemos diferenciar
por eso podemos estudiar todos los exones al mismo tiempo)
Gen DMD, delecciones. (gen distrofina muy grande)
Para dar un diagnstico certero
Recesiva ligada al X (hombres afectados, mujeres portadoras)

CASO 10
ANEMIA DE CELULAS FALCIFORMES O DREPANOCITICA
Debilidad, no crece bien,
En el cultivo hay trepanocitos (eritrocitos en forma de hoz), esta deformacin es por
una alteracin en la cadena b-globina
Para que estn afectados tienen que estar en estado homocigoto
Los heterocigotos, es decir los portadores no se contagian de malaria.
Gen de la b globina humana
PCR

CASO 11
DMD
PCR en tiempo real
Los pacientes con duchenne estn ligados al X, necesito usar PCR en tiempo real para
ver si es portadora, la PCR mltiple si identifica los afectados de duchenne pero no
para identificar portadores.
Normalmente son por delecciones pero hay unas pocas que son por duplicacin

PCR- Cuantitativa: detectas portadoras y aqu si importa si esta ms tenue


o no. Ves dosis gnica. Portadora DNA ms tenue. Una mejor referencia es
la de en tiempo real porque ah esta mas exacto aqu solo lo distingues por
tonos.

MLPA: te permite ver si hay duplicacin o deleccion.


En la secuenciacin automatizada no se ven delecciones
tan grandes.

Cuando se cuenta la protena no se toma en cuenta la metionina.


Para saber el peso molecular del fragmente lo puedo saber contando el
numero de pares.

En PCR tiempo real entre mayor numero de sntesis mayor luz de


floresencia porque corta el tubuo y se separan., sirve para ver la dosis
gnica.
El ct es el aumento estadsticamente de la floresencia.
"a mayor numero de copias iniciales corresponde a un ct ms temprano y
viceversa", el crecimiento es exponencial; por lo tanto si tengo un ct
temprano significa que tengo mas dosis gnica.
El primer que identifica la hebra sentido se busca igual, la que identifica la
hebra contrasentido (lo volteas a 3 prima 5 prima) hay que girarla y tambin
hay que voltear la sonda.

CASO 12
ENFERMEDAD DE CHARCOT-MARIE-TOOTH TIPOA 1A
Neuropata hereditaria ms frecuente
Gen PMP22
Duplicacin de un fragmento del gen
PCR en tiempo real/ dosis gnicas.
Adelgazamiento de la piernas "patas de cigea", dedos de martillo, alteraciones
sensitivas y motoras, parestesias, disestesias etc.
70-80% de los casos tienen duplicacin en este gen
Autosmico dominante
Se puede usar como gen de control otro cromosoma como en este caso se usa el gen
beta globina contra el PMP22 para ver la dosis gnica.

CASO 13
Hunter
Secuenciacin
Mucopolisacaridosis tipo 2
A los dos aos se les va poniendo la cara tosca, piel gruesa, manos en garra, giva en la
columna, van teniendo retraso, se les obstruye la va area, opacidad corneal.
Ligada al X.

CASO 14

ENFERMEDAD POLIQUISTICA RENAL


Dx clnico con ultrasonido
Autosmico dominante
Quistes en varios lados, hipertensin
Varios genes la causa -> "heterogeneidad de locus"
La mayora de los casos esta en PKD1 (protena que tiene que ver con los tbulos
renales).

Biologa Molecular pgina 29

En el electroenceerograma van corriendo los dos alelos cuando se


empalman es porque es heterocigota en ese alelo.

La tcnica MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe


Amplification) consiste en el screening de determinadas
regiones del DNA mediante el estudio de 40 sondas que
hibridarn en diferentes puntos de la regin de inters, se
ligarn 2 a 2 y posteriormente se amplificarn utilizando el
mismo par de primers.
Para un anlisis de la metilacin de las diferentes regiones
especficas, se tratarn las sondas ya hibridadas con una
enzima capaz de cortar nicamente los fragmentos no
metilados, por lo que en la PCR nicamente se amplificarn
las sondas unidas a material metilado.
Mediante un anlisis de fragmentos y aprovechando la
diferencia de tamao de cada una de las sondas debido a un
fragmento cebador de tamao, se podrn identificar
perdidas o ganancias de material gentico, atendiendo a la
normalizacin de las reas de cada pico con respecto a un
control sano.
Pegado de <http://www.genycell.es/prod/genetica_humana/mlpa.php#>

Secuenciacin
jueves, 15 de marzo de 2012
07:16 a.m.

PCR tiempo real son para ver deleciones


MLPA para delecciones y duplicaciones

Se utilizan cuando no sabemos la mutacin determinada de esta enfermedad, no es una buscada dirigida.
Sntesis in vitro del DNA.
Necesitamos: DNA polimerasa, oligos, primers (promotor no porque ese es parte del gen, es la secuencia que
codifica para la iniciacin) y un dideoxinucleotido (tiene 2 hidrgenos en lugar de un hidroxilo en el 2 prima)
Una vez que esta el dideoxinucleotido (para adenina, citosina, guanina y timina) ya no hay cadena 3 libre y ya
no se puede seguir sintetizando, este dideoxinucleotido es colocado por azar por el aparato y me quedan
cadenas de diferentes tamao. Si le agregas desoxinucleotidos (adenina, timina, citosina y guanina) continua la
sntesis normal.
Cuando hay dos picos empalmados en el electroferograma hay un cambio de estado heterocigoto normalmente
sale como N.
Cuando tengo deleciones o inserciones pequeas en el electroferograma las cadenas estn desfasadas y se ven
sobrepuestas como si fueran heterocigotos pero se ven sobrelapadas muchas, aunque por si solo no puedes
determinar si es por delecin o por insercin, necesitas ver la secuencia normal

RT- PCR O reverso transcriptasa, primero de un RNAm (usada como molcula inicial)se
genera un cDNA por medio de una transcriptasa reversa y una vez con esa cadena molde y a
lo amplificas como PCR normal, esta es mucho ms sensible que una PCR normal, se usa para
identificar el riesgo de recaer en paciente con leucemia.

Portador de mosaico en gonada: se ve cuando en un rbol genealgico los


dos hijos estn afectados y los padres no y es una enfermedad
autosmica dominante.

Oligonucletido:

Cadena corta de acido nucleico sintetizada qumicamente

Sonda:

Molcula clonada de DNA o RNA marcada con radioactividad e identificar secuencias


complementarias por hibridacin.

PCR cuantitativa:

Determina en tiempo real el incremento en la cantidad del producto PCR generado durante
PCR.

Endonucleasas de restriccin (enzimas de restriccin):

Duchenne

Amorfa- duhemme, hipomorka-beker


Gen ms grande
Hiperlordosis, pansa de fuera para mantener equilibrio, se acumula grasa en la
pantorrilla.
Ligada al x recesiva.
Lo mas comn es mujer portador
Si se pueden afectar mujeres pero es muy raro, se piensa primero en muchas otras
enfermedades, (para que la mujer sea afectada es que sea homocigoto causandose un
aportadora con un afectado pero es muy raro porque los duchenne muere antes de
edad reproductiva o que una turner tenga mutacin en su x).

La sonda de eleccin a utilizar para la deteccin de una mutacin que afecta una sola
base, o bien que resulte en una pequea insercin o delecin, es un oligonucletido
sinttico, debido a que su menos longitud lo hace mas sensible para detectar el cambio
de una sola base y slo presentar hibridacin con la secuencia complementaria
normal, pero no con la imperfecta; de la misma manera un ASO creado para
corresponder a la secuencia de un gen mutante presenta hibridacin nicamente con la
secuencia complementaria mutante pero no con la normal.
nicamente las sonda ASO pequeas tienen la capacidad para detectar fiablemente
modificaciones en nucletidos nicos.
Para la tcnica de ASO se tiene que tener cuidado porque el que el ASO no hibride no
significa necesariamente que el gen es normal si no que puede ser que la mutacin no
sea la especifica del ASO utilizado.

Biologa Molecular pgina 30

Reconocen secuencias especficas de DNA de doble cadena y rompen el DNA en el lugar de


reconocimiento o cerca de el.

Secuenciacin
Este mtodo aprovecha ciertos anlogos qumicos de los 4 nucletidos
conocidos como dideoxinucelotidos debido a que carecen de un grupo
hidroxilo 3 terminal en su desoxirribosa; si este se incorpora a una cadena
creciente de DNA no permitirn que la DNA polimerasa se una a la
siguiente base complementaria.

Polimorfismos moleculares
jueves, 22 de marzo de 2012
08:55 a.m.

Son cambios en la secuencia de DNA pero que no estrictamente implican padecimientos, o pueden
predisponer para otros.

Genotipo: Es la constitucin gentica de un individuo, ya sea a nivel de sus genes (23,000) o


de un solo locus, gen o alelo en particular
Fenotipo: Son las caractersticas observables de una clula o un organismo, producto de la
expresin del genotipo y su interaccin con el medio ambiente.
Polimorfismo: variante no mrbida (no patolgica) en al menos 1% de la poblacin.
Alelo: variante o forma alternativa de un gen o locus (alelo paterno, mutado etc)
Marcador: caracterstica fenotpica o ms comnmente una secuencia de DNA, cuya
localizacin cromosmica es nica y conocida
Locus: la localizacin cromosmica que guarda una secuencia de DNA o gen
Locus polimrfico: Locus con dos o mas alelos con frecuencia mayor al 1%.

Clasificacin de polimorfismos:
Fenotpicos: coloracin de piel y anexos, rasgos raciales, anatmicos (wormianos)
Bioqumico/serolgicos: ABO, Rh, variantes electroforticas de apolipoprotenas.
Citogenticos:-> a nivel de cromosmicas. Regiones heterocromaticas y regiones con
satlites (bisatelites, trisatelites)
Polimorfismos moleculares: el 30% de nuestros genes son polimrficos, 10-20% de
nuestros loci en estado heterocigoto-> esto no necesariamente implica enfermedad.->
ejemplo la MHL (complejo mayor de histocompatibilidad) es una de las regiones que
presenta mas polimorfismos. Se calcula que cada 300-500 pares de bases hay un
polimorfismo.

En la enf. De x fragil es una duplicacin GGG que no es


codificante.

Los humanos somos iguales en el 99.9% (identidad genmica)


0.1% de diferecnia en DNA -> polimorfismo

Junto con el ambiente:


- Favorece patologa multifactorial
- Respuesta farmacolgica
- Fenotipos variables continuas
- Conducta y adicciones
SIPS: Polimorfismos para nucleotidos
DNA codificante= < 2% -> 80-100 Mb

MARCADOR

NUM.
LOCI

CARACTERISTICAS

EJEMPLOS

DNA RFLPs

>105

Marcador de 2 alelos, heterocigocidad mxima 0.5. Los que puedo reconocer.


Identificables por PCR-restriccin

Endonucleasas de origen bacteriano para los cortes.


Puede tener una variante en un cromosoma por lo
tanto un sitio de corte y en el otro no; por lo tanto no
hay corte y en el PCR-restriccin aparece uno completo
(300) y uno con corte (100 y 200).

DNA VNTRs
>104
(repetidos en tandem
de numero variable)
minisatelites

Mltiples alelos, altamente informativo, cerca de los extremos de los


cromosomas, identificacin por Souther blot o PCR. Secuencia grande que de una
persona a otra varia. Son mas polimorficos que los RFLP

Las regiones de los telomeros.

DNA STRs
>105
(repetidos en tandem
cortos)
microsatelites

Mltiples alelos, altamente informativo, identificacin por PCR, distribucin a lo


largo del genoma. EJ huntington aqu no aplica en la enfermedad en una regin
codificante porque es una mutacin. Son mas polimorficos que los RFLPs pero
parecidos a los VNTRs. 2,3 0 4 bases que se repiten.

DNA SNPs
(polimorfismos de
nucletido nico)

Tipificacin por equipo automatizado, distribucin a lo largo del genoma.


Susceptibilidad a enfs. Multifactoriales. Cambios de una base nitrogenada por
otra. Son biallicos (Solo hay dos opciones). Son menos polimrficos. De repente
pueden ser RFLPs si me quita o me genera un sitio de corte. Identificables por
PCR-restriccin. 1 por cada 500 bases nitrogenadas.

>107

Codificantes (sinnimos: no cambian el aa. Y no


sinnimos: cambian a la a.a pero no causan enfermad, si
la causa ya no es SNPs es una mutacin) y no
codificates (Regiones intronicas, promotoras e
intergenicas).

El reportero es que el emite la floresencia cuando se separa del


quancher.

Telmeros: se acortan cuando vamos envejeciendo.

DNA minisatelites
Dr. Jeffreys
Acua el termino "huella gnica" -> porque hay tanta variacin de minisatlites que
todos tenemos diferentes.
Los uso para reconocer casos de homicidio
Describe regiones peculiares de DNA, altamente repetitivas y polimrficas
"secuencias minisatlites"
Ahora-> Son secuencias hipervaribales de tamao moderado organizadas en tandem
+/- 1,000 de repetidos en tandem que abarcan desde 0.1-20 kb
Abundantes en regiones peritelomricas y algunas en regiones intersticiales
cromosmicas
1er VNTR caracterizado: insulina 11p15.6 y el primero utilizado para diagnstico

Biologa Molecular pgina 31

DNA microsatelite
Cambian hasta en 3
Puede encontrarlos en cualquier regin de mi genoma
PCR y un gen para su identificacin por que lo que tienes
que ver es que si en ese primer hay 2, 3 o 4 copias
Para determinar parentesco los hijos deben de tener

"secuencias minisatlites"
Ahora-> Son secuencias hipervaribales de tamao moderado organizadas en tandem
+/- 1,000 de repetidos en tandem que abarcan desde 0.1-20 kb
Abundantes en regiones peritelomricas y algunas en regiones intersticiales
cromosmicas
1er VNTR caracterizado: insulina 11p15.6 y el primero utilizado para diagnstico
presintomtico alfa-globina.
Si hago PCR y lo hago por tamaos, la de mayor peso molecular es la que tiene mas
repeticiones en tandem
Identificacin de paternidad, usando una PCR en un gen, a minisatelites (diapo)
Generalmente son heterocigotos pero pueden ser homo

DNA microsatelite
Cambian hasta en 3
Puede encontrarlos en cualquier regin de mi genoma
PCR y un gen para su identificacin por que lo que tienes
que ver es que si en ese primer hay 2, 3 o 4 copias
Para determinar parentesco los hijos deben de tener
cuando menos un repetido (de corte heredado del padre).
Si se cuentan los primer 80 (+ numero de repetidos)-> as
te das cuenta de que tamao tiene cuando sale en PCR;
todos tienen 80 pero varan en su numero de repetidos.
Aplicaciones: identificacin de individuos sospechosos,
paternidad.

A las mutaciones que les llamamos silentes en realidad son "polimorfismos sinnimos", si
fueran suficiente para darme enfermedad se llamara mutacin.

Tecnologa de microarreglos

DISCRIMINACIN ALELICA (TAQ-MAN)


Son 3 sondas
La tercera sonda solo reconoce a los individuos que tienen una T porque mi sonda solo
tiene A si no tiene timina la sonda no se pega bien y no se genera florescencia
Tengo una segunda sonda que me reconoce a el otro SNIP es decir que tiene C y mi
sonda G y se genera florescencia con esa sonda.
Si eres homocigoto solo te va a dar florescencia de un solo color pero si eres
heterocigoto te va a dar la florescencia de los dos colores

Cristalitos de 1 por 1 y en cada cuadrito pongo el DNA de una


persona
Solo se reconocen y si hay reconocimiento se ve la
florescencia
En cada subcuadrito se pone el DNA y quiero ver si en un
SNIP en particular quienes son C y quienes T y le pongo la
cadena de seal y veo la florescencia.
Solo si la secuencia es idntica o no a la que agrego.

Polimorfismos: taq-man, microarreglos o PCR restriccin

Variantes genticas:
Segmentos que se repiten de mas de 1000 bases nitrogenadas que se repiten varias
veces.
Esquizofrenia, hay variantes en el numero de copias que la favorecen
Segmentos de mas de 1kb.
Son mas grandes que los minisatelites.
Se reconocen con MLPA (deleciones o duplicaciones grandes)
Parkinson, variante en el DNA mitocondrial que la favorece

Enfermedades por prion: por mutaciones en genoma, como la enfermedad de


Creutzfeld-Jacob e Insomnio fatal familiar, misma mutacin con diferente efecto que
dependi de un polimorfismo.

Significado bilgico del polimorfismo:


a)
b)
c)
d)
e)

Factores epigenticos
Susceptibilidad o proteccin de padecimientos
Variabilidad bilgica
Seleccin natural
Mutaciones de baja penetrancia

Los polimorfismo a veces pueden modificar la severidad de una mutacin.

Un prin o prion1 es una protena patgena que tiene alterada su estructura terciaria,
teniendo un incorrecto plegamiento.
Pegado de <http://es.wikipedia.org/wiki/Prion#Enfermedades_pri.C3.B3nicas>

De polimorfismo a mutacin por factor ambiental:


Influencia en alelos en trans:
Cncer de mama
FQ
Como diferenciar polimorfismo de mutacin:
Los polimorfismo casi siempre ocurren en la regin de la tercera base.
Se tienen que estudiar por lo menos a 100 personas para un polimorfismo
Efecto a nivel de la protena
Si es sitio importante seguro es mutacin
Si varia mucho a lo largo de la poblacin es polimorfismo

Biologa Molecular pgina 32

1. Sordera de herencia mitocondrial inducida por aminoglucosidos. Homocigotos G ->


riesgo de la sordera. Regula el movimiento de cilios del odo interno. Si nunca te dan
aminoglucosidos nunca te das cuenta de que tienes esa variable y nunca presentas
sordera.
2. Polimorfismos, porfiria aguda intermitente.

Medicina genmica
jueves, 29 de marzo de 2012
07:10 a.m.

Enfermedad gentica: Estn involucrados factores ambientales-> sinnimo de enfermedad


multifactoriales
Heredabilidad: Se obtiene a base de estudios de gemelos. Basndonos en que comparten la informacin
gentica; monocigotos 100% y dicigotos 50%.
h=2(Cmc-Cdc)= heredabilidad de 1 dice que todo se determina por los genes. Si es 0 es ambiental.
Entre los seres humanos existe una identidad de 99.9%
Son 33 millones de bases

Estudios de asociacin
Co-ocurrencia de alelos o fenotipos
Alelo A se asocia a la enfermedad si la frecuencia del alelo A en poblacin enferma es mayor que en
poblacin sana ejem. HLA-DR4 presente en 78% de pacientes con AR y slo en 36% de la poblacin
normal.
Hay grupos tnicos que tienen variantes que favorecen a una enfermedad y se les considera un
grupo de riesgo y por lo tanto hay que poner atencin a los factores ambientales que pueden
colaborar a la aparicin de la enfermedad.
Ejemplo labio paladar hendido esta asociado a desnutricin, y deficiencia de acido flico (esto es
porque el metabolismo de acido flico ayuda a metilar el DNA) -> pobreza
Se propone que algunos genes participan en la etiologa de la enfermedad
Se propone que las enfermedades multifactoriales se asocian a variantes comunes con efecto
pequeos.
Se calculan 11 millones de SNPs en el genoma
Alzheimer tardo familiar (70 aos), representa el 25% de los casos de Alzheimer, asociado a
apolipoprotena E alelos 4.
El Alzheimer slo se puede diagnosticar con certeza post -morten por las placas -amiloides que se
forman; antes se puede confundir con otros tipos de demencia. Pero si se sospecha de Alzheimer y
presentan el alelo 4 hay un 97% de que si sea Alzheimer.
La raza de la que provengas tambin influye en el padecimiento de una enfermedad ejemplo los
japoneses presentan mayor riesgo.
El alelo DR3 y DR4 estn asociados a la diabetes y codifican para el MHC
Haplotipo= conjunto de variantes que se heredan juntos, estn en un mismo cromosoma. "se heredan
en bloque"-> Se heredan en conjunto porque estn muy juntos entre ellos en el ADN.
Gen de insulina-> tiene un repetido VNTR de 14 pares de bases

Proyecto de Hap Map


Identificar los SNPs mas frecuentes en diferentes grupos poblacionales y as armar bloque de
haplotipos por equilibrio de alineamiento.
Dos variables que estn en equilibrio de alineamiento quiere decir que segregan independientemente
y no depende una de la otra.
El desequilibrio de ligamento es cundo se forman haplotipos; es decir las variables estn asociadas
a otras cerca de ellas.
Se planteaba que se podran hacer estudios de asociacin del genoma completo en base a la
informacin generada para poder escoger las SNPs y variantes deseadas.
Microarreglos: Pueden genoficar SNPs hasta de 1,000,000 de SNPs, casi todos.
En base a este proyecto podemos escoger cules SNPs debemos genotificar; ya sabemos las
secuencias.
Ejercicio es un factor de proteccin para la diabetes, para esto se pueden dar estudios de
asociacin del genoma completo.
Para encontrar una variable puede haber una base que sea la de asociacin es decir esa variante no
causa la enfermedad pero siempre que esta tambin esta la variante en esa regin que si la causa.
Los resultados no se extrapolan en diferentes grupos tnicos.
Se quiere que en un futuro se obtengan biomarcadores para usarlos en medicina personalizada y as
nos indicaran los riesgo que puede tener esa persona para padecer cierto grupo enfermedades.
Actualmente todava no est bien puestas estas pruebas de microaareglos y se tiene que pensar en
el COSTO-BENEFICIO; es decir son muy caras y que importancia tiene decirlo a una persona donde
toda su familia tiene diabetes y tiene vida sedentaria, es decir que sentido tiene comprobar que
esta en riesgo cundo es evidente.
Biomarcadores
Genmica: secuencia del genoma humano SNP: 11 millones
Trancriptoma: expresin gnica

50 000 microarreglos transcriptos

Protemica: anlisis de protenas

100 000 protenas

Metabolmica

Anlisis de metabolitos

Enfermedades complejas

Diabetes
Obesidad
Alcoholismo
Paladar hendido (cuando no es sindrmico)

Complejidad del genoma nuclear

Genoma de 3.2 millones de nucletidos


1.5% esta implicado en el fenotipo
98.5% del genoma es desconocido (no sabemos como funciona)
Variantes en la secuencia ADN
Susceptibilidad a la enfermedad, el resultado clnico, la respuesta al tratamiento
Adems, regulacin gnica

Diversidad del genoma humano

Biologa Molecular pgina 33

Diversidad del genoma humano


0.1% difiere entre humanos, los gemelos monocigotos no difieren en nada
SNP 37 millones de variantes
Variantes estructurales como CNVs

Complejidad etolgica de fenotipos complejos


Resultado de efecto aditivos y la interaccin entre factores genticos y ambientales
Pocos alelos con un gran impacto
Gradiante de fenotipo de acuerdo a los alelos con poco efecto.

Estudios
Se buscan genes candidatos: en cromosomas en dnde se hereda el gen
GWAS: Estudio molecular a gran escala; se usan muchos individuos y mapeaban todo el genoma por
SNPs y veas las SNPs que se ligaban con la enfermedad.
Estudios no direccionados: GWAS, secuenciar el blanco subgenmico, secuencia el genoma completo,
secuencia del genoma completo, secuenciacin de nueva generacin

Estidios genticos de fenotipos complejos


Estudios de genes candidatos
Estudios no dirigidos
GWAS (exitosos, no tan exitosos) -> Se estudia en el RNA mensajero
Secuenciacin de nueva generacin (buscar base por base pero en todo el genoma, se corta el DNA
en pequeos fragmentos de 150 a 300 pares de bases, se unen exones especficos encuentras su
regin especifica y se hibridan y empiezan a hacer PCR que multiplica estos pedacitos, tienen unos
adaptadores que son los que identifica; sirve para individuos mosaicos o cncer o enfermedades en
las que no sabemos los genes candidatos, alinea los mismos exones y busca cules son los cambios en
un mismo lugar.
Secuenciacin de blancos subgenmicos
Secuenciacin de exoma completo
Explicacin bilgica de los resultados de GWAS.

Poblacin de estudio
Estudios de familiares: Se eligen cuando estn varios afectados y que se tiene acceso a ellos, puede
haber portador, pueden desarrollar enfermedades de penetrancia incompleta, no se puede comparar
con otra familia
Estudios y controles: Se puede comparar con otros grupos tnicos, tienes que comparar muchos, los
casos son limitados , pueden ser pareados es decir que los controles se semejan mucho a el individuo
estudiado. 5 controles contra un caso
Estudios prospectivos de asociacin allica.

Diseo de estudios genticos:

Tamao de la muestra: grandes y controlables para poderlos comparar con otros grupos tnicos.
Caractersticas de la poblacin
Origen tnico o mezclas de orgenes
Complejidad del fenotipo:
Fenotipificacin

Defectos del tubo neural


Anencefalia
Encedalocele
Espina bfida
Etiologa (por edad -> mayores de 40 y menos de 19)
Estudios de asociacin (mujeres con estudios y posgrado porque consuman ms acido flico y
madres con diabetes tambin lo presentan ms)
Etiologa ambiental (antibacterianos)

Las mutaciones de polimorfismos a veces pueden ser muy pequeas pero se pueden ir sumando a
otras y dar una enfermedad muy compleja.
Heredabilidad= 1(gentico) 0 (ambiental)
Medicina genmica: aplicar los conocimientos obtenidos de la estructura y funcin del genoma
humano y sus derivados y crear medicina personalizada.
Estudios de asociacin: Se comparan grupos sanos y enfermos (porque todos tienen polimorfismos).

Alzheimer: hay una lipoprotena E: la variante epsilon 4 (la diferencia es que en lugar de
cistena hay arginina)-> esta variante es la ms asociada a alzhimer; me predispone ms.
Para estos estudios se tienen que manejar entre familias que ya hallan desarrollado la
enfermedad algn familiar.

Desequilibrio del ligamiento: si tienes en un gen 3 o 4 polimorfismos juntos (normalmente


los polimorfismos pueden tener la posibilidad en la segregacin independiente) aqu un
polimorfismo consegrega con otro de manera frecuente, es decir no segrega independiente.

Biologa Molecular pgina 34

Complejo mayor de histocompatibilidad:


genes que estn en el brazo corto del
cromosoma 6

Faltan ejemplos: Alzheimer, DM1 (HLA-DR3/DR4,) alelo de Leyden,


variante en el facto 5 de la coagulacin(relacionado con el desarrollo de
trombos y embolias en mujeres embarazadas y que toman
anticonceptivos)-> cambio de un a.a por otro (de sentido errneo).> lo
identificas PCR-restriccin o secuenciacin directa.

DMII: hacemos estudios de microarreglos; es decir no se estudia gen


por gen, si no se estudian 1 milln de SNPs en una sola persona por un
microarreglo. Porque hay muchos genes que se relacionan a la DM2.

Estudio de gemelos, microarreglos y estudios de asociacin

Gentica y cncer
jueves, 12 de abril de 2012
07:34 a.m.

Las clulas cancerosas son miembros de una clona de clulas somticas que han sufrido una o ms mutaciones.
No necesariamente hereditaria; es gentica pero puede ser adquirida; ejemplo si te expones mucho a rayos UV. 90% de
las personas con cncer son patologas transmitidas; es decir no lo transmiten el 10% que lo transmiten tienen herencia
mendeliana.
El sx de down si tiene predisposicin a cncer.
Los 3 grupos de genes que si se alteran predisponen a cncer: Protoncogenes, genes supresores de tumor y apoptosis y
genes de reparacin de DNA
En las adquiridas se calcula que hay que ir acumulando de 8 a 12 mutaciones que condicionan el desarrollo de neoplasias.
Es ms comn en adultos porque se tienen que ir acumulando mutaciones.

Genes de reparacin de DNA

Participan en el mantenimiento de la integridad del DNA


Se requiere de ambos alelos de una gen mutados para afectar el fenotipo celular
Accin indirecta en el proceso de oncognesis
Su inactivacin aumenta la tasa de mutaciones, afectando a proto-oncogenes y genes supresores de tumor
Sus mutaciones involucran sndromes con alta predisposicin o susceptibilidad a enfermedades malignas.

Padecimientos autosomicos recesivos con predisposicin a cncer


Anemmia de fanconi
Ataxia telangiectasia
Xeroderma pigmentoso: son varios genes que al estar mutados que dan el mismo cuadro clnico; es decir hay varias
mutaciones que lo pueden dar. (heterogeneidad gentica) -> defecto de la reparacin del DNA por la luz UV. La luz UV
pone en el DNA dimeros de timina y en una persona normal los corrige y los quita.
Sindrome de bloom
Xeroderma pigmentoso
Melanoma, carcinoma de celas basales, sarcomas, cncer cerebral, de pulmon o gstrico.

Proto-oncogenes
Promueven de manera positiva la proliferacin celular
Cuando existe una mutacin se denominan oncogenes
Los oncogenes se encuentran activos en forma excesiva o inapropiada (mutaciones hipermorfas o con ganancia de
funcin).
Es suficiente la mutacin en un alelo para afectar el fenotipo celular.
Tienen una funcin anormal excesiva.
Mecanismos de activacin de proto-oncogenes (hay ms)
Amplificacin:
FISH: se hace en clulas en interfase (se meten sondas con floruros que se pegan a las mutaciones) -> normalmente
hay dos secuencias y tendramos que ver dos luminosidades si ves ms quiere decir que hay mas mutaciones que
predisponen a cncer(ejemplo el HER-2/neu que su amplificacin predispone a cncer de mama)-> se genero un
medicamento que inhibe la accin de este oncogen sobrexpresado "hersertina" -> es como quimioterapia dirigida. ->
slo 30% de los cnceres de mama se tratan as porque son los que tienen mutaciones en estos genes.
En algunos casos se correlaciona con mal pronstico.
Mutaciones puntuales: cambios de bases nitrogenadas que causan una mutacin hipermorfa.
Genes RAS que codifican protenas denominadas p21 que participan en la va de transduccrin de seales y adems
tienen funcin de GTPasa
RAS: Es un transductor de seales de membrana al ncleo que indican divisin celular, cundo transmite la seal lo
hace controlada con GTP.
Ras unido a GTP favorece divisin celular y si hay GDP no hay divisin. Si nunca se hidroliza GTP por mutacin
puntual en el gen de RAS hay divisin descontrolada-> cncer de vejiga.
Tumores en el colon tambin tienen mutaciones en RAS y sirven para marcadores para toma de desciones en
tratamiento; cundo se ven estas mutaciones en RAS usan un tx especfico "cetuximab" y esto es porque son
insensibles a los Ab inhibidores del EGFR
Si tomas un anlisis de bilis para detectar mutaciones de RAS tiene 50-67% de detectar colangiocarcionoma y de
80-95% de detectar cncer de pncreas.
Translocaciones
Sobre todo ocurren en leucemias.
Estas translocaciones en leucemias las detectamos por RT-PCR (se detectan en RNA porque en DNA estaran muy
grandes)-> detectamos tambin si el tx dirigido est teniendo resultados. Puede detectar una clula cancerosa en
107 genes
La leucemia mieloctica crnica-> translocacin en el cromosoma filadelfia (t(9;22)(q34;q11); se unen dos genes que
no deberan de estar juntos (BCR/ABL).
Tx: "imatimid"
En linfoma de Burkit: es un gen quimrico anormal, no hay tx especfico. Se dg por PCR tiempo real o RT -PCR

Genes supresores de tumor


Reguladores negativos del ciclo celular: Inhiben la proliferacin celular y favorecen la diferenciacin
Inductores de la apoptosis y reguladores de la transcripcin
Las dos copias tienen que estar mutadas
Las mutaciones condicionan prdida de la funcin (amorfas) o interfieren con la funcin del alelo normal (antimorfas o
efecto dominante negativo).
Ambos alelos de un gen supresor de tumor. Deben mutarse para afectar el fenotipo celular.
Mecanismo de inactivacin de genes supresores de tumores
Mutaciones puntuales
Deleciones
Translocaciones
Inhibicin o degradacin por oncoprotenas virales
Hipermetilacin de islas CpG (citosinas y guaninas)
En todas las clulas tenemos dos alelos normales guardianes y puedo tener uno mutado pero queda uno para defender,
pero si los dos alelos estn muertos no hay quien defienda surge la enfermedad.

Biologa Molecular pgina 35

Proto-oncogen-> gana funcin


Genes supresores y de reparacin-> en cncer pierden
funcin

Retinoblastoma:
Responsable del cncer de ojo ms comn en nios: hay formas hereditarias y no hereditarias; en las hereditarias
adems desarrollan ms neoplasias a lo largo de su vida.
Autosmico dominante
Penetrancia incompleta: es cuando no ocurre la segunda mutacin; si hay una mutacin presenta hay 90% de posibilidad
de que realice la segunda mutacin.
Hereditario: Inicio temprano, bilateral 85%, progenie afectada, alto riesgo de otras neoplasias
No hereditario: inicio tarda >1 ao, unilateral (100%), progenie normal y sin riesgo de otras neoplasias.
Una manera de distinguir entre hereditario y no hereditario es si encuentras las mutacin en cualquier clula del cuerpo
(la mutacin inicial es en clulas germinales) es hereditario y si slo esta la mutacin en clulas del tumor (clulas
somticas) no es hereditario.
Es ms temprano el hereditario porque ya llevas una primera mutacin.
Los retinoplastomas se ven en nios muy pequeos porque se da en la maduracin de la retina.

Caractersticas de los sndromes de cncer familiar


Las neoplasias son diferentes en los distintos miembros de la familia
Aparece en edades mas tempranas de lo habitual para la neoplasia espordica
El tumor es multicntrico
Presencia de mltiples tumores primarios
Los rboles genealgicos son autosmico dominante con penetrancia del 60% (es decir que si ya tienen las primera
mutacin tienes 60% de pasar la segunda).
Sndrome de LI-FRAUMENI: (uno de los 30 tipos de sx cncer familiar)-> si no checas p54 puedes verlo por clinica; es
muy comn el sarcoma o cncer cerebral, o por secuenciacin o MLPA, hay que monitorearlo de manera estrecha si tiene
la mutacin con ayuda del PET (para checar la presencia de tumores constantemente).
Ej: familias con muchas cncer de colon sabes que hay una primera mutacin heredada y la segunda mutacin se dio en
tejido colonico. Para proteccin te tienes que estar checando cada 3 meses (colonoscopia) o algunos prefieren la
reseccin del colon (colectomia) porque la posibilidad de cncer a los 30 aos es de 100% "poliposis familiar adinomatosa"
(gen responsable APC - es un gen supresor de tumor). Generalmente los cncer de colon no son hereditarios para que te
de se tienen que ir acumulando las mutaciones. (de 8-10 mutaciones)

Cncer tipo I o Lynch II


Tambin da cncer de colon
Autosmica dominante
Tambin tienen cncer de endometrio y pncreas
Si el riesgo mayor es de colon se da seguimiento con colinoscopia y en los dems es muy difcil el monitoreo.
Cncer de colon no polipotoso-> riesgo de tumores en <50 aos de lado derecho
Cncer de colon de lado izquierdo >60 aos pensaras ms en un cncer espordico no hereditario.
Hay por lo menos 4 genes relacionados. Con heterogeneidad allica -> se hace secuenciacin.
Se da por malos apareamientos reconocidos por estos 4 genes pero si estn mutados no los reconocen. -> para que te de
el cncer solo con un gen mutado te da pero tienes que investigar los 4 genes para ver el mutado.
Si confirmo esta enfermedad le tienes que hacer estudios a sus familiares y si tienen la primera mutacin tienes que
hacerles colonoscopia mnimo 2 veces al ao. Y en endometrio se hace biopsia de endometrio y marcador de CA125 de
1-2 veces al ao.

Cncer de mama
De todos los cncer de mama 10% son hereditarios y en los otros tienen de 8-10 genes mutados con poco riesgo de
heredarlos.
Hereditario: ocurre ms jvenes con varios familiares con cncer de mama y de ovarios; si es el primer caso lo mas
probable es que no sea hereditario; le ofreces estudio gentico si sospecha de hereditario.
BRCA1 y BRCA2 -> pacientes con cncer de mama que sospechas de heredarlo le haces estos estudios. Si es multifocal y
bilateral, con familiares con cncer de mama y de ovarios; es uno de los genes con mas polimorfismos pero no es mutacin
y ese polimorfismo no quiere decir que hay predisposicin a cncer solo si hay mutacin.
Secuenciacin, autoexploracin mensual, ultrasonidos o marcadores CA-125.
Proto-oncogen RET: a los 10 aos tienen cncer de tiroides (tireidoctomia), lo suplementas con T3, se nota por que tienen
labios gruesos y pequeos tumores en la lengua. Estudio de RET por secuenciacin. -> --"eoplasia endrcina mltiples" ->
tiroides, suprarrenales,

Oncogenes

Genes supresores de tumor

Tipo de
mutacion

Amplificaciones, puntuales,
translocaciones

Deleciones, puntuales y
translocaciones

Expresin
celular

Sobre-expresin dominante

Perdida de funcin recesivo

Clula afectada Somtica

Somtica o germinal

Gnesis

Adquirida o heredada

Adquirida

Biologa Molecular pgina 36

Farmacogentica
jueves, 19 de abril de 2012
07:25 a.m.

Farmacogentica diferente a la farmacogenmica.

Disciplina que estudia el efecto de la variabilidad gentica de un individuo en su respuesta


determinados frmacos.
Farmacogentica: Diferencias genticas en las vas metablicas que afectan las respuestas ante las
drogas o medicamentos, debido a variaciones allicas en las enzimas del metabolismo y de las cosas
que se involucran en la accin de los frmacos.
Es til porque casi nunca un frmaco es til al 100%, el mismo frmaco en diferentes px acta
en diferentes formas.
"Medicina personalizada" en base a los SNPs (polimorfismos en <1% de la poblacin).
Un frmaco me puede dar una sensibilidad aumentada o reducida depende de los SNPs que
tengamos porque pueden cambiar esas enzimas; por que las pueden hacer deficientes o
aumentadas.
Se refiere a las diferencias genticas en las vas metablicas que afectan las respuestas
individuales a las drogas, en trminos de efectos teraputicos.
Farmacogenmica: Estudia las bases moleculares y genticas, pero en las enfermedades para
desarrollar medicina personalizada.

El genoma de dos personas difiere en


0.1%, con 99.9% de similitud en todo el
DNA. El 0.1 % nos da la diferencia en la
asimilacin de frmacos.

Con el desarrollo de la bioinformtica ya se pudo ver todas las secuencias


del genoma humano como influye en la farmacogentica.

Relevancia de la farmacogentica
Medicamentes raramente son 100% efectivos en los pacientes
15-35% de pacientes ninguna o inadecuada respuesta B-bloqueadores
9-23% responden inadecuadamente a los inhibidores de recaptura de serotonina.
20-50% responden inadecuadamente a antidepresivos tricclicos
La farmacogentica inicia en 1909 con Garrod; propona que las variaciones en el metabolismo se
hederaban.
1940: Ford defini el polimorfismo gentico
1959: Freerich Vogel: uso por primera vez el trmino farmacogentica:"el estudio del papel que
juega la variacin de los genes individuales en la respuesta a medicamentos"
1962: Kallow escribi la primera monografa sobre esta disciplina
1991: Vogel, Motulsky y Meyer: distinguieron entre los fenotipos raros y comunes
1998: Aparece el trmino de farmacogenmica
2003: Secuenciacin del cdigo gentico humano

Variacin individual a la respuesta a medicamentos a travs de dos


parmetros.
1. Primer parmetro: Relacin con la farmacocintica (Velocidad con la
que el organismo va a poder, absorber, transportar, metabolizar los
frmacos o sus metabolitos)
EJEMPLOS:
Alelos polimrfico del sistema del citocromo P450: hacen
a la codena ineficaz o que incrementen la posibilidad de
hemorragia en pacientes tratados con warfarina
2. Segundo parmetro: Variacin que influye en la farmacodinmica de
un medicamento. (Variabilidad de las respuestas de un medicamento
secundaria a la variacin gentica en los objetivos de los
medicamentos "receptores, enzimas o vas metablicas")
EJEMPLOS:
Anemia hemoltica, inducida por las sulfamidas en
pacientes con deficiencia de la enzima glucosa-6fosfato
deshidrogenasa.

Farmacogentica

Cualquier variacin gentica determinada por la respuesta frente a los frmacos en lo relativo a su
eficacia y a su toxicidad.

Metabolizadores:
Rpidos, Lentos y Normales
Ultrarrpidos: al administrar el frmaco le tienes que dar ms dosis que asimila muy
rpido, la duracin es ms corta pero tambin se va a ir acumulando el frmaco porque lo
asimila muy rpido pero no lo puede excretar rpido y hay acumulacin "toxicidad"
Ultralentos: al administrar el frmaco se va a acumular y causa toxicidad. Aunque subas la
dosis no lo puedes asimilar.
Los frmacos se disean para los metabolizadores normales (metabolismo normal).

Metabolismo de los frmacos:

Ingesta
Absorcin
Distribucin
Interaccin clula-frmaco
Degradacin
Excrecin
Si no somos asimiladores del frmaco podemos pasar directo de distribucin a excrecin y
no asimilamos nada del frmaco.

Conocer esto en cada paciente nos sirve para tener un rango de ndice teraputico y de
toxicidad. Estos se pueden sobrelapar.
Efectos adversos de frmacos: Toxicidad, algunos condicionan cncer, hay algunos
medicamentos que solo 1 de 4 px tiene un efecto benfico con su uso, 15% de los medicamentos
se asocian a efectos adversos graves.
-> Si nunca nos sometemos a probar cierto tipo de frmacos nunca sabremos si tenemos
sensibilidad con ese tipo de frmacos. Si no hay exposicin al frmaco puede ser que nunca se
detecte.
La variacin en la secuencia de DNA tambin influye en la respuesta a frmacos; podemos
tener polimorfismo pero tambin podemos tener la enzima inhibida por mutaciones que no
solo son polimorfismos, podemos tener deleciones, inserciones que cambian nuestro marco
de lectora y no producimos las protenas y enzimas para degradar los frmacos.
Variaciones de las protenas blanco: receptores y algunas enzimas

Consecuencias en el metabolismo polimrfico del frmaco:

Extensin del efecto del frmaco


Reacciones adversas al frmaco
Ausencia de activacin de profrmacos
Toxicidad
Aumento de la dosis efectiva
Metabolismos por vas alternas deletreas
Interacciones frmaco-frmaco (frmacos que tienen vas metablicas
interrelacionadas).

Cosas que afectan la biotransformacin de los frmacos:


SNPs (principal)
Ambiente
Tabaco
Alcohol
Agentes qumicos
Dieta: por falta de vitaminas, antioxidantes (muchos tiene una mayor
proteccin para el metabolismo).
Genticos
Factores multignicos
Errores congnicos del metabolismo
Endgenos
Edad: disminuye tu metabolismo en edad avanzada, en neonatos entra
lo que sea y predispone y aparte lo puedes exponer a predisposicin.
Sexo: por cuestiones hormonales
Estados hormonales
Enfermedades hepticas

Un metabolizador extensivo = normal.


Metabolizador lento: se administra una dosis pero no hay excrecin, y seguimos
administrado dosis y se acumula.

Unimodal: con una sola moda. No puedes saber si son rpidos o lentos
Dimodal: dos modas (se pueden sobrelapar) ; puedes distinguir entre los rpidos (se refiere
a normales- mayora de la poblacin) y los lentos. Herencia recesivos. No se puede ver bien
que se tiene porque todos los monocigotos en el estudio son iguales..
Trimodal: 3 modas;

Biologa Molecular pgina 37

Relacin en cuanto consumo y cuanto excreto. En un anlisis todos mis


metabolizadores a analizar tienen que ser iguales

Razn metablica: Frmacos que me tomo y los metabolitos que tengo.

Trimodal: 3 modas;

Si administro un mayor numero de frmaco y despus tengo menos metabolitos ->


metabolizador lento
Metabolizador rpido o normal -> administro frmaco y obtengo menos; es equivalente
a la pasada,
Frmaco de liberacin sostenida: tarda mucho tiempo en liberarlo.

Ejemplos:

Alelos polimrficos que existen en el sistema del citocromo P450 (todo una familia),
hace que la codena sea ineficaz o incrementa la posibilidad de hemorragia al
administrar warfarina (anticoagulante).
CYP2D6 (polimorfismos genticos de 80 alelos diferentes, duplicaciones ) ->
estos nos da un montn de posibilidades.
Enzima normal con cantidad normal (metabolizador normal)
Enzima normal en cantidad disminuida:
Metabolizador lento
Enzima inactiva o pobremente activa
Cantidades masivas de la enzima
El frmaco se metaboliza muy rpido porque tengo mucha enzima
Chopo -> prueba gentica de la sensibilidad a warfarina (informacin til
para ajustar las dosis)
CYP2C9: warfarina
CYP2D19
BKORCO: para vitamina K
Contados son los frmacos que ya tienen este tipo de pruebas.
CYP2D6

La poblacin mayoritaria es de los metabolizadores extensivos que van a poder producir a


la enzima sin ningn problema
La poblacin minutara que es la caucasica no hay hidroxilacin y hay metabolizadores
lentos o nulos. -> no hay la enzima.

Metabolizadores lentos -> mas sensibles a los B-bloqueadores: propanolo y


metaprolol y los antidepresivos y antipsicticos. (lista muy grande de todo lo que
puedes ser sensible)

Glucosa 6 fosfato deshidrogenasa:


Gen ligado al X
Frecuencia de deficiencia:
Norte de Europa 0%
Sur de Europa >25%
Africanas >10%
En este ejemplo nos damos cuenta la variacin entre las razas
En los hombres, tienen una resistencia disminuida al estrs oxidativo
La ms comn es la ingesta habas (porque tienen muchos carbohidratos) y con esto se describi y por la exposicin de
frmacos.
Los sntomas a su ingesta de cualquiera de las dos (muchos carbohidratos o frmacos) son la hemlisis aguda con dolor
(anemia hemoltica) y alteraciones urinarias.
Pimgaina y cido metilinico principalmente, pero hay ms que lo causan

Tiopurina metil transferasa TPMT


Participa en la metilacin de las tiopurinas
6-mercaptopurina
6-tioguanina
Acetofurina
Se usan para el manejo de leucemias y trasplantes de rganos
Los homocigotos carecen de la actividad de la TPMT y vamos a tener una mayor frecuencia de los efectos secundarios cundo adm inistramos las
tipurinas:
Leucopenia (disminucin de todas las clulas sanguneas)
Dao heptico severo
Emesis
Diarrea
Dolor abdominal
A los nios par ayudarlos se les administra tiopurinas aparte con una supervivencia de 80%.
No sabes que tienes susceptibilidad a estos frmacos hasta que no se administren.
Tipurinas: agentes antineoplsicos, inmunosupresores-> tratan leucemias
1 de cada 300 tienen efectos adversos
Brazo corto del cromosoma 6-> 10 exones y 9 intrones. 245 a.a
2 alelos *2 y *3 (tenemos 3 variantes del 3) variandos.
*1 -> normal sin variables
*2-> exn 5 cambio de G por C /alanina por prolina (cambio en el marco de lectura) -> baja actividad de la protena (enzima). Solo 2 variables
*3 -> ms de 50 variables
A- exn 7 G por A alanina por tirosina
B- exn 7
C - exn 10
Poblacin africana, tailandesa y japonesa no tengo *3A y B solo hay la C; se debe a una cuestin evolutiva
Para reconocerlo en nios se le hace tamiz neonatal
PCR restriccn para ver las variantes-> *3
PCR arm ->*2
2 bandas -> heterocigoto y tiene polimorfismo -> tiene reducido el metabolismo para esa enzima, si estn homocigotos estn normales o hay
homocigotos que estn mutados -> no tienen ninguna funcin.
Disminucin de la actividad-> heterocigoto.
Puede que halla polimorfismos que an no se han encontrado y causar este mismo deficit

Porfiria aguda intermitente


Biologa Molecular pgina 38

Porfiria aguda intermitente


Alteraciones en la biosntesis de porfirinas
Polimorfismos de herencia autosmica dominante de esta enzima
Mide el paso de un pirol a un tetrapirol y se modifica y da el grupo M
Un bloqueo total es letal (es la nica va que hay para formar grupos M)
Manifestaciones qumicas:
Son por acumulo de percusores de porfirina y de un acido neurotoxico
Dolor abdominal
Parlisis
Debilidad
Alucinaciones
Permanente -> muerte por parlisis de msculos
Inducen: barbitricos, estrgenos, amidas. Sensibilidad de alcohol
Tx -> administracin de derivados de grupos M y se disminuyen los sustratos

Farmacogenmica
Desarrollar nuevos frmacos a travs de los conocimientos de las variantes en los
SNPs y dar un esquema teraputico individualizado.
Actualmente se pueden analizar los polimorfismos por un chip (ampichips) por
microarreglos y vemos varios SNPs, no estn an muy disponibles pero cuestan
mucho-> analiza los principales genes que codifican las principales protenas del
metabolismo. 4

Variacin en la respuesta farmagogentica

Metabolismo de fase I de los medicamentos


CYP450 -> Su funcin es la adicin de uno de los tomos de oxgeno a un tomo de
carbono para marcarlo, se denomina metabolismo de fase I; lo que facilita su
excrecin en lo que se denomina la fase II del metabolismo de los medicamentos.
Las familias de citocromos se agrupan en familias de genes; hay 6 genes concretos que
codifican para stas protenas:
CYP1A1
CYP1A2
CYP2C9
CYP2C19
CYP2D6
CYP3A4
Estas son responsables del metabolismo de fase I de ms del 90% de los frmacos
utilizados con mayor frecuencia.
CYP3A4 est implicado en ms del 40% de los medicamentos
Los genes CYP son polimrficos con alelos que dan lugar a consecuencias funcionales
variadas entre los individuos que pueden disminuir, incrementar o anular la actividad
enzimtica.
Los alelos que no influyen o cambian la funcin de la protena se consideran de tipo
natural o normal, se reconocen 3 fenotipos principales:
Metabolizadores normales
Metabolizadores lentos:
Riesgo de acumulacin de concentraciones txicas de los medicamentos
Metabolizadores ultrarrapidos
Riesgo de recibir un tx insuficiente con dosis inadecuadas para mantener
las concentraciones sanguneas adecuadas
Las variaciones de estas enzimas son importantes para la desintoxicacin de los
medicamentos y para la activacin de los propios frmacos.

Metabolismo de fase II
Genes polimrficos e introducen variabilidad adicional
Ej:
Polimorfismo de la glucoronidacin y toxicidad por irinotecn
Glucoronidacin por la UDP-glucosil transferasa para la excrecin de la bilirrubina en la
bilis
Polimorfismo de la N-acetil transferasa y tratamiento de la tuberculosis con isoniazida
Su falta causa neuropata perifrica y supresin de la mdula sea
En exceso puede dar lupus eritematoso
Polimorfismo en la eficacia de la tipurina metil transferasa y de 6-mercaptopurina
Utilizados en el tx de leucemias infantiles e inmunosupresin
Estos son desintoxicados por su unin a un grupo metilo por efecto de la TPMT (tiopurina
metil transfersa)
Su deficiencia parcial reduce el metabolismo y puede incrementar la eficacia del
medicamento o incrementar su toxicidad.
Polimorfismo de la colinesterasa y prolongacin de la parlisis muscular anestsica en el
postoperatorio.

Biologa Molecular pgina 39

Variacin en la respuesta de farmacodinmica


Deficiencia de glucosa 6-fosfato deshidrogenasa (G6PD) y anemia hemoltica
Esta enzima esta ligada al cromosoma X
Defecto enzimtica causante de enfermedad ms frecuente en el ser humano
con un mayor grado en afroamericanos
Trastorno de mayor heterogeneidad gentica con ms de 70 variantes excepto
por dos todas las variantes son mutaciones puntuales; y las otras dos son
delecciones de codones que no cambian el marco de lectura.
En la deficiencia de G6PD los frmacos oxidantes como primaquina agotan el
glutatin reducido y la consiguiente lesin oxidativa da lugar a hemlisis
Otros compuestos son los antibiticas del grupo de las sufamidas, como dapsona
y naftaleno que provocan hemlisis,
Hipertermia maligna
Trastorno autosmico dominante
Se produce una respuesta adversa frente a la administracin de anestsicos de
inhalacin como el halotano y miorrelajantes despolarizantes como la succinil
colina.
Los px desarrollan un cuadro febril mortal con contracciones musculares
sostenidas y un estado de hipercatabolismo asociado por elevacin de la
concentracin de Ca ionizado.
La hipertermia ests asociada a mutaciones en un gen denominado RYR1 que
codifica un canal intercelular de Ca en 50% de los casos pero existen otros 5 loci
que codifican para canales de Ca.
El dantroleno sdico es eficaz para prevenir o reducir la gravedad en esta
respuesta.

Variacin gentica en farmacodinamia y farmacogentica


Tratamiento con warfarina
La warfarina es un anticoagulante oral que se usa para la prevencin de la
tromboembolia
Su mecanismo de accin, es le bloqueo de la enzima epoxido reductasa vitamina
K1, codificada por le gen VKORC1 que acta reduciendo la vit K de manera que
pueda ser reciclada y utilizada en la biosntesis de los factores de la coagulacin.
La vit K es un cofactor esencial para la carboxilacin de las cadenas laterales de
cido glutmico de los factores de coagulacin II, VII, X y IX
El metabolito ms activo de la warfarina sufre desintoxicacin de fase I por
efecto de CYP2C9
Los alelos que causan la deficiencia de este enzima son el 20% de personas
de raza blanca.
Los heterocigotos para los alelos asociados a la deficiencia requieren de
una dosis de warfarina un 20% inferior para mantenimiento del mismo
grado de anticoagulacin.
Otro gen implicado es la VKORC1
Los homocigotos en estos genes requieren de la quinta a sexta parte de la
dosis de warfarina que necesita un homocigoto normal de estos alelos.

Biologa Molecular pgina 40

Abcc8 ES DIABETES NEONATAL, REACCIONA MEJOR CON


SULFONILUREAS
Gen TCF7L2 es el que mas se relaciona con diabetes, es intrnico,
cambia un T es un polimorfismo

Tamz y diagnstico prenatal


jueves, 19 de abril de 2012
09:03 a.m.

Diagnstico prenatal estrictamente est encaminado a la deteccin de alguna patologa especfica


(podemos identificar 2 principales):
Alteraciones cromosmicas (Down -principal)
Enfermedades monognicas (Dusheno o hemofilia)

Un tamiz es para checar en la poblacin general y buscar factores


de riesgo y el diagnstico es para confirmar o corroborar y
establecer si la persona est afectada o no.

TAMIZ
Es una prueba que se encarga de examinar a toda la poblacin, funciona como filtro para no
investigar a todo la poblacin y me quedo con toda la poblacin que tienen mayores riesgos.
Empleando marcadores especficos.
Evita prueba invasivos, es una prueba de rutina
Los marcadores empleados deben de identificar una gran proporcin afectada con un mnimo de
margen de error:
Deben ofrecer un 75% de tasa de deteccin con un 5% de tasa de falsos positivos.
Deben de tener 75% mnimo porque entre mas alto sea el % obtengo la mayor parte de
las personas en riesgo y tengo menos probabilidades que una persona con riesgo se
valla y no la revise.
Deben de ser seguidos por una prueba diagnstica y manejo.
Debe de realizarse en toda mujer embarazada
Los avances del tamiz han hecho posible ofrecen a todas las mujeres embarazada un tamizaje no
invasivo para determinar el riesgo del feto

Tamisaje-> no invasivo y Pruebas dx-> si invasivos

Indicaciones de diagnstico prenatal:


Tienen sus limitaciones porque es prueba dx invasiva:
Edad materna avanzada (solo se hace hasta los 38 aos)
Tamz prenatal positivo
Hallazgos ultrasonogrficos anmalos
Prdida gestacional recurrente
Presencia de alteraciones cromosmicas estructurales en los padres (translocaciones e
inversiones principalmente, porque en estas la mayora son invisibles porque la informacin est
completa pero en desorden y a veces esto no afecta fenotpicamente pero a la hora de formar
gametos esto si tiene repercusiones)
Antecedentes de un hijo con alguna anomala cromosmica (ejemplo si ya tienes un bebe con Sx
de down)
Antecedentes familiares especficos
Riesgo incrementado en ciertos grupos poblacionales.

Inicio y evolucin del tamz prenatal


En los 70s la edad materna fue el primer mtodo de tamizaje (arriba de los 35 aos la curva de
tener down se eleva) -> slo se detectaba el 30% de las personas.
Riesgos de SX de down
Normal (1-700)
< de 20 (1-1000)
40 (1-100)
45 (1-50)
Mayores de 40 aos se les indica directo un estudio diagnstico
Bebes con down 80% nace y los dems se pierden
En los 80s se introdujo un nuevo mtodo -> marcadores bioqumicos "triples marcadores",
elevados o disminuidos en bebes con Sx de down o en muchas otras patologas y aumento la tasa
de deteccin hasta 70% de la poblacin
En los 90s se introdujo el ultrsasonido, translucencia nucal (aumentada hay mayor riesgo) Aumentan tasa de deteccin al 75%
Se incrementaron nuevos marcadores bioqumicos de tercer trimestre y aumentan la tasa de
deteccin hasta 90%
Actualmente tenemos tasa de certeza del 95%

Tamiz de primer trimestre (11-13.6 semanas)


(por esto los embarazos deberan de ser idealmente planeados)
Es el mejor indicador
Son 3 partes:
Ultrasonografa (USG)
Es el ms importante del 1er trimestre
Translucencia nucal fetal-> es el ms importante (acumulo de lquido en la parte de
atrs en la nuca del bebe "entre ms grande mayor riesgo" de sx de dawn, displasias
seas o patologas cardiacas, Turner (terigium coli - muy aumentada).
Es muy especifica mas que de semanas depende de cuanto mide el bebe
(45-84mm) si no mide eso aunque este en las semanas la sacan de las pruebas.
1mm hace la diferencia.
Se percentila -> peso sobre semana de gestacin sobre percentila
Hueso nasal->70% de los casos con Sx de down no tienen hueso nasal visible
Otros: (entre ms pruebas mejor)
Flujo anmalo del ducto venoso (comunicacin entre la vena umbilical a las
coronarias- asegura el flujo a las coronarias a la cabeza) se identifica por onda A
reversa.
Identificar onfalocele (herniacin fisiolgica de las asas intestinales que despus
se regresa; aqu no se vuelve a meter pero estn cubiertas por el ombligo - no
regresan las asas al abdomen -> puede estar relacionado a trisoma 18)
Biologa Molecular pgina 41

Limitantes del primer trimestre:


Encontrar a alguien que de
verdad sepa medir estos
valores.
No cualquier gineclogo(Es lo
ms importante)
No se debe de ofrecer
aislado; es decir slo USG, no
tiene le misma certera
De nada sirve ofrecer el
tamiz si no tienes manera de
comprobar con prueba
diagnstica.

regresan las asas al abdomen -> puede estar relacionado a trisoma 18)
Gastrocticis (salida completa de las asas y estn expuestas al lquido)
Megavejiga
Arterias umbilicales nicas (trisoma 18, alteraciones cardiacas o renales)
Marcadores bioqumicos
Doble marcador ombotex (2 elementos)
B-hcG (fraccin B de la gonadotropina corinica humana):
Elevada para Sx de dawn
PAPP (Protena A plasmtica asociada al embarazo)
Disminuida para Sx de down
Los dos son secretados por la placenta.
Mtodo de invasivo para diagnstico
Biopsia de vellosidades coriales
11 a 12 semanas de gestacin
Transvaginal o transabdominal
Picas corion y obtienes las muestras
Cultivos de 1 y 7 das
Cariotipo/Fish (en el momento) -> cariotipo molecular con sondas de colores
complementarias en ciertas regiones cromosmicas.
Las sondas se mandan principalmente a 18, 13, 21, 3 X y Y
1-2% de falsos positivos -> porque las vellosidades coriales se forman por una
divisin ms temprana y esta formado principalmente por trofoblasto que es una
divisin muy temprana y si no la ves es porque era un mosaico y la mutacin se dio
despus y por lo tanto no lo puedes identificar; pero si tienes todo lo dems
positivo ya no piensas en mosaico porque hay muchas cosas que lo sustentan.
Riesgo de perder el embarazo es de 1:100 (se ofrece a mayores de 45 aos
porque a esta edad tienen mas riesgo de tenerlo un nio con down 1:50)
Se hace un cariotipo (se obtienen cromosomas rompiendo el ncleo), el cariotipo
es lo mejor porque se identifican ms cosas, hasta alteraciones estructurales.

Segundo trimestre
Marcadores bioqumicos (semana 15-20 "19.6")
.fetoprotena
Elevado en defectos de tubo neural abierto (mielomeningocele)
Si la acetilcolinesterasa esta elevada tambin es un defecto de tubo neural
Elevada en efectos de pared abdominal (gastroctisis)
Triple marcador-> ms comn
AFP (a-fetoprotena)
HGC (hormona gonadotropina corinica completa)
Eus (Estriol no conjugado)
Cudruple-> ms completo
Agregas Inhibina A aparte de los de arriba
En esta ya tienes tasa de deteccin de 80%
Identificas: Turner, trisoma 13 casi no la ves, trisomas, molas (no son viables)
Molas:
Completas: 46 cromosomas, pero su aporte slo es paterno. (el aporte paterno
contribuye principalmente del aporte paterno; es grande con crecimiento
hidatiforme y no hay feto porque no hay contribucin materna)
Parciales: 69 cromosomas (triploides) hay dos casos:
Ovulo haploide (23 cromosomas) y dos espermatozoides de 23 -> diandra
"triploidia tipo 1"
HGC elevado
AFP elevada
Ovulo con 46 cromosomas y un solo espermatozoide - " triploidea 2" ->
Diginia (si hay componente fetal en los otros no)
HGC bajo
AFP bajo
Ultrasonografa
USG estructural (todas las mujeres se o deberan de realizar) -> se ve todo
Se usan marcadores (soft markers) -> porque ninguno es lo suficientemente fuerte
para establecer un dx claro como la tranlucencia nucal
Alteraciones del SNC
Alteraciones cardiacas
Focos ecognicos:
Foco que tiene una densidad ultrasonogrfica similar a la del hueso (manchas
blancas que se ven) -> en corazn puede ser cardiopata etc Focos ecognicos intestinales pensamos en:
Hemorragias intestinales
Infeccines (torch)
Fibrosis qustica.
Grosor del pliege nucal (continuacin de la translucencia nucal aumentada)
Ventriculomegalia
Leves
Severas -> infeccin
Quistes de plexo coroides (50% asociado a trisomia 18)
Pilectasia (inflamacin de vas renales)
Fmur y humero
Incrementan los otros riesgos
Humero corto le sigue a riesgo de la translucencia nucal
Fmur y humero corto tiene mayor riesgo para Down
Mtodo invasivo para dx prenatal
Amniocentesis
Se usa a partir de la semana 15 o 16
Riesgo de 1-200 (menos a la biopsia)

Biologa Molecular pgina 42

Si el primer trimestre tiene tamiz positivo


y en el mtodo invasivo positivo ya no haces
de segundo trimestre, si te salen riesgos
muy bajos tampoco lo haces pero si dudas si
lo haces; depende de cada quien.

Limitantes del segundo trimestre:


Se fundamente en la fecha de ltima
menstruacin (se confa en esto, no
como en la primera que miden porque
aqu las mediadas no estn tan
estandarizadas).
Muchos marcadores bioqumicos
estn alterados con peso materno,
fumadores, diabticas e incluso se
alteran por la raza
No sirve de nada si solo usas
marcadores bioqumicos
Es mejor el de primer trimestre
porque es mas preciso e intervienes
de manera temprana.

Riesgo de 1-200 (menos a la biopsia)


No hay falsos positivos porque en el liquido amnitico si son clulas ms cercanas al
feto por descamacin fetal formado por orina fetal
De 10-20 mm de lquido.
Se gua por USG
Sin anestesia (a veces solo tpica)

OTROS:
Coriosintesis
Puncionar directamente el cordn umbilical y obtener sangre fetal directa
Requiere de mucha ms experiencia porque entras ms cerca del feto
Se requiere para un dx certero y hay escases de lquido o en un dx de anemias
(hemolticas, por infeccin por toxoplasma etc)
Cada vez esta ms en desuso porque ahora miden el flujo de la arteria cerebral
media en el bebe y establecen si est anmico.
Biopsia placentaria (no se hacen mucho en Mxico)

Dx preimplantacin

Se hace en un cigoto o blastmero antes de implantarse


Requiere que la pareja sea sometida a tcnicas de reproduccin asistida (in vitro o
tcnica Ix)
Analizarlas antes de implantarlas e implantar slo blastmeros sanos
No se sabe que repercusin tiene quitar clulas en un producto tan joven.
Tamiz preimplantacin
Cariotipo -> 21, 13, 18, X y Y (5 ms importantes)

Cuerpo polar
Meten a la mujer a una hiperestimulacin ovrica y cundo ovula se quedan con el
cuerpo polar y ven como estn los cromosomas.

Medir RNA y DNA fetal y en sangre materna


Buena solucin a los dx invasivos
Se toma sangre materna y detectas DNA y RNA fetal y hacer las pruebas.
Gnero de bebe, determinacin de grupo y Rh, enfermedades autosmicas dominantes
(que no la padezca la mama; porque si la mama no la tiene y encontramos la mutacin
quiere decir que le producto la tiene) y aneuploidias (por PCR en tiempo real y
cuantitativa -> tres picos en vez de dos "triploidias")
Semana 8 y 9
Son fragmentos DNA diferentes a los de la madre
Se hace en EU para sexo y grupo sanguneo en Mxico como investigacin

Asesoramiento gentico

Ofrecerle a la paciente el riesgo que tiene por la edad.


Limitaciones que tiene,
Si el riesgo es alto que le ofreces
Riesgo que tiene por hacer las pruebas.
Alternativas que tiene

Biologa Molecular pgina 43

Conclusin

Tamiz a toda mujer embarazada


Cada trimestre tiene su pruebas dx especficas
Asesoramiento correcto
Saber decidir entre pruebas correctas y claras.
Decisin ms extremas -> terminar el embarazo

Aplicaciones en oncologa
jueves, 26 de abril de 2012
09:07 a.m.

Cncer espordico es ms frecuente que el familiar


Sx de cncer familiar con herencia autosmica dominante y la aparicin del cncer es ms temprana.
Los dos tienen orgenes genticos y ambientales; pero en el familiar los componentes genticos son ms importantes.
Oncogn:
Un proto-oncogen es un gen que tiene una funcin normal dentro de la clula que es promover la proliferacin celular (en desarrollo, crecimiento etc), se lleva a cabo por
medio de la regulacin del ciclo celular. Los proto-oncogenes toman la seal, la transmiten y ejecutan el trabajo para dar el crecimiento celular.
"codifica para las protenas que participan en la cascada de sealizacin que da el crecimiento celular".
Cundo sufren una mutacin se convierten en oncogenes
Mutaciones puntuales "hipermorfa" (incremento de funcin)
La comunicacin se da por fosforilaciones
Muchas mutaciones son de perder la funcin de censar la seal y la protena se queda prendida y sigue diciendo "divdete"
Amplificaciones: Generar muchas copias del mismo gen
Translocaciones:
Cromosoma filadelfia -> leucemia mieloide crnica
Un fragmento del 22 se pasa al 9 y la del 9 al 22
Se forma un gen quimrico hipermrfo, constitutivamente de esta fosforilando (tirosin cinasa fosforilada), sigue mandando seal de divisin.
CNV: variantes en el numero de copias
Es un marcador pronstico (da mal pronostico) -> gen de fusin
Ya hay un medicamento que inhibe su accin
Identificamos la presencia de este cromosoma por retrotranscripcin y luego de PCR
En personas con esta anemia se les puede hacer el trasplante y si despus del trasplante en sus clulas sigues encontrando la lnea de cromosomas filadelfia;
quiere decir que el trasplante no funcion.
Requerimos de 1 proto-oncogenes mutados para llegar a cncer y en los genes supresores de tumores requerimos que los dos estn mutados o que perdamos los dos para
tener cncer.
Gen tumor supresor
Perdidas de funcin por:
Mutaciones puntuales
Deleciones
translocaciones
Inhibicin o degradacin por oncoprotenas virales
Hipermetilacin de islas CpG
Islas CpG: Regin cercana a genes que son islas o regiones ricas en CG; y estas regiones son muy propensas a metilarse
Cundo las CG se metilan se enrollan y aunque halla genes cerca no se expresan porque estn enrollados en la cromatina.
Es una manera de apagar la transcripcin
Si estas islas estn cerca de los gen supresores se inhiben o pierden su funcin y nos da cncer.

Retinoblastoma
Fallas en un gen tumor supresor
Se comprueba la teora del doble gen "se requieren dos mutaciones en los dos alelos para que se presenta la enfermedad"
Hay formas hereditarias y no hereditarias
Hereditarias son ms tempranas y multifocales
La mayora de los casos ya tienen el primer hit de nacimiento y necesitan una mutacin somtica extra para perder el otro hit. Y por eso se presentan ms temprano, porque
necesita menos tiempo para conseguir los dos hits.
Gen APC:
Causa cncer de colon familiar con polipos
Lo causan mutaciones puntuales en este gen (gen tumor supresor)
Sx de Linch:
"genes de reparacin" -> Genes MMR
Este tipo de cncer se da por fallas en genes que codifican para protenas de reparacin de DNA.
Cuando fallan los mecanismos de reparacin se le llama "inestabilidad de microsatlites"
Microsatelites: repetidos pequeos, secuencia de 3 o 4(recuerda -> los minisatelites son ms grandes). Se hace con PCR "anlisis de microsatlites o de microarreglos"
Cuando hay diferentes resultados en la clula de un px; es decir que algunas de las clulas por estos estudios te das cuenta que los genes pesan ms quiere decir que
hay microsatelites.
Perfil de expresin -> conocer que genes se expresan ms y que genes menos
Microarreglos de alta densidad y perfiles de expresin en cncer con valor pronstico.
Buscan perfiles transcripcionales que permitan identificar sub-categoras entre enfermedades muy similares.
Con esto pueden clasificar si el pronostico es mejor o peor en los diferentes pacientes y de esta manera si sabes que a los q ue presentan una mayor densidad en sus
genes tienen peor pronstico inicias con una terapia ms fuerte desde antes.

Variantes dela tipurina metiltransferasa


Pacientes con leucemia son tratados con tiopurina
Hay alelos que tiene actividad baja para esta enzima, metabolizan de manera lenta la tipurina y pueden tener un efecto adverso para las personas que son tratados con tiopurina
y no la pueden degradas bien como los enfermos de leucemia.

Biologa Molecular pgina 44

Gentica y forense
jueves, 03 de mayo de 2012
07:27 a.m.

Gentica forense: La aplicacin de la gentica para la resolucin de casos legales


Perfil de DNA: Caracterizacin de un conjunto de secuencias variables o polimrficas en un individuo y cuya combinacin es
irrepetible en la poblacin.
Aplicaciones:
Identificacin de individuo en medicina forense
Pruebas de paternidad
Identificacin de individuos en desastres en masa
Investigacin de personas desaparecidas
Investigaciones histricas o antropolgicas
Usos militares (bioterrorismo)
Base de datos de ex-convictos.

Primer caso de doble homicidio y violacin resuelto por perfil de DNA en 1986
"huella gnica" -> cdigo de barras particular
Dr. A. Jeffreys -> estudios mediante anlisis serolgicos y fueron excluyendo, pero quedaron 500 sospechosos que no
se pudieron distinguir de estos anlisis y finalmente se logro descubrir al asesino, siendo la primera vez que se uso
DNA.
Fuentes de DNA en gentica forense
Volantes de automviles
Huellas dactilares
Pelo de mascotas en ropa
Aplicadores-laminillas y ms
Saliva que se quede en el cigarrillo, en chicles etc.
Polimorfismos: Usamos principalmente estos dos:
STRs -> microsatelites (1,2 o 3 bases nitrogenadas que se repiten varias veces)
Localizados en el cromosoma Y, para cuando se sospecha de homicidios varones.
Los puedo estudiar por PCR y su producto lo coloco en un gel vertical (electroforesis) y por la diferencia de peso
molecular puedo ver los fragmentos y ver si son homocigotos y el nmero de repetidos de la variante, si no hay
barras en un mismo nivel (mismo peso molecular) se podra decir que no son familiares por no tener secuencias
parecidas.
16 STR y que en todos halla alelos parecidos
Se estudian en alelos muy polimrficos para mayor seguridad.
SNPS -> cambio de una base por otra (biallicos; es decir o A o C)
Podemos usarlos de DNA somtico o de DNA mitocondrial (principalmente para tipo evolutivo).
Los puedo estudiar por PCR- restriccin (si dan un sitio de corte) si no lo dan, se estudian por secuenciacin
Para decir que es tu familiar tienes que estudiar 16 variantes.
CODIS: Dice en las diferentes poblaciones cual es la frecuencia de determinadas variantes. Me va diciendo las variantes
genticas o allicas que hay en las poblaciones y cuales son los STRs mas polimrficos descritos en las diferentes
poblaciones.
Se eligen los mas polimrficos.
Hay diversas pginas que te pueden proporcionar esta informacin
Escoger estos polimorfismos tiene como funcin que por coincidencia al azar seas parecido a otra persona.
Se escoge los mejores STR
Se usan reacciones de PCR y se ponen en anlisis de geles verticales y por el tamao de fragmento sabes si son homocigotos
o heterocigotos y ver si comparten polimorfismo.
TIENEN QUE COMPARTIR ALELIS CON EL MISMO PESO Y COMPROBARLO 16 VECES.
Casi siempre se toma la muestra de sangre o de mucosa oral
Estudio de perfil de DNA -> 99.9% prcticamente 100%
Entre hermanos compartes 50% de compatibilidad
A veces se puede solicitar la muestra de la madre como control.
Con uno que no sea compatible se sugiere que no es el padre pero se requieren dos.
Con uno no porque los polimorfismos tambin tienen cambios o mutaciones pero son muy raros.
A veces se puede hacer por PCR mltiple donde podemos identificar varios, pero cuando se hace el PCR individual es
por que los alelos tienen pesos moleculares parecidos y hay que investigarlos por separados para ver bien la
diferencia.

Casos en donde se confunden muestras en los laboratorio como en cncer de mama, para no volver a tomar la muestra
porque es peligros, es que comparas las muestras con la persona. Duda si la biopsia era de la seora. Se hacen para saber si
la muestra es suya.
Otro caso es cundo a dos hijos les mandan un tejido de su padre por secuestro y se quieren asegurar que el tejido es de
su padre.
No puedo decir si dos personas son hermanos si no tengo muestras paternas o maternas por el 50% de variabilidad.
Si se usa un secuenciador, es ms rpido el resultado (ya no se usa el gel), el fundamento es el mismo. Los resultados los
ves en picos. El aparato detecta las fluorescencias por peso molecular en un gel interno.
Anlisis de PCR en secuenciacin automtica-> no ves base or base como en una secuenciacin normal; el que ves
primero es el de menor peso molecular.
Si es homocigoto se ve un pico sobrelapado.
Biologa Molecular pgina 45

Gentica y
forense
Grabacin de audio iniciada: 07:31 a.m.
jueves, 03 de mayo de 2012

Si es homocigoto se ve un pico sobrelapado.

Se revisan muchas variantes pera estar muy seguro de que no hay errores, se ve la frecuencia de cada variante en
poblacin general; probabilidad de que sean iguales en tantas variables es de <1 en 1013 ,->probabilidad de coincidencia al
azar en poblaciones.
Esccuhar (bao) -> Tambin sirve para identificar si la persona muerta son sus hijos bilgicos.
Ejemplo -> para ver si es su nieto si muestra del padre; lo hacen con to y abuelo por medio del Y porque si no, no es seguro.
Casi siempre usamos STR y a veces usamos los SNPs
Si estudiamos SNPs tenemos que usar 40 variables (se tiene que estudiar un mayor nmero de loci)
Pero tienen menos mutaciones despus
Posibilidad de inferir etnia
Se usa secuenciacin
Son ms caros los estudios.
Genoma mitocondrial:
SNPs no sirven para determinar paternidad
Perfil de DNA por STRs en perro y gato
Sirven para identificar los criminales
Para homicidios y ver quien es el dueo, agresin de animales

Biologa Molecular pgina 46

DNA recombinante
jueves, 03 de mayo de 2012
09:06 a.m.

Creacin de nuevos DNA


Su ventaja es que la persona que disea el estudio conoce el fragmento con el que esta trabajando
Caractersticas:
Fragmentos (endonucleasas/enzimas de restriccin)
Vectores (vehculos o transportes para los fragmentos de DNA)
Bacterianos: Plsmido
Virales: Fago o bacteriofago
Mezcla de ambos: Cosmido
Clonas (copias del primer fragmento de inters)
Replicacin de clulas husped
Aumento de secuencia clonada
Purificacin y anlisis
El DNA clonado puede transcribiese (por RNAm)

ENZIMAS DE RESTRICCIN
Protenas con actividad enzimtica que van a restringir
Defensa contra fagos en bacterias
Generalmente reconocen y cortan en secuencia palidrmicas de 4 a 8 pb.
Los cortes generan un par de extremos cohesivos o romos (iguales).
Maquinaria que uso para cortar el DNA de manera precisa
En este caso se realizan de manera sinttica a partir de las bacterias
Ejemplo:
Eco R5 -> viene de la E. coli que reconoce la secuencia R5
Cada enzima tiene su propia secuencia que va a reconocer.
Son endonucleasas tipo II -> son especificas y reconocen solo una secuencia; las de tipo I no son especficas.
La secuencia palindrmica solo me sirve para reconocer en donde voy a cortar.
VECTORES:
Elementos que transportan el DNA
Este vector tiene que tener extremos complementarios a mi secuencia de DNA (en sus extremos romos o cohesivos)
El plsmido se someta a la misma enzima que el DNA para dejar los extremos exactamente complementarios a los extremos del DNA y se puedan
unir.
Usas un vector en funcin al tamao del producto que ests usando.
Capacidad de sntesis independiente
Tienen 4 caractersticas:
Replicacin independiente junto con el segmento de DNA que transporta.
Debe contener sitios de corte para enzimas de restriccin
Debe de tener algn marcador de seleccin (confirmar que se inserta de manera correcta a mi clula) -> para distinguir las clulas husped que
transportan al vector las que no lo contienen
Fcil de recuperar (porque mi fin es obtener mltiples copias de esto)
Plsmido:
DNA circular bacteriana de doble cadena
Necesita un sitio ori (indica el inicio del sitio de replicacin)
Seleccin: un gen de resistencia a ampicilina y a tetraciclinas y si al meterlo a ampicilina sobrevive quiere decir que mi seleccin fue exitosa.
5000 pares de bases
Bacterifago:
Los virus la usan para insertan su material gentico en una bacteria y usar la maquinaria de una bacteria para aumentar su potencial infeccioso
Insertan fragmento de 30, 000 pares de bases (es lo que cambia mi seleccin entre usar plsmido o bacterifago)
Gen COS:
Gen que le confiere mayor capacidad de regulacin
podemos trabajar con secuencias de 50, 000 a 70, 000 pares de bases
Construccin molecular:
Gen SRY (Brazo corto del cromosoma Y) -> identificar sexo, permite la expresin de otros genes que conducen la diferenciacin de la gnada.
Lo amplifico por PCR, purifico el producto de DNA y lo insertamos en un vector (P-traget); tiene un promotor, un gen de resistencia a la
ampicilina y mi secuencia de DNA insertada.
Si lo insertamos a un ratn en vida fetal con una o dos divisiones para que todas las clulas tengan esta variante, tendr XX, pero su fenotipo y
funcionalidad ser de un XY.
Sx de varn XX
Transfeccin: Insertar mi construccin a una clula eucarionte.
Animales transgnicos:
Se hace en las etapas iniciales del cigoto cundo estn en proncleo para que todas las divisiones contengan mi material insertado.
KO -> Ej-> mi ratn Knock out le quito su transportador de colesterol -> se ven fenotpicamente o si le insertas para la hormona el crecimiento ese
ratn de la misma camada crece ms
Las medusas en su genoma tienen una protena verde fluorescente (VEDFLUORECENTE) -> gen GFP, lo obtuvieron, la purificaron por PCR y la
podemos insertar en un vector y tengo mi construccin molecular con el vector elegido; lo inserto en un modelo de un ratn y los vuelvo
fluorescentes. (1986).
Ej -> WNT4 -> se inserta en un plsmido que adems tiene un GFP, lo sumamos porque se crea que la WNT4 era para la creacin del rin, al meterlo
juntos se expresan en el mismo lugar y al meterlo el rin fluores y se dieron cuenta que si serva para el desarrollo del rin.
Plantas transgnicas:
Protegen a los cultivos de parasitos.
No se ha usado por que no se ha confirmado que no causa daos a los humanos al comrsela.

Protena C humana
Protena del plasma
Factor regulador de la coagulacin sangunea
Existen pacientes con deficiencia competa de la protena
Tx -> protena C exgena

Biologa Molecular pgina 47

DNA
recombina...
Grabacin de audio
iniciada: 09:09 a.m. jueves,
03 de mayo de 2012

Tx -> protena C exgena


Para crearla uso un vector murino o porcino; lo inserto en el proncleo de un embrin cerdo femenino y obtengo un animal diseado para producir
leche con protena C para el humano. 1gr por litro de leche y eso es 200 veces ms que en la sangre humana; entonces la purifico y la inserto.

Proceso:
Metes plsmidos ya con tu DNA insertado y te aseguras de que halla una mayor proporcin para que te asegures de que rodean a la clula, aumentas
calor para crear poro en la membrana celular y que por azar se introduzcan algunos plsmidos, despus nutres a la clula y se corrigen a los poros y
ya adentro los plsmidos usan la maquinaria de la clula para replicarse y formar protenas en el citoplasma y se empiezan a acumular y despus los
libera.
Producto de RNA recombinante:
Anticoagulantes
Factores sanguneos
Factores de crecimiento
Insulina
Eritropoyetina
Anticuerpos monoclonales
Superxido dismutasa
Vacunas
Factores estimuladores de colonias
Interferones

Ventajas:
Eliminar infecciones
Evitar formacin de anticuerpos.
Obtencin en mayor cantidad de un producto
Costo menor que otros mtodos para purificacin de protenas
Biblioteca de DNA
Genoma
Cromosoma
Genes transcripcionalmente activos
Almacenas genomas de una especie en peligros de extincin
Disear un cromosoma artificial bacteriano para meterle mucho ms informacin hasta 300Kb.
Si le quiero meter ms informacin me voy a ala levadura que tiene un genoma mayor (1000-2000 kb)
BACS y YACS-> Cromosomas artificiales bacterianos (BACs) y de levaduras (YACs)
Desarrollo a finales de 90s
BACs: similares a plsmidos pero con insertos de hasta 300kb, usados en construccin de mapas de alta resolucin del genoma humano
YACs: son los vectores con la mayor capacidad de clonacin y asilamiento de fragmentos de 1000-2000 kb
Oveja dolly (hay mas animales clonados)

Biologa Molecular pgina 48

Biologa molecular en infectologa


jueves, 17 de mayo de 2012
08:49 a.m.

Biologa
molecular ...

Su principal funcin es para dx infecciones intrahospitalarias.

Fuentes de DNA en dx infectolgico

Grabacin de audio iniciada: 09:27 a.m. jueves, 17 de mayo de 2012

Biopsias
Cutneas, linfonodos, heptica)
LCR (ejemplo un bebe con infeccin que presente sntomas que indican que se encuentra en el LCR, como vmito en
proyectil)
Muestras por exfoliacin
Sangre
Derrames pleural, pericrdico; ascitis
Lquido amnitico
Esputo/quimo
Heces fecales/orina
Exudados farngeos
Lavas bronquioalveolares.
Microorganismos:
Genoma con DNA o RNA (algunos virus); si se sospecha de virus se analiza el RNA

Ventajas de dx molecular en infectologa


Rapidez (< 4 horas)
Alta sensibilidad y especificidad (95-100%, incluso de tipo o cepa)
Cultivos -> muy escasa especificidad
Datos adicionales:
Resistencia (por plasmidos o por mutacin de los microorganismos)
Cepas
Carga infectolgica
Seguimiento
Ejemplo, si le doy un retroviral y ver que tanto le esta funcionando.
Simplificacin en la manipulacin y obtencin de la muestra
Alto volumen de muestreo (puedo usar muestras guardadas)
Economa
Estudios retrospectivos (VPH)
Uso rutinario en bancos de sangre en pases desarrollados
En epidemias se pueden tomar muchas muestras al mismo tiempo por medio de microarreglo se analizan mltiples muestras
y se abaratan los costos.
Comparar con muestras tomadas previamente si es la misma cepa o en que cambio por razones como el mal uso de los
antibiticos.

Obtener DNA y amplificarlo para analizarlo:


"PCR convencional" -> se requieren geles.
" PCR- tiempo real" para cuantificar y saber carga viral

Pruebas dx:

PCR y variantes
PCR en tiempo real: cuantificacin carga viral, diagnstica.
RT-PCR: cuantificacin carga vira, diagnstica. A partir de RNA
PCR anidado: diagnstico, genotipificacin (serotipos, resistencias)
Es muy sensible que detecta una clula cancerosa en 1000 normales, se usa en oncologa para detectar clulas cancerosas. Pones PCR normal
con oligos y ese producto obtenido de la PCR le vuelvo hacer una PCR para hacerlo ms especfico
PCR mltiple: Diagnstica y genotipificacin
Tipificar varios virus a la vez; como en papiloma que hay varios, los ms representativos es 17 y 18; los oligos que uso me deben permitir
diferenciar uno de otro por peso molecular.
PCR y restriccin: Diagnstica y genotipificacin
Se usa para ver si son sensibles o no a un medicamento
PCR y SSCP: Deteccin de nuevos genotipos, resistencia.
No examen
PCR - secuenciacin automatizada: Genotipificacin, resistencia, ribotipificacin.
Todo el genoma de un microorganismo. Ver si cambio o se modifico (mut), ver si es resistente a nuevos medicamentos

Consideraciones en el dx
Sensibilidad de la prueba -> # de organismos o molculas blanco insuficientes para deteccin
Buscas la prueba que te de 100% de deteccin, las de 50% no funcionan
Contaminacin -> falsos positivos
Buscar un laboratorio seguro, evitar que la misma flora sea la que estas multiplicando
Equipo y reas especiales
Validacin de la prueba dx en cada zona
Calidad de la muestra: purificacin diferencial
Deteccin de agentes causales de uretritis no gonocccica y EPI
Neisseria gonorrhoeae
Chlamydia: trachomatis, psittaci, pneumoniae
Mycoplasma: hominie
Ureoplasma
Distingues no de otro porque tienes oligos especiales
Extraccin de DNA -> PCR (Con 4 pares de primers representantes de los microorganismos sospechosos; puede haber

Biologa Molecular pgina 49

- - - - fragmento control

Chlamydia: trachomatis, psittaci, pneumoniae


Mycoplasma: hominie
Ureoplasma
Distingues no de otro porque tienes oligos especiales
Extraccin de DNA -> PCR (Con 4 pares de primers representantes de los microorganismos sospechosos; puede haber
infecciones mixtas y por lo tanto se amplificaron 2) -> interpretacin de resultados por electroforesis
Dx molecular de enfermedades de transmisin sexual: PCR mltiple
Ejemplo 4 px con uretritris, les extraes DNA de las secreciones y haces electroforesis, en el control todos los px
tienen banda, y de ah va a haber banda en el px que tenga cada microorganismo segn el fragmento. Amplifica por PCR
en el que presenta el microorganismo.
HPV
La infeccin en la mayora de los casos, no evolucionan a lesiones malignas y si esto ocurre, el lapso transcurrido desde
la infeccin y el CaCU, puede ser hasta de 40 aos (en la prueba te dicen hasta que tipo de papiloma es -> vienen
incluidos en el papanicolao) ->PCR
Hay HPV ya comerciales para detectar.
En Mxico una de las causas ms importante de muerte es por Hepatitis B por tatuajes: sirve para detectar el tipo; si
es B se les monitorea por riesgo a cncer.

Ciclo de VIH

Se usa mucho.
Monitoreas el VIH a travs de tiempo real o RT-PCR (ven carga viral)
Para ver todo el genoma usas secuenciacin (no usas GWAS porque es muy cara y el genoma del VIH es muy chico)
Esta sustituyendo a ELISA porque es ms sensible e incluso mas barato, ELISA tiene ms falsos-positivos
Puedo detectar el nmero de copias del DNA viral (es muy sensible detecta desde 1 copia)
Extraccin de RNA -> RT-PCR en tiempo real
Amplicones y sondas para:
InfA: Genrico de influenza
SW-1: Influenza "porcina"
SW-H1: gen hemaglutinina epidmico
RNAasa: control endgeno humano
SNPS -> sondas en alelos 1 y 2 y veo si flourese o no fluorese, los distingues por la 3ra sonda.
Puedes monitorear se ya hay cepas resistentes y a que son resistentes.
Neuroinfecciones: (meningoencefalitis)
Verdadera urgencia mdica
Origen: bacteriana o viral
Datos clnicos: A veces no puedes distinguir entre los microorganismos para empezar con tx especfico.
Antes se llegaba a hacer hasta biopsia cerebral
Se usa PCR- mltiple para detectar entre los tipos de agentes que causan neuroinfecciones.
Px con sepsis ya hay kits que incluyen bacterias y hongos para saber que agente es.

Biologa Molecular pgina 50

- - - - - fragmento control
- Mycoplasma
Gonorrhea

Diagnstico prenatal molecular


jueves, 24 de mayo de 2012
07:36 a.m.

En estos procedimientos, cundo tienes la muestra lo que ms se usa es el cariotipo

Diagnstico
prenatal m...
Grabacin de audio iniciada: 07:53 a.m. jueves, 24 de mayo de 2012

Ventajas:

Requiere poco DNA


>50% de Liquido Amnitico se puede destinar a estadio citogentico y bioqumico
Se usan 5ml de lquido amnitico para obtener su DNA, lo dems se usa para observar los cromosomas en las clulas que se obtienen
No necesito cultivar las clulas para obtener DNA que tarda mucho
En vellosidades coriales usamos una parte para analizar cromosomas y bioqumicas; y con la otra parte obtenemos DNA.
Su ventaja es que la puedo hacer ms temprano pero su riesgo de perdida del feto es de 2% y de amniocentesis es de 1%.

Desventajas:

Prdida fetal
Infecciones
Malformaciones
Posibilidad elevada de contaminacin con DNA materno decidual en la biopsia de vellosidades coriales porque puedes obtener DNA de la madre.
Mosaicismo necesitan confirmarse por amniocentesis.

Casi siempre cuando se hacen los estudios moleculares es porque hay antecedentes
Se usa la PCR y sus variantes
Sx de Down- 1 de cada 700 nacidos
Por eso el estudio molecular esta ms enfocado a esto que a enfermedades mendelianas que son ms raras.

El 89% de productos con cromosomopata que llegan a trmino, esta conformado por las trisomas 13, 18 y 21.
Resuelve ansiedad materna (resultados en 48 horas)
Se usa electroforesis capilar donde no necesitas cultivar las clulas y por eso el resultado lo obtienes en dos das y no en 15 para esperar el cultivo.
Se amplifica por PCR un porcin polimrfica. (DNA microsatlite)
Si tengo 3 picos sobrelapados -> "Trisoma 21"
El Fish y tcnicas de DNA microsatelite solo analiza las trisomas 21, 13 y 18 por eso esperas al cariotipo para ver todos los cromosomas.
Obtienes lquido amnitico, haces PCR mltiple usando oligos; 11 STRs para 11, 13 y 21, el producto de la PCR se separa en un capilar y se pasan por un laser donde
identificas tu producto porque se separa por tamao y dan fluorescencia.
Si tengo dos picos en el gen que esta en el X significa que es una mujer; si fuera hombre se vera uno nadamas.
Si es patolgico se ven 3 picos.
Tambin lo puedes ver en PCR tiempo real; si tienes un triple dosis se tiene una elevacin exponencial antes. Mi punto CT esta adelantado.
Se compara los cromosomas 18, 21 y 13, todas tienen que estar sobrelapadas en la curva de PCR tiempo real porque tienen la misma cantidad gnica, si una se separa es que
hay trisoma o monosoma dependiendo de donde estn.

Indicacin absoluta:
Historia familiar de trastorno monogentico
Directo:
Caracterizar la mutacin y sexo del producto
Mtodo con certeza diagnstica prcticamente del 100%
Si ya hay antecedentes, ya se que estudio se le puede ofrecer.
Atrofias musculo-espinales -> si lo dx prenatal no se niega la interrupcin del embarazo porque el bebe se la va a pasar hospitalizado y no sobreviven ms de 1 ao.
Son hipotnicos, las neuronas de las hasta anteriores tienen apoptosis.
98% es perdida de informacin del exn 7 y 8
Identificas PCR y restriccin, porque hay un pseudogen (distingues entre gen y pseudogen)
PCR real para ver portadores
Nio con delecin de exn 7 y 8 observas el pseudogen

Enfermedad puntual
Secuenciacin de todo el gen para encontrar la mutacin responsable; ya que lo encontr solo amplifico veo la parte mutada.
Si a partir de un punto hay dos pico sobrelapados es heterocigoto se debe a delecin e insercin
Esclerosis tuberosa:
Expresividad variable
Autosmica dominante
Si hay mucha variabilidad usamos Secuenciacin
Slo hay dos genes responsables
Duchenne
Delecin -> estudio de PCR para definir sexo porque solo se afectan hombres y despus PCR mltiple
Lo ms comn es diagnstico en cromosomas y a veces en mendelianas.
Para paternidad -> PCR y electroforesis.

PCR mltiple -> solo deleciones


GWAS -> lo hago en cncer o enfermedades multifactoriales.

Biologa Molecular pgina 51

Terapia Gnica
jueves, 24 de mayo de 2012
09:05 a.m.

Terapia
Gnica

Modificacin gentica directa de la clula del paciente para lograr un objetivo teraputico

Generalidades:
Conocimiento insuficiente acerca del tratamiento de las enfermedades genticas debido a factores:
1. Genes no identificados o desconocidos de la patogenia
Locus desconocido y genes con mecanismo fisiopatolgico inadecuado
2. Afectacin FETAL previa al diagnstico
Se puede prever en familiares con antecedentes y con pruebas de tamizaje en parejas con riesgo
3. Fenotipos graves son menos susceptibles de respuesta al tratamiento
Por ausencia de protena codificada, protena alterada sin actividad residual
Padecimientos menos graves -> protena residual en grado suficiente para conseguir efecto teraputico.

TRATAMIENTO GENTICOS (no es terapia gnica)


Tratamiento mdico prenatal:
Ejemplos:
Deficiencia de biotinidasa -> se les administra biotina materna
Aciduria metilmalnica con respuesta a vit B12 -> Vitamina B12 materna
HSC (Hiperplasia suprarrenal congnita)-> dexametasona
Una mujer que ya tubo esto, en el siguiente embarazo se le da obligatoriamente dexametasona
Tratamiento quirrgica prenatal
Ejemplos:
Obstruccin urinaria por clvulas uretrales (hidronefrosis) -> catter percutaneo o vesicostoma
Hernia diafragmtica (hipoplasia pulmonar) -> Oclusin traqueal por una sonda de globo
Sx de transfusin entre gemelos -> Ablacin lser (cx en tero) fetoscopa de los vasos placentarios comunicantes (Es muy difcil)

Generalidades en terapia gnica


Mejorar de la salud de un paciente mediante la correccin de un fenotipo mutante -> para curar el px o evitar que siga en evolucin de la enfermedad
Ejemplo: Fibrosis qustica
Autosmica recesiva, principalmente afecta a nivel pulmonar
Tx dar aerosol citico o liposomica, sustitucin del producto anmalo o inexistente; aplicacin de muestras: aporte de gen CFT R en el epitelio de la va respiratoria de un px
con fibrosis qustica
Ejemplo 2:
El gen acta sobre tejido adyacente o alejados
El producto acta sobre el tejido adyacente
Aplicacin de muestras: Implantacin de clulas o inyeccin de DNA dan lugar a la produccin de factores de crecimientos asil as en angio
Estrategias:
Lnea germinal: Modificacin transmisible permanente: EJ: gameto, cigoto o embrin
Clulas somticas: Modificar clulas o tejidos especficos del paciente en una forma limitada
Restitucin gnica: Reemplazar gen mutante por copia funcional o correccin de mutacin in situ. Ej: Padecimientos de gananci a fx
Suplementacin gnica: Proporcionar copia funcional de gen defectuoso. Ej. Padecimientos con prdida de fx (FQ, cncer)
Inhibicin dirgida de la expresin gnica: Inhibicin de fx especiales del patgeno. Silencia OG. Amortiguar respuestas autoi nmunes. Silenciar alelo mutante con
ganancia de fx
Distribucin dirigida a clulas especficas: Cncer "quimioterapia"

Tipos: ex vivo - in vivo


Ex vivo:

Transferencia de genes clonados al interior de clulas cultivadas


Se seleccionan clulas transformadas satisfactoriamente, se expanden por cultivo y se restituyen al paciente
Clulas autlogas (para evitar rechazo)
Clulas accesibles para extraccin y pueden inducirse para injertarse y sobrevivir despus de restitucin
Sist hematopoytico / cel . Piel

In vivo
Tejidos que no son posibles cultivar clulas de receptor en cantidad suficiente
Vector directo al tejido blanco o IV
xito: depende de eficiencia de transferencia y expresin gnica.
Diseo de vectores:
Integracin cromosmica:
Expresin gnica prolongada
Gen en cromosoma de clula husped
Replicacin de vector con divisin celular
Integracin aleatoria en diferentes clulas
Expresin vector impredecible
Activacin otros genes
Episomas extracromosmicos
Partcula gentica que existe de manea autnoma en el citoplasma de clula o bacteria
Duracin de expresin limitada
Dilucin con crecimiento de poblacin celular
Tx repetidos.
Hay dos tipos:
No virales:
Liposomas
Inyeccin directa y bombardeo de partculas
Endocitosis mediada por receptor
Virales
Adenovirus
Vaccina virus
Retro virus
Pox virus
Virus asociado a adenovirus

Biologa Molecular pgina 52

Virus asociado a adenovirus

NO VIRALES
Liposomas:
Vesculas sintticas (lpidos + sol acuosa). Ej: fosfolpidos
DNA se empaca in vitro con liposomas
Se utiliza para transferencia gnica a tejido in vivo
Poseen carga
Catines: sup (+) y enlazan DNA exterior
Aninicos: sup (-) y enlazan DNA interior
Ventajas:
Fcil de preparas DNA/lpido
No lmite de tamao de DNA
Desventajas:
Baja eficiencia transferencia
DNA diseada no se integra al cromosmico
Expresin transitorios de genes
Inyeccin directa /bombardeo de partculas
Inyeccin directa DNA con jeringas directamente en el msculo
Ej: DMD (murinos)
Bombardeo de partculas "pistola de genes"
Pelotitas de metal cubiertas con DNA -> disparo dentro de clulas
til en tejidos que no proliferan
Mala eficacia de transferencia gnica y no se integran de forma estable el DNA inyecta
Todo en modelos murinos
Endocitosis mediada por receptor
DNA acoplado a una molcula blanco que se enlaza a receptor celular e induce endocitosis -> Transferencia DNA al interior de la clula
Ej: clulas hematopoyeticas y receptor de trasnferinas
Transferencia gnica alta
No diseado para la integracin de genes transferidos

VIRALES
Oncorretrovirales
Virus RNA/Transcriptasa reversa
Complejo de preintegracin
Transferir DNA al interior de la clula
Slo pueden infectar clulas en divisin
No en neuronas
Si para tx cncer
Habilidad para transformar clulas
Mutageneis insercional
Capacidad de DNA baja de 8kb -> no sirven mucho
Adenovirus:
Virus DNA
Ventaja:
Ttulos altos de expresin y transduccin eficiente a clulas en divisin y sin divisin
Desventaja
Inmunogenecidad:
En 1999 JESSE Gelsinger muri dos das despus de recibir AV por inyeccin intraheptica en estudio de tx gnica para OTC (tu bo reaccin inmune)
Expresin gnica corto tiempo -> repetir administracin -> exacerba respuesta inmune
Capacidad de 35 kb
Virus adenorrelacionados (AAV)
Mas usados en protocolos
Virus DNA cadena nica no patgenos
Dependen de coinfeccin por virus colaborador para replicarse
Avv humano no modificado se integra en DNA cromosmico
VENTAJAS:
Expresin a largo plazo
Sin Rx mutagneis insercional (problema retrovirus)
Infecta clulas divisin / quiescentes
Desventajas:
Ttulo vrico muy bajo
Limitacin de 4.5 kb
Lentivirus
Casi no se usan
Retrovirus que infecta clulas que no se dividen
Integracin en cromosoma en forma aleatoria
Ventaja:
Expresin gnica a largo plazo
Desventaja:
Mutagneis insercional
HIV es la base de la mayor parte de vectores lentivirales
Rx de replicacin del virus
Se elimino genes innecesarios
Conserva capacidad de infectar clulas que no se dividen
Virus herpes simple
Trpicos para SNC
DNA doble cadena (80 genes)
Infx lactante en ganglios sensoriales
Elementos extracoromosmicos no integrados
Expresin a largo plazo (diseminacin red sinptica)
Aporte de genes al interior de neuronas -> tx Parkinson y tumores SNC

Biologa Molecular pgina 53

Aporte de genes al interior de neuronas -> tx Parkinson y tumores SNC


MENOS DE 30 KB

Requisitos esenciales
Identidad del defecto molculas:
Conocer el gen afectado o al menos fundamento bioqumico
Copia funcional del gen
Clon del DNA complementario (Cdna) del gen o el propio gen
Si el gen es grande -> versin funcional (eliminacin de los componentes no esenciales para disminuir el tamao)
Conocer mecanismo fisiopatologico
Para que la trasferencia del gen: corregir proceso patolgico, prevenir, retrasar o revertir las alteraciones fenotipicas.
Mutaciones con perdida funcional: sustitucin del gen funcional
Dominantes negativas: Inactivacin gen mutante o sis productos
Consciente riesgo-beneficio favorable:
Favorable tx alternativo
Diana celular aprobada:
Clula diana debe tener una sobrevida prolongada o una buena potencia de replicacin in vivo y que es accesible para introduc cin directa del gen, es decir copias
suficientes para tener efecto teraputico
Evidencia de eficacia y seguridad:
Demostracin que el vector y la construccin teraputica
Efectivos y seguros (Animales)
Aprobacin de la normativa

Riesgos de la terapia gnica:

Respuesta adversa frecuente al vector o a la combinacin vector -> enfermedad


Deben ser estudiados sobre animales de experimentacin y ensayos clnicos de manera preliminar
Respuesta inmunitaria adversa -> respuesta catablica del paciente
Mutogenesis de insercin -> tumores malignos
Gen se integra al RNA del paciente y activa en protoncogen o altera GTS (inmunodeficiencia ligada a la X)
Inactivacin insersional de un gen esencial
Mutaciones infrecuentes y solo destruyen clulas aisladas
Excepcin a lnea celular germinal
Riesgoa ceptado en quimioterapia por beneficios teraputicos
Protocolos de terapia gnica primero cncer, monogenicas y de enfermedades infecciosas

Inmunodeficiencia combinada severa


Paciente masculino
Deficiencia de desaminasa de adenosina (ADA)
Transfeccin ex vivo de linfocitos T
Con vector retro viral que contena un gen de ADA funcional
Se expandi en cultivo
Se restituy al paciente
Se expandi teraputicamente a otros px (10-12 tratamientos por individuo}9
Varios con mejoras clnicas notables
Ninguno dejo de recibir su terapia enzimtica -> incierta a magnitud de mejora

Inmunodeficiencia combinada ligada X


Primer xito indudable de terapia gnica (monoterapia)
Tx ex vivo
Uso de vector retroviral que codificaba cadena y (yc) del gen receptor de citocina IL2R
Incubacin por 3 das clulas MO que expresan CD34 CON VECTOR
Se restituyeron al px
9/11 tratados se curaron y llevaron vida normal
2/9 desarrollaron leucemia -> activacin oncogen LMO2 (se suspendieron protocolos)

Fibrosis qustica

De las ms susceptibles a teraputica gnica


Falta de cloruro codificada por CFTR (regulador de conductancia transmembranal fibrosis qustica sobre todo en epitelio respi ratorio)
Aporte gnico en tejido especfico: inhalador de aerosol
Adenovirus -> infeccin natural a clulas pulmonares que no se dividen, dosis altas -> reacciones inflamatorias -> muerte de Jesse Gelsinger
Liposomas AAV (4-5 estudios)
Problema: Barrera fsica de moco y glucocalix
Ideal: clulas madre (c. epiteliales viven 120d)
Nuevas estrategias: potenciadores y correctores

Distrofia muscular de Duchenne


Estudios muestran que sera benfico restituir 20% del gen
Problemas a considerar:
Tamao grande del gen de la distrofina (2.4Mb)
Llevarlo a msculo esqueltico y cardiaco
El c DNA es grande para mucho vectores
Estrategias:
Paciente con delecin E17-48 (46%) codificacin solo present DMD
Se preparo minigen 6.3 kb para vectores adenovirales y retrovirales
Uso de promotor especfico para evitar reacciones inmunitarias
Retos
Llevar al interior de corazn y diafragma.
En Duchen confinados a silla a los 12 y de Beacker despus de los 12
Trasplante de mioblastos en msculos de nios afectados
Algunos mostraron fibras muculares positivas de distrofina
Ninguno con mejora clnica
Pb clulas madre mediante TMO
Capaces de migrar a msculos
Oligonucleotidos antisentido.
Estrategias actuales:
Biologa Molecular pgina 54

Estrategias actuales:
Ologonucleotidos antisentidos
Ncleotidos modificados de RNA o DNA que hibridan con una secuencia de DNA o RNA blanco
Estos pueden unirse a ciertos exones y excitar el splicing en el RNAm
Estrategias para evitar la accin de la H-RNA -asa

Hemofilia B
Deficiencia del factor IX
Enfermedad ligada al X recesiva
Por delecin o mutacin en gen del factor IX coagulacin
Tx: medico: infusin de protena del factor IX -> no efectivo completamente por desarrollo de anticuerpos
Tx gnico: Vectores con AAV diseados:
Expresar gen del factor IX
Inyeccin directa del vector del msculo o arteria heptica
IM: Se ha demostrado evidencia clara sin toxicidad pero con resultado mnimo con niveles subterapeuticos del factor IX

Terapia de cncer
El 64% de la investigacin en terapia gnica se realiza en cncer
Genes suicidas: genes que tiene prodroga que no es txica pero cuando se convierte a droga es txica y destruye la clula
Hay dos:
Terapia con blanco inmunolgico
Genes inmunoestimulantes
Genes de citocinas
Vacunas
Vacunas celulares
Manipulacin ex vivo de clulas presentadoras de antgenos
Vacunas gnicas
Inyeccin directa de genes que codifican antgenos
Terapia con blanco molecular
Genes suicidas
Antioncogenes
Genes supresor de tumores

Suplementar genes que requiero


Inactivacin gnica del oncogen activado
Manipulacin gnica de clulas tumorales para desencadenar apoptosis
Modificar clulas tumorales -> ms antignicas -> sistema inmune destruye al tumor
Uso de virus oncolticos manipulados por ingeniera -> destruccin selectiva
Modificacin de celular cancerosas -> convertir un profarmaco no toxico en txico que lo destruya.

Amaurosis congnita de Leber


Entidad autosmica recesiva
Distrofia de retina
Ceguera al nacimiento
Ausencia de respuesta en electroretinograma (revisa la funcin de conos y bastones)
14 genes involucrados -> 60% de casos ACL
Codifican protenas de retina: vas desarrollo fotoreceptores - restablecimiento de Vitamina A en ciclo retinoide.
Gen RPE65 -> Restauracin en 2 grupos humanos (n=6)
Px que se pican lo ojos como estimulacin
AAV
Mejoramiento agudeza visual
No datos inflamatorios oculares o sistmicos.
Causa mas frecuente de ceguera a nivel mundial , los px van perdiendo la vista de la periferia hacia el centro y primero la p ierden de noche porque van perdiendo los
bastones que son los que dan la adaptacin en la noche, inicia a los 30 -40 aos

Biologa Molecular pgina 55

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