LAPORAN AMALI 6

Tajuk

: Mengukur Diversiti Genetik

Tujuan

: Untuk mengkaji dan mengukur diversiti genetik.

Pengenalan :
Berdasarkan kumpulan individu dari spesies yang sama seperti manusia-manusia,
kucing-kucing dan anjing-anjing, kita mudah menyatakan bahawa kesemua mereka
tidak serupa. Kromosom-kromosom terdiri daripada kumpulan gen-gen, dan ekspresi
gen-gen luaran ( fenotip individu ) yang boleh dibezakan. Ini kerana gen-gen
mempunyai bentuk alternative yang dipanggil alel-alel dan perbezaan luaran yang
diperhatikan, ini disebabkan oleh variasi di mana alel hadir dalam make-up genetik
sesuatu individu. Gene pool spesies ialah koleksi kesemua alel-alel gen yang
berkemungkinan dalam sesuatu spesies. Ahli-ahli pemuliharaan ekologi tidak boleh
mengekalkan kesemua kepelbagaian genetik dalam spesies-spesies tetapi mereka
cuba mengekalkan kepelbagaian genetik antara individu-individu dalam populasi
asal haiwan dan tumbuhan.
Genetik adalah sains gen, keturunan, dan perubahan dalam
organisma hidup. Ia membincangkan struktur molekul dan fungsi gen,
dengan tingkah laku gen dalam konteks sel atau organisma, dengan corak
warisan dari ibu bapa kepada anak-anak, dan dengan pengagihan gen,
variasi dan perubahan dalam populasi. Memandangkan bahawa gen
sejagat kepada organisma hidup, genetik boleh digunakan untuk mengkaji
semua sistem hidup, dari virus dan bakteria, melalui tumbuh-tumbuhan
dan haiwan domestik, kepada manusia. Walaupun genetik memainkan
peranan besar dalam penampilan dan tingkah laku organisma, ia adalah
kombinasi genetik dengan organisma yang menentukan keputusan
muktamad. Sebagai contoh, gen memainkan peranan dalam menentukan
saiz organisma, pemakanan dan kesihatan, yang mana ia boleh memberi
kesan yang besar terhadap perkara ini.
Kini bidang genetik boleh dibahagikan kepada dua peringkat:
genetik klasik dan genetik molekul. Sebahagian besar genetik klasik
merupakan sumbangan ujikaji Gregor Mendel dan penemuan gen-gen
terangkai. Genetik molekul terbit daripada penemuan kod genetik dan
perkembangan teknik pengklonan. Walaupun genetik molekul lebih

berguna dari segi aplikasinya dalam perubatan dan forensik, genetik

klasik masih diguna pakai.
Tugasan

:
Anda bertugas untuk sebuah agensi pemuliharaan dan berdepan
dengan satu krisis: sebuah kawasan dengan enam jenis tanah lembap
yang berbeza, yang diketahui hanya tanah bagi dua jenis orkid liar
yang sedang dibangunkan menjadi kawasan perindustrian.Organisasi
anda hanya mampu membeli dan menjaga empat tanah sahaja. Mana
satukah antara keenam-enam tanah yang harus dijaga? Dua
daripadanya ialah tanah lembap, tiga lagi adalah paya bersama
dengan populasi Pterostylis isozymus. Tiga jenis paya yang lain
merupakan satu-satunya populasi yang paling berkait rapat tetapi
spesies yang jauh Pterostylis polyzymous tinggal.Anda menghantar
sampel daun ke sebuah kolej untuk analisa genetik, dan menerima
data seperti di bawah, iaitu di dalam bentuk gel protien elektroforesis
untuk satu lokus allozyme yang polimorfik bagi kedua-dua spesies.
Lokus tersebut mempunyai dua alel. `Cepat` dan `Pelahan` kerana
mereka bergerak pada kadar yang berbeza merentasi gel tersebut, di
mana alel yang cepat berada di bawah alel yang perlahan.
Langkah 1 : Untuk mengukur bagaimana variasi genetik tersebar di
antara populasi, frekuensi alel perlu dikenalpasti di dalam setiap
populasi. Lokus alozyme mempunyai dua bentuk. Identiti bagi setiap
alel di dalam setiap individu ditunjukkan melalui banding pattern yang
ada di dalam gel. Sebagai contoh,individu pertama di baris pertama di
dalam gel pertama adalah heterozygous, di mana dua alel tersebut
adalah berbeza dan diwakili oleh simbol (+) bagi kedua-dua `cepat`
dan `pelahan`. Sebaliknya, individu di baris kedua ialah homozygous,
yang mempunyai satu band mewakili dua alel perlahan.

Tentukan frekuansi alel di dalam setiap populasi bagi alel cepat

(p) dan alel perlahan (q) dengan megira bilangan alel bagi
individu di dalam setiap populasi (homozygote mempunyai dua
alel yang sama, oleh itu anda perlu mengira + dua kali ganda,
dan jumlah bagi alel bagi 15 individu tersebut ialah 2 x 15 = 30).
Bahagikan jumlah tersebut dengan jumlah alel yang hadir dalam
populasi tersebut(sentiasa sama dengan dua kali ganda
bilangan individu)

Pterostylis isozymus

Pelaha
n
Cepat

Populasi 1(individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)

Pelaha
n
Cepat

+
+

Pelaha
n
Cepat

Pelaha
n
Cepat

+
+

Pelaha

1
3
+

14

15

Jumlah

23

10

1
3
+

14

11 1
2
+

+
+

10

11 1
2

1
3

+
+

15

Jumlah
12

18

14

15

+
+

Jumlah
4

26

Populasi 1(individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)

+
+

Pterostylis polyzymus
1

11 1
2
+

Populasi 3(individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)

Pterostylis polyzymus
1

10

+
+

Populasi 2(individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)

Pterostylis isozymus
1

Pterostylis isozymus
1

10

1
3
+

14

11 1
2
+

+
+

15

Jumlah
12

18

Populasi 2(individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)

7
+

10

11 1
2
+

1
3
+

14
+

15

Jumlah
14

n
Cepat

Pterostylis polyzymus
1
Pelaha
n
Cepat

+
+

16

Populasi 3(individu 1 hingga 15 dari kiri ke kanan)

4

10

11 1
2

+
+

1
3
+

14

15

Jumlah
8

22

Langkah 2 : Anda perlu mengukur perbezaan genetik diantara populasi tersebut.

Biasanya Wright`s Fixation Index or Fst digunakan, dari julat 0 yang
mewakili tiada perbezaan antara populasi tersebut, meningkat,
menandakan
kenaikan perbezaan. Untuk menentukan F st,
heterozygousity perlu dikira bagi setiap spesies (Hs), dengan
menggandakan 2pq bagi setiap satu populasi dan mengira nilai purata
bagi ketiga-tiga populasi untuk setiap spesies.

Frekuensi alel bagi Pterostylis isozymus

Populasi 1

Alel cepat,
p
7/30 = 0.23

Alel perlahan,
q
23/30 = 0.77

Populasi 2
Populasi 3

18/30 =
26/30 =

12/30 =
4/30 =

0.6
0.87

2xpxq

2x0.23x
0.77=0.35
0.4
0.48
0.13
0.23
Purata=1.06/3
(H s) = 1.06/3
= 0.35

Frekuensi alel bagi Pterostylis polyzymus

Populasi 1

Alel cepat,
p
18/30 = 0.6

Alel perlahan,
q
12/30 = 0.4

Populasi 2
Populasi 3

16/30 =
22/30 =

14/30 =
8/30 =

0.53
0.73

0.47
0.27

2xpxq
2x0.6x
0.4=0.48
0.50
0.39

Purata=1.37/3
(H s) = 1.37/3
= 0.46

Langkah 3 : Kira heterozygositi jika ketiga-tiga populasi meneruskan pembiakan,

(Ht). Lakukan kiraan dengan mencari purata bagi p dan q ke atas
ketiga-tiga populasi bagi setiap speseis, digandakan dengan 2 x purata
p x purata q. Jangkaan frekuensi heterozigot di dalam populasi ini
dikatakan mempunyai kawasan pembiakan yang besar dengan
tiadanya perbezaan genetik pada tahap populasi biasa.
Jangkaan heterozigositi (Ht) bagi Pterostylis isozymus
Populasi 1
Populasi 2
Populasi 3
Purata
frekuensi
alel

Alel cepat p
7/30 =
18/30 =
26/30 =

0.23
0.60
0.87
1.70/3
=0.57

Alel pelahan q
23/30 =
0.77
12/30 =
0.4
4/30 =
0.13
1.3/3
=0.43

(Ht) = 2 x purata p x purata q = 2 x 0.57 x purata q (0.43) = 0.49

Jangkaan heterozigositi (Ht) bagi Pterostylis polyzymus

Populasi 1
Populasi 2
Populasi 3
Purata
frekuensi
alel

Alel cepat p
18/30 =
16/30 =
22/30 =

0.6
0.53
0.73
1.86/3
=0.62

Alel pelahan q
12/30 =
0.4
14/30 =
0.47
8/30 =
0.27
1.14/3
=0.38

(Ht) = 2 x purata p ( 0.62 ) x purata q ( 0.38 ) = 0.47

Langkah 4 : Anda perlu mengira jumlah `local`, dengan variasi populasi. Frekuensi
sisihan bagi heterozigot di dalam populasi yang berasingan, (H s) perlu
dicari jika mereka adalah dari populasi besar yang sama, (H t) sertakan
indeks jumlah variasi genetik yang ditemui di dalam satu populasi
`local`. Oleh itu, Fst = (Ht Hs ) / Ht , di mana nilai F st < 0.1 menunjukkan
nilai divergen yang kecil di dalam populasi ( iaitu populasi yang
berbeza dari segi genetik antara satu sama lain). Nilai antaranya
menunjukkan beberapa divergen genetik.

RUMUSAN
Pterostylis isozymus
Fst = ( Ht Hs ) / Ht = ( 0.49 0.35 ) / 0.49 = 0.29
F st > 0.1, menunjukkan divergen yang besar di antara populasi
Pterostylis isozymus
Pterostylis polyzymus
Fst = ( Ht Hs ) / Ht = ( 0.47 0.46 ) / 0.47 = 0.02
Fst < 0.1 menunjukkan tiada divergen di antara populasi Pterostylis
polyzymus
Populasi Pterostylis isozymus adalah lebih divergen daripada
populasi Pterostylis polyzymus . Oleh itu Pterostylis polyzymus
adalah sama secara genetik antara satu sama lain.

Soalan / Perbincangan

1. Adakah populasi bagi setiap spesies adalah berbeza antara satu sama
lain? Adakah sesuatu spesies mempunyai lebih diversiti antara populasi
daripada yang lain? Yang mana satu?
Ya, populasi-populasi bagi setiap spesies adalah berbeza antara satu
sama lain. Untuk memiliki diversiti genetik yang tinggi di dalam
sesebuah variasi populasi, Fst yang dikumpul mestilah melebihi
0.1 di mana ia menunjukkan divergen yang besar antara
populasi. Berdasarkan pengiraan indeks variasi genetik bagi spesies
Petrostylis isozymus melebihi 0.1. Ini membuktikan bahawa spesies
Petrostylis isozymus mempunyai lebih kepelbagaian antara populasi
berbanding spesies Petrostylis polyzymus.
2. Bagaimanakah anda peruntukkan dana yang terhad bagi pemerolehan
tanah lembap? Jelaskan dengan wajar keputusan anda di dalam konteks
memelihara

jumlah

genetik

diversiti

yang

maksimum

yang

menggambarkan kedua-dua spesies.

Saya akan menggunakan peruntukkan dana yang terhad dengan
memilih genetik yang menunjukkan diversiti genetik yang tinggi
antara

populasi,

iaitu

dengan

memelihara populasi spesies

Petrostylis isozymus. Ini kerana, berdasarkan pengiraan indeks variasi

genetik bagi spesies Petrostylis isozymus melebihi 0.1. Jelas terbukti

bahawa

spesies Petrostylis isozymus mempunyai lebih kepelbagaian

antara populasi berbanding spesies Petrostylis polyzymus. Ini dapat

menjimatkan peruntukkan dana serta memulihara tanah lembap yang
mempunyai diversiti genetik yang tinggi bagi medapatkan
populasi yang lebih baik.

3. Apakah pertimbangan selain genetik yang akan mempengaruhi pilihan

anda?
Selain dari faktor genetik saya akan memberi pertimbangan kepada
kepentingan paya tersebut dari segi faktor nilai ekologi, nilai kekayaan dan
keunikkan flora dan fauna dan nilai estetika yang terdapat di sesebuah
kawasan tanah lembap.
Faktor nilai ekologi iaitu membuat kajian dan mengenal pasti paya yang
mempunyai lebih kepentingan kepada alam sekitar. Hal ini kerana, paya
berperanan penting sebagai agen semulajadi yang menapis dan
menyingkir semua bahan pencemar. Apabila air melalui sesebuah
kawasan tanah lembap, kebanyakkan bahan pencemar telah terurai dan
ditukarkan menjadi bahan makanan kepada organisma akuatik. Oleh itu,
semasa membuat pemilihan, kita perlu memberi keutamaan kepada
kawasan tanah lembap atau paya yang bersaiz luas dan selamat.
Faktor nilai kekayaan dan keunikkan populasi spesies flora dan
fauna yang terdapat di kawasan tanah lembap itu. Hal ini kerana apabila
memilih kawasan tanah lembap yang mempunyai kekayaan dan
keunikkan populasi spesies secara tidak langsung akan membantu
meningkatkan lagi proses pemuliharaan dan pemeliharaan

flora dan

fauna dalam ekosistem.

Faktor nilai estetika sesebuah kawasan tanah lembap juga perlu diberi
pertimbangan. Ini boleh dilakukan dengan membuat penilaian dan

pemerhatian yang teliti terhadap sesebuah kawasan tanah lembap kerana

terdapat kawasan tanah lembap yang berpotensi untuk dijadikan kawasan
ekopelancongan bagi tujuan pendidikan di samping kaya dengan
keindahan flora dan fauna yang tersendiri yang perlu dipelihara sebaiknya.

4. Diberi bahawa kedua-dua alel pada lokus yang dikaji ditemui bagi setiap
spesies. Mengapakah lebih daripada satu populasi akan wujud bagi
setiap spesies yang dilindungi?
Berdasarkan kajian yang telah dilakukan , bagi setiap satu
populasi spesies, mereka akan dilindungi apabila diversiti genetik
di dalam populasi itu berbeza antara satu sama lain, dan
mungkin terdapat variasi antaranya. Populasi dengan variasi
genetik

yang

tinggi

menunjukkan

bahawa

semakin

tinggi

peluang populasi tersebut untuk hidup , ini telah dibuktikan dengan

menyatakan bahawa kedua-dua alel telah didapati dalam setiap populasi
pada kedua-dua spesies. Populasi baru ini harus dilindungi kerana dari
situ ia memperoleh kepelbagaian atau variasi dalam populasi tersebut.
Variasi genetik ini dapat membentuk organisma tersebut untuk mempunyai
ketahanan yang lebih tinggi terhadap pelbagai ancaman seperti penyakit
dan keadaan sekeliling. Variasi genetik dapat membentuk satu individu
yang lebih baik supaya dapat mengekalkan spesies haiwan dalam
populasi tersebut.

5. Melalui pembacaan oleh Eldridge (1998) yang bertajuk `Trouble in

Paradise`, bagimanakah saintis memaksimakan diversity genetik bagi
pengenalan semula spesies? Mengapakah mereka tidak memilih hanya
sejenis haiwan dari pulau tersebut?

Saintis telah memaksimakan diversiti genetik bagi re-introduce

population,

dengan

memilih

haiwan

daripada

pulau

yang

berbeza. Ini adalah kerana haiwan daripada spesis yang sama

tetapi

berbeza

persekitaran

(pulau)

mempunyai

peluang

terbentuknya populasi yang pelbagai. Haiwan daripada satu

pulau sahaja akan mempunyai profil identiti yang sama dan
kajian menunjukkan populasi di pulau itu akan mengalami
kekurangan variasi genetik. Mereka tidak memilih hanya sejenis
haiwan dari pulau tersebut kerana apabila hanya satu haiwan
sahaja dipilih, ia berkemungkinan akan terkena penyakit dan
seterusnya akan mati.

Bibliografi :
Buku
Foo Yuen Kooi. (2004). STPM Biology Volume 2. Penerbitan Pelangi Sdn. Bhd;
Johor Bharu, Johor.
Kee Bee Suan, Quek Yoke Hua, Choo Yan Tong, L. N. Cheong & Grace Chiew Lai
Choo. (2010). SPM Focus Biology. Penerbitan Pelangi Sdn. Bhd; Johor
Bharu, Johor.
Laman Web
Azmil Kafrawi. (Januari 2013). Keanekaragaman Gen, Jenis dan Ekosistem.
Di ambil pada March 26, 2013, daripada
http://bozzkaf.blogspot.com/2013/01/keanekaragaman-gen-jenis-danekosistem.html
Cikgu Naza. (2012) . Variasi Dalam Kehidupan. Di ambil pada March 26,
2013, daripada http://www.biologi45.cikgunaza.com/2012/12/variasidalam-kehidupan.html
Fakulti Perubatan dan Sains Kesihatan UPM. (2011). Faculty Of Medicine
And Health Sciences, UPM - iDEC Zon ICT 8. Di ambil pada March 18,
2013, daripada http://www.medic.upm.edu.my/index.php/ms/bidangpengajian-siswazah/192-genetics

Wikipedia, ensiklopedia bebas. (2013 Februari). Lesen Creative Commons

Pengiktirafan / Perkongsian Serupa. Di ambil pada March 20, 2013,
daripada http://ms.wikipedia.org/wiki/Genetik
Wikipedia, ensiklopedia bebas. (2006 Disember). Lesen Creative
Commons Pengiktirafan / Perkongsian Serupa. Di ambil pada April 01,
2013, daripada http://ms.wikipedia.org/wiki/Variasi_genetik