TRANSCRIPCIN DE LOS GENES EUCARITICOS DE CLASE I

INTRODUCCIN A LOS GENES DE CLASE I. La trascripcin en las clulas eucariotas es mucho ms compleja que en procariotas. Los procariotas suelen tener un solo cromosoma por clula y en prcticamente todos los casos el cromosoma contiene nicamente una copia de cada gen. Unos pocos genes, como los del rARN, estn repetidos varias veces. Casi todos los genes en bacterias son exactamente colineales con la secuencia de aminocidos que codifican.

Tamao del genoma (nmero de pares de nucletidos por genoma haploide)

La organizacin de los genes eucariticos es mucho ms compleja, los genes eucariticos, o por lo menos la mayora, tienen una estructura tal que sus secuencias de nucletidos contiene uno o ms segmentos intercalados de ADN que no codifican la secuencia de aminocidos del producto polipeptdico, se llaman intrones, y los segmentos codificantes se denominan exones. La transcripcin en clulas eucariticas se divide en tres clases, siendo realizada cada una por una ARN polimerasa diferente, cada polimerasa tiene una funcin especfica y se fija a diferentes secuencias promotoras.

ARN polimerasa I genes clase I Codifican rARNs 28S, 5.8S y 18S ARN polimerasa II genes clase II Genes de protenas; casi todos los snARN ARN polimerasa III genes clase III Codifican tARNs, rARN 5S, U6-snARN, scARNs ARN polimerasas mitocondrial y cloroplstica

El caso que nos ocupa es el de la ARN Polimerasa I, que es la responsable de un solo tipo de ARN, el ARN prerribosmico, que contiene el precursor de los rARN 18S, 5,8S y 28S

La estructura de los genes eucariotas de clase I sera la siguiente:

MECANISMO DE TRANSCRIPCIN.

El mecanismo de transcripcin se divide en cuatro etapas: 1-Reconocimiento del molde: aqu tiene lugar la unin de la ARN polimerasa al ADN de doble cadena en la regin del promotor. Es entonces cuando las cadenas de ADN se separan para exponer la cadena molde al apareamiento de bases con ribonucletidos. La burbuja de transcripcin se origina mediante un desenrollamiento local que se inicia en el sitio de unin de la ARN polimerasa. En el caso de promotores dbiles es en este paso donde tiene lugar el ensamblaje de todas las protenas necesarias para iniciar la sntesis.

Promotor en eucariotas (conjunto de secuencias que determinan el sitio de inicio de la transcripcin)

2-Iniciacin: sntesis de los primeros enlaces nucleotdicos en el ARN. La enzima permanece en el promotor mientras sintetiza los primeros nueve enlaces. La fase de iniciacin puede verse retrasada por la ocurrencia de intentos abortivos en los que la enzima sintetiza pequeos fragmentos (< 9 bases) y los libera y vuelve a sintetizar ARN otra vez. La fase de iniciacin termina cuando la enzima comienza a alargar la cadena y abandona el promotor.

Inicio de la transcripcin por la ARN Polimerasa I

3-Alargamiento de la cadena: la enzima se mueve a lo largo del ADN y extiende la cadena creciente de ARN. A medida que la enzima se mueve desenrolla la hlice de ADN para exponer un nuevo segmento de la cadena molde del ADN en forma de simple cadena. Los nucletidos se aaden covalentemente al extremo 3OH y se forma un hbrido ADN-ARN en la regin desenrollada. Detrs de la burbuja se vuelve a formar la doble hlice de ADN y el ARN emerge como una cadena libre. La estructura del ADN se altera en la zona de la burbuja, la cadena molde que se encuentra en este punto en forma de simple cadena se aparea con el ARN naciente en el punto de crecimiento. 4-Terminacin: implica el reconocimiento del punto que determina el final de la adicin de bases a la cadena. Debe cesar la formacin de enlaces fosfodister y el complejo de transcripcin debe desintegrarse. Cuando se aade la ltima base la burbuja de transcripcin colapsa al desaparecer el hbrido ADN-ARN y tanto la enzima como el ARN son liberados. La secuencia de ADN necesaria se denomina terminador. En el caso de eucariotas es similar a la de procariotas, pero mucho ms compleja. En este caso la unin de la polimerasa al promotor no es directa adems de la ARN polimerasa intervienen un gran nmero de protenas necesarias para iniciar la trascripcin: La trascripcin en eucariotas requiere el desempaquetamiento del ADN que es la remodelacin de la cromatina y desembalaje del nucleosoma. Existe un transporte ARN al citosol y un procesamiento complejo del ARN La ARN polimerasa I, que contiene 13 subunidades, transcribe solo los genes para el ARN ribosmico de un nico tipo de promotor. El segmento transcrito incluye las secuencias de ARNr tanto largo como corto, las cuales son liberadas luego mas tarde mediante divisiones y procesamiento. Existen muchas copias de la unidad de transcripcin alteARNndo con espacios que no se transcriben organizadas en grupos. El ARN ribosmico es el principal producto de la transcripcin, el numero de genes de los ARNr va desde siete en E.coli hasta 100-200 en eucariotas inferiores hasta varios cientos en eucariotas superiores. Los genes del ARNr grande y pequeo (de las subnidades grande que contiene molculas de ARNr 28S, 5.8S y 5S y pequea, que tiene un ARNr 18S del ribosoma, respectivamente) suelen formar una pareja en tndem. La ausencia de variaciones identificables en las secuencias de las molculas de ARNr implica que todas las del

copias de cada gen deben ser idnticas o al menos con diferencias no detectables. En la mayora de los ncleos eucariotas los genes del ARNr estn en uno o varios grupos genticos en tndem que en ocasiones reciben el nombre de ADNr. Una importante caracterstica de un grupo en tndem es que origina un mapa de restriccin circular, tal como se muestra a continuacin

A y B unidad de repeticin. C final de una repeticin y principio de la siguiente. Se origina un mapa circular. Esto hace difcil diferenciar los extremos de un grupo gentico.

Despus de la trascripcin, el pre-ARNr 45S, se procesa para dar las molculas de ARNr 18S, 5.8S y 28S. Los ARNr se combinan entonces con el ARNr 5S de otras regiones del ncleo y se sintetizan en el citosol las protenas ribosmicas. La regin del ncleo en la que tiene lugar la sntesis del ARNr tiene un aspecto caracterstico con un centro de naturaleza fibrilar rodeado con una corteza granular. El centro es donde el molde del ADN se transcribe en ARN y la corteza esta constituida por las partculas de ribonucleoproteina a las que ese ARNr se es ensambla. El rea completa se denomina nucleolo, decir el lugar del ensamblaje de la subunidad ribosmica en los eucariotas, y su morfologa se muestra en la siguiente figura

El core del nucleolo identifica el ADNr que esta en trascripcin y la corteza granular que lo circunda esta compuesta por subunidades ribosmicas unidas.

FACTORES IMPLICADOS La ARN polimerasa I es una enzima compleja que contiene 13 subunidades como

hemos comentado anteriormente, se sabe que necesita al menos 2 factores de transcripcin; sin embargo dado que tan solo se trascribe una clase de gen es necesario un dispositivo complejo, que incluya mltiples lugares de regulacin, y mltiples factores de transcripcin, como pasa en la ARN Polimerasa II. El ARN polimerasa I requiere de dos factores auxiliares:

UBF1 es un polipptido que se une a una regin rica en G-C tanto en el ncleo del promotor como en UCE. SL1 est formada por 4 protenas entre las que se encuentra la TBP (del ingls TATA binding protein), su nombre se debe a que fue descrita en los promotores de tipo II donde esta protena se une a una secuencia consenso denominada TATA. La unin de UBF1 aumenta la eficiencia del evento de iniciacin. UBF1 se une a UCE

por su surco menor y provoca un lazo en la doble hlice que acerca ambas regiones consenso. La SL1 por s sola no tiene especificidad por el promotor pero una vez que se une la UBF1 esta se puede unir de forma cooperativa para extender la regin cubierta del ADN. Una vez que ambos factores se han unido la ARN pol se puede unir al ncleo del promotor para iniciar la transcripcin (Figura siguiente).

La TBP no se une a las regiones ricas en G-C por lo que probablemente la unin al ADN est mediada por los otros componentes de la SL1. El comportamiento de SL1 se asemeja al factor sigma en la ARN polimerasa bacteriana que como complejo protenico no se une al ADN y s en presencia de otros elementos. La TBP se encuentra tambin formando parte de otros factores requeridos por las polimerasas II y III, un hallazgo comn entre estas tres enzimas en su mecanismo de iniciacin es que la presencia de TBP asociada con otras protenas acta como un factor de posicionamiento de la ARN polimerasa para que esta comience en el sitio adecuado.

EJEMPLO CONCRETO.

Regulacin de los genes de Mating type en levaduras

La etapa haploide se diferencia en dos tipos celulares: a y HMRa: conjunto de genes que dan el tipo a HMR: conjunto de genes que dan el tipo Las regiones cromosmicas HMRa y HMR permanecen siempre silenciadas Cualquier gen que se introduzca en las regiones HMRa y HMR? queda silenciado El ADN includo en las regiones HMRa y HMR??es insensible a la metilacin. La expresin de los genes localizados en HMRa y HMR? requiere de su movimiento a otra regin del cromosoma (MAT)

BIBLIOGRAFA

Libros Bioqumica, 3 edicin, Mathews, Van Holde, Ahern. Editorial Addison Wesley. Genes VII, Benjamin Lewin. Editorial Marbn. Bioqumica,4 edicin, Thomas M. Devlin. Editorial Revert SA. Biologa Molecular de la Clula, 3 Edicin, Bruce Alberts. Ediciones Omega.

Pginas web http://www2.uah.es/biomolq/BM/Esquemas/Tema12.htm http://www2.uah.es/biomolq/BM/Esquemas/Tema13.htm http://fbio.uh.cu/genmol2/temas/transcripcion.htm http://www.um.es/molecula/anucl03.htm