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Bioqumica metablica

Leccin 16 Degradacin de protenas endgenas


Generalidades
Las protenas estn sometidas a un recambio constante degradacin/sntesis, por tanto todos los das podemos degradar hasta 300g de protenas endgenas. Puesto que la concentracin de protenas debe mantenerse constante, hemos de sintetizar la misma cantidad. Esto es lo que se denomina recambio proteico turn over, que implica tanto sntesis como degradacin de protenas para mantener la [protena] dentro de los valores del estado estacionario. En la sntesis de cualquier compuesto se gasta energa, sin embargo en la degradacin de protenas no solo no produce energa, sino que en muchos casos la consume. Los motivos por los que se degradan protenas son: 1. Sntesis de protenas anormales, con algn o varios aminocidos alterados. 2. Envejecimiento proteico. Las protenas a medida que pasa el tiempo se van oxidando, y alterando. 3. El organismo debe tener un mecanismo de respuesta rpido ante el control hormonal. Las hormonas muchas veces son pptidos o protenas. 4. Las protenas mas activas (p.e. enzimas reguladoras) no pueden tener una concentracin elevada constante en la clula, por lo que deben ser degradadas una vez cumplan su funcin Las protenas tienen una vida media en general muy corta, por termino medio establecida en 2 das, pero aquellas protenas mas activas tienen una vida media de unos 2 minutos, y en otros casos, como la hemoglobina, unos 120 das. Las protenas se pueden degradar casi en cualquier lugar de la clula, pero mayoritariamente en los lisosomas y en el citosol. Todas las clulas pueden degradar protenas, pero fundamentalmente el rgano mas implicado es el hgado, y en menor medida el msculo.

Alberto Gmez Esteban

Bioqumica metablica El catabolismo de protenas endgenas esta muy regulado en el organismo, en procesos de desnutricin y malnutricin por la actuacin de glucagn, el hgado degradar mltiples protenas endgenas. En situaciones de estrs con hormonas como catecolaminas, adrenalina, etc Tambin promovern este efecto. Los corticoides cuando se utilizan como frmacos tienen un efecto muy potente en la degradacin de protenas endgenas, fundamentalmente a nivel muscular. En los lisosomas se puede degradar cualquier tipo de protena, pero normalmente la degradacin en lisosomas afecta a protenas que entran a la clula por endocitosis (p.e. lipoprotenas) protenas estructurales (de membranas mitocondriales, plasmticas, etc). Las enzimas que se encargan de degradarlas se conocen en general como catepsinas. Las catepsinas son proteasas lisosomales (se conocen alrededor de 50) bastante inespecficas que tienen las siguientes caractersticas: Pueden actuar tanto como endopeptidasas como exopeptidasas, lo que les confiere gran eficacia degradativa. Su pH ptimo es cido (aprox. entre 3-5). Esto se debe a que si se liberan del lisosoma, el pH citoslico las inactivara para impedir el dao celular. La degradacin en el citosol en cambio requiere una sealizacin de la proteina Suelen degradarse en el citosol proteinas solubles de la celula, las proteinas que se degradan en el citosol deben tener una secuencia especifica que las marque para ser degradadas. La proteina encargada del marcaje es la ubiquitina. La ubiquitina (denominada asi por ser ubicua) es una protena de pequeo tamao que marca otras proteinas para su degradacin. La ubiquitina promueve la degradacin proteica de la siguiente forma: 1. Se une el grupo CT de la ubiquitina a un grupo SH de una enzima, que se denomina enzima activadora de ubiquitina. Esta union requiere de energia en forma de ATP para llevarse a cabo. 2. La ubiquitina se desliga de E1 y se une a una enzima E2 denominada enzima transportadora de ubiquitina. En este paso se libera la enzima E1 3. La proteina diana que se vaya a degradar se une a la ubiquitina a traves del grupo amino (NH2) de una lisina. Se libera la enzima E2 y esta union se lleva a cabo mediante una ligasa. En este paso se forma un enlace similar al peptdico que se denomina isopeptdico.

Alberto Gmez Esteban

Bioqumica metablica Las protenas suelen tener varias lisinas, por lo que pueden unir varias molculas de ubiquitina. La ubiquitina tambin es una protena que contiene lisina, por lo que cada ubiquitina puede unirse a su vez a otras ubiquitinas. Para que la molcula proteica se degrade, debe estar poliubiquitinizada.

Se ha observado que protenas anmalas, envejecidas, daadas, etc Se unen con ms facilidad a ubiquitinas. Tambin se ha comprobado que el aminocido NT de una protena influye en su estabilidad, definiendo su duracin, aunque este aminocido no influya directamente en la unin a ubiquitina. Hay algunas protenas que son abundantes en determinadas secuencias, unen con ms facilidad ubiquitina. La secuencia mejor caracterizada es aquella que denominamos como PEST (Pro-Glu-Ser-Thr).

El sistema degradativo ms importante en el citosol para eliminar proteinas ubiquitinadas es un complejo proteico enorme que se denomina proteasoma. El proteasoma es un complejo con coeficiente de sedimentacin 26S que es un cilindro en el cual entra la protena (ya desubiquitinizada) y una vez dentro proteasas pertenecientes al proteasoma, la degradan. El proteasoma esta formado por mltiples subunidades que forman un cilindro hueco, tiene un componente central formado por multiples subunidades que son proteasas, y otro componente, al menos en el extremo de entrada del proteasoma (aunque puede estar presente en ambos extremos) es reguladora. La proteina ubiquitinizada es reconocida por el componente regulador, se libera de la ubiquitina y entra dentro del cilindro donde es degradada por las proteasas. Por el otro extremo del cilindro salen los restos: aminocidos y pptidos de pequeo tamao. Las subunidades reguladoras tienen actividad isopeptidasa para liberar las ubiquitinas. Para todo el proceso es precisa energa en forma de ATP, lo que indica que la degradacin proteica es muy costosa energticamente. Hay otras proteasas caracterizadas, las mas importantes son las calpinas calpainas que en vez de depender de ATP, dependen de calcio, pero el sistema ms importante en el citosol es el del proteasoma. Existen determinadas enfermedades en las que se acumulan proteinas parcialmente degradadas, pueden deberse a defectos en el proteasoma. Estas enfermedades son sobre todo alzheimer y algunas clases de cncer.

Alberto Gmez Esteban

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