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Universidad Autnoma de San Luis Potos Facultad de Ciencias Programas Analticos del Sptimo u Octavo Semestre de la Licenciatura de Biofsica

1) NOMBRE DE CADA CURSO O ACTIVIDAD CURRICULAR

A) CINTICA ENZIMTICA B) DATOS BSICOS DEL CURSO


Semestre Horas de teora por semana Horas de prctica por semana Horas trabajo adicional estudiante Crditos

7u8

10

C) OBJETIVOS DEL CURSO

Objetivos generales

Al finalizar el curso el estudiante ser capaz de comprender, manejar y utilizar las


diferentes herramientas graficas y matemticas para el anlisis y estudio de las enzimas y los diferentes tipos de inhibicin.

Unidades

Objetivo especfico El alumno comprender las bases termodinmicas de la catlisis enzimtica y ser capaz de derivar las ecuaciones de MichaelisMenten y los diferentes mtodos grficos en la determinacin de los parmetros cinticos.

1. Enzimas

2. Inhibicin enzimtica Objetivos especficos 3. Enzimas multisustrato

El alumno conocer los diferentes tipos de inhibicin, derivar sus respectivas ecuaciones y los analizar grfica y matemticamente.

El alumno comprender que algunos sistemas enzimticos involucran mltiples sustratos y/o productos.

4. Cooperatividad y Alosterismo

El alumno comprender y analizara el fenmeno de cooperatividad enzimtica as como el de alosterismo como una forma de control de las vas metablicas en la clula.

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D) CONTENIDOS Y MTODOS POR UNIDADES Y TEMAS


5h/semana, 16 semanas: 80 h/semestre Unidad 1 Enzimas
Tema 1.1. Introduccin a la catlisis enzimtica 1.1.1. Estructura tridimensional de las enzimas 1.1.1.1. Cofactores enzimticos 1.1.1.2. Coenzimas 1.1.1.3. Clasificacin internacional de las enzimas 1.1.2. Como trabajan las enzimas 1.1.2.1. Energa de activacin 1.1.2.1.1. Calculo de la energa de activacin 1.1.2.2. Velocidad de la reaccin 1.1.2.3. Constante de Equilibrio (Keq) 1.1.2.4. Relacin Keq y G 1.1.2.5. Entalpa ( H) y entropa ( S) 1.1.2.6. Calculo de la Keq, H y S Tema 1.2. Ecuacin de Michaelis-Menten 1.2.1. Equilibrio rpido 1.2.2. Estado estacionario 1.2.3. Derivacin de la ecuacin de Michaelis-Menten 1.2.4. Derivacin de la ecuacin de Lineweaver-Burk 1.2.5. El grafico de Lineweaver-Burk o de los dobles inversos. 1.2.5.1. Determinacin de Vmax y Km . 1.2.6. Nmero de recambio (kcat) 1.2.7. Eficiencia cataltica (Vmax/Km) 1.2.8. Otros mtodos grficos de anlisis enzimtico 1.2.9.1. Hanes-Wolf 1.2.9.2. Eady-Hofstee 1.2.9.3. Scatchard 1.2.10. Efecto de la temperatura en la actividad enzimtica 1.2.10. Efecto del pH en la actividad enzimtica 20 h 10 h

10 h

Lecturas y otros recursos

Mtodos de enseanza Actividades de aprendizaje

Lecturas de libros especializados en termodinmica y cintica enzimtica. Ejemplos selectos y realizacin de ejercicios que permitan la mejor comprensin de los temas. Derivacin de ecuaciones y utilizacin de mtodos grficos en la obtencin de parmetros termodinmicos y de cintica enzimtica. Realizacin de regresiones lineales utilizando calculadora cientfica y regresiones no-lineales en computadora utilizando software cientfico (Microcal Origin). Clases presnciales del profesor con apoyo de material visual y/o audiovisual que describa y ejemplifique los conceptos analizados, apoyndose en libros y en datos tomados de artculos cientficos. Exposicin de conceptos por los alumnos, resolucin de dudas en clase. Realizacin de ejercicios en clase y tareas en casa. Utilizacin de calculadora cientfica, material grafico (papel milimtrico y escuadras) y software de PC. Lecturas complementarias, posteriores a cada tema, para concretar conceptos y reforzar conocimientos. Realizacin de ejercicios y tareas en casa de ejemplos prcticos tomados de la literatura cientfica.

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Unidad 2. Inhibicin enzimtica

30 h Tema 2.1. Inhibicin competitiva 10 h 2.1.1. Derivacin de la ecuacin de Michaelis-Menten para la inhibicin competitiva 2.1.1.1. Derivacin de la ecuacin de Lineweaver-Burk para la inhibicin competitiva 2.1.2. Determinacin de la constante de inhibicin (Ki) 2.1.3. Anlisis computacional de la inhibicin competitiva utilizando software 2.1.3.1. Edicin de la ecuacin de Michaelis-Menten para la inhibicin competitiva 2.1.3.2. Regresin no lineal mltiple 2.1.4. Otros mtodos grficos de anlisis de la inhibicin competitiva 2.1.4.1. Hanes-Woolf 2.1.4.2. Eady-Hofstee 2.1.4.3. Scatchard Tema 2.2. Inhibicin no-competitiva 10 h 2.2.1. Derivacin de la ecuacin de Michaelis-Menten para la inhibicin no-competitiva 2.2.1.1. Derivacin de la ecuacin de Lineweaver-Burk para la inhibicin no-competitiva 2.2.2. Determinacin de la constante de inhibicin (Ki) 2.2.3. Anlisis computacional de la inhibicin no-competitiva utilizando software 2.2.3.1. Edicin de la ecuacin de Michaelis-Menten para la inhibicin no-competitiva 2.2.3.2. Regresin no lineal mltiple 2.2.4. Otros mtodos grficos de anlisis de la inhibicin no-competitiva 2.2.4.1. Hanes-Woolf 2.2.4.2. Eady-Hofstee 2.2.4.3. Scatchard Tema 2.3. Inhibicin acompetitiva 10 h 2.3.1. Derivacin de la ecuacin de Michaelis-Menten para la inhibicin acompetitiva 2.3.1.1. Derivacin de la ecuacin de Lineweaver-Burk para la inhibicin acompetitiva 2.3.2. Determinacin de la constante de inhibicin (Ki) 2.3.3. Anlisis computacional de la inhibicin acompetitiva utilizando software 2.3.3.1. Edicin de la ecuacin de Michaelis-Menten para la inhibicin acompetitiva 2.3.3.2. Regresin no lineal mltiple 2.3.4. Otros mtodos grficos de anlisis de la inhibicin acompetitiva 2.3.4.1. Hanes-Woolf 2.3.4.2. Eady-Hofstee 2.3.4.3. Scatchard Lecturas de libros especializados en termodinmica y cintica enzimtica. Ejemplos selectos y realizacin de ejercicios que permitan la mejor comprensin de los temas. Derivacin de ecuaciones y utilizacin de mtodos grficos en la obtencin de parmetros termodinmicos y de cintica enzimtica. Realizacin de regresiones lineales utilizando calculadora cientfica y regresiones no-lineales en computadora utilizando software cientfico (Microcal Origin).

Lecturas y otros recursos

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Mtodos de enseanza Actividades de aprendizaje

Clases presnciales del profesor con apoyo de material visual y/o audiovisual que describa y ejemplifique los conceptos analizados, apoyndose en libros y en datos tomados de artculos cientficos. Exposicin de conceptos por los alumnos, resolucin de dudas en clase. Realizacin de ejercicios en clase y tareas en casa. Utilizacin de calculadora cientfica, material grafico (papel milimtrico y escuadras) y software de PC. Lecturas complementarias, posteriores a cada tema, para concretar conceptos y reforzar conocimientos. Realizacin de ejercicios y tareas en casa de ejemplos prcticos tomados de la literatura cientfica. 10 h 10 h

Unidad 3. Enzimas multisustratos


Tema 3.1. Enzimas bisustrato 3.1.1. Reacciones BiBi 3.1.1.1. Reacciones secuenciales ordenadas y al azar 3.1.1.2. Reacciones Ping-pong 3.1.2. Ecuaciones de velocidad 3.1.3. Equilibrio rpido 3.1.4. Estado estacionario 3.1.5. Grficos 3.1.6. Diferenciacin del mecanismo secuencial y ordenado

Lecturas y otros recursos

Lecturas complementarias de libros especializados en estructura y funcin de protenas. Lectura de algunos volmenes de la serie Methods in Enzymology. Utilizacin de equipo de cmputo y software especializado para el estudio de la estructura tridimensional de protenas. Bsqueda de estructuras en bases de datos en Internet. Permitir la exposicin de conceptos investigados como parte de sus tareas para facilitar la construccin del concepto formal. Clases presnciales del profesor con apoyo de material visual y/o audiovisual que describa y ejemplifique los conceptos analizados, apoyndose en libros especializados y en recursos en Internet. Lecturas complementarias, posteriores a cada tema, para concretar conceptos y reforzar conocimientos. Utilizacin de recursos y bases de datos en Internet. 20 h 10 h

Mtodos de enseanza Actividades de aprendizaje

Unidad 4. Cooperatividad y Alosterismo


Tema 4.1. Cooperatividad enzimtica 4.1.1. La ecuacin de Hill 4.1.1.1. Calculo grfico de Vmax, S0.5 y numero de Hill (n). 4.1.2. La ecuacin logartmica de Hill 4.1.3. El grafico logartmico de Hill 4.1.4. Calculo de los parmetros cinticos por regresin no-lineal Tema 4.2. Regulacin alostrica

10 h

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4.2.1. La ecuacin de Adair 4.2.2. El modelo simtrico de Monod, Wyman y Changeaux. 4.2.3.1. Interacciones homotrpicas 4.2.3.2. Interacciones heterotrpicas 4.2.4. El modelo secuencial Lecturas y otros recursos Mtodos de enseanza Lecturas complementarias de libros especializados de cintica enzimtica Permitir la exposicin de los conceptos investigados como parte de sus tareas, hasta la construccin del concepto formal. Clases presnciales del profesor con apoyo de material visual y/o audiovisual que describa y ejemplifique los conceptos analizados. Estudio de casos particulares en libros y sobretodo en artculos de la literatura cientfica. Lecturas complementarias, posteriores a cada tema, para concretar conceptos y reforzar conocimientos. Realizacin de ejercicios prcticos, utilizando calculadora cientfica o bien software especializado.

Actividades de aprendizaje

E) ESTRATEGIAS DE ENSEANZA Y APRENDIZAJE


Exposicin del maestro con apoyo de recursos visuales y audiovisuales Realizacin de tareas en casa. Realizacin de ejercicios prcticos e ilustrativos tomados de la literatura cientfica Implementacin de experimentos ilustrativos en el laboratorio de prcticas. Utilizacin de bases de datos y aplicaciones de Internet. Exposicin de estudiantes de temas de manera individual y/o en equipo. Evaluacin de la capacidad de sntesis e integracin del conocimiento mediante la resolucin de problemas en clase utilizando metodologa grfica y matemtica. Evaluacin de conceptos formales en exmenes parciales que incluye la resolucin de problemas. Elaboracin de un reporte de prcticas de laboratorio

F) EVALUACIN Y ACREDITACIN
Elaboracin y/o presentacin
Primer examen parcial Segundo examen parcial Tercer examen parcial Cuarto examen parcial Examen general ordinario

Periodicidad
1 1 1 1 1

Abarca
Unidades 1 Unidades 2 Unidades 3 Unidades 4 Unidades 1-4 TOTAL

Ponderacin
15% 15% 15% 15% 40% 100%

Nota: Para poder tener derecho a calificacin aprobatoria se deber haber cumplido con al menos el 90% de asistencia a clases. Los puntos ganados en clase sern sumados a la calificacin del examen parcial correspondiente.

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G) BIBLIOGRAFA Y RECURSOS INFORMTICOS


Textos bsicos Cornish-Bowden, Athel. Fundamentals of Enzyme Kinetics. 1995. pp. 343. Segel, Irwin H. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems, Wiley Classics Library. 1993. pp. 984. Berg, Jeremy M.; Tymoczko John L. y Stryer, Lubert. Biochemistry, 5a Edicin. USA. WH Freeman Company. 2007. pp: 1514. Textos complementarios Millar, Frederick P., Vandome, Agnes V., McBrewter, John. Enzyme kinetics: Enzyme assay, Michaelis-Menten kinetics, Lineweaver-Burk plot, Enzyme inhibitor, Eadie-Hofstee diagram, Enzyme catalysis. Alphascript Publishing. 2009. pp. 68. Cornish- Bowden, J.A. Principles of Enzyme Kinetics. 1976. pp. 240.

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