Gen bacteriano Intercambio en la naturaleza Los genes entre bacterias independientes viajan ms a menudo una vez que se asume.

Estudio del proceso puede ayudar a limitar los riesgos de liberar microbios genticamente modificados en el medio ambiente by Robert V. Miller en la dcada de 1980, cuando los cientficos estaban perfeccionando las tcnicas de empalme genes extraos en algunas bacterias, Los investigadores empezaron a sugerir maneras de utilizar la tecnologa en beneficio del medio ambiente. Por ejemplo, se propone que bacterias modificadas genticamente podra ser desplegado para tareas tales como limpieza de derrames de petrleo o la proteccin de los cultivos de la depredacin y la enfermedad. Pero la empresa, conocida como biotecnologa ambiental, pronto cay bajo el fuego. Entonces, como ahora, las propuestas suscit preocupacin de que los microbios alterados puede que causa estragos o que sus genes saltaba a otro impredecible organismos, un fenmeno denominado "Horizontal" de la transferencia gnica (para distinguirla de la "vertical" de transferencia que se produce entre un padre y su descendencia). Dichas actividades, que era tema, podra de alguna manera irreparable daar el medio ambiente, los animales o personas. Algunos observadores incluso emitidos advertencias de que los organismos naturales que destruyen la tierra. No ya eran tabloides preocupados por los ataques de los "tomates asesinos" de exterior espacio, ahora el peligro era de cosecha propia genticamente alterado microorganismos que comera el medio ambiente. Desafortunadamente, en ese entonces, los bilogos tenan poca informacin slida sobre la que respuestas de base. Ellos saban casi nada sobre el destino de los microorganismos modificados genticamente en la naturaleza y sobre la propensin de los genes bacterianos innatas o introducida a migrar a nuevos huspedes. Que escasez de datos est siendo remediada, gracias a una cooperacin sin precedentes entre los investigadores genticos microbianos y los ecologistas, que estudian los microorganismos en sus hbitats normales. Actualmente, por lo menos dos cepas de bacterias genticamente modificadas han conseguido la aprobacin (para uso agrcola) por los EE.UU. Agencia de Proteccin Ambiental, y docenas de ensayos de campo se han realizado. Esos juicios e investigaciones ms generales de la transferencia de genes entre bacterias en sus hbitats naturales indican que las bacterias manipuladas genticamente s mismos es improbable que proliferen fuera de control. Ellos tienden a ser frgiles y morir con relativa rapidez en lugar de persistir indefinidamente, por ello, sus genes probablemente no tiene mucha oportunidad de propagarse. Sin embargo, bajo ciertas circunstancias, la genes potencialmente pueden encontrar su camino en otras bacterias o incluso en otros tipos de organismos. Una clave para la liberacin segura de los microbios, entonces, es identificar los condiciones que favorecen o disuadir bacterias especficas de la transferencia de su genes a otros organismos, un reto mi laboratorio en la Universidad Estatal de Oklahoma y otros estn llevando a cabo vigorosamente. Con esta informacin en mano, bilogos pueden seleccionar las bacterias que se ser menos propensos a intercambiar genes con otros organismos en el sitio particular siendo "tratada". A modo de ejemplo, para la liberacin en un lago, biotecnlogos podra ser capaz de elegir una especie bacteriana que no es fcilmente intercambiar sus genes en agua.

Los cientficos an no pueden compilar una lista exigente de que las bacterias son los mejores para cualquier aplicacin dada. el combinado la investigacin ha puesto de manifiesto una gran cantidad, sin embargo, acerca de la propensin de los tres las formas ms comunes de la horizontal de genes transferencia de la transduccin, conjugacin y-transformacin que se produzca en la naturaleza. Esos resultados sern el tema central de este artculo, pero debo sealar que la mejora de comprensin de las condiciones que faciliten la transferencia horizontal de genes en bacterias tiene relacin con otro moderno preocupacin: el aumento de resistencia a los antibiticos en bacterias que causan enfermedades. Resulta que las bacterias, que son organismos unicelulares, a menudo donar antibitico genes de resistencia a otras especies de bacterias en el cuerpo humano. Entender cundo y cmo se produce esta transferencia debe ayudar a los investigadores desarrollar estrategias para bloquendola. En un plano ms terico, el descubrimiento de que la transferencia horizontal de genes es bastante comn en la naturaleza sugiere que, lo largo del tiempo evolutivo, el proceso de podra haber contribuido a la gran diversidad gentica ahora evidente en las bacterias. Algunos hallazgos indican que incluso los genes han sido intercambiados entre los tres grupos importantes de la vida biolgica: bacterias, eucariotas (animales, plantas, hongos y protozoos) y arqueas (antiguos microbios que tiene algunas propiedades tanto bacterias y eucariotas). La informacin actual sugiere que la transferencia gnica Se ha producido desde las bacterias hasta los eucariotas, desde bacterias hasta arqueas y eucariotas, especialmente de las bacterias. Intercambio horizontal de genes puede tener as influido en la evolucin de cualquier nmero de las formas de vida. Un viaje de pesca Fateful Mi propia participacin en la exploracin de transferencia horizontal de genes en la naturaleza se remonta a la primavera de 1976, cuando yo era un profesor asistente en la Universidad de Tennessee en Knoxville. Yo Fue entonces estrictamente un genetista interesado en la forma en que viven funcionan las clulas. Me di cuenta de que ciertas bacterias naturalmente podra transmitir los genes de una clula bacteriana a otra madura. Desde mi punto de vista, sin embargo, la transferencia gentica horizontal es de inters slo en la medida en que proporcionan una forma prctica de introducir nuevos gen y por lo tanto nuevos rasgos, en clulas que son estudiada en el laboratorio. Un viaje de pesca un sbado por la tardecon Gary Sayler, otro joven profesor asistente en la universidad, de pronto alterado mi punto de vista estrecho. Cuando nos sentamos ennuestro barco, Sayler, eclogo microbiano,me pregunt si yo pensaba mucho intercambio gentico ocurre entre las bacterias en el lago. Supuse Las clulas bacterianas se dispersa en la agua y tendra relativamente poco contacto uno con el otro. Por lo tanto supuso que la tasa de transferencia de genes fue baja. Cuando se pulsa, sin embargo, tena que admitir que no estaba muy versado en los trabajos cientficos sobre gentica horizontal transferir en la naturaleza. El lunes siguiente, confiado que la literatura sera extensa, dirigi a la biblioteca en busca de una mayor respuesta autorizada. Varias horas ms tarde sal sorprendido y decepcionado; prcticamente no se saba nada. Sayler, sin embargo, estaba eufrico. Tena acaba de desarrollar una cmara para el estudio

de organismos que viven en agua dulce. Podramos probar el dispositivo y comenzar a llenar un vaco cientfico mediante la medicin de la cantidad de transduccin llevando a cabo en nuestra pesca agujero. Durante el otoo y la primavera siguiente estaciones del ao, se llev a cabo los primeros estudios demostrando que la transduccin puede ocurrir en agua dulce. Cuando publicamos los resultados, en 1978, fueron algunos otros sera tan intrigado como nosotros y que nuestro papel representa el primero de una larga serie de proyectos de investigacin sobre el gen bacteriano cambio en la naturaleza. Sin embargo, en el momento, ningn agencias de financiamiento compartido nuestra visin. Por 1985, sin embargo, la preocupacin por la liberacin de bacterias modificadas genticamente en el medio ambiente haba cambiado todo eso. Por lo tanto, Sayler y yo-y otros-comenzaron a jugar cin de puesta al da y explorar el potencial de transferencia horizontal de genes a ocurrir en una variedad de entornos. La conjugacin es confirmada conjugacin fue el primer mecanismo de transferencia gnica estudiado ampliamente como una forma de bacteria podra diseminar material gentico en las arenas nonlaboratory. Fue identificado en 1946, cuando Josu Lederberg y Edward Tatum de Yale University encontr que la bacteria intestinal Escherichia coli utiliza un proceso parecido a sexo a cambio de ADN circular elementos que estn llamados plsmidos. Los plsmidos que contienen genes pero estn separados del cromosoma bacteriano, que es ms grande y contiene los genes necesarios para la reproduccin bacteriana. (Cromosomas a veces puede ser intercambiado por conjugacin tambin, pero slo en circunstancias extremadamente raras.) plsmidos suelen llevar genes que mejoran la posibilidades de supervivencia en circunstancias hostiles. Por ejemplo, adems de incluir los genes necesarios para su propio replicacin y transferencia, que a menudo albergan genes para las protenas que permiten que las bacterias para evadir la destruccin por los antibiticos, para degradar compuestos txicos, tales como bifenilos policlorados (PCB) o al transforman el mercurio u otros metales pesados en formas menos nocivas. Por razones histricas, los microbilogos dividen en bacterias gram-negativas y gram-positivas, dependiendo de los tipos si las bacterias retener una determinada mancha. El trabajo de laboratorio se ha demostrado que en bacterias gram-negativas, que no se puede hacer mantener la conjugacin de manchas, comienza cuando una bacteria donante se une un apndice llamado un pilus a una bacteria receptora que muestra un receptor para el pilus; a continuacin, se retrae el pilus, dibujo juntos el donante y el receptor. generalmente, los muchos donantes se extienden aproximadamente a la pili mismo tiempo, y las clulas de varios donantes pueden convergen en un recipiente a la vez. Por consiguiente, la extensin de pili hace que las clulas bacterianas a agregarse en grupos. Despus agregacin se produce, puentes, o poros, forma entre el donante y las clulas receptoras, y los plsmidos que pasan a travs de los puentes de los donantes a los receptores. Algunos pili puede promover la agregacin de clulas bacterianas en lquido y en superficies slidas, otros pueden estimular la agregacin eficientemente slo sobre superficies slidas. Tal diferencias implican que los investigadores que quera introducir un genticamente bacteria gram-negativa en un medio acutico podra ser conveniente seleccionar una especie que tiene pili que inducen agregacin sobre superficies slidas. Conjugacin en bacterias gram-

positivas no implica pili. En anticipacin de conjugacin a un posible beneficiario de nuevo genes segrega sustancias que impulsan donantes potenciales para producir protenas, a menudo llamados factores de formacin de conglomerados, capaces de llevar las clulas bacterianas juntos. cuando el clulas se asocian, forman los poros necesarios para la transferencia de ADN. Por lo tanto, si los investigadores fueron que elegir un recombinante bacteria gram-positiva para la liberacin al un rea que contiene otras bacterias gram-positivas bacterias, que podra reducir el riesgo de la transferencia de genes en el ajuste mediante la alteracin la bacteria de modo que no pudo Fabricamos cualquier factor de aglutinacin. En general, las bacterias gram-negativas y Gram, que pueden ocurrir juntos en acutico natural y terrestre ambientes, el intercambio de plsmidos exclusivamente con miembros de su propio grupo; muchos restringir el intercambio de sus propias especies. Sin embargo, algunos "promiscuas" plsmidos pueden transferir ADN entre muy especies no emparentadas: entre las bacterias gram-negativas y gram-positivas, e incluso a partir de bacterias a las clulas de levadura y plantas. Obviamente, a continuacin, las bacterias, que llevan plsmidos promiscuos sera pobre opciones para el uso fuera del laboratorio. Pero es conjugacin, de hecho, se producen con la suficiente frecuencia en la naturaleza para justificar las precauciones sugeridas por la investigacin banca? Desde el advenimiento de la biotecnologa ambiental en la dcada de 1980, los investigadores han demostrado que la conjugacin tiene lugar en muchas natural esferas, incluso en el agua, en tierra y en varias plantas y animales. Los estudios clave conjugacin En particular, en una serie de estudios, John C. Fry, el da de Martin J. y sus colegas de la Universidad de Gales demostrado que la transferencia gnica travs de la conjugacin puede ocurrir entre bacterias en ambientes de agua dulce. Los investigadores encontraron que la conjugacin puede habilitar una cepa de laboratorio de Pseudomonas aeruginosa a recoger un plsmido que, naturalmente, proporciona resistencia a la toxicidad del mercurio en las bacterias que habitan en el ro contaminado Taft, cerca de Cardiff, Pas de Gales. P. aeruginosa es un suelo comn y de agua dulce bacteria que puede causar infecciones de las vas respiratorias y urinarias en los seres humanos cuyas defensas inmunes se debilitan. Los investigadores comenzaron por mutacin un gen de P. aeruginosa; esta manipulacin causado el gen para generar una versin anormal de la protena especificada por el gen intacto. La protena alterada ms tarde servir como un marcador para el seguimiento de la presencia de clulas bacterianas puesta en el ro. Habiendo revisado el gen de P. aeruginosa, el equipo introdujo el marcado bacterias en los alimentos ricos en capas viscosas, o epilithons, cubriendo sumergido piedras en el ro. (Las piedras eran envuelto en un material de filtro muy fino a evitar que las bacterias se escape.) Despus de 24 horas, el grupo recuperado las piedras y examin las epilithons marcados por las clulas de P. aeruginosa que tenan recibido un plsmido de resistencia mercurio de la poblacin de origen natural P. aeruginosa en las rocas. Slo entre uno de cada 10.000 y una en un billn de la presentacin P. aeruginosa se haba adquirido un plsmido, pero tena dicha transferencia sin lugar a dudas tenido lugar. El trabajo tambin arroj la informacin til que tales factores como la temperatura del agua acidez nivel y la concentracin de nutrientes afectan la frecuencia de conjugacin. En muchos estudios, los factores ambientales se han encontrado para modular la conjugacin de manera

diferente en la naturaleza que en la laboratorio. Por ejemplo, en los experimentos de Fry, Day y sus colegas, conjugacin se produjo a los seis y 18 grados Celsius, las temperaturas demasiado bajas para Conjugacin de apoyo en las cepas de laboratorio de bacterias. Estos resultados inesperados significa que la conjugacin tiene que ser estudiado en la naturaleza si los investigadores deben especificar con precisin las condiciones que lo mantienen a un mnimo. Basado en el trabajo del da Fry, y otros, los cientficos concluyen que aunque las bacterias hacen uso de la conjugacin con transferir la informacin gentica en muchos diferentes ambientes, plsmidos modificados genticamente probablemente representan poco peligro. Los plsmidos frenar las tasas de crecimiento de bacterias y son generalmente eliminados si no hay ninguna ventaja a un organismo en su mantenimiento. Por ejemplo, si un plsmido manipulado genticamente que lleva el mercurio resistencia rasgo encontrado su camino en un organismo vivo fuera de un mercurio contaminado configuracin regional, el nuevo host pronto se librara del plsmido. Adems, los plsmidos son rara vez, o nunca, integrado en los cromosomas bacterianos. Por lo tanto, incluso si viajan a un husped bacteriano nuevo, no se conviertan en un establo parte del genoma que de acogida; cromosomas estn invariablemente copiado y distribuido a las nuevas generaciones de bacterias clulas cada vez que una clula madre reproduce s, pero los plsmidos no se reproducen constantemente cuando las clulas se dividen. Sin embargo, para eliminar virtualmente la posibilidad un gen que poner en una bacteria genticamente modificada se extender a travs de la conjugacin, biotecnlogos considerando el uso de bacterias recombinantes en la naturaleza tienen optado para insertar los genes en cromosomas en lugar de plsmidos. Riesgo de transformacin es mnima Aunque conjugacin fue el primer mecanismo de transferencia de genes bacterianos para ser estudiado ampliamente en el medio ambiente, no fue el primero en ser identificado. El estudio de la transferencia de genes entre las bacterias se inici en 1928, cuando Bacterilogo britnico Frederick Griffith observ que no virulentas bacterias neumoccicas se convirti virulento cuando se inyectan en ratones con neumococos virulentos muertos. Griffith concluy que las bacterias no virulentas inicialmente tom una "transformacin" agente de las bacterias virulentas muertas y por lo tanto se convirti en lo suficientemente potente como para matar a los ratones. Ese agente transformador ahora se conoce a ser de ADN que se libera en el medio circundante cuando los muertos las bacterias se vino abajo. Un gen se dice que est intercambiado con xito a travs de la transformacin si se toma en el marco de una plsmido completo o si un fragmento de ADN que contiene el gen se integra en el cromosoma de un destinatario. Transformacin natural en ambas bacterias gramnegativas y grampositivas requiere que el ADN liberado se mantienen estables y que las clulas receptoras potenciales a ser competente para tomarla. Esto es, los beneficiarios debern mostrar especializado protenas de superficie que se unen al ADN y que interiorizar. Hasta hace poco, los investigadores asumieron que la transformacin no se producira en la mayora de los lugares, porque el ADN libre hara no ser estable en el suelo o el agua. Pero los estudios por Michael Lorenz y Wackernagel Wilfried de la Universidad de Oldenburg en Alemania Stotzky, Guenther de Nueva York University y otros han demostrado que el ADN libre puede

convertirse estable mediante la asociacin con componentes del suelo y que este ADN se puede tomar por las clulas competentes. Newer investigaciones indican que el ADN plasmdico tiene en veces han sido transferidos por la transformacin en agua de los ros y en el epiliton sobre las piedras del ro. (No conozco ninguna observacin, sin embargo, lo que indica que los genes cromosmicos han sido transferidos por transformacin de los animales acuticos o terrestres ambientes.) Sin embargo, algunos investigadores creen que el intercambio de genes por transformacin es probable derivarse fcilmente si genticamente las bacterias se colocan en el medio ambiente. Transformacin natural parece ocurrir slo entre las clulas de la misma especie, y especies bacterianas son relativamente pocos capaz de llegar a ser competente para transformacin, biotecnlogos pueden evitar el uso de estas especies para la ingeniera gentica. Adems, aunque las bacterias muertas a veces puede liberar grandes cantidades de ADN que es absorbido por ciertos otras bacterias, el ADN a menudo no es asimilado como genes intactos. Juan Pablo de la Universidad del Sur de Florida y su colegas han demostrado que el alto concentraciones de clulas libres de ADN bacteriano pueden aparecer en aguas estuarinas despus amanecer, cuando muchas bacterias normalmente mueren y liberar su material gentico. Sin embargo, en experimentos de laboratorio, los investigadores encontrado que el ADN liberado ms rescatado por bacterias vivientes se descompone rpidamente en sus partes constituyentes para utilizar en la sntesis de nuevo ADN; la genes contenidos en el ADN libre son rara vez se mantiene intacta De las bacterias al Virus y vuelta A diferencia de la transformacin, la tercera forma de transferencia horizontal de genes de transduccin pueden producirse en una amplia gama de bacterias. En la transduccin, bacterifagos (virus que infectan bacterias) recoger material gentico de una clula bacteriana y depositarlo en otro. Como parte de su ciclo de vida, los bacterifagos se adhieren a las bacterias e inyectar su ADN. Este ADN sirve entonces como una plan para hacer ms copias del bacterifago, que brot de la bacteria infectada y pasar a infectar otras clulas. A veces, sin embargo, algunos de los las nuevas partculas llevar bacteriana en lugar de ADN viral. En efecto, bacterifagos son capaces de transferir plsmidos enteros y piezas de cromosomas entre hosts. (Cromosomas completos estn demasiado grande para caber en bacterifagos.) Laboratorio experimentos indican que algunos bacterifagos aparentemente puede infectar varias especies e incluso gneros de bacterias, lo que sugiere que podra transmitir genes bacterianos mucho ms all de la configuracin regional donde primero tom los genes. Debido a que la transduccin podra dar lugar a una amplia dispersin de una poltica exterior gen, mis colegas y yo concentrarse en su estudio. Inicialmente, se busc transduccin mediante la recopilacin de las bacterias en el tipo de contencin medioambiental cmara inventada por Sayler. Esa cmara consista en un tubo de plstico transparente terminado en ambos extremos con filtros que permiten el agua y los nutrientes, pero impide la filtracin de bacterias. Estos da usamos gas permeables bolsas de plstico para nuestros experimentos. Sobre la base de nuestros estudios, hemos propuso un modelo para la dispersin de material gentico transductionmediated de una bacteria a otra introducido bacterias en la naturaleza. En pocas palabras, nuestro modelo indica que cuando una

bacteria que lleva un nuevo gen entra en un hbitat, bacterifagos infectar a la clula y crear ms partculas de bacterifago. Si las partculas terminan contiene el nuevo gen, que gen puede ser transmitida a los indgenas poblacin bacteriana. Este modelo est igualmente aplicable a la transduccin de ADN cromosmico y el plsmido. Recientemente hemos tratado de demostrar que esta escenario es, de hecho, lleva a cabo en agua dulce. Tenemos bacterias aisladas y bacterifagos de varios lagos y han demostrado que las bacterias comparten informacin gentica por transduccin en esos ajustes. Muchos microbilogos originalmente transduccin de pensamiento no sera una medio importante de intercambio de genes en el medio ambiente, ya que requiere los virus y bacterias-ambos de los cuales fueron cree que estar presente en concentraciones bajas-a interactuar. Pero mis compaeros de trabajo y recientemente he encontrado bacterifagos en concentraciones muy altas (a menudo 100 000 000 000 partculas de virus por mililitro) en aguas dulces y marinas. Estas observaciones han provocado una reevaluacin de la frecuencia de las interacciones, incluyendo transduccin, que se producen entre bacterifagos y sus anfitriones. Aun as, la comprensin actual sugiere que la transduccin de genes lleva por bacterias genticamente modificadas en la medio ambiente es, probablemente, muy limitado por una serie de factores. Una es que la mayora de los bacterifagos infectan slo uno especies de bacterias, no muchos diferentes especies. Otra es que la mayora de los bacterifagos en estado silvestre slo infectan a las bacterias que son nativos de los aos bacterifago hbitat no las cepas de laboratorio de bacterias utilizado en ingeniera gentica. Con el tiempo, los bilogos moleculares debera tambin poder equipar alterado genticamente bacterias con caractersticas que limitan la capacidad del ADN bacteriano y para moverse a sobrevivir en otra especie, tales restricciones estn ya en fase de desarrollo. Los bilogos ahora puede manipular la composicin gentica de casi cualquier organismo. Adems de ser aplicado a la creacin de bacterias recombinantes, la tecnologa est siendo utilizada por los agricultores para crecer cultivos genticamente modificados resistentes a varias enfermedades [vase "Cmo hacer arroz resistente a las enfermedades," por Pamela C. Ronald, Scientific American, noviembre de 1997]. Los estudios reunidos de bacterias en sus hbitats nativos sugieren que genticamente organismos modificados se pueden poner en el medio ambiente de manera segura y que la mayora consideracin importante es si el organismo genticamente modificado har el trabajo que se le formulasen. No obstante, se recomienda precaucin. Como la comprensin de horizontal de genes transferencia se expande, los biotecnlogos ambientales deben obtener la informacin necesaria para reducir los riesgos para la mnimo estricto