Universidad Nacional de Rio Cuarto Facultad de Ciencias Exactas, Fsico-Qumicas y Naturales

UNIVERSIDAD NACIONAL DE RO CUARTO FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS, FSICO-QUMICAS Y NATURALES DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGA E INMUNOLOGA CARRERA/S: MICROBIOLOGA PLAN DE ESTUDIOS: (VERSIN 3) ASIGNATURA: ECOLOGA MICROBIANA DOCENTE RESPONSABLE: Dra. Miriam Etcheverry EQUIPO DOCENTE: Dra. Lilia Cavaglieri, Dra. Andrea Nesci AO ACADMICO: 2012 REGIMEN DE LA ASIGNATURA: Bimestral RGIMEN DE CORRELATIVIDADES: (para cursado) Aprobada 2161 6235 CARGA HORARIA TOTAL: 9 TERICAS: 4 hs PRCTICAS: LABORATORIO: 5 hs Regular 2115 2116 2118 CDIGO: 2137

CARCTER DE LA ASIGNATURA: Optativa

A. CONTEXTUALIZACIN DE LA ASIGNATURA La asignatura pertenece al ciclo de profundizacin (Materias optativas)

B. OBJETIVOS PROPUESTOS OBJETIVOS GENERALES: Comprender el papel de los microorganismos en la biosfera, las interrelaciones microbianas y las asociaciones con otros organismos Conocer los mtodos y tcnicas de estudio propios de la ecologa microbiana aplicables a los distintos ecosistemas Analizar la importancia de los aspectos biotecnolgicos de la ecologa microbiana para la conservacin del medio ambiente C. CONTENIDOS BSICOS DEL PROGRAMA A DESARROLLAR MDULO I: INTRODUCCIN A LA ECOLOGA MICROBIANA MODULO II: HABITAT ECOLGICO Y CUANTIFICACIN MICROBIANA MDULO III: CARACTERIZACIN DE AMBIENTES NATURALES. .MDULO IV: ASPECTOS BIOTECNOLGICOS DE LA ECOLOGA MICROBIANA D. FUNDAMENTACIN DE LOS CONTENIDOS Los contenidos estn dirigidos a estudiar el rol crucial de los microorganismos para el cuidado de los ecosistemas naturales y los avances metodolgicos particulares en el mbito de la microbiologa ambiental que permitan al egresado realizar, interpretar y certificar anlisis microbiolgicos de los ecosistemas aire agua y suelo, midiendo adems el impacto de contaminantes ambientales sobre las poblaciones nativas. El futuro profesional podr clasificar, inventariar y evaluar los recursos microbianos de los ecosistemas naturales a los efectos de su aprovechamiento, reproduccin y conservacin de la diversidad microbiana. El desarrollo de la asignatura permitir una visin general de las actividades microbianas y de las aplicaciones biotecnolgicas para los procesos de biorremediacin relacionados al saneamiento ambiental, produccin de energa y control microbiano de pestes. En la microbiologa ambiental se debe recuperar el conocimiento de las interrelaciones microbianas en los ambientes particulares de la biosfera. Para ello los estudiantes confeccionarn al final del cursado de la asignatura una monografa de una temtica a eleccin que le permita rescatar los conceptos estructurantes de esta ciencia.

E. ACTIVIDADES A DESARROLLAR Se analizarn los fundamentos tericos de la ecologa microbiana en clases de discusin terica que incluyen exposicin de seminarios. Adems se realizarn actividades de

laboratorio. Los alumnos confeccionarn los protocolos de trabajo y efectuarn el anlisis y discusin de resultados. CLASES DE TRABAJOS PRCTICOS DE LABORATORIO: Clases de laboratorio 5 horas semanales CLASES TERICAS: Discusiones Tericas (3 horas semanales) F. NMINA DE TRABAJOS PRCTICOS Trabajo Prctico N1: Estudio de las poblaciones del ecosistema de raz del cultivo de maz. Influencia de factores ambientales. Trabajo Prctico N2: Bacterias fotosintticas: Columna de Winogradsky Trabajo Prctico N3: Determinacin de la competencia microbiana Trabajo Prctico N4: Interaccin microbiana Trabajo Prctico N5: Resistencia a metales pesados y agroqumicos Laboratorio 6: Monitoreo del agente patgeno en plntulas de maz mediante la aplicacin de tcnicas moleculares G. HORARIOS DE CLASES: Clases de Laboratorio: Lunes de 8-13 Discusiones Tericas: Lunes de 14,30-17,30 horas. HORARIO DE CLASES DE CONSULTAS: Martes de 10-12 horas H. MODALIDAD DE EVALUACIN: Evaluaciones Parciales: Escrita. Presentacin de monografa y puesta en comn de la misma. Evaluacin Final: Oral CONDICIONES DE REGULARIDAD: Aprobacin de los parciales y entrega de monografa

PROGRAMA ANALTICO A. CONTENIDOS MDULO I: INTRODUCCIN A LA ECOLOGA MICROBIANA Tema 1: Concepto bsico de ecologa microbiana. Desarrollo histrico. Alcances de la disciplina. Perspectivas de aplicacin y desarrollo. Tema 2: Rol de los microorganismos en el flujo de energa de los ecosistemas. Papel de los microorganismos en el reciclado de nutrientes de la biosfera. Poblaciones, comunidades y ecosistemas microbianos. Dinmica de las poblaciones microbianas. Tema 3: Interaccin de Poblaciones. Interacciones entre microorganismos y plantas. Interacciones entre microorganismos y animales. MODULO II: HABITAT ECOLGICO Y CUANTIFICACIN MICROBIANA Tema 4: Factores abiticos sobre el crecimiento microbiano. Ley del mnimo de Liebig. Ley de tolerancia de Shelford. Efectos de condiciones ambientales extremas. Tema 5: Mtodos en ecologa microbiana. Mtodos de enriquecimiento y aislamiento. Identificacin y recuento. Mediciones de la actividad microbiana en los ecosistemas. Estudios ecolgicos en laboratorio. Modelos experimentales. Sistemas en lotes y continuos. Modelos matemticos. Aspectos estadsticos del anlisis experimental. MDULO III: CARACTERIZACIN DE AMBIENTES NATURALES. Tema 6: Microbiologa del suelo. Grandes grupos de microorganismos presentes en el suelo. Microorganismos autctonos y de origen exgeno. Factores abiticos de importancia en microbiologa del suelo. Interacciones de los microorganismos del suelo entre s y con los vegetales. Micorrizas. Manejo de suelos agrcolas. Tema 7: Microbiologa del agua. Grandes grupos de microorganismos presentes en el medio acutico. Factores abiticos de importancia en la microbiologa acutica Adaptaciones microbianas a la vida en el agua. El medio marino. Tema 8: Microbiologa de la atmsfera. Estructura y dinmica de las poblaciones en el aire. El aire como vehculo de transporte de los microorganismos. Viabilidad de los microorganismos en la atmsfera. Microbiologa de la

atmsfera en el interior de edificios. La microbiologa de la atmsfera en el ambiente hospitalario y en la industria. MDULO IV: ASPECTOS BIOTECNOLGICOS DE LA ECOLOGA MICROBIANA Tema 9: Contaminacin ambiental Tratamiento de desechos slidos. Tratamiento de aguas de desecho y aguas negras. . Microbiologa del agua potable. Aspectos ecolgicos del control del biodeterioro. Biomagnificacin de compuestos sintticos. Interaccin microbiana con contaminantes inorgnicos y xenobiticos. Tema 10: Ensayos de biodegradacin. Monitoreo de la biotransformacin de contaminantes xenobiticos. Ensayos de biodegradabilidad y biomagnificacin. Biorecuperacin de los ecosistemas suelo, agua, aire. Tema 11: Los microorganismos en la recuperacin de metales y Energa. Producin de biomasa. Recuperacin de metales y de petrleo. Produccin de combustibles lquidos y gaseosos. Produccin de biomasa microbiana. Tema 12: Poblaciones causantes de enfermedades y control biolgico de pestes. Modificaciones de poblaciones en el husped y en los vectores. Parasitismo y amensalismo microbiano para el control de patgenos. Patgenos microbianos y predadores para el control de pestes de plantas y animales. Ingeniera gentica en el control biolgico.

PROGRAMA DE CLASES DE LABORATORIO Trabajo Prctico N1: Estudio de las poblaciones del ecosistema de raz del cultivo de maz. Influencia de factores ambientales Objetivo Seleccionar bacterias, levaduras y hongos filamentosos cpaces de competir en las mismas condiciones ambientales en que se desarrollan especies de hongos productores de micotoxinas. Trabajo Prctico N2: Bacterias fotosintticas: Columna de Winogradsky Objetivos -Reproducir en el laboratrio un ecosistema natural que corresponde a un sedimento superficial de una laguna eutrfica. -Comparar La tradicional columna de Winogradsky com La placa de Winogradsy. -Demostrar caractersticas morfofisiolgicas de las bacterias fotosintticas que se desarrollen en la columna. Trabajo Prctico N3: Determinacin de la competencia microbiana Objetivos -Seleccionar bacterias levaduras y hongos filamentosos con capacidad para competir en las mismas condiciones ambientales en que se desarrollan especies de hongos productores de micotoxinas. -Comparar las metodologas utilizadas y determinar la utilidad de cada una de ellas en la determinacin de la competencia microbiana. Trabajo Prctico N 4. Interaccin Microbiana Objetivo -Determinar la influencia de bacterias/levaduras/hongos filamentosos competentes sobre le crecimiento y la produccin de toxinas de hongos productores de micotoxinas. Trabajo Prctico N 5: Resistencia a metales pesados y Agroqumicos Objetivos -Aislar y caracterizar microorganismos cuyas capacidades metablicas permitan luego desarrollar sistemas biolgicos capaces de detectar o eliminar iones metlicos y agroqumicos de efluentes contaminados y muestras de suelo. -Deducir la aplicacin biotecnolgica de los resultados obtenidos.

Trabajo Prctico N 6: Monitoreo de hongo patgeno en plntulas de maz mediante la aplicacin de tcnicas moleculares Objetivo Aislar e identificar por PCR a Fusarium verticillioides presente en la zona interna de races de plntulas de maz.

B. CRONOGRAMA DE CLASES Y PARCIALES CRONOGRAMA DE ACTIVIDADES ECOLOGA MICROBIANA AO 2011 FECHA 16 de agosto 20 de agosto 20 de agosto 27 de agosto 27 de agosto 3 de septiembre 3 de septiembre 6 de septiembre 10 de septiembre 10 de septiembre 17 de septiembre 17 de septiembre 24 de septiembre 24 de septiembre 1 de octubre 4 de octubre entrega de Monografias 5 de octubre Discusin de Monografas ACTIVIDAD Discusin Terica Laboratorio Discusin Terica Laboratorio Discusin Terica Laboratorio Discusin Terica Parcial Laboratorio Discusin Terica Laboratorio Discusin Terica Laboratorio Discusin Terica Parcial HORARIO 10-14 10-14 14,30-17,30 8-13 10-14 8-13 14,30-17,30 8,30 -10,30 8-13 14,30-17,30 8-13 14,30-17,30 8-13 14,30-17,30 8-10

C. BIBLIOGRAFA (Obligatoria) -Aaronson, A. 1970. Experimental Microbial Ecology. Academic Press, New York. -Alexander, M .1971. Microbial Ecology. John Wiley and Sons, New York. -Alexander, M. 1977. Introduction to Soil Microbiology, John Wiley and Sons, New York. -Alexander, M. 1977. (ed). Advances in Microbial Ecology. Plenum Press. New York. -Alexander, M.(ed).1984. Biological Nitrogen Fixation: Ecology, Terminology and Physiology. Plenum Press, New York. -Atlas, R M (1990) Microbiologa: Fundamentos y aplicaciones. Compaa Editorial Continental. -Atlas, R M and Bartha R. 1997. Microbial Ecology. Fundamentals and Applications. The Benjamin/ Cummings Publishing Company, Inc. Redwood City, California -Blakeman, J P (de) 1981. Microbial Ecology of the Phyloplane. Academic Press, London. -Brock, T.D 1966. Principles of Microbial Ecology. Prentice-Hall, Englewood Cliffs, N.J. -Brock T D, Madigan M.T Martinko J M Parker J. 1994. Biology of Microorganisms.PrenticeHall, Englewood Cliffs, New Jersey. -Burns, R G and J H Slater (eds).1982. Experimental Microbial Ecology.Blackwell Scientific Publications, Oxford,England. -Campbell, R E.1983.Microbial Ecology. Blackwell Scientific Publications, Oxford, England. -Codd, G A.1984. Aspects of Microbial Metabolism and Ecology. Academic Press, London.

-Colwell, R R and R Morita (eds) 1974. Effect of the Ocean Environment on Microbial Activities University Park Press, Baltimore. -Collins, C.H.; Lyne, PM (1989) Mtodos Microbiolgicos. Editorial Acribia. Zaragoza. Espaa. -Edmonds, P .1978. Microbiology- An Environmental Perspective. McGraw-Hill, New York. -Ehrlich, H L.1981. Geomicrobiology. Marcel Dekker, New York. -Fenchel T and Blakburn T H.1979. Bacterial and Mineral Cycling. Academic Press, London. -Madigan MT, Martinko JM Parker J (2004) Brock Biologa de los Microorganismos, 10 Edicin. Pearson Prentice Hall. Madrid. -Primrose S B and Wardlaw A C .1982. Sourcebook of experiments for teaching of microbiology. Academic Press. London. -Stanier,RY.; Ingraham, J L.; Wheelis, ML Painte, PR.(1981) El Mundo de los Microbios. Prentice Hall. -Starr M P,; Stolf H.; Truper G H.; Balows A.; Schlegel H G.1981. The Procaryots: A Handbook on Habitats. Isolation and Identification of Bacteria. Springer-Verlag, Berln, Heidelberg, New York. -Tortora G J, Funke B R Case CL. (2007) Introduccin a la Microbiologa. 9 Edicin. Editorial Mdica Panamericana S.A. Madrid BIBLIOGRAFA ADICIONAL (Consulta) Artculos cientficos relacionados a cada mdulo, sern discutidos en clase de acuerdo al inters del estudiante por una temtica en particular.