Los diez grandes retos de la vida sinttica

Un equipo Internacional de Investigadores ha elaborado un informe detallado con las enormes ventajas para la biotecnologa y, por ende, para la humanidad que tendra crear organismos completamente artificiales, diseados para satisfacer necesidades, algunas de las cuales consideramos tan imposibles de satisfacer que ni sabemos que las tenemos. La construccin de la vida artificial es uno de los principales retos cientficos de la era de la biologa sinttica. El objetivo de construir la primera clula artificial es ya una posibilidad real lo que sera un hito cientfico y el punto de partida de una amplia gama de aplicaciones, desde la produccin de biocombustibles hasta el diseo de frmacos Los bilogos estn tratando de desarrollar vida artificial, tanto por sus enormes aplicaciones en la biotecnologa y como una forma de arrojar luz sobre la cuestin de los orgenes de la vida. Algunos trabajos, como el llevado a cabo por Aaron M. Leconte y sus colaboradores de la Universidad de la Jolla (California) en los que crearon nuevos nucletidos con los que ampliar el alfabeto de 4 Adenina, Tianina, Guanina y Citosina en los que se basa el cdigo de ADN, demostraron que un cdigo gentico artificial podra servir para albergar ms informacin que los existentes en la naturaleza y servira para crear protenas que ningn ser vivo ha sido capaz de fabricar.

Discovery, Characterization, and Optimization of an Unnatural Base Pair for Expansion of the Genetic Alphabet. Sin embargo, para llegar a crear organismos, completamente diseados en un laboratorio har falta superar diez obstculos fundamentales: 1-Llegar a unconsenso sobregenomas sintticos Un sistema vivo mnimo consta de un componente de informacin, un componente metablico y un recipiente de mantenimiento de ambos componentes, vinculados entre s La receta para hacer de abajo a arriba un organismo basado en un mnimo de auto-que evolucione requiere: (1) un sistema de informacin heredable que se replique y que controle (2) un sistema metablico que convierta recursos en piezas de construccin junto con (3) un contenedor para la localizacin de los genes y el metabolismo, as como la captacin de recursos y la replicacin del sistema a travs de la divisin. Las mayores trabas seran: (a) auto-ensamblaje de los componentes en un proto-organismo; (b) la absorcin o fusin de los recursos en el recipiente (alimentacin);

(c) Contenedores asociados de replicacin del sistema de informacin (replicacin de los genes); (d) la transformacin metablica de los recursos en los piezas de construccin (crecimiento), as como e) la divisin del proto-organismo en dos o ms copias frtiles. 2- Creando desde cero Un sistema mnimo de vida tiene que ser capaz de procesar los recursos que tenga a su alcance y transformarlos en sus propias piezas de construccin para crecer y dividirse 3- Aprendiendo de la naturaleza Hay un nmero mnimo de caractersticas o funciones necesarias para mantener una clula viva que estn en relacin con un entorno particular. 4- Afinar y hacer realidad el concepto de chsis biolgico. El concepto de un chasis gentico, sobre el cual se construiran diversos sistemas artificiales, en los que el cdigo gentico actuara como un circuito integrado es uno de los ms difciles de hacer realidad 5 Fabricacin de los sistemas biolggicos La palabra ortogonal, tomada prestada de las matemticas, aqu resumira la necesidad de que todos los sistemas de la clula acten con una cierta independencia de manera que funcionen sea cual sea el programa gentico que se le de a la clula. 6- La superacin de las limitaciones fsicas y qumicas Varios factores fsicos plantean problemas importantes para que la envoltura de una clula sinttica pueda ser funcional y, por lo tanto, es necesario abordar, en particular, estrategias destinadas a la construccin de las clulas de novo con la bioqumica y diseos similares a los de las clulas naturales. Por ejemplo, la forma de la clula es esencial ya que, en la mayora de los casos, la relacin de volumen respecto a la superficie influye en la expresin gnica. La presin osmtica y el gradiente electroqumico tambin han de tenerse en cuenta. Una limitacin adicional est ligada a la propia naturaleza de los componentes qumicos de la clula. Muchos intermediarios metablicos son altamente reactivos y que pueden dar lugar a reacciones secundarias no deseadas. Esta es la raz de muchos procesos de envejecimiento. Muchos organismos eucariotas han utilizado la compartimentacin en los orgnulos para resolver este obstculo Hay tambin limitaciones asociadas con la capacidad de la clula para perpetuarse. 7- De los modelos a las clulas y la de vuelta al modelo La Materia viva coordina el metabolismo (por ejemplo, la produccin de energa a travs del catabolismo y el uso de la energa para construir estructuras celulares a travs de anabolismo), el almacenamiento y procesamiento de informacin (por ejemplo, la transcripcin del ADN, la

traduccin del ARNm, etc), as como los procesos de compartimentacin y entidades (por ejemplo, clulas formacin de la pared, el transporte de membrana, etc), cada uno con sus propias escalas de longitud, tiempo, energa y masa. Estas escalas muy diferentes plantean retos enormes para el modelado y la simulacin computacional, no muy diferente de las dificultades a escala mltiple que se encuentran en la modelizacin del clima .. 8- La replicacin y la reproduccin Freeman demostr convincentemente que, mientras que con la reproduccin (hacer una copia similar) se pueden acumular nueva informacin, la replicacin (hacer una copia idntica) est condenada a acumular errores. 9- Hacia una estrategia de diseo integrado de organismos sintticos La seleccin natural ha demostrado, sobradamente, ser capaz de crear organismos con la mxima complejidad que de forma natural se puede alcanzar Las estrategias de seleccin tales como la evolucin dirigida, la evolucin de adaptacin y otros enfoques darwinianos podra dar lugar a una aceleracin exponencial de la consecucin de formas de vida artificiales. 10 Acompasar el desarrollo cientfico con la informacin a la opinin pblica La experiencia sobre la percepcin pblica de los alimentos genticamente modificados, especialmente en Europa, debe servir de leccin para la implementacin de una plataforma slida de informacin que debe ir de la mano con el desarrollo de sistemas sintticos. La asociacin por la opinin pblica entre la Biologa Sinttica (SB) y la biotecnologa que se espera. Por otra parte, el nombre mismo de la disciplina, la biologa sinttica, parece haber sido calculada para producir una fuerte reaccin negativa (http://www.synbiosafe.eu/). De hecho, la referencia a la muy reciente creacin de una bacteria sinttica en primer lugar, a pesar de su artificialidad limitada y su evidente falta de peligro, ha provocado una reaccin negativa sin precedentes. Sera un error olvidar que los principales peligro estn asociados a la los organismos naturales. Gritar que viene el lobo sin cerciorarse de que est ah siempre ha trado malas consecuencias cuando el verdadero depredador ha aparecido.

Fuente: Editorial Springer Systems and synthetic biology