Protenas: Relacin Estructura - Funcin

Protenas: Relacin Estructura - Funcin

Macromolculas proteicas
Funciones genricas

Propiedades fisico-qumicas
cido-base
Solubilidad
nin
Reacti!idad qumica

Protenas fibrosas
Estructura general: fibras
"ueratinas
#ol$geno

Protenas de membrana
Estructura general
%opologa de membrana
&nsercin en la membrana
Protenas globulares: 'emoglobina
Estructura de Mioglobina ( 'emoglobina
#ur!as de unin de )
*
: transporte
#ambio conformacional ( cooperati!idad
'emoglobinas mutadas: +, falciforme
Para Enrique Castro
Los trabajos de terceros
retienen su licencia original
Enrique Castro, 2003
* 2010 Enrique Castro
Protenas: funciones generales
Protenas: funciones generales

Enzimas
Metabolismo
Sealizacin
Expresin gnica

Regulacin
Sealizacin
control gnico

Defensa
Sistema inmune

Motores
moleculares
Transporte intracelular
Movimiento celular

Transporte
Intracelular
Extracelular

Almacenamiento
Ligandos unidos
Protena

Estructural
!itoes"ueleto
#rg$nulos% membranas
Matriz extracelular
Fosforilasa
Prot. Quinasas
!"#, $!"#%oli&erasas
"ctina, Queratinas,'ubulina
istrofinas
Col(geno
)e&oglobina
"lb*&ina s+rica
Ferritina
,-oalb*&ina
Cinesinas
ina&ina
.iosinas
$ece%tores /PC$
Factores de transcri%ci0n
Factores .)C
1n&unoglobulinas
1&%ortinas2
e3%ortinas
#at$lisis
interacciones
macromoleculares
unin de
ligandos
Enrique Castro, 2003
- 2010 Enrique Castro
Propiedades de las protenas
Propiedades de las protenas

Solubilidad:

solubles en agua

insolubles en solventes org$nicos

dependencia de p& e I

Espectroscpicas:

absorcin a '() nm *+%,- *+ es .luorescente-

'/' nm *peptdico-

cido-base:

an.teras

carga neta depende del p&

Propiedades:
Reconocimiento:
0eaccin del 1iuret

0eaccin xantoproteica

Estabilidad:

desnaturalizacin por calor

2idrlisis
Precipitan por3
tricloroactico
&!l#
4
Etanol%
cloro.ormo !elson 4 Co3, 56 Ed, %. 70
Enrique Castro, 2003
. 2010 Enrique Castro
Dadores y aceptores de pdH en protenas
Dadores y aceptores de pdH en protenas
Enrique Castro, 2003
/ 2010 Enrique Castro
Protenas: propiedades cido-base
Protenas: propiedades cido-base
ur!a de titulacin de "emoglobina
E
#
u
i
!
a
l
e
n
t
e
s


a
$
a
d
i
d
o
s
%cido
base
arga
neta
&egati!a
positi!a
p'(p)
arga neta
p'*p)
arga neta
+
+
+
+
+
+
+

+
+
' 4 5 ( /) /'
p),-./
p'
0
1
)
'6
6)
76
'6
6)
76

Anfteras
8rupos $cidos 9 grupos b$sicos

arga depende del p'

Punto isoel2ctrico
p& al cual carga:)
Enrique Castro, 2003
0 2010 Enrique Castro
Protenas: grupos ionizables
Protenas: grupos ionizables
8erg, '9&oc:;o, <tr9er =6 Ed. %. 33
pH = pK
a
+log(
A
-
|
HA|
)
Enrique Castro, 2003
1 2010 Enrique Castro
Protenas: Solubilidad y pH
Protenas: Solubilidad y pH
+

+
+

+
+

+
+

+ +

+
+
+
+
+
+
+
+
+ +
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+ +
+
+
+
+
p'*p)
carga neta 0
repulsin

p'(p)
carga neta -
repulsin
p',p)
carga neta +
;o repulsin de largo alcance posibilita
interacciones locales
Puentes salinos e interacciones
2idr.obas *van der +aals-
Solubilidad *mg<ml-
de la =>lactoglobulina
p'
Precipitacin isoelctrica:
Solubilidad mnima a p'2p&
Enrique Castro, 2003
3 2010 Enrique Castro
Protenas: Solubilidad y fuerza inica
Protenas: Solubilidad y fuerza inica
+

+
+

+
+

+
+

+
+

+
+

+
+

+
?uerza inica% I
L
o
g
*
s
o
l
u
b
i
l
i
d
a
d
-
Precipitacin por salado:
no desnaturalizante
re!ersible
f%cil 3 barata
@tms.era inica impide
interacciones
macromoleculares directas
E4ceso de sal 5secuestra6
agua de "idratacin de
las macromol2culas
^)7
adicin de sal
^)7
adicin de sal
Salting-in
Aumento de solubilidad con )
Salting-out
Disminucin de solubilidad con )
Enrique Castro, 2003
4 2010 Enrique Castro
Protenas : estabilidad y desnaturalizacin
Protenas : estabilidad y desnaturalizacin

Desnaturalizantes
!alor *todos% pd2-
Extremos de p& *ionizacin% salinos% pd2-
solventes org$nicos
detergentes
caotrpicos *urea% guanidinioA!l- *pd2-
efecto >idrof0bico
%
m
'ransici0n r(%ida?
#ooperati!idad

Desnaturalizacin
P+rdida de estructura 3 nati-a @ des%lega&iento
<in rotura de Enlaces co-alentes
Coo%erati-a
1rre-ersible Asal-o condiciones controladasB
ProteCnas desnaturali:adas
Cadenas des%legadas
9 entrela:adas
Enrique Castro, 2003
56 2010 Enrique Castro
Protenas: Unin y reactividad
Protenas: Unin y reactividad

8nin estereospec9fica
Dni0n a ligandos
Dni0n %roteCna#%roteCna
Dni0n a otras &acro&ol+culas
Por enlaces dbiles: superficies complementarias

Reacti!idad #u9mica
!at$lisis3 Enzimas
Ligando
ProteCna de uni0n
interacci0n su%erficial
estereos%ecCfica
E
Superficies
complementarias
1n&unoglobulina
&nteraccin
antgeno-anticuerpo
%+%tido )1F
&nteraccin macromolecular:
actina-misosina muscular
Enrique Castro, 2003
55 2010 Enrique Castro
Protenas: Relacin Estructura - Funcin
Protenas: Relacin Estructura - Funcin

Macromolculas proteicas
Funciones genricas

Propiedades fisico-qumicas
cido-base
Solubilidad
nin
Reacti!idad qumica

Protenas fibrosas
Estructura general: fibras
"ueratinas
#ol$geno

Protenas de membrana
Estructura general
%opologa de membrana
&nsercin en la membrana
Protenas globulares: 'emoglobina
Estructura de Mioglobina ( 'emoglobina
#ur!as de unin de )
*
: transporte
#ambio conformacional ( cooperati!idad
'emoglobinas mutadas: +, falciforme
Enrique Castro, 2003
5* 2010 Enrique Castro
Estructura tridimensional: prot. de membrana
Estructura tridimensional: prot. de membrana
7licosilacin

secuencias es%ecCficas

e3tracelular
'lice o transmembrana

aa a%olares

20#2G aa A3#5 n&B

8lucle insertado

ida 9 -uelta

aa cargados a%areados
%erminador

aa b(sicos Acarga B

Dni0n a fosfolC%idos AB
E9tracelular

/lobular

Dno o -arios do&inios

&ntracelular

/lobular

Dno o -arios do&inios

7licoforina de eritrocitos
Protena integral de membrana
HG.0 n&
Enrique Castro, 2003
5- 2010 Enrique Castro
Identificacin transmembrana: Perfil de hidropata
Identificacin transmembrana: Perfil de hidropata
30 I
20#2G aa
=#J -ueltas K#>+lice
Fentana
20 aa
: #
Fentana
20 aa
Enrique Castro, 2003
5. 2010 Enrique Castro
Topologa de protenas transmembrana
Topologa de protenas transmembrana
n ;nico segmento %M< : e9tracelular
n ;nico segmento %M< # e9tracelular
M;ltiples segmentos %M
M;ltiples segmentos %M
En diferentes cadenas
#anal ;nico
Sin segmentos %M< +ncla=es co!alentes
+mbos
#on segmentos %M ( +ncla=es co!alentes
Enrique Castro, 2003
5/ 2010 Enrique Castro
Insercin de protenas de membrana
Insercin de protenas de membrana

Se$ales topog2nicas
secuencia se$al &-terminal
secuencia se$al interna
secuencia de parada de
transferencia
secuencia se>al:
8$sico ? 56-5/ @idrfobos
parada de transferencia:
*6-*/ @idrfobos AtransmembranaB
Enrique Castro, 2003
50 2010 Enrique Castro
Topologa transmembrana y seales de insercin
Topologa transmembrana y seales de insercin
se>al :-terminal
5 stop interno
se>al interna
5 stop interno
0 se>al internas
0 stop internos
5 se>al :-terminal
- se>al internas
- stop internos
Enrique Castro, 2003
51 2010 Enrique Castro
Prot. Perifricas: Anclajes lipdicos a la membrana
Prot. Perifricas: Anclajes lipdicos a la membrana
Enrique Castro, 2003
53 2010 Enrique Castro
Protenas: Relacin Estructura - Funcin
Protenas: Relacin Estructura - Funcin

Macromolculas proteicas
Funciones genricas

Propiedades fisico-qumicas
cido-base
Solubilidad
nin
Reacti!idad qumica

Protenas fibrosas
Estructura general: fibras
"ueratinas
#ol$geno

Protenas de membrana
Estructura general
%opologa de membrana
&nsercin en la membrana
Protenas globulares: 'emoglobina
Estructura de Mioglobina ( 'emoglobina
#ur!as de unin de )
*
: transporte
#ambio conformacional ( cooperati!idad
'emoglobinas mutadas: +, falciforme
Enrique Castro, 2003
54 2010 Enrique Castro
Estructura tridimensional: Prot. Fibrosas
Estructura tridimensional: Prot. Fibrosas

aracter9sticas estructurales
!adena polipetdica extendida en un eBe axial
Secuencias cortas repetitivas
Interacciones laterales3 asociacin en .ibras
0esistencia mec$nica a tensin<contraccin axial
Insolubles3 estructuras slidos
?uncin estructural *citoes"ueleto% matriz extracelular-

Tipos

Familia de
Filamentos intermedios

intracelulares
Familia de #ol$geno

.atri: e3tracelular
Enrique Castro, 2003
*6 2010 Enrique Castro
Protenas fibrosas: Composicin en aa
Protenas fibrosas: Composicin en aa
.atteLs, -an)olde 4 ">ern 36Ed A2002B. 'abla =.2
o#queratina?
alif(ticosM20N
Enrique Castro, 2003
*5 2010 Enrique Castro
Protenas Fibrosas: o-queratinas
Protenas Fibrosas: o-queratinas

o-#ueratinas
Cnidad b$sica3 2lice enrollada *coiled coil-
0ica aa ali.$ticos 9 !9s
Interacciones laterales3 asociacin en .ibras
Entrecruzamiento por &SP *ricas en S-
C, :-%erminal

-ariable

globular
C, #-%erminal

-ariable

globular
C, #entral

conser-ado O315 aa

>elicoidal Acoiled coil le-0giroB

re%etici0n Aa#b#c#d#e#f#g#B
n
a,d >idr0fobosB
+rrollamiento le!giro de dos - o @lices
Acoiled coilD @lice enrolladaB
&nteracciones
@idrofbicas
entre @eptadas
unen las @lices
o#>+lice
aa a%olares cada 5, J
<ecuencias es%aciadoras
A7#17aaB
Enrique Castro, 2003
** 2010 Enrique Castro
Familia de Filamentos Intermedios
Familia de Filamentos Intermedios
Lodis> et al. A2000B 56 Ed
Enrique Castro, 2003
*- 2010 Enrique Castro
o-queratinas: ensamblaje de IF
o-queratinas: ensamblaje de IF
Cmero coiled-coil paralelo
%etr$mero antiparalelo AsimtricoB
o&. !#ter&inal 9 es%aciadores
esenciales en di&eri:aci0n
10 n&
2#3 n&
asociaci0n lateral de %rotofila&entos
asociaci0n cabe:a#cola de tetr(&eros
asociaci0n >elicoidal Ale-0giraB de
5 de %rotofibrillas
Enrique Castro, 2003
*. 2010 Enrique Castro
-queratinas
-queratinas

:ibro9na de seda

Secuencia repetitiva *8l9>@la-

n
Cnidad b$sica3 l$minas apiladas
0esistente axial% .lexible lateral
Seda de ara>a

.e:cla :onas a&orfas2cristalinas

+la
7l(
Puentes de >idr0geno inter>ebra
gran
resistencia
tensil
fle3ible
A-dPB
interacciones de
-an der Paals
Enrique Castro, 2003
*/ 2010 Enrique Castro
Protenas Fibrosas: Colgeno
Protenas Fibrosas: Colgeno

aracter9sticas
Tres cadenas similares *2o
1
?1o
2
)
D/)6) aa cada una
!omposicin aa especial
E6F 8l9% D')>'6F Pro<&9p
aa modi.icados *&9p% &#>L9s-

Secuencia repetitiva *8l9>G>,-

n

-A7-E-FB
n
-
E: usual&ente Pro
F: frecuente )9%
%ropocol$geno

3 cadenas2tri%le >+lice

.r 27G ;a

300 n& largo

1,5 n& di(&etro

Enrique Castro, 2003
*0 2010 Enrique Castro
Colgeno: aa modificados
Colgeno: aa modificados
.-')-Pro A'(pB

fuer:a Cy#endo

%osici0n Q
--')-Pro G /-')-Pro

Pd) -Ca agua

/-')-H(s A'(pB

/licosilaci0n Aensa&blaje tri%le >+liceB

Enlaces cru:ados AaldolB? Fibras

Enrique Castro, 2003
*1 2010 Enrique Castro
Triple hlice de colgeno: estructura y estabilidad
Triple hlice de colgeno: estructura y estabilidad
'lice de col$geno

@#G5R @E1GGR

le-0gira

aa %or -uelta? 3,2

a-ance %or aa ? 0,2S n&

3,3 aa
0,SG n&
>+lice
le-0gira
tri%le >+lice
de3tr0gira
su%er>+lice
de3tr0gira
pd' intercatenarios

/l9#!) = ,@C Aotra cadenaB

trans#a3iales
"rrolla&iento
no se%arable
-
er
aa @acia el interior

s0lo /l9 Ano $B

&utado en ,1, E<

7l( en rojo
Secuencia 7l(-E-F

!o co&%atible o#>+lice

!o co&%atible #la&ina
Restricciones estricas

(ngulo %refijado Pro

%irrolidina >acia fuera

Are%ulsi0n est+ricaB

Q? Cy#endo
Enrique Castro, 2003
*3 2010 Enrique Castro
Funcin de 4-hidroxi-Pro (Hyp)
Funcin de 4-hidroxi-Pro (Hyp)
)
*
#)
*
+scorbato
AFita&ina CB
es>idroascorbato
Prolil-.-@idro9ilasa

tetr(&ero o
2

@ P1

FeA11B co&o cofactor

consu&e ascorbato

Escorbuto
'(p IcongeladaJ en conformacin @lice
Aefecto estereoelectr0nicoB
'(p estabiliKa triple @lice
Enrique Castro, 2003
*4 2010 Enrique Castro
Tipos de colgeno
Tipos de colgeno
Enrique Castro, 2003
-6 2010 Enrique Castro
Fibras de colgeno
Fibras de colgeno
Puentes cruKados ')-H(s
!#ter&inal = C#ter&inal
tridi&ensional
Ensambla=e

alinea&iento cabe:a#cola

)ueco =5#=J n& A125#12GB

MG0 n& di(&etro

Enrique Castro, 2003
-5 2010 Enrique Castro
Hyl: Puentes cruzados
Hyl: Puentes cruzados
Enrique Castro, 2003
-* 2010 Enrique Castro
Biosntesis de colgeno
Biosntesis de colgeno
')-H(s: esencial %ara
ensa&blaje de tri%le >+lice
')-H(s: esencial %ara
ensa&blaje de fibras
Enrique Castro, 2003
-- 2010 Enrique Castro
Fibras elsticas
Fibras elsticas

Elastina
$ica en /l9 A30NB, "la, Fal
#villo aleatorio3 extensible
Entrecruzada3 desmosina
puentes cruKados
desmosinas A. H(sB
Enrique Castro, 2003
-. 2010 Enrique Castro
Protenas: Relacin Estructura - Funcin
Protenas: Relacin Estructura - Funcin

Macromolculas proteicas
Funciones genricas

Propiedades fisico-qumicas
cido-base
Solubilidad
nin
Reacti!idad qumica

Protenas fibrosas
Estructura general: fibras
"ueratinas
#ol$geno

Protenas de membrana
Estructura general
%opologa de membrana
&nsercin en la membrana
Protenas globulares: 'emoglobina
Estructura de Mioglobina ( 'emoglobina
#ur!as de unin de )
*
: transporte
#ambio conformacional ( cooperati!idad
'emoglobinas mutadas: +, falciforme
Enrique Castro, 2003
-/ 2010 Enrique Castro
Equivalencia estructural de las globinas
Equivalencia estructural de las globinas
Enrique Castro, 2003
-0 2010 Enrique Castro
Protoporfirinas y Hemo
Protoporfirinas y Hemo
Enrique Castro, 2003
-1 2010 Enrique Castro
Estructura genrica de la globina
Estructura genrica de la globina
Enrique Castro, 2003
-3 2010 Enrique Castro
Homologa secuencial en las globinas
Homologa secuencial en las globinas
Enrique Castro, 2003
-4 2010 Enrique Castro
Unin del hemo a la globina
Unin del hemo a la globina
1&%edi&ento est+rico
Enrique Castro, 2003
.6 2010 Enrique Castro
Unin del O
2
(1)
Unin del O
2
(1)
Enrique Castro, 2003
.5 2010 Enrique Castro
Unin del O
2
(2)
Unin del O
2
(2)
Enrique Castro, 2003
.* 2010 Enrique Castro
Dinmica molecular de la unin de O
2
Dinmica molecular de la unin de O
2
Enrique Castro, 2003
.- 2010 Enrique Castro
Curva de unin de O
2
a Mb y Hb
Curva de unin de O
2
a Mb y Hb
Enrique Castro, 2003
.. 2010 Enrique Castro
Transporte de O
2

Transporte de O
2

Enrique Castro, 2003
./ 2010 Enrique Castro
Transporte de O
2
a tejidos activos
Transporte de O
2
a tejidos activos
Enrique Castro, 2003
.0 2010 Enrique Castro
Propiedades de un buen transportador
Propiedades de un buen transportador
Enrique Castro, 2003
.1 2010 Enrique Castro
Cooperatividad
Cooperatividad
Enrique Castro, 2003
.3 2010 Enrique Castro
Cooperatividad: ecuacin de Hill
Cooperatividad: ecuacin de Hill
Enrique Castro, 2003
.4 2010 Enrique Castro
Modelos de cooperatividad
Modelos de cooperatividad
Enrique Castro, 2003
/6 2010 Enrique Castro
Cooperatividad: intoxicacin por CO
Cooperatividad: intoxicacin por CO
Enrique Castro, 2003
/5 2010 Enrique Castro
Estructura cuaternaria de la Hb
Estructura cuaternaria de la Hb
C
l
T
C
l
T
Enrique Castro, 2003
/* 2010 Enrique Castro
Cambios cuaternarios en la oxigenacin de Hb
Cambios cuaternarios en la oxigenacin de Hb
Enrique Castro, 2003
/- 2010 Enrique Castro
Mecanismo de la cooperatividad
Mecanismo de la cooperatividad
Estado % Estado R
Enrique Castro, 2003
/. 2010 Enrique Castro
Papel del 2,3-BPG
Papel del 2,3-BPG
Enrique Castro, 2003
// 2010 Enrique Castro
BPG (2): HbF
BPG (2): HbF
#adenas y
'is5.- A'#B = SerA'#B
Enrique Castro, 2003
/0 2010 Enrique Castro
Efecto Bohr: pH
Efecto Bohr: pH
Enrique Castro, 2003
/1 2010 Enrique Castro
Equilibrio CO
2
-HCO
3
-
: Anhidrasa carbnica
Equilibrio CO
2
-HCO
3
-
: Anhidrasa carbnica
Enrique Castro, 2003
/3 2010 Enrique Castro
Efecto Bohr: CO
2

Efecto Bohr: CO
2

Enrique Castro, 2003
/4 2010 Enrique Castro
Acoplamiento del transporte de CO
2
/O
2
Acoplamiento del transporte de CO
2
/O
2
Enrique Castro, 2003
06 2010 Enrique Castro
Papel del NO en el ciclo respiratorio
Papel del NO en el ciclo respiratorio
Enrique Castro, 2003
05 2010 Enrique Castro
Estructura del gen de globina
Estructura del gen de globina
Enrique Castro, 2003
0* 2010 Enrique Castro
Evolucin de los genes de globina
Evolucin de los genes de globina
Enrique Castro, 2003
0- 2010 Enrique Castro
Expresin de genes de globinas
Expresin de genes de globinas
Enrique Castro, 2003
0. 2010 Enrique Castro
Mutaciones en genes de globinas
Mutaciones en genes de globinas
Enrique Castro, 2003
0/ 2010 Enrique Castro
Hemoglobinopatas por mutaciones puntuales
Hemoglobinopatas por mutaciones puntuales
Enrique Castro, 2003
00 2010 Enrique Castro
Anemia falciforme
Anemia falciforme
Enrique Castro, 2003
01 2010 Enrique Castro
Talasemias
Talasemias