UNIVERSIDAD DEL QUINDIO

Programa de Biologa
Facultad de Ciencias Bsicas y Tecnologas
Bioqumica
2015

Asignatura: Bioqumica
Semestre: Tercero
Docente: Ral Eduardo Rivera Quiroga B.Sc., M.Sc.
Taller cidos nucleicos
1. Cules son las diferencias estructurales de las purinas y pirimidinas, grafquelas.
2. Cules son las posiciones de un anillo de purina de un nucletido purinico que
poseen el potencial para formar enlaces de hidrgeno, pero que no los forman en
los pares de bases de Watson y Crick?
3. Una hebra de un ADN en doble hlice tienen la secuencia 5
GCGCAATATTTCTCAAAATATTGCGC 3. Escribir la secuencia de bases de la
hebra complementaria. Qu tipo especial de secuencia tiene este fragmento de
ADN? Puede la doble cadena de ADN formar estructuras alternativas?
4. Calcular el peso en gramos de la molcula de ADN de una doble hebra que se
extendiera de la tierra a la luna (aprox. 320000 km). La doble hlice pesa
aproximadamente 1 x 10 -18g Por cada 1000 pares de nucletidos; cada par de
bases tiene 3,4 (Angstrom), para establecer una comparacin interesante,
pensar que el cuerpo humano contiene aproximadamente 0,5 g de ADN.

5. En las clulas de muchos organismos eucarioticos existen sistemas altamente

especializados para reparar especficamente los errores de apareamiento G-T en
el ADN. El error de apareamiento se repara creando un nuevo par de bases G-C
(no A-T). la reparacin del apareamiento errneo G-T acta al mismo tiempo que
un sistema ms general que repara prcticamente todos los errores de
apareamiento. Puede proponer una razn para que la clula necesite un sistema
especializado para reparar los errores de apareamiento G-T?
6. Explique por qu aumenta la absorcin de luz UV (efecto hipercrmico) al
desnaturalizar el ADN.

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7. La concentracin de una protena o cido nucleico en una disolucin que
contenga ambos complementos, puede estimarse aprovechando sus distintas
propiedades de absorcin de la luz. Las protenas presentan una fuerte
absorcin a 280 nm, mientras que los cidos nucleicos absorben la luz con ms
intensidad a 260 nm. Cuando en una solucin se hayan disponibles cidos
nucleicos y protenas, es posible estimar sus concentraciones respectivas
calculando la absorbancia (A) de la disolucin a 280 y 260 nm y utilizando la
siguiente tabla. La tabla indica el porcentaje de ms total que corresponde al
cido nucleico en funcin de R280/260 (relacin de absorbancia). El factor F,
permite corregir la lectura de la absorbancia a 280 nm para obtener una mejor
estimacin de la concentracin de la protena. La concentracin de la protena
(mg/ml) es igual a F x A280 (suponiendo que la cubeta tenga 1cm de espacio de
paso de luz). Calcular las concentraciones de la protena y cido nucleico si
A280= 0,69 y A260=0,94.

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8. en dos muestras de ADN aisladas a partir de dos especies no identificadas de
bacterias X e Y, los porcentajes de adenina, sobre el total de bases son 32% y
17% respectivamente. Cules son las proporciones relativas de A-G-CT que
esperara encontrar en las muestras de ADN? en qu supuestos se basa?. Una
de las especies se aisl del manantial termal (64C). sugiera que especie
corresponde a la bacteria termfila. en que se fundamenta su respuesta?
9. Dibuje las siguientes estructuras y ordenelas segn su solubilidad relativa en
agua (de ms soluble a menos soluble): desoxirribosa, guanina, fosfato. Por
qu estn estas solubilidades en consonancia con la estructura tridimensional de
DNA de doble cadena?
10. El siguiente fragmento de ADN fue secuenciado por el mtodo Sanger. El
asterisco representa un marcador fluorescente.

Una muestra de ADN fue tratada con ADN polimerasa y con cada una de las
mezclas de nucletidos (en un tampn apropiado) indicadas a continuacin. Los
didesoxirribonucleotidos (ddNTP) fueron aadidos en cantidades relativamente
pequeas.

El ADN resultante fue separado por electroforesis en gel de agarosa y las bandas
fluorescentes localizadas. Se muestra el patrn de bandas obtenido con la
mezcla de nucletidos 1. Suponiendo que todas las mezclas fuesen analizadas
en el mismo gel, Qu apariencia tendran los restantes carriles?

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11. Una exonucleasa es una enzima que separa nucletidos de forma secuencial a
partir de una cadena polinucleotidica. La fosfodiesterasa de veneno de serpiente,
que hidroliza nucletidos desde el extremo 3de cualquier oligonucletido que
tenga un grupo 3hidroxilo libre, corta entre el 3hidroxilo de la ribosa o
desoxirribosa y el grupo fosforilo del siguiente nucletido. Acta tanto sobre ADN
de cadena sencilla como sobre ARN y no presenta especificidad de base. Esta
enzima se utiliz en la determinacin de secuencias antes del desarrollo de las
tcnicas modernas de secuenciacin de cidos nucleicos. Cules son los
productos de la digestin parcial por al fosfodiesterassa de veneno de serpiente
de un oligonucletidos con la siguiente secuencia?