Universidad Central de Venezuela

Facultad de Medicina
Escuela Luis Razetti
Ctedra de Bioqumica

TEMA 1.
LA CLULA Y SUS COMPONENTES MOLECULARES

MDULO I:
TOMOS, IONES Y MOLCULAS

Vanessa Miguel
Isis Landaeta

Octubre 2011

INDICE

tomos, Iones y Molculas ......................................................................................... 3

La Estructura del tomo ............................................................................................. 4
Los Enlaces Qumicos .............................................................................................. 12
Fuerzas de Van der Waals y Puentes de Hidrgeno ................................................ 17
Los Compuestos Orgnicos ..................................................................................... 20

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tomos, Iones y Molculas
Objetivos

Contenidos

1) Definir tomo.

tomo

2) Describir la estructura bsica del

tomo.

Ncleo y corteza. Protones, neutrones, quarks,

electrones y orbitales.

3) Definir nmero atmico y nmero de Nmero atmico (Z) y nmero de masa (A).
masa.
4) Indicar las caractersticas de un
elemento dado.

Composicin de protones, neutrones y

electrones. Nmero atmico, nmero de masa,
distribucin de electrones en los orbitales.

5) Comparar la estructura de los

tomos, las molculas y los iones.

Componentes, carga elctrica, enlaces.

6) Definir nmero de Avogadro, mol,

masa molar y peso molecular.

Nmero de Avogadro, mol, masa molar y peso

molecular.

7) Calcular la cantidad de un elemento Peso molecular, conversin entre moles y

o molcula en gramos o moles.
gramos.
8) Definir las expresiones mili, micro,
nano y pico asociadas a gramos y a
moles.

Miligramos (mg), microgramos (ug), nanogramos

(ng) y picogramos (pg). Milimoles (mmol),
micromoles (umol), nano (nmol) y pico (pmol).

9) Comparar el enlace covalente con

el inico.

Tipo de interacciones entre los tomos que

forman el enlace.

10) Comparar el enlace covalente polar

y el enlace covalente no polar.

Electronegatividad entre los tomos que forman

el enlace.

11) Describir los enlaces qumicos

dbiles.

Fuerzas de Van der Waals: dipolo-dipolo, dipolodipolo inducido, fuerzas de dispersin. Puentes
de Hidrgeno.

12) Identificar las frmulas qumicas de Alcoholes, teres, aldehdos, cetonas, cidos
los grupos funcionales de las molculas carboxlicos, steres, aminas, amidas.
orgnicas.
13) Identificar los grupos funcionales
de carbohidratos, lpidos, cidos
nucleicos y protenas.

Alcoholes, teres, aldehdos, cetonas, cidos

carboxlicos, steres, aminas, amidas..

14) Identificar los enlaces qumicos

Enlaces hemiacetal, ter, ster, fosfomonoster,
formados por los grupos funcionales de fosfodister, tioster, amido.
las molculas orgnicas.

Actividad de Aprendizaje
Realiza la siguiente lectura: La Estructura del tomo
La Estructura del tomo
tomo
(Del latin atomun = indivisible)
Es la partcula ms pequea de un elemento que conserva las caractersticas
qumicas del propio elemento. Est constituido por un ncleo formado por protones
(partculas positivas) y neutrones (neutros), rodeado por uno o ms orbitales de
electrones (partculas negativas)
Aunque la mayor parte de un tomo es espacio vaco, los tomos estn
compuestos de partculas ms pequeas llamadas partculas subatmicas. El tomo
se divide en:
Ncleo: Zona densa central compuesta por protones y neutrones,
colectivamente llamados nucleones. Los protones y los neutrones estn a su
vez formados por partculas ms pequeas llamadas quarks.
Corteza: Parte ms externa del tomo compuesta por una nube de
electrones. Los electrones se encuentran en orbitales, los cuales tienen
diferentes formas geomtricas. Un orbital es una regin del espacio en la que
la probabilidad de encontrar al electrn es mxima.
En la tabla 1 se describen las caractersticas de las principales partculas
subatmicas.
Tabla 1. Caractersticas del electrn, el protn y el neutrn

Electrn

Neutrn

Protn

Es una partcula elemental con carga elctrica negativa igual a

1,602 x 10-19 coulomb y masa igual a 9,1083 x 10 -28 g, que se
encuentra formando parte de los tomos de todos los elementos.
Es una partcula elemental elctricamente neutra y masa
ligeramente superior a la del protn, que se encuentra formando
parte de los tomos de todos los elementos.
Es una partcula elemental con carga elctrica positiva igual a
1,602 x 10-19 coulomb, cuya masa es 1837 veces mayor que la del
electrn y que se encuentra formando parte de los tomos de
todos los elementos.

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El tomo de hidrgeno consta de un electrn y un protn, representados en
la Fig.1. Se observa como el electrn se representa girando en un orbital alrededor
del ncleo constituido por el protn.
Fig. 1. Representaciones del tomo de Hidrgeno

El tomo de helio consta de dos electrones, dos protones y dos neutrones y

lucira como se ilustra en la Fig. 2. En esta figura se ilustran los quarks componentes
de los nucleones, los ups (u) y los down (d). Los protones poseen dos u y un d,
mientras los neutrones tienen un u y dos d.
Fig. 2. El tomo de Helio

Nube electrnica

Ncleo:
Protones y neutrones

Para darnos una idea de la relacin de tamao de los componentes del tomo,
podemos imaginarnos que si los protones y neutrones los representamos de 1
centmetro de dimetro, entonces los electrones y los quarks seran ms pequeos

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que el dimetro de un cabello, y el dimetro del tomo entero sera ms grande
que el largo de 30 campos de ftbol y todas las partculas estaran en movimiento.
El ncleo ocupa una regin del espacio 10.000 veces menor que todo el tomo, sin
embargo, casi toda la masa de un tomo est concentrada en su ncleo. El 99,9%
del tomo es espacio vaco.
En condiciones de estabilidad el nmero de los electrones es igual al de los
protones, de manera que el tomo es elctricamente neutro. El nmero de protones
de un determinado tomo se denomina nmero atmico (Z) y es nico y
caracterstico de cada elemento y determina su posicin en la tabla peridica. El
nmero atmico del carbono es 6 y el del uranio es 92, por lo cual sabemos que
tienen 6 y 92 protones respectivamente.
Nmero atmico (z)
Nmero entero positivo que equivale al nmero total de protones existentes en el
ncleo atmico. Es caracterstico de cada elemento qumico
El nmero de masa (A) es el nmero total de protones y neutrones presentes
en el ncleo de un tomo. Los tomos con el mismo nmero atmico, pero distinta
masa atmica (por tener diferente nmero de neutrones) se denominan istopos.
Los tomos con diferente nmero de electrones son llamados iones y por
ende tienen una carga elctrica neta. Por ejemplo el tomo de sodio (Na), tiene 11
protones y 11 electrones (Z=11), mientras que el in Na + tiene 11 protones y 10
electrones, por lo cual es un in con carga positiva. El tomo de Cloro (Cl) est
constituido por 17 protones y 17 electrones (Z=17), pero puede ganar un electrn y
convertirse en el in cloruro (Cl -), el cual posee una carga negativa. Los iones con
carga positiva se denominan cationes y los iones con carga negativa aniones. Los
iones como el Na+ y el Cl- reciben el nombre de monoatmicos porque contienen un
solo tomo. Tambin se pueden combinar dos o ms tomos y formar un in que
tenga una carga neta positiva o negativa. Los iones que contiene ms de un tomo
se denominan poliatmicos, como el caso del in hidrxido (OH -), el in cianuro
(CN-) y el in amonio (NH4+).
En la tabla peridica moderna los elementos estn ordenados de acuerdo con
su nmero atmico (Z) y, por lo tanto, de su nmero de protones (que es igual al
nmero de electrones en tomos neutros).
La distribucin de los elementos en la tabla peridica se basa en que los
elementos de un mismo grupo poseen la misma configuracin electrnica en su
capa ms externa, llamada capa de valencia. Como el comportamiento qumico est
principalmente dictado por las interacciones de estos electrones de la ltima capa,
de aqu el hecho de que los elementos de un mismo grupo tengan similares
propiedades fsicas y qumicas. Por otra parte, la variacin en las propiedades
peridicas se deber al aumento de electrones en esa capa y al aumento de la
carga nuclear, que atraer con ms fuerza a esos electrones. Vamos a explicar este
concepto posteriormente ms detalladamente.
La Configuracin de los Electrones en los tomos
La naturaleza peridica de los elementos se debe a la configuracin de los
electrones. Dicho en otras palabras, la manera en la cual los electrones de los
tomos se organizan alrededor del ncleo de los mismos afecta sus propiedades.

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Los electrones no estn localizados arbitrariamente alrededor del ncleo del
tomo, sino que ellos se distribuyen ocupando sucesivamente los orbitales con
menor energa, completando capas dependiendo de su cantidad. Cada capa tiene
una capacidad limitada de electrones, los cuales se distribuyen en subniveles (ver
tabla 2). Por ejemplo, la capacidad de la primera capa es de dos electrones (un
subnivel s), la de la segunda capa es de ocho electrones (subniveles s y p) y la de la
tercera capa es de18 electrones (subniveles s, p y d).
Tabla 2. Distribucin de electrones en los diferentes subniveles
S Nmero de orbitales Electrones por orbital Nmero de electrones
ubnivel
s

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14

Fig. 5. Distribucin de electrones de algunos tomos

Grupo IA

VIA

VIIA

VIIIA

Litio

Oxgeno

Flor

Nen

Sodio

Tal como se puede apreciar en la Fig.5, el sodio tiene tres capas de

electrones, mientras que el litio tiene dos. Estos tomos lo que tienen en comn es
que ambos tienen un electrn en su capa ms externa. Estas capas externas de
electrones (denominadas valencia de electrones) son importantes al determinar las

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propiedades qumicas de los elementos. Si imaginamos la capa externa (valencia)
de un tomo como una esfera abarcando todo lo que est adentro, entonces es slo
la capa de valencia la que puede interactuar con otros tomos. Por consiguiente, la
valencia de la capa de los electrones de un tomo determina su interaccin con los
tomos cercanos y sus propiedades qumicas. Ya que ambos, el sodio y el litio,
tienen un electrn de valencia, ellos comparten propiedades qumicas similares.
Masas Atmicas
Las masas atmicas se expresan en unidades de masa atmica (uma), unas
unidades relativas de masa basadas en un valor exactamente de 12 para el istopo
C-12 del carbono, el cual tiene 6 protones y 6 neutrones. Debido a que los tomos
tienen masas muy pequeas, se trabaja con muestras que contienen muchos
tomos, por lo cual se utiliza una unidad para describir un nmero grande conocido
de tomos. Esta unidad es el mol. As como existen unidades como el par o las
docenas, para referirnos a dos o a 12 cosas; el mol se refiere a 6,022 x 10 23
partculas. Este nmero se denomina nmero de Avogadro en honor al cientfico
italiano Amedeo Avogadro. Este es el nmero de tomos que hay exactamente en
12 gramos de istopo de carbono-12.
Masa Atmica
La masa atmica relativa de un tomo es el cociente entre la masa de un tomo y la
doceava parte de la masa de un tomo de carbono 12
Nmero de Avogadro
Cantidad de tomos que hay exactamente en 12 gramos del istopo de carbono-12
6,022 x 1023 (602.200 trillones)
Mol
Cantidad de una sustancia que contiene tantas entidades elementales (tomos,
molculas, iones u otras partculas) como tomos hay en exactamente 12 g de
istopo de carbono-12 (6,022 x 1023 tomos)
As vemos que un 1 mol de tomos de carbono-12 tiene una masa de 12 g y
contiene 6,022 x 1023 tomos. Esta es su masa molar que se define como la masa
(en g Kg) de1 mol de unidades (como tomos o molculas) de una sustancia. La
masa molar del carbono-12 en gramos y su masa atmica en uma son
numricamente iguales (12 g y 12 uma respectivamente). Si se conoce la masa
atmica de un elemento tambin se conoce su masa molar.
Para ilustrar estos conceptos vamos a tomar el cobre (Cu) como ejemplo. La
masa atmica del Cu es 63,54 uma. Sabemos que su masa molar es
numricamente igual a su masa atmica pero en unidades de g/mol, por lo cual su
masa molar es 63,54 g/mol. Esto ltimo quiere decir que un mol de tomos de Cu
pesa 63,54 g, o lo que es lo mismo, que 6,022 x 1023 tomos de Cu pesan 63,54 g.

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Masas Moleculares
Cuando los tomos comparten o ceden electrones forman enlaces qumicos.
Cuando dos o ms tomos se unen mediante enlaces qumicos forman molculas.
Molcula
Agregado de por lo menos dos tomos en un arreglo qumico que se mantiene unido
mediante fuerzas qumicas, tambin llamadas enlaces qumicos
La masa molecular o peso molecular (si estamos bajo el efecto de la
gravedad de la Tierra) de una molcula es la suma de las masas atmicas de los
tomos que lo constituyen.
Peso Molecular
Es el peso en gramos de un mol de una molcula
(Igual a la suma de las masas molares de los tomos de su frmula)
PM=g/mol
As, si conocemos las masas molares de los tomos que componen una
molcula, podremos calcular su peso molecular. Por ejemplo, la masa molar del
hidrgeno es 1 g/mol y la del oxgeno es 16 g/mol. Como la frmula del agua es
H2O, 2(1) + 16 = 18, el PM del H2O = 18 g/mol

Actividad de Prctica
Realiza los siguientes ejercicios de prctica.
1. Compare las caractersticas y localizacin en el tomo de los electrones,
protones y neutrones.
2. Cul es la diferencia entre el nmero atmico (Z) y el nmero de masa (A)?
3. Identifique a qu elemento corresponden los siguientes nmeros atmicos:
a) Z=6, b) Z=9, c) Z=17, d) Z=20
4. Cuntos electrones, protones y neutrones hay en un tomo cuyos valores de Z
y A son 35 y 77, respectivamente?
5. Cuntos electrones tiene en su ltima capa el Cloro?
6. Dada la lista: Sodio, azufre, oxgeno, in potasio, cloruro, in magnesio, fsforo.
Identifica en ella los tomos, los iones, los cationes y los aniones. Escribe, para
cada uno de los componentes de la lista, su nmero de electrones y de protones.

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7. Complete en la siguiente tabla el nmero de electrones y de protones de
cada elemento (2 pts):

Na
Na+
Mg++
Cl-

Nmero atmico
(z)
11
11
10
17

Electrones

Protones

8. Qu relacin existe entre mol, masa molar y nmero de Avogadro?

9. Calcule el peso molecular del monxido de carbono (CO).
10. Calcule el peso de 1,5 moles de cafena (C8H10N4O2). Exprselo en gramos,
miligramos y nanogramos.
11. Calcule el peso de 500 milimoles de sacarosa (C 12H22O11) Cuntos tomos de
hidrgeno hay en esa cantidad de sacarosa?
12. Cuntos moles de dixido de carbono (CO 2) hay en 88 g del mismo? Cuntos
tomos de carbono hay en esa cantidad de CO 2?
13. Cuntos moles de cloruro de sodio (NaCl) hay en 29,25 g del mismo?
14. En una masa de carbonato cido de sodio, llamado tambin bicarbonato de
sodio (NaHCO3) (utilizado como anticido estomacal) hay 2,71 x 1024 tomos de
oxgeno Cuntos moles de NaHCO3 hay en dicha masa?
Respuestas.
3. a) carbono, b) flor, c) cloro y d) calcio
4. 35 electrones, 35 protones, 42 neutrones
5. El cloro tiene en su ltima capa 7 electrones
6.
electrones
Sodio (Na)
11
tomos
Oxgeno (O)
8
Fsforo
15
Azufre
16
Cationes In potasio (K+)
18
++
In Magnesio (Mg )
10
Iones
Aniones
Cloruro (Cl-)
18

protones
11
8
15
16
19
12
17

11
7.

Mg++
ClK
K+

Nmero Atmico
(Z)
10
17
18
18

Electrones

Protones

8
18
18
17

10
17
18
18

9. 28 g/mol.
10. 291 g; 291.000 mg; 2,91x1011 ng.
11. 171 g, 6,6223 x1024 tomos de hidrgeno.
12. 2 moles, 1,204 x 1024 tomos de C.
13. 0,5 moles
14. 1,5 moles

Investiga en lnea
En el siguiente enlace: http://www.lenntech.com/espanol/tabla-periodica.htm
Se encuentra una Tabla Peridica interactiva. Cada elemento qumico en esta tabla
contiene un enlace web (link) que explica sus propiedades qumicas, efectos sobre
la salud, efectos sobre el medio ambiente, datos de aplicacin, fotografa y tambin
informacin acerca de la historia y el descubridor de cada elemento. Tambin
puedes consultar el apartado especial de terminologa de los efectos de las
radiaciones sobre la salud.
http://concurso.cnice.mec.es/cnice2005/93_iniciacion_interactiva_materia/curso/mat
eriales/atomo/estructura.htm

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Actividad de Aprendizaje
Realiza la siguiente lectura: Los Enlaces Qumicos
Los Enlaces Qumicos
Una molcula est compuesta de dos o ms tomos que se mantienen unidos
mediante interacciones entre sus capas de electrones externas. Un tomo estable
no reaccionar con otros tomos para formar molculas, esto es, cuando su capa
externa est completamente ocupada o vaca, mientras que ser reactivo si su capa
de electrones externa slo est parcialmente llena. Todos los gases inertes o nobles
(helio, nen, argn, criptn, xenn y radn) tienen llena su capa electrnica externa.
Un tomo reactivo puede lograr estabilidad al perder electrones (cuando vaca
completamente la capa externa) o al ganarlos (si llena de esta manera la capa
externa), o al compartirlos los electrones con otro tomo, cuando ambos tomos se
comportan como si tuvieran las capas llenas. Las prdidas, las ganancias y el
compartir electrones tienen como resultado fuerzas qumicas que mantienen los
tomos unidos en las molculas. Estas fuerzas qumicas se denominan enlaces
qumicos.
Enlace inico
Algunos tomos tienen capas de electrones casi vacas y otros las tienen casi
llenas. Ambos tipos pueden estabilizarse perdiendo los electrones de su ltima capa
o ganando electrones para llenar su ltima capa. Por ejemplo, cuando se combinan
tomos de elementos metlicos (como el sodio) con tomos de elementos no
metlicos (como el cloro), la va que suelen seguir estos tomos para completar su
ltima capa, es que el tomo del metal pierda electrones y el del no metal los gane.
Esto es lo que ocurre cuando se combinan el sodio con el cloro y forman cloruro de
sodio (NaCl). El sodio tiene un nico electrn en su capa ms externa, y lo pierde
con facilidad. De este modo su capa ms externa pasa a ser una capa completa.
Por su parte, el cloro tiene siete electrones en su capa ms externa y facilidad para
ganar otro electrn. De esta forma completa su ltima capa de electrones. El
electrn de la capa ms externa del sodio es transferido a la capa ms externa del
cloro, quedando ambos con su capa ms externa completa. En este momento el
sodio tiene 11 protones en su ncleo y 10 electrones en su corteza, por lo que tiene
una carga de +1, y lo representamos como Na +. El cloro tiene ahora 17 protones en
su ncleo y 18 electrones en su corteza, por lo que tiene una carga de -1, y lo
representamos como Cl -. La diferencia entre las cargas de los iones provoca
entonces una fuerza de interaccin elctrica entre los tomos que los mantiene
unidos (ver Fig. 6). A este tipo de unin se le denomina enlace inico.
El enlace inico
Atraccin elctrica entre iones con carga opuesta

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Fig.6 Enlace inico en la formacin del cloruro de sodio

La atraccin elctrica no se limita a un slo in, sino que cada uno de ellos se
rodea del nmero mximo posible de iones de carga opuesta, formando una red
cristalina inica tridimensional. Los compuestos inicos no forman molculas
independientes (ver Fig.7).

Fig.7. Red Cristalina del cloruro de sodio (NaCl)

La atraccin electrosttica entre iones individuales es dbil, pero en la
estructura cristalina formada, cada in est rodeado por varios iones de carga
opuesta, esto hace que la fuerza de enlace en los compuestos inicos sea muy
fuerte.
Enlace covalente
Un tomo con una capa de electrones parcialmente llena, puede llenar su
ltima capa al compartir electrones con otro tomo. A este tipo de unin se le llama
enlace covalente. Por ejemplo, el oxgeno tiene seis electrones en su ltima capa y
el hidrgeno tiene un electrn. Para ser estables el oxgeno necesita de dos
electrones para completar a ocho su ltima capa, mientras que el hidrgeno
necesita un electrn para completar su nica capa (recuerda que en la primera capa

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slo caben dos electrones). En la molcula de agua el oxgeno forma enlaces
covalentes con dos molculas de hidrgeno, de manera que los tres tomos
completan su capa externa, como se ilustra en la Fig. 8.
Fig 8. Enlaces covalentes en la molcula de agua.

El oxgeno aporta para cada enlace un electrn (en azul y vaco) y el hidrgeno
otro (en rojo y relleno). Cada hidrgeno comparte electrones con el oxgeno.
En el caso del amonaco (NH3), el nitrgeno forma tres enlaces covalentes
con tres tomos de hidrgeno de forma de llevar su ltima capa de 5 electrones a
8 electrones, mientras que los tomos de hidrgeno completan, con el electrn
que comparten con el nitrgeno, su ltima capa (ver Fig. 9).
Fig 9. Enlaces covalentes en la molcula de amonaco (NH3)

Un enlace covalente tambin puede formarse entre dos tomos, en el que uno
de ellos aporta los electrones que van a compartir. Este tipo de enlace se denomina
enlace covalente dativo o coordinado. Un tomo, como el nitrgeno en la
molcula de
amonaco (ver Fig. 9), que posee un par de electrones no
comprometido en un enlace con otro tomo, puede donarlo a un tomo, in o
molcula capaz de aceptarlo. Un ejemplo de este tipo de enlace se puede observar
en la formacin del in amonio, en donde el nitrgeno cede su par de electrones no

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apareados a un in de hidrgeno (como el hidrgeno tiene un solo electrn, al
perderlo queda slo un protn) como se ilustra en la Fig. 10. Este enlace se
representa con una flecha para indicar el tomo donante de los electrones.
Fig, 10 Enlace coordinado en el in amonio

Enlace coordinado

Electronegatividad
Es la fuerza con que un tomo en una molcula atrae los electrones en un
enlace qumico. La electronegatividad no posee unidad, es un nmero arbitrario que
Pauling en 1932 eligi asignndole el valor 4 al elemento ms electronegativo, el
flor. En la Tabla peridica esta propiedad aumenta en los grupos de abajo hacia
arriba y en los perodos de izquierda a derecha.
Se entiende por polaridad al desplazamiento de la nube de electrones hacia
uno de los tomos del enlace (hacia el tomo del elemento ms electronegativo). La
molcula H2 es un buen ejemplo del enlace covalente no polar. Como los dos
tomos son iguales, tienen una atraccin (o afinidad) hacia los electrones igual, por
lo tanto los electrones que se enlazan son igualmente compartidos por los dos
tomos. Un enlace polar se forma cuando los electrones son desigualmente
compartidos entre dos tomos. Los enlaces polares covalentes ocurren porque un
tomo tiene una mayor afinidad hacia los electrones que el otro (sin embargo, no
tanta como para empujar completamente los electrones y formar un in). En un
enlace polar covalente, los electrones que se enlazan pasarn un mayor tiempo
alrededor del tomo que tiene la mayor afinidad hacia los electrones. Un buen
ejemplo del enlace polar covalente es el enlace hidrgeno - oxgeno en la molcula

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de agua. El oxgeno tiene mayor afinidad por los electrones, atrayendo a los
electrones compartidos en el enlace hacia su ncleo.

Actividad de Prctica
Identifica en las siguientes molculas el o los tipos de enlace que mantiene(n)
unidos sus tomos. Justifica tus respuestas.
a) O2
b) H2
c) Metanol (CH3OH)
d) Cloruro de magnesio (MgCl 2)
e) Cloruro de amonio (NH4Cl)
f) In hidronio (H3O+)
Respuestas
a) Un enlace covalente doble entre los dos tomos de oxgeno, completando
ambos tomos su ltima capa con ocho electrones.
o lo que es lo mismo
b) Un enlace covalente entre los dos tomos de hidrgeno, completando ambos
tomos su capa con dos electrones.
c) El carbono forma cuatro enlaces covalentes, tres con 3 tomos de hidrgeno y
uno con el oxgeno. Con cada uno de estos tomos comparte electrones, con estos
cuatro electrones lleva su ltima capa que tiene 4 electrones a 8 electrones,
llenando as la misma. Los tres tomos de hidrgeno completan a dos electrones su
ltima capa. El oxgeno forma tambin un enlace covalente con otro hidrgeno,
completando as los electrones de su ltima capa de seis a ocho.
d) El magnesio forma dos enlaces inicos con dos iones cloruro. El magnesio tiene
dos electrones de su ltima capa, los cuales cede a dos tomos de cloro,
formndose un in magnesio (Mg ++) y dos iones cloruro (2Cl -) cuyas cargas
opuestas ejercen una unin elctrica entre los tres iones.
e) El nitrgeno forma tres enlaces covalentes y un enlace dativo. El in amonio
forma un enlace inico con el cloruro.
f) Dos enlaces covalentes y un enlace covalente coordinado. El oxgeno comparte
electrones con dos tomos de hidrgeno y dona su par de electrones desapareados
a un protn, formando un enlace covalente coordinado.

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Actividad de Aprendizaje
Realiza la siguiente lectura: Fuerzas de Van der Waals y Puentes de
Hidrgeno.

Fuerzas de Van der Waals y Puentes de Hidrgeno

Los tomos pueden interaccionar mediante atracciones elctricas que no
involucran la prdida o ganancia de electrones como el enlace inico. Son
interacciones ms dbiles que los enlaces inicos, pero de gran importancia en las
molculas orgnicas que se encuentran en las clulas. Entre estas interacciones
elctricas (interacciones no covalentes) estn los puentes de hidrgeno y las
Fuerzas de Van der Waals.
Fuerzas de Van der Waals
Las nubes electrnicas de los tomos que constituyen una molcula no estn
distribuidas uniformemente en un momento cualquiera, debido a que los electrones
estn en continuo movimiento en sus orbitales. Un lado de la molcula puede por
casualidad, tener un ligero exceso de electrones en relacin con el lado opuesto, por
lo cual tendr ms cargas negativas. Es decir, en un instante dado puede haber una
regin ms negativa y otra ms positiva en una molcula. Cuando esto ocurre, se
dice que la molcula posee un momento dipolar. La regin negativa puede
interaccionar con la regin positiva de otra molcula o de otra regin de la molcula,
si se trata de molculas muy grandes o macromolculas. Tambin la existencia de
un dipolo en una molcula, puede provocar que otra molcula cercana adopte
temporalmente un dipolo opuesto (dipolo inducido), lo cual como resultado induce
una ligera atraccin entre las dos molculas (ver Fig. 11).
Fuerzas de Van der Waals
Son interacciones electrostticas producidas por fuerzas transitorias, que
tienen su origen en el dipolo que produce en todos los tomos el movimiento de los
electrones alrededor del ncleo

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Fig.11. Representacin de las Fuerzas de Van der Waals

Puentes de Hidrgeno
Los puentes de hidrgeno son un caso especial de interaccin dipolo-dipolo
relativamente fuerte. Se forman entre molculas que contienen tomos de hidrgeno
unidos a tomos electronegativos como F, O y N. Estos tomos son muy
electronegativos con respecto al hidrgeno (tiene mayor afinidad por los electrones)
por lo cual la nube electrnica se encuentra desplazada hacia estos tomos,
quedando el hidrgeno con una carga parcial positiva y los tomos electronegativos
con una carga parcial negativa. Los tomos de hidrgeno interactan mediante
atraccin elctrica con los pares de electrones no apareados de otros tomos
electronegativos, usualmente el oxgeno o el nitrgeno (ver Fig.12)
Enlace puente de Hidrgeno
Interaccin elctrica entre un H unido a un elemento fuertemente
electronegativo, como el F, el N y el O, de una molcula llamado donador y otro
tomo menos electronegativo llamado aceptor del enlace de hidrgeno

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Fig.12 Ejemplos de puentes de hidrgeno

Actividad de Prctica
1. Dada la siguiente lista de enlaces covalentes:
A. C-C
B. C=O
C. C-H
D. N-H
E. O-H
F. H-H
Y consultando la tabla de valores de electronegatividad y la escala de Pauling dada
a continuacin:

Electronegatividad

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Escala de Pauling (diferencia de electronegatividad entre los tomos que
interaccionan):
Enlace Inico (superior o igual a 1,7)
Enlace Covalente polar (menor de 1,7 y mayor de 0.4)
Enlace Covalente no polar (diferencia igual o inferior a 0.4)
Responda.
1.1. Identifique los enlaces covalentes polares, indicando hacia que tomo se
encuentra desplazada la nube electrnica.
1. 2. Identifique cuales tomos podran formar enlaces de hidrgeno con una
molcula de agua, identificando si seran donadores o aceptores del enlace de
hidrgeno.
2. Compare (establezca semejanzas y diferencias) los enlaces inicos, las
interacciones de Van der Waals y los puentes de hidrgeno.
Respuestas.
1.1 . B (hacia el oxgeno), D (hacia el nitrgeno) y E (hacia el oxgeno).
1.2 . B (oxgeno aceptor), D (H enlazado al N como donador) y E (H enlazado al O
como donador).

Actividad de Aprendizaje
Realiza la siguiente lectura: Los Compuestos Orgnicos
Los Compuestos Orgnicos
El carbono es el elemento principal de los compuestos orgnicos. Estos
compuestos que contienen tomos de carbono unidos mediante enlaces covalentes,
constituyen el principal componente estructural de clulas y tejidos. Participan en
infinidad de reacciones metablicas y proveen energa para los procesos de la vida.
Un tomo de carbono tiene un total de seis electrones, dos de estos en el
primer nivel de energa y cuatro en el segundo. Con cuatro electrones en la ltima
capa, cada tomo de carbono puede formar cuatro enlaces covalentes con otros
tomos de manera de completarla con 8 electrones. Los tomos de carbono pueden
forman enlaces covalentes simples muy estables unos con otros. Tambin pueden
compartir dos pares de electrones, formando enlaces dobles (- C = C -). En algunos
compuestos se pueden formar triples enlaces ( C C ). Las cadenas de carbono
pueden ser ramificadas o no ramificadas. Los tomos de carbono tambin pueden
formar estructuras cclicas. El tomo de carbono puede unirse con ms elementos
distintos que cualquier otro tomo. El hidrgeno, el oxgeno y el nitrgeno son los
tomos que con mayor frecuencia se unen a l. Algunos de estos enlaces se
representan en la Fig. 13.

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Fig. 13. Representacin de algunos tipos de enlaces que forma el carbono

Los compuestos orgnicos constituidos solamente por carbono e hidrgeno,

se llaman hidrocarburos. Aunque estos compuestos no son muy frecuentes en los
seres vivos, los combustibles derivados de materiales fsiles son hidrocarburos,
formados por compuestos orgnicos de especies que vivieron y murieron hace
millones de aos
Compuestos Oxigenados
El nmero atmico del oxgeno es 8, lo que quiere decir que tiene 8 protones
en el ncleo. Siendo el oxgeno un compuesto neutro, tendr ocho electrones en la
corteza: 2 en la primera capa y 6 en la segunda. Por tanto, le faltan dos electrones
para completar su ltima capa. Puede conseguir estos dos electrones formando un
doble enlace, como en el caso de la molcula de oxgeno (O 2), o formando dos
enlaces simples, como en la molcula de agua (H 2O).
Esta capacidad de formacin de enlaces covalentes del oxgeno da lugar a
nuevas familias de compuestos carbonados, que se construyen sustituyendo
tomos de hidrgeno de las cadenas carbonadas por un tomo de oxgeno o un
grupo de tomos (grupos funcionales) que contienen oxgeno. Los principales
grupos funcionales oxigenados son el hidroxilo, el carbonilo y el carboxilo.
Alcoholes (R-OH)
Los alcoholes son compuestos carbonados que resultan de sustituir, en un
hidrocarburo, un tomo de hidrgeno por un grupo hidroxilo (-OH). El ms sencillo
de ellos es el metanol, CH3OH (derivado del metano). Otros ejemplos son el etanol
(CH3CH2OH), el propanol (CH3CH2CH2OH) y el 2-propanol (CH3-CHOH-CH3).
Observa que, a partir del propanol, hay que numerar los tomos de carbono y
especificar en cul de ellos se encuentra el grupo hidroxilo, ya que hay ms de una
posibilidad. Si hay ms de dos grupos hidroxilo en la misma molcula se utilizan los
sufijos "diol", "triol", etc. Por ejemplo, el 1,2-propanodiol, CH3-CHOH-CH2OH.

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teres R-0-R
Se forman cuando el hidrgeno que le queda al grupo hidroxilo se sustituye por
un radical hidrocarbonado. El ms simple es el ter etlico, CH 3-O-CH3.
Grupo carbonilo C=O
El grupo carbonilo consiste en un tomo de carbono trigonal unido a un tomo
de oxgeno a travs de un enlace doble, C=O. El carbono puede unirse con los otros
dos enlaces sobrantes a una o a dos ramas de hidrocarburo, lo que dar lugar a dos
familias de compuestos distintas: los aldehdos y las cetonas. Otros compuestos que
contienen el grupo carbonilo son los cidos carboxlicos, los steres, los anhdridos
y las amidas.

Aldehdos
Se forman cuando slo uno de los dos enlaces del carbono del grupo carbonilo
est unido a una cadena hidrocarbonada y el otro est unido a un tomo de
hidrgeno. Se nombran sustituyendo la terminacin -o de los alcanos por la
terminacin -al. El ms simple de ellos es el aldehdo derivado del metano, el
metanal, conocido comnmente como formol, y que se usa para preservar muestras
biolgicas.

Cetonas
Las cetonas se forman cuando los dos enlaces libres que le quedan al carbono
del grupo carbonilo se unen a cadenas hidrocarbonadas. Se nombran como los
alcanos, cambiando la terminacin -o por la terminacin -ona. El ms sencillo es la
propanona, de nombre comn acetona, y que es un disolvente de uso muy comn.

cidos carboxlicos
.
Cuando se une un grupo hidroxilo a un grupo carbonilo se forma un nuevo
grupo funcional, el grupo carboxilo, dando lugar a los cidos carboxlicos. Este
nuevo grupo suele representarse como -COOH. El nombre para este tipo de
compuestos contiene el prefijo cido y el sufijo -oico (se nombran cambiando la
terminacin o de los alcanos por la terminacin -oico). El grupo carbonilo siempre se
va a encontrar al final de la cadena, por lo que no es necesario colocar el nmero
para localizarlo.
Los cidos carboxlicos ocupan un lugar importante dentro de la qumica
orgnica, dado que sirven para la construccin de derivados relacionados, como
steres y amidas. Algunos ejemplos son el cido clico, uno de los principales
componentes de la bilis humana y los cidos alifticos de cadena larga como el
cido oleico y el cido linolico. Tambin se encuentran en la naturaleza muchos
cidos carboxlicos saturados simples. Por ejemplo, el cido actico, CH 3COOH, es

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el principal componente orgnico del vinagre; el cido butanoico,
CH3CH2CH2COOH, es el que da el olor a la mantequilla rancia, y el cido hexanoico
(cido caproico), CH3(CH2)4COOH, es la causa del inconfundible olor de las medias
deportivas despus de hacer ejercicios.

steres
.
Los cidos carboxlicos reaccionan con los alcoholes formando steres
(R-COO-R') y agua.
esterificacin
R-COOH + HO-R'

R-COO-R' + H2O

cido

ster

alcohol

agua

Compuestos Nitrogenados
El tomo de nitrgeno tiene siete protones en su ncleo y siete electrones en
su corteza, dos en la primera capa y cinco en la segunda y ms exterior. Por tanto,
le faltan tres electrones para completar esta ltima capa, y puede conseguirlos
formando: a) tres enlaces simples, b) un enlace simple y uno doble, c) un enlace
triple. Un ejemplo de un compuesto con un tomo de nitrgeno formando tres
enlaces simples es el amonaco (NH3).
Esta capacidad del nitrgeno para combinarse, va a dar lugar a otras varias
familias de compuestos que resultan de la sustitucin de hidrgenos de los
hidrocarburos, por grupos de tomos que contienen nitrgeno. Estos grupos
funcionales dotan al compuesto modificado de propiedades especficas.
Los compuestos con grupos funcionales nitrogenados son las aminas, las
amidas y los nitrilos
Aminas R-NH2
El grupo funcional amina consiste en una molcula de amonaco (NH3) a la
que se le ha quitado un tomo de hidrgeno, -NH2, por lo que ese enlace sobrante
puede unirse con un radical de hidrocarburo. Esto da lugar a un grupo genrico de
compuestos denominados aminas que tienen gran importancia en los seres vivos.
La amina ms simple es la metilamina, CH3NH2. Tambin puede el amonaco perder
dos o los tres tomos de hidrgeno, de modo que el amonaco puede, en realidad,
unirse a uno, dos o tres radicales de hidrocarburo, dando lugar, respectivamente, a
las aminas primarias, secundarias y terciarias.

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Aminocido
Amina 1a

Nicotina

Amidas R-CO-NH2
El grupo funcional amida est formado por un grupo carbonilo, uno de cuyos
enlaces sobrantes est unido a un grupo amina, es decir, -CO-NH2. El enlace que
an queda puede unirse a un radical hidrocarbonado. Esto da lugar a una familia de
compuestos denominados amidas, cuyo ejemplo ms simple es la etanoamida,
CH3CONH2.
Nitrilos R-CN
El grupo funcional nitrilo resulta de un triple enlace entre un tomo de C y otro
de N. El cuarto enlace que puede formar el carbono puede usarse para unirse con
un radical hidrocarbonado, lo que da lugar a la familia de compuestos llamados
nitrilos, cuyo representante ms sencillo es el etanonitrilo, CH3CN.
Una unidad estructural aislada de macromolculas orgnicas se llama
monmero, estos se unen mediante enlaces covalentes formando polmeros.
Algunos de los polmeros importantes para la bioqumica celular son los
polisacridos, los cidos nucleicos, los lpidos y las protenas, y cada uno de ellos
est formado por una clase de monmero caracterstico. En general, los monmeros
son compuestos orgnicos pequeos que se agrupan en clases conforme a sus
propiedades qumicas. Hay cuatro clases de monmeros que vamos a estudiar:
azcares, los monmeros constituyentes de los polisacridos; cidos grasos, las
unidades monomricas de los lpidos; nucletidos, las unidades bsicas de los
cidos nucleicos (DNA y RNA); y aminocidos, los monmeros que forman las
protenas. Estos monmeros se unen mediante diferentes tipos de enlaces, algunos
de los cuales se ilustran en la Fig. 14. Algunos enlaces forman grupos funcionales,
recibiendo su nombre (ter, ster...).

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Fig. 14. Algunos de los tipos de enlaces frecuentes en las molculas
orgnicas

Actividad de Prctica
1. Aparea un grupo funcional de la columna de la izquierda con una estructura de la
columna de la derecha.
a)
b)
c)
d)
e)
f)

Amido
Carbonilo
Carboxilo
ter
Alcohol
Nitrilo

1)
2)
3)
4)
5)
6)

RCO-NH
-R-CN.
R-OH
R-C=O
R-O-R
RCOOH

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2. Identifica en las siguientes estructuras los grupos funcionales y tipos de
enlace:

Metionina
Glucosamina

Acetil-CoA
Actividad de Aprendizaje
Realiza la lectura: Hidrocarburos y Macromolculas de Importancia Biolgica (Anexo
Mdulo I).
Nota: Referencias bibliogrficas del Tema 1 en la parte final del mdulo 3.