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Este dogma fue as hasta los aos 60 a 70. En los aos 70 se descubri que
algunos virus, en su nucleoide, en su centro replicativo, no haba DNA, su
nucleoide era RNA; as apareci la clasificacin de los virus DNA y RNA. Al estudiar
los mecanismos de explicacin de RNA, se vio que estos virus al entrar a la clula
se activaba una enzima, y se vio que a partir de su RNA se fabricaban muchas
copias de DNA, por eso se llaman retrovirus, porque ellos en su constitucin
tienen adems de su RNA, una enzima que el la Transcriptasa Inversa, Reversa, es
decir son capaces a partir del RNA, fabricar una copia de DNA viral, y una vez
fabricada esa copia de DNA, la clula que tiene la trancriptasa no inversa, fabrica
muchos RNA de ese DNA viral ahora. Es la clula la que reproduce al virus, no es
el virus el que se reproduce, es la clula que lo multiplica. Lo nico que hace este
retrovirus es entrar con o tres constituyentes, un RNA y una enzima. Esa enzima
tambin la fabrica el husped, porque en el propio ADN est la informacin para
generar la protena que es la transcriptasa Inversa. Por lo tanto, la clula copia de
un RNA una DNA, y este gen lo que es, es volver a fabricar varios RNA estables,
porque no se desarman, y al mismo tiempo este RNA codifica la transcriptasa
inversa del propio virus y alguna que otra protena. Esto es un hallazgo
importante no solo para entender patologas virales, sino que trae consigo una
herramienta tecnolgica, nosotros podemos producir la enzima transcriptasa
reversa en el laboratorio con esta enzima, se puede fabricar DNA. (PCR, etc.)
El DNA es una doble hebra, donde hay puentes de hidrgeno entre estas
bases nitrogenadas, pero el algn momento una hebra sirve de molde para la
formacin de un RNA, El RNA mensajero. La nica diferencia es que en vez de
Timina el RNA usa otra base modificada, que es el Uracilo. Esta es la nica
diferencia, pero es importante porque la presencia de Uracilo impide que el RNA
sea una doble hebra a su vez, porque si el RNA fuera hebra doble no se podra
leer, por eso es nica, simple. Hoy da sabemos que esta simple hebra es la que
lleva el mensaje de traduccin para generar una protena. De qu manera, se
podra impedir que se formara una protena? Tericamente cmo se les ocurre? Si
tuviera tijeras que hara
Alumna: inhibir con enzimas.
Profe: Las que participan en este proceso.
Alumna: S.
Profe: Tiene sus riesgos, la DNA polimerasa, lo hace para todos los genes, por lo
tanto si inhibes la DNA polimerasa, te mueres. La pregunta es si aqu en este
trozo de DNA hay una mutacin tal que el RNA que se forma va a generar una
protena que tiene un aac distinto y eso hace que esa protean sea intil o
peligrosa, una mutacin tiene sentido, no basta que cambie una base por otra, pq
sabemos que son tres ases las que dan la orden para un aac, por lo tanto hay
duplicaciones. Pero si podra cambiar si estas tres codifiquen para otro aac.
entonce sl a protena ya no es la misma, es otra, basta que cambie un aac. La
enfermedad de Kreutzber Jacob, es gentica, enfermedad que es familiar, hay
gente que lo tiene en Punta Arenas, lo trajeron unos croatas. Ese gen, es la
mutacin de un aminocido, se cambia una valina por una prolina, y eso se
transforma en un prion maligno. De modo que no es buena idea inhibir la RNA
polimerasa.
De qu otra manera?
Alumno: Sintetizar una hebra complementaria de RNA.
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El
se form el vulo, por lo tanto para las primeras enzimas para replicar el DNA, de
las clulas del cigoto, la mama entreg la RNA polimerasa, si no, no podra
duplicarse en dos blastmeros. Podra fecundarse, pero no duplicarse.
Les cuento que en el DNA humano hay 300 millones de pares de bases, pero
los genes tiles no son ms que cinco millones, e decir, el DNA tiene una enorme
cantidad de partes que no sabemos la funcin, el resto no se sabe o estn solo
estructuralmente. Alguien tiene que decir como leer este sistema. Hagan el
siguiente ejercicio: copien una pgina de la Biblia, despus squenle los acentos,
los espacios, las maysculas, las comas, saquen los puntos y traten de leer. Traten
de entender lo que dice, es una ensalada de letras, no se puede leer si alguien no
nos dice donde inicia y donde termina la secuencia. El espaciador nos va dando la
secuencia. En la historia de la escritura ms que las letras importan los espacios.
Si no, no se entiende. Hoy da existen mquinas que secuencian en dos das. El
genoma humano se demor 10 aos en estar casi completamente secuenciado.
Se mete todo el DNA de un salmn y en dos das se entrega la secuencia, ya no
es gracia. Lo que es gracia es cmo leer, de dnde a donde, es una sopa de
letras.
Hoy da sabemos que el inicio de bases es siempre igual. No basta tener la
secuencia, el problema es leer. Se comienza a leer en las secuencias
promotoras, en las secuencias TACs, donde hay riqueza de Adeninas y Timinas,
de ah para adelante se leen los genes. Si se ve la sopa de letras, se ve una zona
rica en TACs se puede asumir que de aqu a ac hay un gen. Podemos espaciar
ciertas cosas. Efectivamente es as.
Se
tienen
zonas
promotoras, estas son de
RNA de E. coli. Se ven
zonas ricas en timinas y en
TACs.
Hay
secuencias
promotoras
donde
comienzan a leerse los
genes. As es como se lee
un genoma. Son 4 letras,
pero la combinacin es
enorme.
Pongamos a funcionar esto. Tenemos DNA, hay una hebra que se leer y ah
parecer RNA mensajero. Pero este RNA m tiene informacin del trozo de DNA
que se est leyendo. Hay una maquinaria biolgica que lee el mensaje del RNA m
para llevarlo a protena. Ejemplo de las cintas de video, podra ser un RNA
mensajero, el aparato para ver la pelcula es la video casetera, que tena dos o 4
cabezales y as se proyectaba y se vea la pelcula. Esto ocurre en la clula, la
video casetera, los cabezales de la casetera, corresponden a otro RNA, es el RNA
ribosomal.
trozos de el, fragmento que es pedazo y pegado, es lo que se llama los intrones y
extrones.
Hay trozos de RNA m que se eliminan, no tienen informacin, se pegan
ciertas cosas, y de ese RNA ms chico, producto de la escisin, del corte de uno
ms grande y pegados, de ese ms pequeo, ah est la informacin para la
protena. Por lo tanto, no es muy fcil hacer el ejercicio, de cuando tenemos toda
la secuencia del ADN, si la tuviramos, eso no significa exactamente que de toda
esa secuencia podamos hacer un RNA mensajero y todo ese RNA mensajero leerlo
como secuencia de aac.
Porque en ese contexto an no ha sufrido el fenmeno de SPLICING, corte
y pegado del RNA. En bacterias con la secuencia de ADN se puede predecir las
protenas que se estn formando. En las clulas animales, vegetales, eucariontes
es ms difcil, porque est ese mecanismo en el medio y hay que ver qu seales
verdaderas existen para entender. Este salto se vio en la dcada pasada de los 90
al 2000, todo el mundo estaba en la locura de la genmica, que era determinar la
secuencia de los genes, hoy da el DNA secuenciado se logra a travs de una
mquina en 48 horas, (pgina sin espacios ni acentos) la pregunta es donde est
la protena, sabeos donde inicia la lectura, donde se cort, el dolor de cabeza es
la PROTEOMICA, qu secuencia de protena o qu protena es la que
efectivamente est codificada en esta ensalada de DNA. Sobretodo saber qu
protenas humanas, mamferas corresponde a ese cdigo de letras de ADN.
No se saben las bases claritas para predecir a ojos cerrados. Pero se est
jugando a eso a nivel molecular. Es caro y complicado. Cuando se sepa, qu? El
peligro de saber rpidamente que tengo un gen defectuoso es que no seremos
asegurados, se cae en un problema tico y legal. Hoy se conoce el gen Brack 1 y
2 que predisponen al cncer de glndula mamaria y de ovario. Se sacan el
sustrato para no tener cncer. Maana aparecer el gen e la diabetes, de
cualquier cosa.
Cuando se analiza la clula, cmo sabe la protena donde ir dentro de la
clula, qu le dice a una protena: usted pertenece a la mitocondria, usted a la
membrana, porque todas se sintetizan en el citoplasma.
Esa informacin est en la propia estructura de la protena, es decir, est en
la propia informacin, en el DNA, se llaman secuencias seales, en las primeras
secuencias de nucletidos.
El RNA m es copia entera o fragmentada del DNA, una posibilidad es q
al RNA se le unen los ribosomas libres en el citoplasma, y al pegarse estos
lectores se comienzan a fabricar estas cadenas proteicas, pegando unos aac
tras otros, resultado de esto, vamos a tener una protena disuelta en el
citoplasma y esa protena, puede ser una que se qued all, y normalmente
es protena hidrofilica, sus aac son solubles en agua, hidrosolubles. Ese RNA
m tiene esa secuencia de aac que son hidrosolubles, la informacin sigue
estando en el DNA. Ejemplo: cmo se metaboliza la glucosa, por medio de la
glicolisis, todo ocurre en el citoplasma para secuencia de degradacin de la
glucosa hasta obtener acido piruvico, as entra a la mitocondria, por lo
tanto las enzimas que participan son protenas hidrosolubles (exoquinasa,
fructoquinasa); hay otra posibilidad: que estas protenas que se form, los
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primeros aac, que por lo tanto, corresponden a una seal del propio RNA
tengan una cierta especificidad para ir a algn organelo, por qu?, porque
tiene aac tales que la membrana, por ejemplo, del cloroplasto, es capaz de
reconocer esta seal, meterla y dejarla en la membrana del cloroplasto.
Esta seal puede hacer que esta protena se vaya a la membrana del
cloroplasto. Tambin se puede ir al peroxisoma, o que tenga al medio y no al
final una secuencia de aac, que hace q esta protena se pliegue de esta
manera e ingrese al ncleo. Las protenas no se forman en el ncleo, las que
hay en el ncleo (histonas estructurales, polimerasas que duplican DNA en
el ncleo), se forman afuera del ncleo, se pliegan de alguna manera e
ingresar al ncleo, porque trabajan adentro, pero se forman afuera, se
pliegan y vuelven a entrar. La informacin de la polimerasa se forma
adentro del ncleo, sale RNA, se pliega y vuelve a entrar. Hay pptido seal
que hace que la protena sea reconocida por la mitocondria, de modo que el
destino est en la propia estructura.
La otra posibilidad es que este RNA, la secuencia de sus propios
nucletidos, haga que los ribosomas, se comience a fabricar una protena,
que se llama SECUENCIA FINAL PEPTIDO SEAL, es una secuencia tal que la
protena inmediatamente se incrusta en la pared del retculo endoplsmico
y eso hace que cuando uno mira un retculo endoplsmico, que est
fabricando protenas, los ribosomas estn pegados o adosados a la
membrana. Los primeros segmentos de la protena tienen afinidad por esta
membrana, los ribosomas van a trabajar all. (clula heptica tiene un gran
RE porque est continuamente fabricando protenas), al mirarlo al
microscopio se ve un RE rugoso precioso. Si a esa clula heptica la cultivo
en el laboratorio y le doy un antibitico que inhibe la sntesis de protenas ,
miro al RE y no va a ser rugoso, ser liso, no tiene ribosomas, porque estos
no estn all, se van a pegar ah, cuando la protena que estn sintetizando
tenga ese pptido reconocido. La informacin de donde, est en la propia
estructura, por lo tanto en el DNA. El destino de todo est fijado.
Molculas
Mediadas
por
receptores.
Colesterol. El propio recetor desencadena
que se forma la vescula. Las cosas ingresan
unidas al receptor.
Vesculas
Clatrinas.
con
protenas
alrededor,
las
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Dibujo vs Microscopa
electrnica de transmisin.
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