Professional Documents
Culture Documents
Populacja
Najprostszy model
p+q=1
Brak migracji
Rwnowaga Hardyego-Weinberga
Jeeli czstoci alleli A1 i A2 to odpowiednio p i q
to czstoci genotypw
!
A1A1
2
p
A1A2
pq + qp = 2pq
A2A2
2
q
Rwnowaga Hardyego-Weinberga
Mutacje
Dobr
Migracje
Dryf
Dobr
Dostosowanie (w) prawdopodobiestwo odniesienia sukcesu
reprodukcyjnego przez osobnika o danym genotypie
A1A1 : w11
A1A2 : w12
A2A2 : w22
w=1s
gdzie s to wspczynnik selekcji
Nie ma znaczenia, czy chodzi o prawdopodobiestwo przeycia, czy o liczb
wyprodukowanych gamet, czy o kondycj potomstwa itp.
walka o byt uproszczona i niekiedy mylca metafora
p w11
w
2 pqw12
w
q w22
w
Przykad empiryczny
Allel CCR5-32
Rzadko spotykany
Allel CCR5-32
A1A1: w11 = 1
A1A2: w12 = 0,75
A2A2: w22 = 0,75
A1A1: w11 = 1
A1A2: w12 = 0,995
A2A2: w22 = 0,995
p = 0,01
A1A1: w11 = 1
A1A2: w12 = 0,75
A2A2: w22 = 0,75
p = 0,01
Dostosowanie (w)
A1A1: w11 = 1
A1A2: w12 = 1
A2A2: w22 = 1 - s
p = 0,01
A1A1: w11 = 1
A1A2: w12 = 1
A2A2: w22 = 0,4
Dostosowanie (w)
A1A1: w11 = 1
A1A2: w12 = 1 - s
A2A2: w22 = 1 - s
p = 0,01
A1A1: w11 = 1
A1A2: w12 = 0,4
A2A2: w22 = 0,4
Eugenika
Eugenika
Po 10 pokoleniach
q = 0,05
!
Po 40 pokoleniach
q = 0,02
Dobr heterozygot
Dobr heterozygot
Rwnowaga
Przykady u czowieka
Mukowiscydoza (dla
najczstszego allelu F508)
Dobr heterozygot
Ucz si najszybciej
rozpoznawa osobniki typowe, co
faworyzuje te nietypowe
Mutacje
Czsto mutacji -
p = p p
'
q = q + p
'
p = p p = p
po n pokoleniach
'
pn = p0 e
=10-5
Mutacje i dobr
Rwnowaga mutacje-selekcja
q =
Migracje
Prosty model
Parametry symulacji
Pocztkowe czstoci alleli
wyspy p=0; q=1
ld
p=1; q=0
!
Wsobno
Czstsze krzyowanie
osobnikw spokrewnionych
Wsobno
Krzyowanie wsobne nie zmienia czstoci alleli, ale wpywa na czsto
genotypw.
!
!
!
!
!
!
Wspczynnik wsobnoci
A1A1
A1A2
A2A2
p2(1-F)+pF
2pq(1-F)
q2(1-F)+qF
Depresja wsobna
Dryf genetyczny
czciowo (polimorfizm)
cakowicie
Model dryfu
Losujemy 10 kulek
Efekt:
Dziaanie dryfu
choroby i pasoyty
zmiany rodowiskowe
konkurencja
So morski
pnocny
Gepard
So morski pnocny
Inne przykady
Gepard
Inne przykady
ubr
Czowiek
Analiza nDNA
Analiza mtDNA
Efekt zaoyciela
Dryf genetyczny
Dla p=0,6; N = 10
Utrata heterozygotycznoci
Utrata
heterozygotycznoci
"
%
t
1
H t = H 0 $1
'
2N &
S. Wright,# 1931
1
1
H t = H 0 dla t = 2N ln( ) 1, 39N
2
2
Przykady Ne/N
grizzly: 0,27
Przykad eksperymentalny
Utrwalenie allelu
Prawdopodobiestwo utrwalenia konkretnego allelu
Dryf i mutacje
Prawdopodobiestwo, e nowy
allel si utrwali wynosi 1/2N
1
2N
=
2N
Ewolucja neutralna
Dryf i dobr
A1A2
A2A2
w 1
1+s
1+2s
Dryf i dobr
Prosty model (kodominacja)
A1A2
A1A2
A2A2
w 1
1+s
1+2s
4 N e sq
1 e
P=
4 N e s
1 e
Dryf i dobr
4 N e sq
1 e
P=
4 N e s
1 e
4 N e sq
1 e
P=
4 N e s
1 e
Wielko
populacji
Mutacja
neutralna
1000
0,05%
10000
0,005%
Mutacja
Mutacja
korzystna (s niekorzystna
= 0,01)
(s = -0,001)
2%
0,004%
2%
~10-20
Dryf i dobr
1
2N
=
2N
2N 2s = 4Ns
1
s
4N e