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1).

Lexique des diffrentes molcules cites dans le cours de biologie


molculaire:
-Triton ou Tween: Dtergents facilitant la rupture de cellules lors de la lyse osmotique
(solubilisation des protines).
-2-mercaptonethanol: Utilis pour la centrifugation diffrentielle lors de la solubilisation des
protines. Rduit les ponts disulfures prsents dans les protines et peut jouer un rle
d'antioxydant biologique.
-Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) : utilis comme inhibiteur des mtallo-enzymes. Son
utilisation est trs frquente dans la purification des acides nucliques (ADN ou ARN) et des
protines (centrifugation diffrentielle).
-Dextran et polyacrylamide: Constituent les gels de la chromatographie par filtration sur gel.
-Agarose: Polymre glucidique naturel soluble dans l'eau chaude. Forme un gel lorsque la
solution est refroidie. Utilis pour la sparation de molcules d'ADN ou de protines.
Constituant du gel de la chromatographie par filtration sur gel.
-Bromure de cyanogne (CNBr): Activation de l'agarose (chromatographie par filtration sur gel).
Hydrolyse spcifiquement les liaisons peptidiques aprs les rsidus mthionine.
-Sodium dodcyl sulfate (SDS): Dtergent anionique qui forme un lien fort avec les protines
leur confrant une forme de btonet. (1 SDS par 2 acides amins). Utilis pour la filtration par
SDS-PAGE en purification de protines. Envahit le coeur hydrophobe des protines.

-Dithiothritol (DTT): Son pouvoir rducteur sur les thiols en fait un ractif trs utilis
en biochimie pour empcher l'oxydation des cystines dans les protines et il coupe
les ponts disulfures. l'tat oxyd, il se cyclise en formant un pont disulfure
intramolculaire.

Phenyl isothiocyanate (PITC) : ou Ractif de la dgratdation d'Edman.


Egalement utilis en HPLC en phase inverse. Ragit avec la fonction amine N-terminale
pour donner un complexe qui, aprs action d'un acide dans des conditions douces libre
une phnylthiohydantone et le peptide restant intact.

-Diethylaminoethyl cellulose (DEAE):rsine charge positivement utilise en chromatographie


changeuse d'ions permettant la sparation spcifique de certaines molcules.

-Thiocyanate de potassium (KSCN): Agent chaotrope, dstabilise la structure native des


protines par rupture des interactions hydrophobes. Autres agents chaotropes: SCN-, ClO4, I-, Ba
2+, Ca 2+, Ure et ion guanidinium.
-Glucose: Aldohexose directement assimilable par l'organisme, dont il est un carburant essentiel,
notamment pour le cerveau.
-Cellulose: Polysaccharide de glucose. Principal constituant structural
des parois cellulaires vgtales, reprsente plus de la moiti du
carbone dans la biosphre. Chaque rsidu glucose runis par des
liaisons (1 4) dune chane est retourn par rapport au rsidu
prcdant et est maintenu dans cette position par des liaisons
hydrognes intracatnaires et intercatnaires.

-Chitine: Constituant structural fondamental de lexosquelette


dinvertbrs tels que les crustacs, les insectes et les araignes, et on la
trouve dans les parois cellulaires de la plupart des champignons et
beaucoup dalgues. Homopolymre de rsidus N-actyl- D-glucosamine
runis par des liaisons (1 4).
-Maltose: Disaccharide form de deux glucoses unis par liaison (1 4),
produit de dgradation de lamidon.
-Lactose: Disaccharide form de galactose uni glucose par liaison (1 4), sucre du lait.
-Isomaltose: Disaccharide form de deux glucoses unis par liaison (1 6), produit de dgradation
de lamylopectine et du glycogne.
-Cellobiose: Disaccharide form de deux glucoses unis par liaison (1 4), produit de dgradation
de la cellulose.
-Saccharose: Disaccharide form de glucose uni au fructose par les carbones anomriques
1( )2;, sucre transport dans la sve des plantes et
stock dans la betterave et la canne sucre.

-Amidon: Glucide complexe form de molcules de D-glucose. Rserve nutritionnelle pour les
plantes et un aliment majeur pour les animaux. Dans le cytoplasme des cellules vgtales sous
forme de granules insolubles constitus d-amylose et damylopectine. La mise en rserve de
glucose sous forme damidon ou de glycogne diminue fortement la valeur des pressions
osmotiques intracellulaires qui seraient atteintes si le glucose tait stock sous forme
monomrique.
--Amylose: Les rsidus D-glucose de l-amylose sont runis par des liaisons (1 4). Ce
polymre rptitif rgulier forme une hlice de pas gauche.
-Amylopectine: Polymre de molcules de glucose que l'on retrouve chez les
plantes. Structure primaire prs dun de ses points de branchement (1 6). Les
rsidus glucose aux points de branchement sont en ralit spars tous les 24-30
rsidus glucose. Son quivalent chez les mammifres est le glycogne.
-Glycogne: Glucide complexe polymre du glucose. Il consiste en une chane de
glucose li en (1-4) et est branch en (1-6) tous les 8 12 rsidus. Il est utilis par les
animaux pour stocker de l'nergie et grce aux branchements permet de librer rapidement du
glucose (principalement dans le foie sous forme de granules cytoplasmiques et dans les cellules
musculaires) au mme titre que l'amidon chez les vgtaux.
-Acide hyaluronique: Glycosaminoglycane rparti largement parmi les tissus
conjonctifs, pithliaux et nerveux (ex : Liquide synovial et humeur vitre des
yeux). C'est l'un des principaux composants de la matrice extracellulaire. Il
contribue de faon significative la prolifration et la migration des cellules.
-Chondrotine sulfate: Glycosaminoglycane constituant le cartilage.
-Dermatan sulfate: Glycosaminoglycane trs rpandu dans la peau.
-Keratan sulfate: Glycosaminoglycane qui constitue la corne, le cartilage et les os.
-Hparine: Glycosaminoglycane qui a des proprits anticoagulantes extrmement puissantes.
Se trouve dans les granules intracellulaires des mastocytes qui bordent les parois artrielles et
qui nest pas un constituent des tissus conjonctifs.
-Glycrol: Dans les organismes vivants, le glycrol est un composant important des glycrides
(graisses et huiles) et des phospholipides. Quand le corps utilise les graisses stockes comme
source d'nergie, du glycrol et des acides gras sont librs dans le sang.
-Sphingosine: Driv des amino-alcools formant la base de la structure des sphingolipides.
-Cholestrol: Strode le plus abondant chez l'animal. Constituant majeur
des membranes plasmiques et abondant dans les lipoprotines du plasma
sanguin. Diminue la fluidit de la membrane prs de la surface car son
noyau rigide interfre avec les mouvements des queues d'acides gras.
-Ribose: Aldopentose et composant de l'ARN utilis dans la transcription

gntique, et est apparent au dsoxyribose qui est un composant de l'ADN. C'est galement un
composant de l'ATP (Adnosine triphosphate), du NADH, et de diverses autres molcules
importantes dans les processus mtaboliques.
-Dsoxyribose: Aldopentose driv du ribose par substitution d'hydrogne en remplacement du
groupement hydroxyle en position 2, ce qui implique la perte d'un oxygne. Composant de
l'ADN.
-Ciprofloxacine: Antibiotique inhibant les topoisomrases.
-Doxorubicine: Anticancreux inhibant les topoisomrases et agent intercalant qui
interfre avec la rplication de l'ADN. Bloque la division cellulaire en phase S.
Traitement de certains cancers, effets secondaires non ngligeables.
-Erythromycine: Macrolide inhibant la synthe protique des bactries mais pas de l'homme.
Agit au niveau de la translocation du ribosome en longation de la traduction.
-Chloramphnicol: Inhibiteur de la synthse protique des bactries mais pas de l'homme. Agit
au niveau de la transpeptidation de l'longation de la traduction.
-Sterptomycine: Aminoglycoside inhibiteur de la synthse protique des bactries mais pas de
l'homme.
-Ttracyclines: Inhibiteurs de la synthse protique des bactries mais pas de l'homme. Agit au
niveau de la fixation de l'ARNt lors de l'longation de la traduction.
-Vemurafenib: Traitement contre les cancers dues des mutations activatrices de RAF. 45% des
mlanomes.
-Imatinib: Traitement contre les cancers dues des mutations activatrices d'un rcepteurtyrosine kinase. Certaines tumeurs gastro-intestinales.
-Rapamycine: Immunosuppresseur qui bloque la prolifration des lymphocytes et la production
d'immunoglobulines en agissant sur mTOR.
-Bromure d'thidium: Agent intercalant dont la fluorescence augmente lorsqu'il est insr
dans l'ADN. Utilis pour la dtection fluorescente de l'ADN bicatnaire.
-SYBR-green: Agent intercalant dont la fluorescence augmente lorsqu'il est insr dans
l'ADN. Utilis pour la dtection fluorescente de l'ADN bicatnaire.

2).Lexique des diffrentes maladies ou troubles cits dans le cours de


biologie molculaire:
-Acidose: Dviation de la valeur normale du ph sanguin. Le bicarbonate est le tampon le plus
significatif.
-Anmie Falciforme: Maladie molculaire rcessive due une mutation de Glu 6 (HbA) en Val
(HbS) dans la squence de la sous-unit de l'hmoglobine de l'rythrocyte. Ce dernier prend
une forme en croissant et devient rigide ce qui gne leur passage dans les capillaires.
L'hmoglobine mutante a une charge anionique moins ngative que l'hmoglobine normale. Les
htrozygotes non malades mais porteurs du trait sont rsistants la malaria.
-Anomalie de squence dans la kratine 14 ou 5: Maladie hrditaire qui altre l'intgrit de la
peau.
-Scorbut: Maladie due une dficience en citamine C. Lors de la synthse de collagne, la prolyl
hydroxylase qui ncessite de l'acide ascorbique, ne peut former des fibres correctement ce qui
entrane des lsions de la peau, une fragilit des vaisseaux sanguins et des cicatrisations
laborieuses.
-Ostogense imparfaite: Mutations dans une des chane du collagne de type I ou de type III.
Par exemple, remplacement de la Gly centrale par Ala entrane une distortion de la triple hlice
et diminue sa temprature de dnaturation.
-Athrosclrose: Dpt de lipides sur les parois des artres. Peut tre due une dficience en
rcepteurs des LDL ou hypercholestrolmie familiale. Relation troite avec le taux de
cholestrol dans le plasma. La formation d'athromes peuvent provoquer la mort par infarctus
du myocarde ds l'ge de 5 ans.
-Hypercholstrolmie familiale (FH): Les homozygotes ont un taux de cholestrol 3 5 fois plus
lev que le taux normal (175mg/100ml). Leurs cellules sont compltement dpourvue de
rcepteurs LDL fonctionnels et sont par consquent incapable d'utiliser le cholestrol des LDL.
-Hmophilie: Anomalie constitutionnelle de la coagulation sanguine en rapport avec un dficit
dun des facteurs de la coagulation. Cependant, dans un tiers des cas, l'hmophilie est
engendre par une mutation de novo. Gne li au chromosome X.
-Daltonisme: Anomalie dans laquelle un ou plusieurs des trois types de cnes de la rtine
oculaire, responsables de la perception des couleurs, sont dficients. Gne li au chromosome X.
-Syndrome d'Angelman: Mutation ou dltion du gne UBE3A qui est soumis l'empreinte
parentale. L'allle paternel est mthyl (silencieux) et seul l'allle materne est exprim. Enfants
trs gais souffrant de troubles psychomoteurs graves. Mutation nouvelle ou hrite. La mre
transmet l'allle mutant 50% de ses enfants, le pre ne le transmet pas.

-Infection du larynx par Corynebacterium diphtriae: Exotoxine diphtrique, protine qui rentre
dans les cellules et possde une activit enzymatique. Facteur d'longation modifi (ajout
d'ADP-ribosyl) inactif et blocage de la traduction. Inhibition de la synthse protique et mort
cellulaire.
--thalassmie: Perte d'expression de la -globuline. Forme d'anmie hrditaire sassocie
une hmoglobinopathie (dficience dans la synthse d'une ou de plusieurs des quatre chanes
formant l'hmoglobine des globules rouges). Cela se traduit par une anmie (taux
d'hmoglobine trs bas) assez importante. On observe galement une hypertrophie de la rate et
des dformations du crne et des os longs. Le traitement se fait par transfusion.
-Syndrome de Li-Fraumeni: Maladie hrditaire dominante chez les jeunes. Cancers et sites
multiples. Due une mutation germinale htrozygote de p53 (Facteur de transcription) dans
50% des cas. Les cellules cancreuses acquirent une seconde mutation (somatique): perte
homozygote de p53 ou effet dominant ngatif.

3). Lexique des diffrents protines cites dans le cours de biologie


molculaire:
-Isoenzyme/isenzyme: enzymes prsentant une squence d'acides amins diffrente d'une
autre enzyme mais catalysant la mme raction chimique. En mdecine clinique, isozyme a
un sens plus restreint en se limitant l'ensemble des formes physiquement distinctes et
sparables d'une enzyme au sein d'un tre humain.
-Hexokinase: enzyme cytosolique qui catalyse la raction de phosphorylation des hexoses sur
leur carbone no 6. Isoenzyme des muscles et du coeur. Affinit pour l'ATP.
-Glucokinase: enzyme qui catalyse la formation de glucose 6-phosphate (et ADP) partir de
glucose et d'ATP. Chez les mammifres, isoenzyme caractristique du foie (et b-pancras).
-Lysozyme: hydrolase acide scrte par les granulocytes et les monocytes. Elle dtruit la paroi
bactrienne en catalysant l'hydrolyse des peptidoglycanes la constituant. Antibiotique corporel.
-Protase: Ensyme de protolyse par hydrolyse des liens peptidiques d'une protine.
-Nuclase de staphylocoque: endo-exonuclease qui digre prfrentiellement les brins simples
d'acides nucliques.
-Hmoglobine: Protine de transport du dioxygne dans l'organisme qui se trouve
essentiellement l'intrieur des globules rouges du sang. Elle est constitue de quatre
chanes : deux chanes et de deux chanes . Chacune de ces chanes est associe un
groupement prosthtique : l'hme. On la symbolise par Hb . Une molcule d'hme
est constitue d'un ion fer complex par une porphyrine. Voir Anmie Falciforme.

-Albumine: protine soluble plasmatique produite par le foie. Coagulable sous l'action de la
chaleur, des acides minraux, de l'alcool, de l'ther. Maintien de la pression osmotique.
-Insuline: Hormone peptidique scrte par les cellules des lots de Langerhans du pancras.
rle majeur dans la rgulation des substrats nergtiques. Premire protine tre squence
et dtermine en 1953 par Fred Sanger. 2 chanes lies par des ponts disulfures.
-Trypsine: Hydrolyse spcifiquement les liaisons peptidiques aprs des rsidus chargs
positivement ( Lysine ou Arginine).
-Cytochrome c: Protine eucaryote trs bien conserve au cours de l'volution ( 38 rsidus sur
105 sont invariants). Une seule chane polypeptidique se trouvant dans la mitochondrie comme
composant de la chane de transport des lectrons. Il doit interagir avec les complexes III et IV de
la chane respiratoire. Tout changement par mutation affectera trs vraisemblablement ces
interactions.
-Histone: Protine servant l'emballage de l'ADN, interagissant avec d'autres histones et avec
ADN ngatif grce ses charges positives. Compactage de l'ADN dans la chromatine la rend tout
fait intolrante tout changement mutationnel. Squence trs conserve chez les eucaryotes.
5 types principaux : H1, H2A, H2B, H3 et H4.
-Fibrinopeptides: Peptides libres lors de la conversion du fibrinogne en fibrine ( pas de
fonction propre).
-Kratine: 2 hlices (chez les
mammifres) de pas droit s'enroule en
super-hlice de pas gauche, le dimre.
Celui-ci s'asscoie avec d'autres dimres
pour former un protofilament, puis une
microfibrille, une macrofibrille et enfin un
cheveu. Protine relativement acide (type
I) ou basique (Type II). Protine fibreuse
retrouve dans les cheveux, les ongles et
les cornes.

-Collagne: Protine fibreuse forme de 3 chaines motif pseudo-rptitif (Gly-X-Y) en


hlices de pas gauche assembles en super-hlice de pas droite. Fibres trs rsistantes la
tension. Existe une vingtaine de types diffrents (I: peau, os tendon, corne, vaisseaux sanguins.
II: cartilage, disques intervertbraux. III: Vaisseaux sanguins, peau foetale). Les molcules de
collagnes en arrangement dcal forme des fibrilles et donne un aspect stri au miscroscope.

-Prolyl hydroxylase: Hydroxylation des rsidus prolines (ex: Synthse du collagne) en


hydroxyproline pour former des fibrilles correctes par ponts hydrogne et augmenter la
temprature de dnaturation du collagne (modifications post-traductionelles). Ncessite de
l'acide ascorbique (vitamine C).
-Myoglobine: protine forme d'une chane unique, contenant un noyau porphyrique avec ion
fer II au centre. Elle est le transporteur intracellulaire principal de l'oxygne dans les tissus
musculaires et stocke l'oxygne dans les muscles.
-Concanavaline A: glycoprotine qui se lie spcifiquement par affinit au D-mannose et au Dglucose. Produite par le haricot sabre.
-Anhydrase carbonique: Enzyme prsente la surface plasmique intracellulaire des
globules rouges qui transforme le CO2 en H2CO3 et inversement.
-Glutamine synthtase: Enzyme bactrienne forme de 12 sous-units identiques
tablissant des relations de symtrie D6. Rle majeur dans la synthse de glutamine.
-Glycogne phosphorylase: Enzyme de dgradation du glycogne en glucose-1-phosphate,
premire tape de la transformation du glycogne en glucose. Raction de phosphorolyse
dans la cellule.
-Glycophorine A : Glycoprotine transmembranaire des membranes plasmiques des
rythrocytes. Porte les antignes de groupe sanguin MNS. Peut se colorer au bleu de Coomassie
dans un SDS-PAGE.
-Spectrine : Protine fibreuse htrodimrique (2 chaines et ) du cytosquelette des hmaties,
relie la membrane-plasmique. Deux de ces htrodimres s'unissent pour former un
htrottramre (2). Rseau hexagonal de htrottramres.
-Lipoprotine de basse densit (LDL) : Transporteur principal du cholestrol dans la circulation
sanguine.
-Topoisomrase : Enzyme polypeptidique qui modifie le surenroulement de l'ADN par rupture et
recombinaison. Indispensable pour la rplication et la transcription, peut tre inhibe par des
antibiotiques et anticancreux.
-Hlicase : Protines qui utilise lnergie dhydrolyse de lATP ou du GTP pour catalyser
louverture dacides nucliques ( rupture des ponts hydrognes entre les bases azotes) apparis
sous forme double brins. Directionnalit de 5 vers 3.
-ARNase ou ribonuclase: Enzyme de type nuclase qui catalyse la dgradation de lARN en
lments plus petits. Attaque nuclophile de l'oxygne 2'.

-ATP synthtase : complexe protique enzymatique qui se trouve dans les crtes
mitochondriales et la membrane plasmique des bactries et des arches. Le rle de
cette protine membranaire est de synthtiser l'ATP partir du gradient lectrochimique de
protons entretenu par la chane respiratoire et ADP, ainsi que de Phosphate inorganique.
-ADN mthyltransfrases: Enzyme qui catalyse le transfert de groupes mthyle d'une Sadnosylmthionine (cofacteur) sur des rsidus cytosine ou adnine. Les cytosines mthyles les
plus connues prcdent un rsidu guanine dans ce que l'on appel les lots CpG1,2.
-Oxydorductase : Catalyse la dmthylation de 5-mthyl-cytosine en cytosine dans l'ADN pour
la gamtogense. Formation de ponts disulfures entre rsidus cystines lors de modifications
post-traductionelles des protines.
-Nuclosome : complexe dADN et de protines (les histones) qui
constituent, chez les eucaryotes, lunit de base de la chromatine. Il
reprsente le premier niveau de compaction de lADN. En contrlant
laccessibilit du double-brin dADN, il est directement impliqu dans la
rgulation de plusieurs processus nuclaires comme la transcription,
la rplication ou la rparation de lADN.
-Facteur de transcription : Protine ncessaire l'initiation ou la
rgulation de la transcription. Les facteurs de transcription sont des
activateurs ou des rpresseurs du complexe transcriptionnel constitu
autour de l'ARN polymrase qui agissent en se fixant sur les squences rgulatrices en amont
des gnes transcrire.
-ADN polymrase : Enzyme de rplication de l'ADN. Fabrique de l'ADN bicatnaire partir
d'ADN monocatnaire en respectant la complmentarit des bases. Travaille dans les fourches
de rplication et allonge l'extrmit 3' de l'ADN. Energie fournie par hydrolyse des liens
phosphates des dsoxyribonuclotides. Ncessite une amorce d'ARN (ARN-dpendante).
-Primase : Enzyme de synthse d'ARN (et des amorces pour la rplication de l'ADN). Travaille
dans le sens 5' vers 3'.
-ADN ligase : Enzyme qui lie les fragments d'Okasaki (ADN) entre eux et lie galement les
morceaux d'ADN aprs utilisation d'enzymes de restriction.
-Cohsine : Complexe maintenant les deux chromatides surs associes lissue de la
rplication.
-Transcriptase reverse : Enzyme qui transcrit l'information gntique de virus de l'ARN en ADN,
qui peut s'intgrer dans le gnome de l'hte.

-Tlomrase : Les eucaryotes ADN linaire utilisent la tlomrase, une variante de la


transcriptase inverse, avec le modle d'ARN contenu dans l'enzyme elle-mme. Pas toujours
prsente dans les cellules humaines. Fabrique le tlomre et l'allonge pour protger le
chromosome.
-ARN polymrase : Fabrique de l'ARN en respectant la complmentarit des bases. Travaille de
5' vers 3'. Ne ncessite pas d'amorce et utilise de NTP donc elle tire l'nergie. Chez les
eucaryotes 3Types : ARN polymrase I (ARN ribosomiaux), II (ARNm, micro-ARN) et III (ARNt,
ARNr et petits ARN circulaires).
-p53 : Facteur de transcription ttramre rgulant certaines fonctions cellulaires importantes
comme la mitose ou la mort programme. Le gne codant pour la protine p53 est inactiv dans
la moiti des cancers chez l'Homme. La plupart des mutations se font sur le domaine fixant
l'ADN. Peut entrainer le syndrome de Li-Fraumeni.
-Histone actyl-transfrase (HAT): enzyme associe l'activation
de la transcription, notamment en agissant sur le remodelage et la
dcondensation de la chromatine, permettant ainsi l'exposition de
nombreux sites de liaisons pour l'ARN polymrase II et pour les
protines de rgulation de la transcription. Actylation des lysines
des histones.
-Histone dsactylase (HDAC) : Enzyme qui dsactyle l'histone
permetant celui-ci de condenser l'ADN. La transcription est
inhibe. L'expression de l'ADN est rgule par l'actylation et
dcactylation.
-Exonuclase : Nuclase, une enzyme qui coupe les acides nucliques (ADN ou ARN). Le prfixe

exo prcise que cette coupure se fait partir d'une extrmit 1, un nuclotide la fois, et dans
un sens 5' vers 3' ou l'inverse.
-Poly A-polymrase : Enzyme d'addition de la queue poly A au signal de polyadnylation lors de
la maturation de l'ADN.
-Splicosome : particule d'pissage, est un complexe dynamique de particules
ribonucloprotiques (composes d'ARN et de protines) et localis dans le noyau des cellules.
Son rle est d'assurer l'excision des introns, des rgions non-codantes de l'ARN pr-messagers et
la suture des exons, qui correspondent aux parties codantes. C'est une tape essentielle du
processus de maturation des ARN messagers, un mcanisme conserv chez tous les
organismes eucaryotes. 5 ARN (U1 U5).

Ribosome : Complexes ribonucloprotiques (c'est--dire composs


de protines et d'ARN) prsents dans les cellules eucaryotes et procaryotes.
Leur fonction est de synthtiser les protines en dcodant l'information
contenue dans l'ARN messager. Ils sont constitus d'ARN ribosomiques, qui
portent l'activit catalytique, et de protines ribosomiques. Les ribosomes
sont constitus de deux sous-units, une plus petite qui lit l'ARN
messager et une plus grosse qui se charge de la synthse de la protine correspondante. 3 sites
E (Exit), P (Proteine) et A(Aminoacyl-ARNt). Ils se trouvent dans le cytoplasme, libres, ou
associs, soit aux membranes du rticulum endoplasmique, soit l'enveloppe nuclaire. Le
ribosome bactrien 70S (50S+30S) contient plus d'ARN que de protine. Le ribosome eucaryote
80S (60S+40S) contient galement plus d'ARN que de protines. Le ribosome mitochondrial par
contre 55S (39S+28S) contient moins d'ARN que de protines.
-Facteurs d'initiation (elF): Protines qui assistent le ribosome pour le dmarrage de
la traduction de l'ARNm en protines. Prparent l'assemblage du ribosome avec l'ARNm et
l'ARNt. Chez les eucaryotes :
-eIF4E, qui se lie spcifiquement la coiffe (inhibe par EBP1)
-eIF4G, qui se lie a eIF4F et la PABP et permet le recrutement de la petite sous-unit ribosome
via eIF3 ;
-eIF3 permet le recrutement du ribosome au niveau de la coiffe sur le complexe eIF4G:
eIF4E:PAPB ;
-eIF2 se lie l'ARNt de dmarrage.
-Facteurs d'longation (eEF) : Protines qui assistent le ribosome dans le dcodage (eEf-1) et la
translocation (eEF-2) de la traduction eucaryote. EEF2 est inactive par AMP kinase lors de
l'effort musculaire afin d'conomiser l'nergie.
-Peptidyl-transfrase :
Enzyme
de
type aminoacyltransfrase entirement
compose
d'ARN ribosomique. Elle est une composante
essentielle du ribosome car elle catalyse llongation
de la chane peptidique naissante. Les ARNt sont
regnrs par amino acyl ARNt synthtase.
-Aminoacyl-ARNt synthtases : Famille d'enzymes
qui catalysent l'estrification des acides amins sur
l'extrmit 3' des ARN de transfert. Cette tape est
essentielle la traduction du message gntique en
protines, les acides amins ainsi ajouts
l'extrmit des ARNt tant incorpors par
le ribosome dans la chane polypeptidique en cours
de synthse. Une enzyme diffrente pour chaque
acide amin.

-Facteurs de terminaison (eRF): Protines qui hydrolysent le lien peptidique entre l'ARNt et la
chaine peptidique forme et dissocient le complexe ribosome-ARNt-ARNm.
-Protine chaperonne : Protine qui aide d'autres protines se replier correctement.
-Drosha : Clivage de Pri-miRNA en Pr-miRNA.
-Dicer : Clivage de Pr-miRNA en miRNA double brin.
-RNA-induced sliencing complex (RISC) : Intgre miRNA double brin pour donner un miRNA
mature.
-Glycosyltransfrase : Catalyse le transfert d'un monosaccharide, depuis un sucre activ
(donneur), gnralement par un phosphate, vers une molcule accepteur (le plus souvent
un alcool ou une amine). Utilise lors de la glycosylation sur srine et thronine en modification
post-traductionelles des protines. Ex : Groupe sanguin ABO.
-Protasome : complexes enzymatiques multiprotiques. Dans les cellules eucaryotes, ils se
trouvent dans le noyau, le cytosol et associs au rticulum endoplasmique. Dgradation des
protines mal replies, dnatures ou obsoltes de manire cible par protolyse (rupture
des liaisons peptidiques par protases). Les protines sont marques pour la dgradation par
une protine appele ubiquitine. Le protasome a une forme de baril et possde une cavit
en son centre cerne par quatre anneaux, fournissant ainsi un espace clos pour la digestion
des protines. Abondant =1% des protines cellulaires.
-Farnesyl-protine transfrase: Catalyse la farnsylation sur cystine lors de modifications
post-traductionelles.
-(Poly)-ADP-ribose-polymrase (PARP): Catalyse la (poly)-ADP-Ribosylation lors de modifications
post-traductionelles de protines sur Arginine, Lysine, Glutamine et Acide
aspartique.
-Ubiquitine: Protine servant de marqueur de protines liminer. Localise dans
tous les compartiments subcellulaires de toutes les cellules des organismes, elle est
dite ubiquitaire. L'ubiquitination dsigne la fixation spcifique et rgule d'une ou
plusieurs ubiquitines sur une protine cible (il faut quatre ubiquitines pour qu'une
protine soit dgrade). Cette modification post-traductionnelle a pour principale
fonction la reconnaissance puis la destruction de la protine ainsi marque, par le
complexe protolytique du protasome. Fixation aux lysines de protines par son
extrmit C terminale. Une tte hydrophobe.
-Mitogen Activated Protein (MAP)-kinases : Famille de protines kinases Serine et Thronine
spcifiques impliques directement dans la rponse cellulaire un stimuli. Elles rgulent la
prolifration, l'expression d'un gne, la diffrenciation, la mitose, la survie cellulaire, l'apoptose,
etc.. Uniquement chez les eucaryotes.

-Protine Ras : Protine exprime par le gne Ras, un proto-oncogne. Une tumeur sur quatre
chez l'Homme possde une mutation de ce gne (25% des mlanomes et nombreux autres
cancers).
-RAF ou MAP kinase kinase kinase : Protine de la voie de transduction des MAP kinases. Activ
par le rcepteur tyrosine-kinase et conduit la rponse la MEK ou MAP kinase kinase. Mutation
activatrices au niveau de RAF (45% des mlanomes).
-MEK ou MAP kinase kinase: Protine de la voie de transduction des MAP kinases. Activ par
RAF et conduit la rponse la ERK ou MAP kinase.
-ERK ou MAP kinase: Protine de la voie de transduction des MAP kinases. Activ par MEK et
conduit la rponse aux protines concernes par le signal.
-Growth factor recpetor bound protein 2 (GRB2): Protine d'adaptation implique dans la voie
de transduction du signal.
-Kinase active par Adnosine Monophosphate (AMPK): Enzyme d'homostasie d'nergie
cellulaire appartenant au systme AMPK ( systme de traducation li aux ressources). Sa
stimulation par AMP inactive les facteurs d'longation (eEF2) et interrompt la traduction. Ainsi,
lors d'un effort musculaire intense, la quantit d'AMP augmente et la traduction ralentit afin
d'conomiser de l'nergie.
-mTOR: Enzyme appartenant au systme mTOR de traduction lie aux ressources. Stimule par
les acides amins ou facteurs de croissance, elle phosphoryle 4EBP1 et ainsi dsinhiber elF4. Elle
peut stimuler S6K par phosphorylation et indirectement stimuler S6, une protine ribosomiale.
Traduction augmente.
- 4EBP1: Inhibiteur de elF4. Lorsqu'elle est active par mTOR, inhibition de elF4 inactive et la
traduction reprend. Systme mTOR de traduction lie aux ressources.
-EcoR1, BamH1, Xho1, Nhe1, Hind III et Xba1: Enzymes de restriction reconnaissant un site de

restriction spcifique palindromique. Rle: reconnaissance d'ADN tranger. Utilises sur les
plasmides bactriens pour insrer de l'ADN.

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