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UNIVERSIDAD NACIONAL

AUTNOMA DE MXICO

CIDOS NUCLEICOS
BASES, NUCLEOSIDOS Y NUCLEOTIDOS I
BCT I (2453)

1
Catalina Crdenas Ascencin
Historia

Dilucidacin de la estructura

2
Freidrich Miescher (1871) aisl del ncleo
de las clulas de pus una sustancia cida
rica en fsforo a la que llam nuclena.

Un ao ms tarde, en 1872, aisl de la


cabeza de los espermas del salmn un
compuesto parecido a la nucleina .

Lo fracciona en un componente proteico


(protamina) y un componente que contiene
P, de carcter cido, que Altmann
denomina cido nucleico

3
Cuando se realiza la hidrlisis
qumica completa de los cidos
nucleicos, se obtiene una mezcla
equimolar de:
Una base nitrogenada
heterocclica:
purina o
pirimidina
Una pentosa:
ribosa o Freidrich Miescher
desoxirribosa.
cido fosfrico . 4
Estudios posteriores a Miescher demuestran la
existencia de dos tipos de cido nucleico: uno
abundante en la levadura, que recibe el nombre de
cido zimonucleico y otro, abundante en el timo,
llamado cido timonucleico.

Posteriormente se comprueba que en la composicin


del llamado zimonucleico hay ribosa, y es llamado
cido ribonucleico (RNA, ARN), mientras que el
timonucleico contiene desoxirribosa, es llamado
cido desoxirribonucleico (DNA, ADN)
5
EXPERIMENTOS DE GRIFFITH

En 1928, Friedrich Griffith utiliz dos cepas de


bacterias de Streptococus pneumoniae (cepa S:
smooth), cuyas colonias eran de superficie lisa y
producan la muerte de ratones. Us tambin una cepa
R no encapsulada (rough), cuyas colonias tienen una
superficie rugosa y que no mataban a los ratones.

6
OBSERVACIONES DE GRIFFITH
La cepa S produca infeccin letal en los ratones de
su laboratorio y los de la cepa R, no lo hacan.
Las cepas S muertas por calor son tambin
inofensivas, excepto cuando se las mezcla con cepa R
vivas.
En este ltimo caso, se puede producir una infeccin
fatal y en los ratones infectados se encuentran
clulas vivas con cpsulas caractersticas de la cepa
S.
Este experimento permiti inferir que algn factor
de la cepa S muerta pasa a las cepas R vivas y las
transforma en cepas infecciosas letales.
Griffith no supo cual era ese factor. 7
EXPERIMENTOS DE GRIFFITH

8
EXPERIMENTOS DE AVERY (1944)

El neumococo tipo R (rough, rugoso) (colonias a la izda.)


puede ser transformado en neumococo tipo S (smooth, liso)
(colonias a la dcha.) por el DNA del neumococo S. Esta
transformacin se transmite a la descendencia.
9
En los aos 40, Oswald Avery, Colin MacLeod, y Maclyn McCarty
revisaron el experimento de Griffith y concluyeron que el factor de
transformacin era el ADN.
Oswald Avery repitiendo el trabajo de Griffith con el agregado de
una enzima que destrua el ADN, demostr que el factor de
transformacin era el ADN.

Cuando Avery agregaba esta enzima, no observaba la


transformacin obtenida por Griffith.

Concluy que el material hereditario era ADN y no una protena.

Su evidencia era fuerte pero no totalmente concluyente, para esa


poca el "candidato principal" para ser el material hereditario eran
una protena.
10
11
En 1952, Hershey y Chase estaban estudiando el ciclo de vida
del bacterifago T2. Dado que el T2 esta compuesto casi
completamente de ADN y protena, el objetivo era
determinar el destino del ADN y la protena durante la
infeccin. Para ello, hicieron crecer clulas infectadas por T2
en presencia de istopos radiactivos (S35 y P32).

Cuando se hacan crecer clulas infectadas por T2 en


presencia de S35, se producan virusT2 con protena
marcada.
Similarmente, cuando las clulas infectadas con T2 se
hacan crecer en presencia de P32, el virus contena ADN
marcado.
12
Los investigadores encontraron que casi toda la
protena radiactiva permaneca fuera de la clula
infectada y que poda ser eliminada sin que se
interrumpiera la infeccin, mientras que el ADN del
fago entraba en la clula infectada.

Dado que los genes de T2 pueden controlar la


maquinaria de una clula infectada, dedicndola a
producir nuevos bacterifagos T2, se deduce que si
es el ADN del fago, y no su protena, lo que entra
al hospedador, el ADN debe llevar informacin
gentica.
13
Experimentos de Hershey y Chase

14
14
Cuando se realiza la hidrlisis qumica completa de los
cidos nucleicos, se obtiene una mezcla equimolar de:
Una base nitrogenada heterocclica:
purina o
pirimidina
Una pentosa:
ribosa o
desoxirribosa.
cido fosfrico .

15
15
BASES NITROGENADAS

16
BASES NITROGENADAS DERIVADAS DE LA PIRIMIDINA

(DNA/RNA)

(DNA)

(RNA) 17
BASES NITROGENADAS DERIVADAS DE LA PURINA

(DNA/RNA)

(DNA/RNA)
18
OTRAS PURINAS NATURALES

CAFENA TEOFILINA

19
PROPIEDADES FSICO-QUMICAS DE LAS BASES
NITROGENADAS

1. Naturaleza bsica

2. Hidrofobicidad y disposicin coplanar

3. Dipolos

4. Tautomera

5. Absorcin de luz

20
TIPOS DE AZCAR

5 5

4 1 4 1
2 2
3 3

RIBOSA DESOXIRRIBOSA
(ARN) (ADN)

21
ACIDO FOSFRICO

22
LIBERTAD CONFORMACIONAL

23
AZCAR DE 5 C (PENTOSA)
RIBOSA

ENLACE GLICOSDICO
DESOXIRRIBOSA
ENLACE TIPO STER

BASE NITROGENADA

NUCLESIDO

NUCLETIDO
PRICA
ADENINA
GUANINA

PIRIMIDNICAS
TIMINA
CITOSINA
URACILO

GRUPO FOSFATO 24
NOMENCLATURA DE NUCLETIDOS Y CIDOS NUCLEICOS

25
NUCLETIDOS

Son las unidades monomricas de los cidos nucleicos


Cada nucletido posee los siguientes componentes
elementales:
Una base nitrogenada
Un azcar (pentosa)
Un fosfato
Cuando la molcula no tiene el grupo fosfato se
denomina nuclesido
NUCLETIDO = NUCLESIDO + GRUPO FOSFATO

26
ADENINA NUCLESIDO

H2O
+
HO -

DESOXIADENOSINA
DESOXIRRIBOSA 27
Nuclesido

NUCLETIDO

HO -

+ H2O

Desoxiadenilato
(Desoxiadenosn -5- monofosfato)
cido fosfrico 28
Funciones de los NUCLETIDOS

1. Constituyentes de los cidos nucleicos

2. Compuestos ricos en energa que dirigen los


procesos metablicos (fundamentalmente la biosntesis)
en todas las clulas

3. Seales qumicas capaces de responden a seales


qumicas en los sistemas celulares (estmulos
extracelulares de tipo hormonal y de otros tipos)

4. Componentes estructurales de cofactores


enzimticos e intermedios metablicos
29
Nucletidos no nucleicos

Son nucletidos que no forman parte de los cidos


nucleicos.

Se encuentran libres en las clulas.

Pueden actuar como:

Reguladores metablicos (aportando energa)


Activadores de enzimas
Coenzimas

30
ATP (adenosin trifosfato): Es el portador
primario de energa de la clula. Esta molcula
tiene un papel clave para el metabolismo de la
energa.

La mayora de las reacciones metablicas que


requieren energa estn acopladas a la hidrlisis
de ATP.

31
ATP (Adenosin trifosfato)

32
33
Nuclesido polifosfatos

5-Adenosina
monofosfato, AMP

5-Adenosina
difosfato, ADP

5-Adenosina
trifosfato, ATP

34
ATP

El trifosfato de adenosina (adenosn trifosfato, del ingls


Adenosine TriPhosphate) es un nucletido fundamental en la
obtencin de energa celular.

Est formado por una base nitrogenada (adenina) unida al


carbono 1 de un azcar de tipo pentosa, la ribosa, que en su
carbono 5 tiene enlazados tres grupos fosfato.

Se produce durante la fotorrespiracin y la respiracin celular,


y es consumido por muchas enzimas en la catlisis de
numerosos procesos qumicos.

35
ADP
El adenosn difosfato (ADP) es un nucletido
difosfato, es decir, un compuesto qumico formado por
un nuclesido y dos radicales fosfato unidos entre s.
En este caso el nuclesido lo componen una base
prica, la adenina, y un azcar del tipo pentosa que es
la ribosa.
Se produce ADP cuando hay alguna descarboxilacin
en algunos de los compuestos de la gluclisis en el
ciclo de Krebs.
El ADP es almacenado en los densos grnulos de las
plaquetas, y es movilizado por la activacin
plaquetaria. 36
ATP COMO DONADOR DE ENERGA

37
AMP cclico - AMPc
Se forma a partir de ATP en el interior celular por la accin de
la adenilato ciclasa.
La enzima acta por la unin a la membrana celular de
determinadas molculas (hormonas).
La formacin del AMPc activa enzimas que actan en
reacciones metablicas
Se le conoce tambin como segundo mensajero (las
hormonas son los primeros mensajeros

38
39
AMP cclico - AMPc

AMP cclico: Es una de las molculas encargadas de transmitir una


seal qumica que llega de la superficie celular al interior de la 40
clula.
NAD+ y NADP+

41
NAD+ y NADP+: (nicotinamida adenina dinucletido y
nicotinamida adenina dinucletido fosfato). Son
coenzimas que intervienen en las reacciones de oxido-
reduccin, son molculas que transportan electrones
y protones. Intervienen en procesos como la
respiracin y la fotosntesis.
Abreviado NAD+ en su forma oxidada y NADH en su
forma reducida, es una coenzima encontrada en
clulas vivas y compuesta por un dinucletido, ya que
est formada por dos nucletidos unidos a travs de
sus grupos fosfatos, siendo uno de ellos una base de
adenina y el otro de nicotinamida. Su funcin
principal es el intercambio de electrones e
hidrogeniones en la produccin de energa de todas
las clulas. 42
Transportadores de electrones: FMN

FMN
El flavin mononucletido
(FMN), o riboflavina-5'-fosfato,
es un derivado de la riboflavina
(vitamina B2) que acta como
coenzima de diversas
oxidoreductasas.

43
Transportadores de electrones: FAD

El flavn adenn
FAD dinucletido o dinucletido
de flavina-adenina
(abreviado FAD en su forma
oxidada y FADH2 en su forma
reducida) es una coenzima
que interviene en las
reacciones metablicas de
oxidacin-reduccin.
Interviene como dador o aceptor de electrones y
protones (poder reductor) en reacciones
metablicas redox 44
Coenzima A

Es un derivado del ADP.


Interviene en procesos
metabolicos como
transportador de grupos acilo
(R-CO-) procedentes de cidos
orgnicos.

El acetil CoA, un derivado de la


CoA con gran importancia en el
metabolismo celular.

45
cGMP
El guanosn monofosfato cclico,
GMPc o GMP cclico es derivado
cclico del nucletido trifosfato
GTP, generado por mediacin de
la enzima guanilato ciclasa

Tambin conocida como


guanililciclasa, e implicado como
segundo mensajero en las rutas
de transduccin de la seal
celulares.

46
Nucletidos (desoxirribonucletidos)

5-dTMP 3-dCMP

47
ANTIBITICOS NUCLEOSDICOS

Puromicina
Antibitico inhibidor
de la sntesis de
protenas

Cordicepina
Medicamento contra el cncer;
es un tipo de antibitico antitumoral.

48
ANTIVIRALES NUCLEOSDICOS

Citosin arabinsido
(Vidarabin)
Activo contra herpes y varicela

49
ANTIRRETROVIRALES NUCLEOSDICOS, EJ. VIH

50
Espectros de absorcin de los nucletidos ms comunes

51
ESTRUCTURA DEL ADN
REGLAS DE CHARGAFF PARA ADN DE DOBLE HLICE
A=T. la relacin entre adenina y timina es igual a la
unidad (A/T=1).

G=C. La relacin entre guanina y citocina es igual a la


unidad (G/C=1).

La proporcin de bses pricas (A+G) es igual a la de


las bases pirimidicas (T+C). (A+G)=(T+C). La relacin
entre (A+G) y (T+C) es igual a la unidad
(A+G)/(T+C)=1.

Sin embargo, la proporcin entre (A+T) y (G+C) era


caracterstica de cada organismo, pudiendo tomar
EDWIN CHARGAFF por tanto, diferentes valores segn la especie
estudiada. Este resultado indicaba que los cidos
nucleicos no eran la repeticin montona de un
tetranucleotico.

Exista variabilidad en la composicin de bases nitrogenadas. 52


Estructura del ADN
Difraccin de rayos X de cristales de ADN

A partir
Rosalin dela los
Franklin, que estudios
lo hizo tododel
ADN mediante la difraccin de los rayos X,
Franklin y Wilkins observaron entre 1950 y 1953 que el cido
desoxirribonucleico tena una estructura fibrilar de 20 de dimetro,
en la que se repetan ciertas unidades cada 3,4 , y que haba otra
repeticin mayor cada 34 .
Su trabajo, una estructura helicoidal

3,4
20
Amstrongs
Amstrongs

53
Basndose en los datos anteriores, J. Watson y F. Crick elaboraron, en
1953, el modelo de la doble hlice.
El ADN, segn dicho modelo, estara formado por dos cadenas de
polinucletidos que seran antiparalelas, es decir, tendran los enlaces
5'3' orientados en diferente sentido, complementarias y enrolladas una
sobre la otra en forma plectonmica o de doble hlice.

54
Las cadenas del ADN son complementarias, no
iguales, Por lo tanto, la secuencia de cada cadena
es diferente.

El enrollamiento plectonmico implica que, para


separar las dos hebras, hay que girar una respecto
a la otra.

En la estructura secundaria del ADN, los grupos


hidrfobos de las bases se disponen hacia el
interior de la molcula, estableciendo
interacciones hidrfobas entre grupos lipfilos, que
colaboran con los puentes de hidrgeno en dar
estabilidad a la macromolcula.

Las pentosas y los fosfato (carga negativa) quedan


en el exterior. Debido a la ionizacin, los cidos
nucleicos tienen carcter cido. Las bases de
ambas hebras estn en el interior y unidas por los
puentes de hidrgeno. 55
Caractersticas de la doble hlice
Dos cadenas polinucletidas unidas entre s
Antiparalelas
Complementarias
Estabilizadas por puentes de hidrgeno
entre bases nitrogenadas
Enrolladas en espiral alrededor de un eje
imaginario
Esqueleto azcar fosfato hacia fuera
Planos de las bases perpendiculares al eje y
paralelos entre s
Enrollamiento plectonmico
Gira en sentido dextrgiro (reloj)
10 pares de nucletidos por vuelta (3,4 nm)
Dimetro .- 2 nm 56
James Watson y Francis Crick

En 1953 Watson y Crick propusieron


el modelo de doble hlice, para esto
se valieron de los patrones
obtenidos por difraccin de rayos X
de fibras de ADN.

Este modelo describe a la molcula


del ADN como una doble hlice,
enrollada sobre un eje, como si
fuera una escalera de caracol y cada
diez pares de nucletidos alcanza
para dar un giro completo.
57
MODELO DE WATSON - CRICK, A

El DNA es una
doble hlice
plectonmica y
dextrgira,
3.4 nm con un paso de
rosca de 3.4 nm

58
MODELO DE WATSON-CRICK, B
5 3

3 5
Cada una de las dos hlices es un polinucletido entrelazado
con el otro de manera que su polaridad es opuesta (es decir,
corren en sentido antiparalelo) 59
MODELO DE WATSON-CRICK, C

El eje ribosa-fosfato se sita


hacia el exterior de la doble hlice,
en contacto con el solvente

Mientras que las bases nitrogenadas


(anillos planares) se sitan, apiladas,
hacia el interior de la estructura, en
un entorno hidrofbico
60
MODELO DE WATSON-CRICK, D

0.34 nm

Las bases estn situadas en planos aproximadamente


perpendiculares al eje mayor de la doble hlice. La distancia
entre planos es de 0.34 nm 61
Modelo de Watson-Crick, E

Cada base interacciona


con su opuesta a travs de
enlaces de hidrgeno, de
manera que:

(a) Adenina (A) slo puede


interaccionar con timina (T)
(y viceversa), a travs de dos
puentes de hidrgeno.

62
Guanina (G) slo
puede interaccionar con
citosina (C) (y viceversa),
a travs de tres puentes
de hidrgeno

63
GEOMETRA DE LA DOBLE HLICE (DNA-B)

Paso de rosca 3.4 nm


3.4
Distancia entre 0.34 nm
0.34
planos de bases

Pares de bases/vuelta 10

Anchura 2.4 nm
2.4

64
JAMES WATSON Y FRANCIS CRICK, CAMBIARON EL MUNDO EN UNA
PGINA

65
Modelo de la doble hlice de ADN Representacin abreviada de un segmento
de ADN

66
Pares de bases del
ADN:
La formacin
especfica de enlaces
de hidrgeno entre
G y C y entre A y T
genera los pares de
bases
complementarias

67
UNA CORTA SECCIN DE LA DOBLE HLICE DE ADN

Las hebras son


antiparalelas,
pues una de ellas
tiene sentido 5
3, y la otra
sentido 3 5.

68
Flexibilidad y polimorfismo del DNA.
DNA A.
DNA Z.
DNA H.

Polimorfismo e interaccin protena-DNA.


(Contenido informacional de los surcos).

69
MODELOS DE DOBLE HLICE DEL ADN
En la actualidad se conocen tres tipos de estructura en
doble hlice del ADN: las formas B, A y Z

La forma B (descrita por Watson y Crick).

ADN B

70
Modelos de doble hlice del ADN: forma A
La forma A tambin es dextrgira,
pero las bases complementarias se
encuentran en planos inclinados y
une el eje de la molcula que
atraviesa dichos planos por puntos
desplazados del centro.

Esta forma aparece cuando se


deshidrata la forma B.
No se ha encontrado en
condiciones fisiolgicas.
Es ms ancha y corta que la
forma B.
Contiene 11 pares de bases por
vuelta (10 en la forma B) 71
Modelos de doble hlice del ADN: forma Z

La forma Z es levgira, y tiene un


enrollamiento irregular que provoca una
configuracin en zigzag, a la que hace
referencia su nombre.

Esta estructura aparece en regiones del


ADN donde se alternan muchas citosinas y
guaninas.

Se piensa que la forma Z constituye seales


para las protenas reguladoras de la
expresin del mensaje gentico.
Mas larga y estrecha que la forma B.
Contiene 12 pares de bases por vuelta.
72
n de nucleotidos
TIPO DE ADN GIRO DE HELICE nm por Vuelta Plano entre bases
por vuelta
A Dextrgiro 2.8 inclinado 11
B Dextrgiro 3.4 perpendicular 10
Z Levgiro 4.5 zig-zag 12

ADN A ADN B ADN Z 73


ADN-A ADN-B ADN-Z

los surcos
son ms
parecidos
en anchura:
Ms surco Ms
mayor
corta estrecho y larga
profundo
surco el surco mayor
menor no existe, es muy
19 ancho y poco profundo
superficial bases algo
inclinadas:
9 surco menor,
profundo y
estrecho

dextrgira levgira

74
SURCOS DEL ADN:

Son las zonas donde las bases nitrogenadas van a ser


accesibles desde el exterior. Se van alternando as dos tipos
de surcos: un surco mayor y un surco menor.

75
DNA B DNA A

Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)


76 76
DNA B

DNA A

77
DNA Z

78
NIVELES DE ORGANIZACIN DEL MATERIAL GENTICO
Qu relacin existe entre: Gene ADN Cromatina Cromosoma?

79
ESTRUCTURA DEL ADN
En el ADN se distinguen los tres
niveles estructurales:

1. La estructura primaria o
secuencia de nucletidos.
2. La estructura secundaria o
doble hlice.
3. La estructura terciaria o ADN
superenrollado: torsin de la
doble hlice sobre s misma.
Para conseguir que el ADN quepa
dentro del ncleo, se encuentra muy
empaquetado, y an ms cuando se
condensa para formar un cromosoma.
80
Estructura ADN

Primaria Secundaria Terciaria

81
ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN (SECUENCIA DE NUCLETIDOS)

Es la secuencia de nucletidos de una sola


cadena.
Se pueden distinguir en ella un esqueleto de
pentosas y fosfatos y una secuencia de bases
nitrogenadas.
El nmero de hebras diferentes de ADN que
se puede formar combinando las cuatro
bases nitrogenadas -adenina, guanina,
citosina y timina-, es muy elevado.
Los anlisis qumicos han demostrado que el
porcentaje de guanina, citosina, adenina y
timina es el mismo para todos los
individuos de una misma especie. Este
hecho se debe a que las caractersticas son
muy similares dentro de la especie.
82
ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ADN (DOBLE HLICE)

La estructura secundaria del ADN es la


disposicin espacial en doble hlice de
dos cadenas de polinucletidos, con las
bases nitrogenadas enfrentadas y unidas
mediante puentes de hidrgeno.

83
TIPOS DE ADN SEGN SU ESTRUCTURA, SU FORMA Y SU EMPAQUETAMIENTO

ESTRUCTURA FORMA EMPAQUETAMIENTO

Monocatenario Asociado a
Lineal histonas
(Virus) (Eucariotas)

Circular No asociado a
Bicatenario
(Procariotas) histonas

84
LONGITUD DEL ADN

En cuanto a su longitud, el ADN mide:


1,7 en el virus del polioma;
1,36 mm en Escherichia coli;
11,2 cm en cada clula de Drosophila;
0,57 m en el erizo de mar;
0,93 m en el gallo;
1,89 m en el perro,
2,36 m en el hombre (sumando el ADN de los 46
cromosomas), etc.

85
LONGITUD DEL ADN

La longitud del ADN no siempre guarda relacin con la


complejidad del organismo.

Muchas especies tienen mucho ms ADN que el


necesario para codificar su estructura y fisiologa.

Esto ha dado lugar a numerosas hiptesis sobre las


funciones de ese ADN supernumerario.

86
FUNCIN BIOLGICA DEL ADN

El ADN es la molcula almacn de la informacin


gentica y contiene todas las instrucciones
necesarias para construir todas las molculas del
cuerpo de un ser vivo. Para ello tiene que ser capaz
de realizar copias de si mismo (replicarse)
mediante un proceso basado en la
complementariedad de las bases.

87
EL ADN SUPERENROLLADO. EL EMPAQUETAMIENTO DEL ADN CIRCULAR

Las molculas de ADN circular, como el ADN bacteriano o


el ADN mitocondrial, presentan una estructura terciaria,
que consiste en que la fibra de 20 se halla retorcida
sobre s misma formando una especie de superhlice.
Esta disposicin se denomina ADN superenrollado.

88
Superhlices en plsmidos
(ADN extracromosmico)
DNA circular,
relajado

DNA circular, con


superhlice negativa

89
SUPERENRROLLAMIENTO

Al disminuir L, se facilitan los


procesos de replicacin y
transcripcin.

90
INTERACCIN PROTENA-DNA

91
Desnaturalizacin renaturalizacin del ADN
La doble hlice de ADN en estado natural es muy estable; pero, si se
calienta, cuando la temperatura llega aproximadamente a 100C, las dos
hebras de la doble hlice se separan, se produce la desnaturalizacin del
ADN.

Si posteriormente se mantiene el ADN desnaturalizado a 65C, las dos


hebras vuelven a unirse.

Esta restauracin de la doble hlice es lo que se llama renaturalizacin y


es lo que permite la hibridacin si se parte de hebras de distintos ADN

92
El caso de Streptomyces

Desnaturalizacin renaturalizacin del ADN


La temperatura a la cual permanece desnaturalizado un 50% del ADN se
llama temperatura de fusin (Tm) y depende de la cantidad de pares
guanina-citosina que haya en la cadena. Si este nmero es elevado, Tm
ser elevada, puesto que hay que romper un mayor nmero de enlaces de
hidrgeno y se necesitar mayor energa para hacerlo.

Las tcnicas de
desnaturalizacin y
renaturalizacin permiten
hibridar cadenas de ADN de
distintos organismos.

El porcentaje de hibridacin
dar una idea de la relacin
entre los dos organismos y es
una tcnica muy til en la
diagnosis de enfermedades o
en medicina forense. 93
ACIDOS NUCLEICOS
Desnaturalizacin.
Tm (Composicin de bases).

94
Acidos Nucleicos

Desnaturalizacin. UV. Hipercromicidad

95
Estructura de RNAs (tRNA y
rRNA)

96
ARN CIDO RIBONUCLECO

El cido ribonucleco se forma por la polimerizacin de


ribonucletidos.

Estos a su vez se forman por la unin de:


a) un grupo fosfato.
b) ribosa, una aldopentosa cclica y
c) una base nitrogenada unida al carbono 1 de
la ribosa, que puede ser citocina, guanina,
adenina y uracilo.
Esta ltima es una base similar a la timina.

97
98
En general los ribonucletidos se unen entre s,
formando una cadena simple, excepto en
algunos virus, donde se encuentran formando
cadenas dobles.

La cadena simple de ARN puede plegarse y


presentar regiones con bases apareadas, de este
modo se forman estructuras secundarias del
ARN, que tienen muchas veces importancia
funcional, como por ejemplo en los ARNt (ARN
de transferencia).
99
Se conocen tres tipos principales de ARN y
todos ellos participan de una u otra
manera en la sntesis de las protenas. Ellos
son:
ARN mensajero (ARNm)
ARN ribosomal (ARNr)
ARN de transferencia (ARNt).

100
5

2-OH en la pentosa

RNA

3 101
Reactividad qumica:
El RNA, al tener el grupo 2-OH, es mucho ms reactivo
qumicamente que el DNA. En concreto, puede ser completamente
hidrolizado por lcali a una mezcla de 2- y 3-nucletidos.

Estructura tridimensional
Las formas en doble hlice del RNA adoptan la configuracin A (en
lugar de la B, propia del DNA), as como los hbridos DNA-RNA.

La pentosa aparece en forma endo-3 (y no endo-2)

102
RNA COMO ENZIMA

Algunos RNA son capaces de catalizar reacciones qumicas


del mismo modo que las enzimas: son las ribozimas

Participan en el procesado del


RNA transcrito primario y en la
formacin de enlace peptdico
en la sntesis de protenas.

Ribozima
hammerhead

103
FUNCIONES Y TIPOS DE RNA

Los distintos tipos de RNA permiten la expresin fenotpica


del DNA:

Como mensaje gentico que determina la secuencia de


aminocidos en la sntesis de protena: RNA mensajero o
mRNA

Como molcula que activa a los aminocidos para poder


ser incorporados en una nueva protena: RNA de
transferencia o tRNA

Como elemento estructural bsico de las partculas


encargadas de llevar a cabo la sntesis proteica, los
ribosomas: RNA ribosmico o rRNA
104
FUNCIONES Y TIPOS DE RNA

Participa en el procesado del transcrito primario


(HnRNA) para dar lugar al RNA mensajero o mRNA,
mediante los snRNA (RNAs nucleares pequeos)

Opera como enzima (ribozimas) en el procesado del


HnRNA y en la formacin de enlace peptdico en las
protenas.

Es el material gentico de algunos virus.

105
-
O O
P O
- H
O N
O N
H
N
H 2C N N
O H

OH
-
O O
P H H
-
N
O
O

H 2C
N
C
Unin del aminocido al O
N O

extremo 3 del tRNA -


O O
H
OH
H
P N
-
O
O N

H 2C N O
C
O

-
O O OH H
H N
P
-
O N

H 2C
O N

N
A
N
O

H O OH
H 3N C C
O
106
R
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEL TRNA

Extremo aceptor

Lazo TYC

Lazo variable

Lazo anticodon

107
rRNA 23s

108
ARN MENSAJERO (ARNm)
Consiste en una molcula lineal de nucletidos
(monocatenaria), cuya secuencia de bases es
complementaria a una porcin de la secuencia de
bases del ADN.

El ARNm dicta con exactitud la secuencia de


aminocidos en una cadena polipeptdica en particular.
Las instrucciones residen en tripletes de bases a las
que llamamos codones.

Son los ARN ms largos y pueden tener entre 1000 y


10000 nucletidos. 109
ARN RIBOSOMAL (ARNr)

Este tipo de ARN una vez transcripto, pasa al nucleolo


donde se une a protenas. De esta manera forman
parte de las subunidades de los ribosomas.

Aproximadamente dos terceras partes de los ribosomas


corresponde a sus ARNr.

110
ARN DE TRANSFERENCIA (ARNt)
Este es el ms pequeo de todos, tiene
aproximadamente 75 nucletidos en su cadena,
adems se pliega adquiriendo lo que se conoce como
forma de hoja de trbol plegada.

El ARNt se encarga de transportar los aminocidos


libres del citoplasma al lugar de sntesis proteica.

En su estructura presenta un triplete de bases


complementario de un codn determinado, lo que
permitir al ARNt reconocerlo con exactitud y dejar el
aminocido en el sitio correcto.

A este triplete lo llamamos anticodn.


111
Molcula de ARNt

112
Regiones complementarias dentro de
la misma cadena de ARN

113
El ADN y el ARN se diferencian:

ADN ARN
Peso molecular mayor menor
Azcar desoxirribosa ribosa
Bases nitrogenadas A, T, G, C A, U, G, C

Configuracin Doble hlice Polinucleotido lineal


espacial monocatenario

114
Diferencias estructurales entre el DNA y el RNA

pentosa bases nitrogenadas estructura

DNA

RNA

115
Diferencias entre DNA y RNA
DNA RNA
Doble cadena helicoidal Cadena Simple
Tiene las bases A, T, G y C Tiene las bases A, U, G y C
La pentosa es una La pentosa es una ribosa
desoxirribosa
Es una Macromolcula Es ms pequea que el DNA
Esta en el Ncleo Se encuentra en el citoplasma
Constituye los Genes (se replica o Es una molcula involucrada en
se trascribe a RNA) la sntesis de protenas

116
ESTRUCTURA DE LOS CIDOS NUCLEICOS

5 terminal
5 terminal

Enlace Enlace
fosfo fosfo
dister dister

ARN
ADN
3 terminal 3 terminal

117
Bioqumica Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002
REPRESENTACIN ESQUEMTICA DE LA SECUENCIA DE NUCLETIDOS

3
OH Nucletido

Oligonucletido
118
Se ha observado la existencia
de ARN con funcin
biocatalizadora (ribozimas),
por lo que se ha sugerido
que, en el origen de la vida,
los ARN pudieron ser las
primeras molculas capaces
de auto duplicarse. Despus,
Ribozima
sera el ADN el encargado de hammerhead
guardar la informacin
gentica, ya que su cadena es
ms estable.
Participan en el procesado del RNA transcrito
primario y en la formacin de enlace peptdico en la
sntesis de protenas. 119
El ARN se encuentra en muchos tipos de virus y en las clulas procariotas y
eucariotas. En stas hay de cinco a diez veces ms ARN que ADN.

Los ARN se clasifican en:

1. ARN bicatenario (en los reovirus)


2. ARN monocatenario:

a. ARN de transferencia (ARNt)


b. ARN mensajero (ARNm)
c. ARN ribosmico (ARNr)
d. ARN nucleolar (ARNn)

El hecho de que las clulas que fabrican grandes cantidades de protenas


sean ricas en ARN fue una de las pistas para desvelar la transmisin de la
informacin gentica.

120
ARNm ARNr ARNt

121
EL ARN DE TRANSFERENCIA (ARNt).

Tiene entre 70 y 90 nucletidos y se encuentra disperso en el


citoplasma.
Hay unos cincuenta tipos de ARNt.
Constituye el 15% del ARN de la clula.
Su funcin es transportar aminocidos especficos hasta los
ribosomas, donde, segn la secuencia especificada en un ARN
mensajero (transcrita, a su vez, del ADN), se sintetizan las
protenas.
Las diferencias entre los ARNt son debidas fundamentalmente a
una secuencia de tres bases nitrogenadas, denominada
anticodn.
Entre los nucletidos que forman los ARNT, adems de A, G, C y
U, aparecen otros que llevan bases metiladas, como la
dihidrouridina (UH2 ), la ribotimidina (T), la inosina (I), la
metilguanosina (GMe), etctera, que constituyen el 10 % de los
ribonucletidos totales del ARNt. 122
El ARNt es monocatenario, pero
presenta zonas con estructura
secundaria en doble hlice, y zonas con
estructura primaria o lineal, que forman
asas o bucles, lo que confiere a la
molcula una forma de hoja de trbol.
En ella se distingue:

Brazo D: Unin con el enzima que


cataliza la unin a los aminocidos.
Brazo T: Lleva timina
Brazo A (del anticodn).
Extermo 3: aceptor de aminocidos
Extremo 5: Siempre lleva guanina y un
grupo fosfrico libre. 123
EL CIDO RIBONUCLEICO - ARN
El cido ribonucleico o ARN est constituido por
nucletidos de ribosa, con las bases adenina,
guanina, citosina y uracilo. No tiene timina como el
ADN.

Estos ribonucletidos se unen entre ellos mediante


enlaces fosfodister en sentido 5 '3', al igual que
en el ADN.

El ARN es casi siempre monocatenario, excepto en


los reovirus que es bicatenario.

124
EL ARN NUCLEOLAR (ARNn).
Es un ARN que se encuentra constituyendo, en parte, el nuclolo.

Se origina a partir de diferentes segmentos de ADN, uno de los cuales se


denomina regin organizadora nucleolar (NOR).

A partir de este ADN, se forma en el nuclolo un ARN de 45 S. Este ARN


nucleolar se asocia a protenas, procedentes del citoplasma, muchas de las
cuales son las que conformarn los ribosomas.

Posteriormente, la partcula de ribonucleoprotena se escinde en tres ARN.

A continuacin se aade un ARN de 5 S, tambin asociado a protenas,


sintetizado fuera del nuclolo, es decir, en el nucleoplasma, a partir de
otro segmento de ADN.

A partir de todos ellos se forman las dos subunidades ribosmicas, una de


40 S y otra de 60 S, que atraviesan la envoltura nuclear y se unen en el
citoplasma, dando lugar a un ribosoma de 80 S.
125
EL ARN PEQUEO NUCLEAR (ARNpn)

Existe un quinto tipo de ARN, el ARN pequeo nuclear (ARNpn),


denominacin que hace referencia a su pequeo tamao y a
su presencia en el ncleo de las clulas eucariotas.

Tambin se le denomina ARN-U por su elevado contenido en


uridina.

El ARNpn se une a ciertas protenas del ncleo formando las


ribonucleoprotenas nucleares (RNPpn), y as acta
realizando el proceso de eliminacin de intrones (maduracin
del ARNm), gracias a que posee secuencias complementarias
a las de los extremos de los intrones (secuencias de
nucletidos no codificantes).

126
FUNCIONES DE LOS CIDOS RIBONUCLEICOS
Las funciones de los ARN pueden resumirse en tres:
1. Transmisin de la informacin gentica desde el ADN a los ribosomas.
Las enzimas ARN-polimerasas a partir de un gen de ADN, es decir, una
secuencia de nucletidos de ADN con informacin sobre una protena,
sintetizan, mediante la complementariedad de las bases, un ARN
mensajero, proceso denominado transcripcin. Luego, este ARNm llegar
hasta los ribosomas. El ADN es utilizado nicamente como almacn de
informacin gentica.

2. Conversin de la secuencia de ribonucletidos de ARNm en una


secuencia de aminocidos. Este proceso se denomina traduccin y se
realiza en los ribosomas. En l intervienen, adems del ARNm, el ARNr de
los ribosomas y el ARNt que transportan los aminocidos.

3. Almacenamiento de la informacin gentica. Algunos virus carecen de


ADN y, por ello, contienen su informacin biolgica en forma de ARN. Por
ejemplo, el virus de la gripe, el de la polio, el de la inmunodeficiencia
humana, los reovirus (que poseen ARN bicatenario), etc
127
En realidad la molcula est mucho ms replegada, adoptando una
estructura terciaria en forma de L.

128
EL ARN MENSAJERO (ARNm)

Es monocatenario, bsicamente
lineal, y con un peso molecular que
oscila entre 200.000 y 1.000.000.

Su funcin es transmitir la
informacin contenida en el ADN y
llevarla hasta los ribosomas, para que
en ellos se sinteticen las protenas a
partir de los aminocidos que
aportan los ARNt.

El ARNm tiene una estructura


diferente en procariotas y en
eucariotas.
129
El ARNm eucaritico

Presenta algunas zonas (pocas) en doble hlice,


por complementariedad de bases entre distintos
segmentos, y zonas lineales que dan lugar a los
llamados lazos en herradura.
El ARNm eucaritico se forma a partir del
transcrito primario (pre-ARNm), tambin
llamado ARN heterogneo nuclear (ARNhn),
nombre que hace referencia a la variabilidad de
su tamao.
Posee una serie de segmentos con informacin,
denominados exones, alternados con otros sin
informacin denominados intrones, que luego
son suprimidos y no aparecen en el ARNm.
Este proceso se denomina maduracin y se
produce en el ncleo.
130
El filamento de ARN se puede enrollar
sobre s mismo mediante la
formacin de pares de bases en
algunas secciones de la molcula,
formando las denominadas estructura
secundarias del ARN 131
Estructura del ARNm eucaritico

El ARNm eucaritico posee en su extremo


5' una guanosina trifosfato invertida y
metilada en el nitrgeno 7 (m7 Gppp).
Esta molcula, que recibe el nombre de
caperuza, bloquea la accin de enzimas
exonucleasas que pueden destruir el
ARNm, y constituye la seal de inicio en la
sntesis de protenas.
A continuacin, hay un segmento sin
informacin, seguido de otro segmento
con informacin que suele empezar con la
secuencia AUG.

132
En el extremo 3' o extremo final posee
de 150 a 200 nucletidos de adenina,
lo que se denomina cola de poli-A.
Es un estabilizador frente a las
exonucleasas.
Entre la sntesis y la degradacin del
ARNm no transcurren ms que unos
cuantos minutos, para evitar una
superproduccin de protenas.
El ARNm eucaritico es
monocistrnico, es decir, slo contiene
informacin para una cadena
polipeptdica.
133
134
ESTRUCTURA DEL ARNm DE PROCARIOTAS
El ARNm procaritico no adopta la estructura del ARN
eucaritico.
No presenta exones e intrones
Carece de caperuza (empieza con un nucletido trifosfato no
invertido, por ejemplo: pppG-...) y de cola de poli-A,.
Es policistrnico, es decir, contiene informaciones separadas
para distintas protenas.

5 LIDER CISTRN CISTRN TRAILER 3

Secuencia
espaciadora 135
ESTRUCTURA DEL ARNm DE PROCARIOTAS

5 LIDER CISTRN CISTRN TRAILER 3

Secuencia
espaciadora
El sector comprendido entre el extremo 5 y el codn de inicio se
denomina Lder (no lleva informacin).

La secuencia comprendida entre el codn sin sentido y el extremo 3 del


ARNm se denomina extremo Trailer y tampoco lleva informacin.

Los ARNm Policistrnicos presentan secuencias de longitud variable que


separan las regiones codificantes o Cistrones, estas se denominan
regiones espaciadoras, usualmente de 10 pb. de longitud.

Cada Cistrn posee un codn de inicio y uno sin sentido (finalizacin). 136
EL ARN RIBOSMICO (ARNr)

Es el ARN que constituye, en parte, los ribosomas. Este tipo de ARN


representa el 60% del peso de dichos orgnulos.
El ARNr presenta segmentos lineales y segmentos en doble hlice.
El ARNr est asociado con las protenas ribosmicas (ms de 70), formando
una estructura relacionada con la sntesis de protenas (da alojamiento al
ARNm y a los ARNt, portadores de los aminocidos que formarn las
protenas durante dicho proceso).

El peso molecular del ARNr oscila


entre 500.000 y 1.700.000.
En general, el peso de los ARNr y de los
ribosomas se suele expresar segn el
coeficiente de sedimentacin (s) de
Svedberg. Las clulas procariotas
presentan ribosomas de 70 S, menor
peso que los de las clulas eucariotas,
de 80 S
137
138
RNA de transferencia

139
RNA ribosomal

140
Diversidad de tipos y tamaos.
Avance sostenido de la ciencia genmica

141
Acidos Nucleicos (Seccin Bioqumica)
DETALLES DE LA ESTRUCTURA DE ADN

142

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