LES MUTATIONS

PROBLEME D INTERPRETATION :
Polymorphisme
Variant
Mutation

CRITERES POUR DISTINGUER POLYMORPHISMES ET MUTATIONS :

- Changement ou pas dAA
- Changement ou pas de famille dAA
- AA conserv ou pas
- AA dans un domaine protique ou pas
- Variant retrouv ou pas dans des contrles
- Expriences de biologie (in vitro, souris invalides)

Mutation = modification de l'information gntique (ADN). Une mutation peut tre:

* Ponctuelle = anomalie dans la squence des nuclotides
* Chromosomique = altration d'un chromosome complet

VARIATIONS DE SEQUENCE :
1- MUTATION ALTERANT LE PROMOTEUR :
- Rarement recherch
- Motifs consensus (TATA, CAAT, etc)
- Conservation inter espce
- Ou est la limite du PROMOTEUR ?
- Expriences de biologie: transfection cellulaire et comparaison activit du promoteur N et variant

2- REGION CODANTE :
a- CHANGEMENT DUNE BASE :
Transition : A #G ou G # A (purine)
C #T ou T #C (pyrimidique)
Transversion : Purine (A ou G) # Pyrimidique (C out T)
Mutation faux-sens (missense) : AA #AA
Ex : CUA (Leu, L) #CGA (Arg, R) : hydrophobe # basique
Mutation non-sens (non-sens): apparition dun codon stop : UAA, UAG, UGA
Ex:

b- INSERTION/DELETION
DE (1 - 3 BASES) :
- Changement du cadre
de lecture

- Pas de changement
de cadre de lecture :
Mucoviscidose, gne
CFTR F508
3- MUTATION
ALTERANT
LEPISSAGE (SPLICING) :

1
CONSEQUENCES = Changement de squence du peptide
- Codon STOP prmatur
- Exceptionnellement : pas de changement du cadre de lecture

Squence ESE (Exonic Splicing Enhancer) :

- dans lexon
- riche en bases puriques
- fixe protine SR

Pathologies :

4-

EXPANSION DE TRIPLETS :

5-

GRANDS REMANIEMENTS (INSERTION, DELETION, INVERSION)

2
Cause des mutations :
Erreur lors de la sparation des chromosomes (mutations chromosomiques) la division cellulaire
Erreur de rplication (erreur de copie non rpare)
Erreur cause par une altration de l'ADN par des agents extrieurs = agents mutagnes
Causes physiques : radiations (UV, X, gamma)
Causes chimiques : molcules agissant sur l'ADN
- Goudron du tabac
- Benzne
- Radicaux libres

Nomenclature pour dcrire les variants/mutations : (HUGO Gene nomenclature committee)

Indiquer le type de squence de rfrence utilise en faisant prcder la description de la variation par une
lettre :
- "g." pour une squence gnomique (ex : g.76A>T)
- "c." pour une squence cDNA (ex : c.76A>T)
- "m." pour une squence mitochondriale (ex : m.76A>T)
- "r." pour une squence ARN (ex : r.76a>u)
- "p." pour une squence protique (ex : p.Lys76Ala)