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Ambiente Suelo

Introduccin
El suelo como sistema biolgico y componente de los ecosistemas terrestres,
cumple un papel fundamental en el sostenimiento de la vida en la biosfera. Pero
para ello el suelo debe de tener una buena estructura donde el agua y el aire
circulen con facilidad y se hallen en un equilibrio que permita el desarrollo de las
colonias de microorganismos (algas, hongos, actinomicetos y bacterias), ya que su
estructura constituye un entramado en el que pueden acomodarse tanto en el
exterior como en el interior de los agregados.
La diversidad microbiana es esencial para garantizar los ciclos de los nutrientes y
los procesos de descomposicin del material vegetal en cualquier ecosistema
terrestre debido a los procesos biolgicos como la oxidacin, la reduccin, la
descomposicin de materia orgnica y la mineralizacin, as como las interacciones
interespecficas e intraespecficas que se establecen en el suelo.

A partir de muestras de suelo y planta se cuantifican y aslan bacterias y hongos de


diferentes regiones; los resultados obtenidos permiten realizar un diagnstico de la
diversidad microbiana, y por lo tanto la salud del suelo.
Tradicionalmente los estudios para caracterizar la diversidad bacteriana en
diferentes ambientes se basan en la suposicin de que las tcnicas de cultivo
permiten recuperar la mayor parte de los microorganismos en una muestra. Sin
embargo, nicamente entre 0.1 y 10% de las bacterias en el ambiente son
cultivables, esto debido a que se desconocen los requerimientos nutricionales y las
condiciones fisicoqumicas necesarias para el desarrollo de un gran nmero de
grupos microbianos en su ambiente natural. Adems de su papel en el ciclo de los
nutrientes del suelo muchos organismos tienen funciones bsicas para el
mantenimiento de una buena estructura y del funcionamiento del suelo,
especialmente los hongos, que favorecen una buena estructura pues estabilizan los
agregados envolviendolos con sus redes de micelios y evitando que sean
arrastrados por el agua de lluvia u otros agentes responsables de la erosin.
El papel bioqumico de los microorganismos, es el ms conocido e importante. Sin
ellos el ciclo de la vida se interrumpira y no podran reciclarse los residuos
orgnicos que llegan al suelo ni integrarse en el ciclo de la vida los minerales que
forman parte de las rocas:
Transformacin de materia orgnica:
Solubilizacin de los minerales
Fijacin de nitrgeno

Algunos elementos qumicos se reciclan en ciclos biogeoqumicos, en los que los


microorganismos son esenciales para su continuidad
En el ciclo del carbono los fotoauttrofos son los protagonistas.
En el ciclo del nitrgeno el nitrgeno que se encuentra en la atmsfera puede
ser asimilable, al romper la unin de sus enlaces por medios enzimticos y
as poder producir compuestos nitrogenados, que pueden ser aprovechados
por la mayora de los seres vivos, en especial las plantas, que forman
relaciones simbiticas con este tipo de bacterias.

www.bdigital.unal.edu.co/10717/1/giovannaandrealandazabalcuervo.2013.pdf
http://saberesyciencias.com.mx/2015/02/10/importancia-de-la-diversidad-microbiana-en-el-
suelo/
Tortora J,G [et al]. Introduccin a la microbiologa. 9 Edicin. Ed. Mdica
Panamericana. Pp 811-817. (2007)

Objetivos
Diversidad microbiana en el suelo
Determinar la diversidad de algunos grupos microbianos en una muestra de
suelo rizosfrico.
Comparar la diversidad microbiana (muestras de suelo de la prctica de
campo) mediante la aplicacin de ndices de similitud.
Evaluacin de algunos procesos microbianos del ciclo del carbono.
Aislar y cuantificar las poblaciones de microorganismos celulolticos y
amilolticos en muestras de suelo.
Microorganismos del ciclo del nitrgeno.
Determinar experimentalmente los principales procesos metablicos
involucrados en el ciclo del nitrgeno.

Resultados

Diversidad microbiana en el suelo

Bacterias Mesoflicas aerobias. Actinomicetos.


Estacin
UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g
(B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.)
Sec. 1 Sec. 2 Promedio Sec. 1 Sec. 2 Promedio

1 6.5x106 2.7x107 1.67x107 2.7x103 1.2x105 6.13x104

2 2.08x106 7x106 4.54x106 9.04x105 4.4x105 6.7x105


3 7.2x107 2.6x107 4.9x107 >1x102 5.4x106 2.7x106

4 5.4x105 6.3x106 3.42x106 5.19x105 4.7x104 2.83x105

5 5.3x105 7.6x104 3.03x105 2.04x106 1.57x105 1.09x106

6 6.2x107 1.8x106 3.19x107 2x105 1.3x104 1.06x105

7 1.05x109 4.59x106 5.27x108 1.40x105 3x104 8.5x104

8 7.75x106 - 7.75x106 6.63x105 - 6.63x105

Pseudomonas fluorescentes. Bacillus spp.


Estacin
UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g
(B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.)
Sec. 1 Sec. 2 Promedio Sec. 1 Sec. 2 Promedio

1 2.4x104 2.8x105 1.52x105 3.7x104 2.1x104 2.9x104

2 4.2x103 4.3x104 2.36x104 4.25x104 1.6x104 2.92x104

3 1x106 4.39x106 2.69x106 7.4x105 2.7x105 5.05x105

4 1.03x106 1.07x106 1.05x106 3.89x102 4.7x104 2.36x105

5 >1x102 4.2x104 2.1x104 2.7x105 2.1x104 1.45x105

6 3x106 3x106 3x106 6x103 3.3x104 1.9x104

7 4.8x106 6.12x104 2.43x106 1.03x106 5.1x103 5.17x105

8 >1 - >1 1.63x104 - 1.63x104

Bacterias Corineformes. Hongos filamentosos.


Estacin
UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g
(B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.)
Sec. 1 Sec. 2 Promedio Sec. 1 Sec. 2 Promedio

1 7.6x104 1.5x105 1.13x105 1.17x105 7.1x104 9.4x104

2 1.22x103 4.3x104 2.21x104 2.07x105 1.4x105 1.73x105

3 1x104 4.94x102 5.24x103 3.1x105 4.12x106 2.21x106

4 3.24x106 8.3x103 1.62x106 1.52x105 4.1x105 2.81x105

5 1x103 1.36x104 7.3x103 1.1x107 1.7x105 5.58x106

6 1.6x106 3.3x106 2.45x106 8.1x105 4.06x105 6.08x105


7 3.66x106 1x104 1.83x106 1.23x107 8.16x105 6.55x106

8 1x103 - 1x103 1.02x105 - 1.02x105

Imagen 1. Grfica log UFC/g en base seca de diversos microorganismos.


Promedio de UFC/g en base seca de Bacterias Mesoflicas Aerobias, Actinomicetos,
Pseudomonas fluorescentes, Bacillus sp, Bacterias Corineformes y Hongos
Filamentosos.

Ciclo del Carbono

Almidn (Amilolticos) Celulosa (Celulolticos)


Estacin

UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g


(B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.) (B.S.)
Sec. 1 Sec. 2 Promedio Sec. 1 Sec. 2 Promedio

1 9.04x106 1.4x106 5.2x106 2.8x106 3.7x105 1.585x106

2 1.06x105 1.8x106 9.53x105 6.38x10 1.24x106 9.39x105


5

3 7.4x105 1.03x106 8.85x105 2.18x10 1.48x106 1.83 x106


6
4 2.98x106 5x104 1.515x106 1.56x10 2x105 8.8x105
6

5 5.6x105 7.4x104 3.17x105 2.8x106 1.38x105 1.469x106

6 2.02x105 8x105 5.01x105 2.7x105 6x105 4.35x105

7 3.06x106 2.6x106 2.83x106 5.9x105 4.59x106 2.59x106

8 3.1x106 - 3.1x105 2.9x106 - 2.9x106


Tabla 4. Microorganismos degradadores de polmero de carbono.

Imagen 2. Grfica log UFC/g en base seca de microorganismos degradadores


de polmeros de Carbono. Promedio de UFC/g en base seca de los
microorganismos amilolticos y celulolticos por estacin.

Ciclo del Nitrgeno

Amonificadores Nitrificantes Desnitrificantes


Estacin

UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g (B.S.) UFC/g UFC/g UFC/g UFC/g (B.S.) UFC/g
(B.S.) (B.S.) (B.S.) Sec. 1 (B.S.) (B.S.) (B.S.) Sec. 2 (B.S.)
Sec. 1 Sec. 2 Promedio Sec. 2 Promedio Sec. 1 Promedio

1 1.27x103 3.2x102 7.95x102 >15.06x102 >1.5x103 1.5x103 1.02x104 <4.2x102 5.31x103

2 4.57x102 4.6x102 4.58x103 2.55x102 24.4 1.39x103 3.19x102 <3.19x102 3.19x102

3 5.63x104 8.2x102 6.91x105 >11.70x102 58.24 6.14x104 <3.19 395.6 1.99x105


4 2.07x103 3.4x103 2.73x103 >14.28x103 <3.57 7.14x106 <3.89 <3.57x102 1.80x104

5 9.4x103 2.44x102 1.69x105 >11.22x102 9.57 5.65x105 3.66x104 <3.19x102 3.42x104

6 3.1x104 1x103 6.55x104 >14.8x102 38.66 7.59x104 <4.05 <4x102 2.02x105

7 1.2x104 3.97x102 6.19x104 5.28x102 23.46 2.75x104 1x103 <3.06x102 6.53x102

8 2.8x103 - 2.8x103 1.5x104 - 1.5x104 <3.06 - <3.06


Tabla 5. Microorganismos representantes de los procesos del ciclo del
Nitrgeno.

Imagen 3. Grfica log UFC/g en base seca de microorganismos de ciclo del


Nitrgeno. Promedio de UFC/g en base seca de los microorganismos del ciclo del
nitrgeno por estacin.

Proteolticos
Estacin

UFC/g UFC/g UFC/g


(B.S.) (B.S.) (B.S.)
Sec. 1 Sec. 2 Promedio

1 4.8x105 1.1x107 5.74x106

2 9.57x105 3.7x105 6.63x105

3 4.25x106 4.39x105 2.34x106


4 4.54x106 3.5x106 2.44x106

5 1.53x105 <1 7.65x105

6 9.45x106 4.6x106 7.02x106

7 2.2x106 3.57x106 2.88x106

8 4.59x106 - 4.59x106
Tabla 6. Microorganismos proteolticos del procesos del ciclo del Nitrgeno.

Imagen 4. Grfica de log UFC/g en base seca microorganismos proteolticos.


Promedio de UFC/g en base seca de los microorganismos proteolticos presentes
en el ciclo del nitrgeno por estacin.

Discusin

En los resultados obtenidos, las bacterias mesoflicas aerobias ocupan el grupo


microbiano ms abundante en las diferentes estaciones, esto porque dentro de este
grupo se encuentra el mayor nmero de especies cultivables en las condiciones de
incubacin que utilizamos en el laboratorio, despus se encuentra el grupo de
pseudomonas fluorescentes, ya que varias especies de este grupo participan en
relaciones especficas con plantas que evita la llegada de patgenos hacia la planta
y esta le provee a la bacteria de exudados con gran cantidad de nutrientes lo que
permite su crecimiento, esto se refleja en el alto conteo de este grupo microbiano,
adems que este grupo tambin soporta variaciones de pH en su ambiente.
Los corineformes son un grupo microbiano presente en todos los suelos pero con un
conteo de UFC/g que est entre exponentes de 10^4 y 10^5, que tienen la
capacidad de degradar compuestos de alto peso molecular como hidrocarburos y
polmeros de carbohidratos como celulosa y almidn, el alto conteo de estos nos
indica indirectamente una gran cantidad de compuestos de este tipo, en caso de los
hidrocarburos que son un contaminante, nos ayuda a tener una idea del grado de
contaminacin que sufre el rea,obtuvimos un conte en todas las estaciones que
oscila entre exponentes 10^4 y 10^6 nos habla de un alza de estos
microorganismos, incluso rebasando a los Actinomicetos en algunas estaciones
como son la 1, 4,6, y 7, esto porque al ser ambos estrategas de tipo K, los
corineformes tienen un crecimiento ms rpido respecto a los Actinomicetos, lo que
permite la utilizacin de fuentes de carbono como lo son la celulosa y el almidn que
tambin son utilizadas por el segundo grupo microbiano, esto disminuye la
proliferacin de estos y ocasiona un conteo disminuido, en condiciones de pH
alcalino, pH que todas las estaciones mantienen, se esperara que el conteo de
Actinomicetos aumentar bastante respecto a los otros grupos microbianos pero no
fue as, principalmente por lo mencionado anteriormente, estos cambios de pH
significativos se dan principalmente por los desechos que son arrojados sobre el
suelo directamente o sobre el agua y que al llegar a las orillas del ro y se depositan
en el suelo, ocasionando variaciones en este factor fsico qumico, la mayora es de
pH ligeramente alcalino ( 7.2) y en los encontrados en suelo de las estaciones ronda
entre 9 - 13, los contaminantes principalmente detergentes y jabones ocasionan
variaciones de pH hacia lo alcalino, una presuntiva es que este tipo de
contaminantes proviene de los desechos del poblado cercano que son arrojados al
ro,estas condiciones de pH tambin afecta a los hongos filamentosos, los cuales
crecen en pH ligeramente cidos, y se ven afectados por pH alcalinos, esto provoc
un recuento de estos ligeramente bajo con exponentes en el recuento entre 10^5 y
10^4 donde lo normal sera recuentos con exponentes entre 10^5 y 10^6, estos
microorganismos a pesar de estar e menor cantidad que las bacterias, tienen una
cantidad de biomasa ms significativa por ser mas grandes, ademas tambien son
algunos de los principales degradadores de materia orgnica en el ambiente, esto
significa que un bajo conteo de estos adems de los actinomicetos repercutir en
los ciclos que se llevan a cabo en el suelo como el del carbono y Nitrgeno
Pero a pesar de las alteraciones, algunos de los microorganismos siguen haciendo
su funcin dentro del ecosistema, este es el caso de los microorganismos
amilolticos y celulolticos cuantificados en la prctica del ciclo del carbono, donde
pudimos observar una elevada cantidad de ellos en todas las estaciones
muestreadas, esto nos dice que al ser un lugar con tanta vegetacin, y por lo tanto
bastantes residuos de plantas, los microorganismos deben de estar en una
proporcin alta para poder degradar los residuos de celulosa y almidn y as
incorporar el carbono a su ciclo, esto fue comprobado satisfactoriamente.
Por otro lado, lo planteado al principio de la discusin, fue corroborado con la
prctica de ciclo del nitrgeno, ya que los microorganismos proteolticos y
amonificadores tuvieron ms o menos la misma proporcin, por lo que las
condiciones del ecosistema resultan ser las mismas en cada estacin, no
permitiendo una variacin en los resultados de estos microorganismos, en cambio
los microorganismos nitrificantes y desnitrificadores s variaron en todas las
estaciones, esto pudo ocurrir debido a que los niveles de oxgeno no eran muy altos,
por lo cual ambos procesos no pueden ser favorecidos, ya que para llevar a cabo el
proceso de nitrificacin se requiere de oxgeno y para el procesos de desnitrificacin
se requieren de condiciones anxicas. Y al verse favorecidos slo unos grupos de
microorganismos se ve alterado el ciclo, ya que se acumula un determinado
metabolito, como es el caso del amonaco, el cual en concentraciones tan altas se
vuelve txico inhibiendo el crecimiento de los dems grupos provocando una baja
biodiversidad en el ecosistema.

Conclusiones
*El grupo microbiano en el suelo ms abundante en la zona de las cascadas de
Atlihietzian son las bacterias mesoflicas aerobias seguido por Pseudomonas
fluorescentes

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