La Campaa de Vilcanota frente a Mariscal del Valle.
Prisin y muerte de Tpac
Amaru El Mariscal del Valle, que estaba a cargo de un nutrido contingente de soldados, acompaado del Visitador Areche llegaron al Cuzco el 24 de marzo y de inmediato prepararon la gran expedicin que deba marchar al sur contra los rebeldes. La conformacin de las tropas era de una base de seis columnas, un cuerpo de reserva y dos destacamentos que en total conformaban unos veintitrs mil hombres con las tropas dejadas para resguardo del Cuzco. (Bello, 1981, pg. 418)
El primer combate se dio el 20 de marzo en Pucacasa y consisti en un violento fuego de
fusilera y una retirada de las fuerzas espaolas a una nueva posicin de defensa. Despus de estas acciones, las tropas realistas continuaron su avance hacia Tinta donde estaba el rebelde. A pesar de que Tpac Amaru haba concebido la tctica de la guerra entre ellos tener claro la topografa, el tiempo y las tcticas de guerra de guerrillas, los espaoles ya les estaban pisndo los talones, aunque se retrasaron estratgicamente, los rebeldes despus bajan al valle bsicamente al cuartel de los rebeldes generndose enfrentamientos que va a dar con su captura. Tpac Amaru tiene la posibilidad de huir al rea de los cuarteles de los rebeldes, pero fue traicionado por sus seguidores, los soldados finalmente los apresaron y entregado a las tropas triunfantes quienes lo condujeron al Cuzco donde se le sigui un proceso que le conden a muerte. La ejecucin del caudillo rebelde tuvo lugar en la plaza del cuzco, donde fue decapitado luego de que los cuatro caballos que tiraban sus extremidades no lograran destrozar su cuerpo. Micaela Bastidas, esposa del curaca, y otros parientes fueron tambin cruelmente ejecutados.
Las guerras de Puno entre 1781 y 1782
Muerto el caudillo rebelde la revolucin no termino, pues inmediatamente comenz la segunda fase de la misma, en el Altiplano, peruano boliviano, bajo el liderazgo de Diego Cristbal Tpac Amaru, Pedro Vilcapasa y Tupac Catari, que establecieron su cuartel general en Azngaro. Los rebeldes sitiaron Puno, luego la Paz, en dos oportunidades diferentes Sotara y todo el Collao fue un territorio liberado del yugo espaol, durante casi dos aos. El Mariscal Jos del Valle, marcho con sus diecisiete mil soldados a derrotarlos y, los indios rebeldes libraron las batallas de Condorcuyo, Pukinakankari y una intensa guerra de guerrillas, que redujo el ejrcito espaol a la octava parte. (Bello, 1981, pg. 430) Puno tuvo que ser evacuado y los espaoles se retiraron con su ejrcito del Altiplano hacia el Cusco, sin haber podido vencer a los rebeldes.