Cuntas secuencias similares se han obtenido con la secuencia de la rata?

100 secuencias similares

Cuantos HSPs tiene el primer hit, y el segundo y el tercero?

Solo un HSPs

Tienen todos los HSPs el mismo E-value?

EL E-value de todos tiene un valor de 0.0

Para la secuencia de la Rata:

Cuantos alineamientos distintos hay para cada secuencia?

1 alineamiento para cada secuencia excepto por 1 que tiene dos y corresponde a mus
musculus 10 days neonate medullla obloganta CDNA-RI

En el caso de haber distintos HSPs tienen todos el mismo E-value?

En el caso que presenta dos HSPs no presentan el mismo E-value, pues uno tiene un valor de 0
y el otro de 1.5e-165

Con que criterio estn ordenados los HSPs dentro de cada secuencia?

Son ordenados deacuerdo a su E-value.

Qu E-value aparece en la tabla resumen?

Secuencia 1
Estructura de dominios

Especie: Dermacentor variabilis

Molecula: mRNA

Otras molculas

Otras especies

Drosophila kikikawai

Amyelois transitelia

Rhipicephalus microplus

Secuencia 2
Estructura de dominios:

Especie: Amblyomma variegatum

Molecula: Amblyomma variegatum RNA-binding protein LARK mRNA, partial cds

Otras molculas: no presenta

Otras especies. No presenta

Secuencia 3

Especie: Amblyomma variegatum

Molcula: Amblyomma variegatum salivary mucin mRNA, complete cds

Otros organismos: no presente ambos HSPs estn presentes en Amblyomma

variegatum

Otras molculas: Amblyomma variegatum peritrophin mRNA, complete cds

Secuencia 4

Molecula: Amblyomma variegatum hypothetical glycine-rich secreted cement protein

mRNA, complete cds.
Otro organism: Algibacter alginicilyticus.

Otras moleculas
Amblyomma variegatum hypothetical glycine-rich secreted protein 3
Amblyomma variegatum hypothetical glycine-rich secreted protein 5
Secuencia 5

Estructura de dominios

Molcula: etobacter baumannii partial bla-oxa69 gene for Betalactamase, strain SDF

Otros organismos:
Acinetobacter calcoaceticus

Otras moleculas

Acinetobacter baumannii partial bla-oxa69 gene for Betalactamase, strain SDF.

Acinetobacter baumannii 276/2C blaOXA gene for OXA-51 family carbapenem-

hydrolyzing class D beta-lactamase OXA-383, complete CDS.

Acinetobacter baumannii strain DR36519/96 transposon ISAba1 transposase

gene, complete cds

Secuencia 6

Molecula: S.marcescens Sme-1 gene for Sme-1 carbapenem hydrolysing beta-

lactamase.
Estructura de dominios

Organismo: Serratia marcences.

Otros organismos: no hay

Otras molculas:

Serratia marcescens smeR and sme1 genes for lysR-type proteins

Serratia marcescens S6 blaSME gene for carbapenem-hydrolyzing class A beta-
lactamase SME-1, complete CDS
Serratia marcescens 41727R blaSME gene for carbapenem-hydrolyzing class A beta-
lactamase SME-4, complete CDS.
Secuencia 7

Organism: Homo sapiens

Moelcula: Homo sapiens toll like receptor 10 (TLR10), transcript variant 5, mRNA
Estructura de dominios

Otros organismos:

Gorilla gorilla gorilla

Nomascus leucogenys

Rhinopitecus bieti

Otras moleculas: todosd son receptors TLR 10

Secuencia 8

Estructura de dominios

Organismo: homo sapiens

Molcula: NLR family CARD domain-containing protein 4 isoform a [Homo sapiens]

Otros organismos

Pan Troglodytes

Pan paniscus

Gorilla gorilla gorilla

Otras molculas

PREDICTED: NLR family CARD domain-containing protein 4 [Pan troglodytes]

Secuencia 9
Estructura de dominios

Organismo: Atlantic horseshoe crab

Molecula: complement factor B-like

Otros organismos

Otras molculas

complement factor B-1 [Hasarius adansoni]

CUB and sushi domain-containing protein 3 isoform X6 [Sus scrofa]
sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1-
like [Orbicella faveolata]

secuencia 10