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TRABAJO DE BIOQUIMICA

Fase 4 - Actividad colaborativa ABP


de Ácidos nucleicos
Estudiantes

Juan Camilo Sepúlveda Palacio C.C 8101205


Luz Bibiana tabaresquinchia cc 43185123
Sandra Milena Sánchez García cc 43102670

Grupo del curso


201103_44

Presentado a
GOLDA MEYER TORRES VARGAS

FECHA

20 de abril de 2018
FORMATO PARA LA ENTREGA DE APORTES Y CONSOLIDADCIÓN
DEL TRABAJO FINAL
Fase 4 - Actividad colaborativa ABP de Ácidos nucleicos

Aportes Individuales
Señor estudiante: no modifique el formato, no le suprima ni
anexe tablas o filas. Solamente adjunta la información
solicitada.

SITUACIÓN PROBLEMA: METILACIÓN DEL ADN


Señor estudiante: seleccione uno de los siguiente temas y
realice una revisión bibliográfica ( usar normas APA, para citas
como para referencias) y un mapa conceptual en donde se
resuman los aspectos más importantes:

1. Metilación enzimática del ADN para la formación de 5-


metilcitosina
2. Relación Metilación del ADN y modificaciones epigénicas
3. Enfermedades que tiene su origen por la metilación del ADN.
Entregue un resumen de la Revisión teórica seleccionada
Nombre
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del
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estudiante

2. Relación Metilación del ADN y modificaciones epigénicas


La metilación del ADN es uno de los mecanismos epigenéticos implicados en la regulación de la expresión génica en los
Camilo
mamíferos, es vital en el desarrollo embrionario y tiene un papel crítico en el silenciamiento de genes específicos durante la
Sepulveda. diferenciación celular.
La Epigenética se refiere a los cambios heredables en el ADN e histonas que no implican alteraciones en la secuencia de
nucleótidos y modifican la estructura y condensación de la cromatina por lo que afectan la expresión génica y el fenotipo. Las
modificaciones epigenéticas son metilación del ADN y modificaciones de histonas.

Los principales mecanismos epigenéticos comprenden la metilación del ADN, la modificación de las histonas y la acción de los
ARN no codificantes. De ellos, el más conocido y sobre el que más estudios se han realizado en cuanto a su relación con el
desarrollo de enfermedades, es la metilación del ADN.

Los cambios epigenéticos, como la metilación del ADN, representan un mecanismo mediante el cual los factores ambientales
pueden influir en la expresión génica individual. Resulta un campo de investigación de gran interés en el ámbito de la medicina,
sobre todo en el estudio de aquellas enfermedades en las que se han detectado factores de riesgo ambiental que participan en
su presentación y desarrollo, como ocurre en la esclerosis múltiple. Tomado de
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0213485315000638

Los mecanismos epigenéticos tienen un papel crucial en los procesos de modificación sináptica y en la formación y desarrollo
de la memoria.El ADN presenta regiones de 1.000-1.500 pares de bases ricas en dinucleotidos CpG (islas CpG), que son
reconocidas por las enzimas ADN-metiltransferasas. Durante la replicación del ADN, las citosinas de la cadena recién
sintetizada son metiladas, manteniéndose así la memoria del estado metilado en la molécula hija de ADN. En general esta
modificación se hace estable y es heredada como un patrón clonal de metilación. La sobremetilación de estas regiones
mantiene la estructura condensada de la cromatina e impide la transcripción de los genes involucrados.

Finalmente se ha determinado que los mecanismos epigenéticos juegan un papel central en las funciones cerebrales, por lo que
cualquier alteración puede conducir a trastornos en el desarrollo neurológico o a procesos neurodegenerativos. Tomado de
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0213485314000310
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estudiante Máximo de hojas (1).
3. Enfermedades que tiene su origen por la metilación del ADN.

Estudiante
Los patrones de metilación del ADN son importantes para regular de manera adecuada la expresión de los genes y asegurar
2. un desarrollo normal del ser humano, por lo que su alteración se relaciona con enfermedad. Los cambios en la expresión
Luz Bibiana génica pueden deberse a problemas en la maquinaria encargada de producir y mantener la metilación, tales como mutaciones
Tabares en los genes que codifican para las ADN metiltransferasas, o en aquellos que codifican para las proteínas de unión al ADN
metilado o por cambios en la secuencia de nucleótidos del ADN o en los complejos remodeladores de la cromatina que
Quinchia conducen a cambios en su patrón de metilación. Entre este tipo de padecimientos se encuentran los síndromes: ICF
(inmunodeficiencia, inestabilidad centromérica y anomalías faciales), de Rett, de X frágil y ATR-X (alfa talasemia y retraso
mental ligados al X). Otras enfermedades humanas, como los síndromes de BeckwithWiedemann y de PraderWilli /Angelman,
están asociadas con cambios en la dosis funcional de genes sujetos a impronta genómica, y pueden originarse por diferentes
mecanismos que incluyen microdeleciones o duplicaciones de la región improntada, disomíauniparental y alteraciones en los
mecanismos de regulación epigenética. 8,15,87,88 Por otra parte, la metilación aberrante es un fenómeno relativamente frecuente
en los procesos neoplásicos caracterizados por inestabilidad genómica y alteraciones en la expresión génica
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1. metilación enzimática del ADN para la formación de 5 metilcitosina.

La metilación de la citosina para formar 5-metilcitosina ocurre en la quinta posición en el anillo de la pirimidina en el que
Estudiante 3. se encuentra el grupo metilo de la base de ADN, timina, distinguiéndola de la base análoga del ARN, uracilo, que no tiene
Sandra Milena un grupo metilo. La sustitución más común y universal en el ADN, es la de uracilo por timina. sin embargo, en el ARN no
Sánchez pudo haber evolucionado como un mecanismo de control de errores, para facilitar la eliminación de uracilos generados
por la desaminación espontánea de la citosina.La metilación del ADN, así como muchos de sus contemporáneas de ADN
García metiltransferasas, se ha pensado que evolucionó a partir de la actividad temprana de la metilación del ARN primitivo y
está apoyada por varias líneas de evidencias.
La metilación del ADN en la posición 5 de la citosina tiene el efecto específico de reducir la expresión génica y se ha
encontrado en todos los vertebrados examinados. En las células somáticas adultas (células en el cuerpo, no utilizadas
para la reproducción), la metilación del ADN se produce normalmente en un contexto dinucleótidoCpG (es decir, donde
una citosina es seguida por una guanina); la metilación que no involucra los CpG es frecuente en las células madre
embrionarias, y también se ha encontrado en el desarrollo neural. De igual manera, en la metilación que no involucra los
CpG se ha observado en las células progenitoras hematopoyéticas, y es producida sobre todo en un contexto de
secuencia CpApC.
Hay ocasiones en las que un gen ha de ser desactivado por completo y permanentemente. Para ello se recurre a la
metilación del ADN y a la modificación de nucleosomas. Cuando un gen no se expresa, una ADN-metiltransferasa
(metilasa) puede metilar citosinas tanto en el promotor, como en la secuencia codificante o en sitios de unión de
activadores situados en la posición 5’ respecto del gen. De esta manera, se genera la 5-metilcitosina, la cual por sí sola es
capaz de impedir la unión de la maquinaria de transcripción o de activadores. Para ello se unirán otras proteínas como
MeCP2 (proteína que impide la unión de factores de transcripción o bien bloquea el avance de la ARN polimerasa), que
reconocen estas metilcitosinas y son además capaces de reclutar al complejo represor Sin3, el cual presenta actividad
desacetilasa de histonas.
Se ha estimado que la 5-metil citosina es aproximadamente 1% del total de bases nitrogenadas del ADN y representa de
70 a 80% del total de dinucleótidosCpG en el genoma.
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La metilación del ADN


Consiste en la adición de una modificación bioquímica concreta, un grupo metilo a los nucleótidos que componen la
Estudiante 4. secuencia del ADN. Principalmente la modificación se realiza sobre las citosinas, aunque recientes estudios apuntan a un
papel relevante de la metilación de adeninas. Los grupos metilo actúan como señales de reconocimiento sobre el ADN,
Adriana peña favoreciendo el reclutamiento de proteínas que participan en la regulación de la expresión génica.
Espinal
 Modificación de las proteínas histonas
Las proteínas histonas participan en la compactación y organización del ADN en el interior del núcleo celular. Aminoácidos
específicos de las histonas pueden ser modificados mediante la adición de grupos acetilo, metilo o fosfato. Las
combinaciones de modificaciones de las histonas definen la conformación de la cromatina (complejo formado por ADN y
proteínas histonas) e influyen en la expresión génica

 MicroARNs
Los ARN pequeños pueden silenciar a los genes interfiriendo directamente con las regiones del ADN promotoras de la
transcripción, o bien a través de la unión con proteínas para formar complejos de silenciamiento transcripcional.

Las modificaciones epigenéticas funcionan como intermediarias entre el ambiente y los genes, por lo que influyen en
diferentes aspectos de la biología y su alteración puede derivar en enfermedades como el cáncer.
Recuperado de: https://revistageneticamedica.com/epigenetica/
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estudiante

Máximo de hojas (1).


Estudiante 5.
REALICEN AQUÍ EN ADELANTE LA CONSOLIDACIÓN DE LA
REVISIÓN TEORICA SOLICITADA, DE ACUERDO A LOS APORTES
INDIVIDUALES, INCUYENDO LOS MAPAS CONCEPTUALES.
MAXIMO DE HOJAS 5
Cada Estudiante del grupo entregará aportes en relación a:

Analice: En términos bioquímicos que implica la metilación del ADN se produce en las bases de citosina
del ADN eucariótico, que se convierten en 5-metilcitosina por las enzimas ADN metiltransferasa (DNMT).

Es decir: Explicar con sus propias palabras, usando térmicos bioquímicos el proceso enzimático que
implica la 5-metilcitosina por las enzimas ADN metiltransferasa (DNMT).

Estudiante 1 La metilación del ADN en la célula eucariótica implica la adición de un grupo metileno al carbono de la
posición 5 del anillo pirimidínico de las citosinas que van seguidas de las guaninas, llamados
Juan Camilo Sepúlveda dinucleotidos CpG, esta reacción es catalizada por una metiltransferasa de ADN (S-adenosil-
Lmetionina) en la secuencia 5’ -CG-3’, dando lugar a la formación de 5 metilcitosina permitiendo la
interacción de proteínas-ADN. La asociación de proteínas a 5 metilcitosina a ADN metilado puede
bloquear la capacidad de los factores de transcripción para encontrar y unirse al ADN, esta inhibición
se da por el impedimento estérico, lo que produce alteración en la composición genética.
Estudiante 2 Este proceso enzimático en el cual implica la 5-metilcitosina ocurre en la quinta posición en el anillo de
la pirimidina en el que se encuentra el grupo metilo de la base de ADN, distinguiéndola de la base
Luz Bibiana Tabares análoga del ARN, uracilo, que no tiene un grupo metilo. para facilitar la eliminación de uracilos
Quinchia generados por la desaminación espontánea de la citosina. tiene el efecto específico de reducir la
expresión génica La metilación modifica la función del ADN cuando se encuentra en el gen promotor.
La metilación del ADN generalmente actúa para reprimir la transcripción génica. La metilación del
ADN es esencial para el desarrollo normal y se asocia con una serie de procesos como la impronta
genómica, la inactivación del cromosoma X, la represión de elementos repetitivos, el envejecimiento y
la carcinogénesis.
Estudiante 3 La metilación del ADN es la modificación epigenetica (factores no propiamente de los genes, pero que
interaccionan con ellos) más estudiada en vertebrados.
Sandra Milena Sánchez Consiste en la adicción por enlace covalente de un grupo metilo (-CH3) al carbono cinco del nucleótido
García
citosina, generalmente cuando una citosina está adyacente en el carbono cinco a una guanina,
formando el dinocleótido CpG.
La p significa que en el enlace citosina-guanina existe el fósforo.
Las enzimas encargadas de éste proceso son las ADN-Metiltransferasas (DNMTs).
La cantidad y localización de CpG es de gran interés en el estudio de la metilación del ADN debido a
su condición como secuencia diana (portadora de enzimas).

Estudiante 4 La 5-metilcitosina es una forma metilada de la base nitrogenada citosina, que puede estar implicada
en la regulación de la transcripción de genes. Cando la citosina está metilada, el ADN mantiene la
Adriana Peña Espinal misma duda de nucleótidos, pero la expresión de genes metilados puede ser alterada (como estudia
la epigenética). La 5-metilcitosina se incorpora en el nucleósido 5-metilcitidina.

En la 5-metilcitosina, un grupo metilo está unido al 5º átomo del anillo de 6 átomos (cóntase en
sentido contrario a las agujas del reloj desde el nitróxeno del NH en la posición de las 6 horas en
punto, no de las 2 en punto). Este grupo metilo distingue a la 5-metilcitosina de la citosina.

Estudiante 5 No exceda las 100 palabras

Consolidado grupal No exceda las 250 palabras

Espacio para las


observaciones del tutor
Analice. Por qué la metilación del ADN es de vital importancia para mantener el silenciamiento génico en
el desarrollo normal, la impronta genómica y la inactivación del cromosoma X.

Es decir: Expliquen con sus propias palabras, Por qué la metilación del ADN es de vital importancia para
mantener: el silenciamiento de genes en el desarrollo normal, la impronta genómica y la inactivación del
cromosoma X.

Estudiante 1 La activación del gen equivocado en el momento equivocado puede causar estragos en la célula. Para
evitar que esto suceda, los organismos dependen de la metilación de ADN para mantener desactivados
Juan Camilo Sepúlveda a los genes que no necesitan. La metilación del ADN es fundamental para señalar qué genes deben
encenderse o apagarse de manera definitiva en momentos específicos del desarrollo, o para procesos
como la inactivación del cromosoma X, impronta genética (La impronta afecta al crecimiento prenatal y
se ha establecido su importancia en la generación de enfermedades) recombinación y mantenimiento de
la estabilidad genómica; es vital en el desarrollo embrionario y tiene un papel crítico en el silenciamiento
de genes específicos durante la diferenciación celular. También vemos su importancia en la formación
de la estructura de la cromatina, que permite a una célula crecer en un organismo multicelular complejo
compuesto de diversos tejidos y órganos.

Estudiante 2 La metilación del ADN es de vital importancia para mantener el silenciamiento génico en el desarrollo
normal, la inactivación del cromosoma x la impronta genómica y por ende las alteraciones en ella ya q
Luz Bibiana Tabares Quinchia están implicadas en algunas enfermedades humanas, como aquéllas relacionadas con defectos en el
desarrollo y el proceso neoplásico. Esta importancia nombra los aspectos moleculares de la metilación
del ADN y su participación en el desarrollo normal, el cáncer y en algunas patologías humanas en las
cuales los mecanismos epigenéticos tienen que ver en su origen o están implicados. Las modificaciones
epigenéticas que ocurren en las enfermedades humanas serán sumamente importantes para su manejo
en un futuro. Estos cambios en los patrones de metilación podrán ser manejados en cáncer y serán
indispensables para crear estrategias terapéuticas que impliquen la reactivación o el silenciamiento de
genes específicos que la producen.
Estudiante 3 Los científicos han hecho diversos descubrimientos sobre la metilación del ADN y como es importante
para varios procesos celulares tales como revelado embrionario, desactivación del cromosoma X,
Sandra Milena Sánchez impresión genómica, supresión del gen, carcinogénesis y estabilidad del cromosoma. La metilación
García anormal del ADN está asociada a varios resultados adversos, incluyendo enfermedades humanas.
En lugares donde la metilación sea escasa, se encuentran cadena CpG (Citosina-fosforo-Guanina)
desnaturalizadas, lo cual puede implicar el silencionamiento o inactividad de ciertos genes supresores
de enfermedades y del cromosoma X.
Estudiante 4 La metilación del ADN es de vital importancia para mantener el silenciamiento de genes en el desarrollo
normal, la impronta genómica y la inactivación del cromosoma Xya que las modificaciones en los
Adriana Peña Espinal mecanismos de regulación permiten al organismo adaptarse a las circunstancias de cada momento, de
manera que alteraciones en estos patrones de regulación podrían llevar al desarrollo de distintas
enfermedades. Otro aspecto importante de los avances en epigenética es la posibilidad de adentrarse
en nuevas terapias, que nos permitan intervenir directamente sobre los cambios epigenéticas asociados
a la enfermedad
Estudiante 5 No exceda las 100 palabras

Consolidado grupal No exceda las 250 palabras

Espacio para las


observaciones del tutor
Analice. Por qué los aspectos moleculares de la metilación del ADN y su participación en el desarrollo
normal, el cáncer y en algunas patologías humanas en las que los mecanismos epigenéticos han sido
implicados.

Es decir: Expliquen con sus propias palabras y en 250 palabras, cuál es la implicación de la metilación del
ADN en el desarrollo de ciertas patologías como el cáncer.

Estudiante 1 Cuando la metilación del ADN se desregula contribuye a la aparición de enfermedades como el cáncer.
Los defectos en la metilación del ADN están estrechamente relacionados con el cáncer, aunque
Juan Camilo Sepúlveda ninguna mutación o deficiencia en cualquiera de las DNMTs ha sido identificada como causalmente
vinculada al desarrollo de tumores, lo más probable por su papel crítico durante la embriogénesis.
Asimismo, firmas basadas en cambios de metilación del ADN en genes concretos, son capaces de
predecir la agresividad tumoral, la respuesta a terapia o la recidiva en diversos tipos de cánceres. En
cáncer humano los patrones de metilación del ADN cambian drásticamente generando una
reprogramación del epigenoma y alterando los patrones de expresión. Por un lado, se produce la
hipermetilación de genes supresores tumorales, y por otro se da una ola de hipometilación global del
ADN que afecta a secuencias repetitivas en dominios de heterocromatina, y elementos transponibles y
retrovirales integrados en el genoma. Estos cambios estimulan, no solo la transformación y desarrollo
temprano de neoplasia, sino que se acumulan y fomentan la progresión y metástasis de las células
tumorales.
Estudiante 2 La metilación del ADN es un proceso epigenético en el cual participa en la regulación de la expresión
génica.Directamente al impedir la unión de factores de transcripción, e indirectamente propiciando la
Luz Bibiana Tabares quinchia estructura de la cromatina. El ADN presenta regiones de 1000–1500 ricas en dinucleótidos, que son
reconocidas por las enzimas ADN–metiltransferasaspor ende, durante la replicación del ADN metilan el
carbono 5 de las citosinas de la cadena recién sintetizada, manteniéndose así la memoria del estado
metilado en la molécula hija de ADN.Podría decirse que la metilación es un proceso unidireccional, de
esta manera, cuando una secuencia CpG adquiere metilación de Novo, esta modificación se hace
estable y es heredada como un patrón de metilación clonal. Asímismo, la pérdida de metilación
genómica se asocia frecuentemente con el proceso neoplásico y es proporcional a la severidad de la
enfermedad.

Los genomas de las células preneoplásicas, cancerosas y envejecidas tienen cambios importantes en
los niveles de metilación esta va ligada al desarrollo de algunos tumores. hipo metilación de la
heterocromatina que conduce a una inestabilidad genómica e incrementa los eventos de recombinación
mitótica, hipermetilación de genes individuales, hipermetilación de genes constitutivos y genes tumor
supresor. Los dos niveles de metilación pueden presentarse en forma individual o simultánea, en
general, la hipermetilación está involucrada con el silenciamiento de genes y la hipometilación ciertas
proteínas en los procesos de invasión y metástasis.

Estudiante 3 El cáncer siendo una enfermedad compleja tanto en su desarrollo como en sus manifestaciones, se
caracteriza por alteraciones en los mecanismos genéticos y/o epigenéticos que regulan la división
celular, llevando a una proliferación descontrolada. (alteraciones en supresores tumorales, genes de
reparación, diferenciación celular y apoptosis, entre otros).
De tal suerte, las funciones fisiológicas de los tejidos se perturban, originando muchas manifestaciones
clínicas, dependiendo del órgano afectado, el tamaño del tumor y la propagación de las células
cancerígenas (metástasis).
Según algunos autores, la epigenética y la carcinogénesis se encuentran fundamentalmente enlazados.
Si entendemos por epigenética los cambios heredables en el patrón de expresión genética, que no son
consecuencia de alteraciones en la secuencia nucleotídica del gen, los cambios en la expresión
genética están dados por diferentes mecanismos: la metilación del ADN, la impronta genómica y la
modificación delas proteínas histonas, que en conjunto interfieren silenciando o sobreexpresando genes
que regulan el funcionamiento celular normal.
Entre los mecanismos antes mencionados, la metilación del ADN en sitios ricos en citosinas y guaninas
(islas CpG) es un factor que se ha visto alterado en carcinogénesis. En las células tumorales, las islas
CpG localizadas en los promotores de genes involucrados en carcinogénesis se encuentran
frecuentemente hipermetiladas, evitando la expresión del gen correspondiente, y favoreciendo la
pérdida de heterocigocidad; esto último corresponde a la pérdida de la expresión génica mediante el
daño en el alelo de un gen en el que su otro alelo había sido previamente inactivado. De igual forma, en
las células tumorales otras regiones del genoma pueden estar hipometiladas, llevando a inestabilidad
cromosómica y aparición de eventos de translocaciones.

Estudiante 4 La metilación del ADN tiene una influencia directa sobre la transcripción génica, habiéndose descrito
alteraciones en todas las vías de señalización conocidas. Es el proceso epigenético mejor
Adriana Peña Espinal caracterizado, y un gran número de estudios ha definido un catálogo en continua expansión de
biomarcadoresepigenéticos con potencial aplicación clínica. De tal modo que una alteración o
irregularidad de dicho proceso es sin duda una gran fuente de diferentes tipos de cáncer.
Dicho proceso es bastante complejo e importante ya que de este pueden depender varias patologías
pero también son una ventana de oportunidad para estudiar, prevenir y/o genes concretos capaces de
predecir la agresividad tumoral, la respuesta a terapia o la recidiva en diversos tipos de cánceres
Estudiante 5 No exceda las 100 palabras

Consolidado grupal No exceda las 250 palabras

Espacio para las


observaciones del tutor
SITUACIÓN PROBLEMASITUACIÓN PROBLEMA:
ENZIMAS
Señor estudiante: seleccione uno de los siguientes temas y
realice una revisión bibliográfica(usar normas APA, para citas
como para referencias) y un mapa conceptual en donde se
resuman los aspectos más importantes:

1. La inhibición enzimática
2. Cinética enzimática: generalidades y factores
3. Cinética enzimática: Vmax. Km: significado e
interpretación
4. Cinética enzimática: método Lineweaver – Burk
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2. Cinética enzimática: generalidades y factores.

La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas. Estos estudios proporcionan
Estudiante información directa acerca del mecanismo de la reacción catalítica y de la especifidad del enzima. La velocidad de una
1. reacción catalizada por un enzima puede medirse con relativa facilidad, ya que en muchos casos no es necesario purificar o
Juan aislar el enzima. La medida se realiza siempre en las condiciones óptimas de pH, temperatura, presencia de cofactores, etc.
Se utilizan concentraciones saturantes de sustrato. En estas condiciones, la velocidad de reacción observada es la velocidad
Camilo máxima (Vmax). La velocidad puede determinarse bien midiendo la aparición de los productos o la desaparición de los
Sepúlveda reactivos.
Al seguir la velocidad de aparición de producto (o de desaparición del sustrato) en función del tiempo se obtiene la llamada
curva de avance de la reacción, o simplemente, la cinética de la reacción. A medida que la reacción transcurre, la velocidad
de acumulación del producto va disminuyendo porque se va consumiendo el sustrato de la reacción (Figura de la derecha).
Para evitar esta complicación se procede a medir la velocidad inicial de la reacción (v0). La velocidad inicial de la reacción es
igual a la pendiente de la curva de avance a tiempo cero (Figura de la derecha). De esta forma, la medida de v0 se realiza
antes de que se consuma el 10% del total del sustrato, de forma que pueda considerarse la [S] como esencialmente
constante a lo largo del experimento. Además, en estas condiciones no es necesario considerar la reacción inversa, ya que la
cantidad de producto formada es tan pequeña que la reacción inversa apenas ocurre. De esta forma se simplifican
enormemente las ecuaciones de velocidad.
Para estudiar la cinética enzimática se mide el efecto de la concentración inicial de sustrato sobre la velocidad inicial de la
reacción, manteniendo la cantidad de enzima constante. Si representamos v0 frente a [S]0 obtenemos una gráfica como la de
la Figura de la derecha. Cuando [S]0 es pequeña, la velocidad inicial es directamente proporcional a la concentración de
sustrato, y, por tanto, la reacción es de primer orden. A altas [S]0, el enzima se encuentra saturada por el sustrato, y la
velocidad ya no depende de [S]0. En este punto, la reacción es de orden cero y la velocidad es máxima (Vmax). Tomado de:
http://www.ehu.eus/biomoleculas/enzimas/enz3.htm

Factores que afectan a la actividad enzimática: Concentraciones de Sustrato, Enzima (Actividad enzimática) Activadores e
Inhibidores, Temperatura, pH, Fuerza iónica, Naturaleza de los iones presentes en el medio, etc.
pH y medio iónico afectan a la conformación tridimensional de la proteína, La actividad de la enzima depende de la extensión
de la reacción dedisociación de ciertos aminoácidos en la estructura proteica. Si el sustrato tiene propiedades ácido-base es
probable que la enzima sólo pueda catalizar la transformación de su forma disociada o de su forma no disociada.Tomado de:
file:///C:/Users/camilo/Desktop/Clase_Enzimas.pdf
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Estudiante 2. 5. Cinética enzimática: método Lineweaver – Burk


Luz Bibiana
Diagrama de Lineweaver-Burk se emplea como herramienta gráfica para calcular los parámetros cinéticos de una enzima.
Tabares Quinchia
Su utilidad consiste en que el recíproco de la cinética de Michaelis-Menten es fácilmente representable y que de él emanan
mucha información de interés.

Representa 1/v frente a 1/s y permite determinar a partir de medidas experimentales parámetros básicos de la cinética
enzimática como la constante de Michaelis y la velocidad máxima de reacción
Donde V es la velocidad de reacción, Km es la constante de Michaelis-Menten, Vmax es la velocidad máxima, y [S] es
la concentración de sustrato.
La representación gráfica de Lineweaver-Burk permite identificar el Km y Vmax; el punto de corte con el eje de ordenadas es el
equivalente a la inversa de Vmax, y el de abscisas es el valor de -1/Km.
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Estudiante 3.
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estudiante
1.. La inhibición enzimática
La actividad enzimática se puede inhibir, es decir, reducir o eliminar la actividad enzimática o catalítica de enzimas específicas.
La inhibición puede ser:
Estudiante A. Irreversible - el inhibidor se une covalentemente a la enzima, casi siempre a un grupo de la cadena lateral de los amino
4. ácidos en el foco activo. La enzima queda inactiva permanentemente.
Adriana B. Reversible: el inhibidor puede disociarse de la enzima porque no se une por enlaces covalentes. Esta inhibición puede ser
competitiva o no-competitiva.
Peña  Inhibición Competitiva - el inhibidor competitivo es muy similar al sustrato
Espinal normal de la enzima. Dada esa similitud estructural, este tipo de inhibidor
se une reversiblemente al foco activo de la enzima.

 Inhibición No-Competitiva: el inhibidor se


combina con la enzima en un lugar distinto al foco activo. Tanto EI como EIS se forman:

La unión del inhibidor afecta la configuración tridimensional de la enzima y bloquea la reacción. Este
tipo de inhibidor no compite directamente con el sustrato para unirse a la enzima (no afecta la unión
ES), por lo tanto, este tipo de inhibición no es reversible cuando aumenta la concentración del
sustrato.

 InhibicionIncompetitiva: el inhibidor se combina sólo con ES (no con la enzima), por lo que el
inhibidor ejerce su efecto sólo a altas concentraciones de sustrato en las que hay gran
cantidad de complejo enzima-sustrato (ES). Por lo tanto, variando la [S] no afecta o evita la
unión con el inhibidor. Por otro lado, es evidente que el sustrato y el inhibidor se combinan
con la enzima en lugares diferentes.

Resumen:
Efecto cinético en reacción inhibida relativas a la reacción sin inhibir:
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Máximo de hojas (1).

Estudiante 5.
REALICEN AQUÍ EN ADELANTE LA CONSOLIDACIÓN DE LA
REVISIÓN TEORICA SOLICITADA, DE ACUERDO A LOS APORTES
INDIVIDUALES, INCUYENDO LOS MAPAS CONCEPTUALES.
MAXIMO DE HOJAS 5
Cada Estudiante del grupo entregará aportes en relación a:

Analice. Como mediante el equilibrio entre la relación de concentraciones plasmáticas de insulina y de


glucagón ([I]/[G]), el organismo mantiene la glucemia casi constante a pesar de las grandes fluctuaciones
de la ingesta.

Es decir: Explicar con sus propias palabras, cómo el organismo empleando un tipo de inhibición
enzimática, llega al equilibrio ( nivel de glucemia constante) al mantener las concentraciones
plasmáticas de insulina y de glucagón ([I]/[G].

Estudiante 1 El cuerpo dispone de un complejo sistema de hormonas que se encargan de mantener la glucemia
dentro de niveles adecuados. Cuando los niveles de azúcar empiezan a bajar, el glucagón, la
Juan Camilo Sepúlveda adrenalina y los glucocorticoides se encargar de estimular la producción de glucosa a través de la
utilización de proteínas del músculo y de la grasa almacenada en el tejido adiposo, por ello se llaman
hormonas hiperglucemiantes. Por el contrario, cuando los niveles de azúcar en sangre empiezan a
subir es la insulina la que se encarga de mantenerlos “a raya”, a través de varios mecanismos:
estimula la entrada de glucosa en el músculo y en el tejido adiposo (retirándola del torrente
sanguíneo), estimula la formación de glucógeno (utilizando la glucosa) en el hígado y en el músculo,
estimula la formación de grasa (partiendo de la glucosa) en el hígado y en tejido adiposo, estimula la
captación de aminoácidos por parte del músculo y favorece la síntesis de proteínas en el mismo. Por
todo ello decimos que es una hormona hipoglucemiante (baja niveles de azúcar en sangre) y
anabólica (estimula la formación del músculo y tejido adiposo).

Debido a la función endocrina del páncreas que es responsable de regular la cantidad de glucosa
(azúcar) en la sangre vemos que a lo largo del páncreas hay estructuras llamadas islotes de
Langerhans. Dos tipos de células en los islotes son las células alfa y beta. Las células alfa
comprenden de alrededor de 25 por ciento de los islotes. Son responsables de secretar una hormona
conocida como glucagón. Las células beta representan alrededor del 75 por ciento de los islotes.
Ellas producen y secretan una hormona conocida como insulina. Los capilares que rodean los islotes
permiten que las hormonas se secreten directamente en la sangre.
Estudiante 2 Debido al control del metabolismo energético es factor decisivo el estado de fosforilación de
Luz Bibiana Tabares Quinchia determinadas proteínas por la cual se puede decir q según su modificación covalente de la estructura
primaria motiva aumento o pérdida de su actividad. El predominio de una u otra forma (fosforilada/no
fosforilada) viene determinada por la relación de actividades catalíticas proteína cinasa/fosfoproteína
fosfatasa, enzimas que, por ende, están sometidas a un control hormonal: la insulina (I) estimula la
actividad fosfoproteína fosfatasa y, por consiguiente, la desfosforilación de enzimas; el glucagón (G),
por el contrario, estimula la fosforilación de las mismas a través de la activación de varias proteínas
cinasa. Mediante el equilibrio entre la relación de concentraciones plasmáticas de insulina y de
glucagón ([I]/[G]), el organismo mantiene la glucemia casi constante a pesar de las grandes
fluctuaciones de la ingesta
. Esta glándula endocrina responde a la entrada de glucosa en sus, secretando insulina, hormona
que en estados basales de glucemia, se encuentra almacenada como proinsulina en las células  de
los islotes pancreáticos de Langerhans.

Cuando la concentración de glucosa en plasma es superior al valor normal las células  del páncreas
captan el monosacárido mediante la proteína transportadora de glucosa GluT2. La elevada constante
de transporte propia de esta proteína (aproximadamente 60 mM) permite la entrada de glucosa según
una cinética lineal y no saturable en condiciones fisiológicas. En el interior celular, la glucosa, por la
acción catalítica de la glucocinasa, se convierte inmediatamente en glucosa-6-fosfato que sigue la vía
glucolítica. La activación de esta ruta degradativa favorece la entrada de Ca2+ en las células
pancreáticas a través de los canales situados en la membrana plasmática y, como consecuencia, la
liberación de insulina por exocitosis.

Una vez en el torrente circulatorio, la insulina se une a los receptores específicos presentes en la
membrana plasmática de las células de diferentes tejidos. Estos receptores son proteínas que
atraviesan la membrana plasmática y poseen actividad tirosina-cinasa, a las que se une la insulina
para iniciar una cascada de señalización que regula la transcripción de genes determinados, la
síntesis de determinadas proteínas y la actividad de enzimas citosólicas.

Estudiante 3 No exceda las 100 palabras

Estudiante 4 No exceda las 100 palabras

Estudiante 5 No exceda las 100 palabras

Consolidado grupal No exceda las 250 palabras

Espacio para las


observaciones del tutor

2.Analice: expliquen como las enzimas alostéricas son aquellas en las cuales la catálisis en el sitio
activo puede modularse por la presencia de efectores en un sitio alostéricas.

Estudiante 1 En las enzimas alostéricas la unión de un sustrato a un sitio activo puede afectar las propiedades de
otros sitios activos en la misma molécula. Un posible resultado de esta interacción entre subunidades
Juan Camilo Sepulveda es que la unión del sustrato resulte cooperativa, es decir que la unión del sustrato en un sitio activo
facilita la unión de los otros sustratos en los sitios activos vecinos. Además, la actividad de una
enzima alostérica puede ser alterada por moléculas regulatorias que se unan de manera reversible
sitios sobre la proteína que se encuentren en sitios diferentes al sitio activos. Así, las propiedades
catalíticas de las enzimas alostéricas pueden ajustarse para cumplir con las demandas inmediatas de
la célula. Debido a ello las enzimas alostéricas son los puntos clave de regulación de las vías
metabólicas.
Estudiante 2 Las enzimas alostericas cambian su conformación al unirse un efector, esto sucede para someterse
a un cambio aparente en la afinidad de unión de otro Ligando en un sitio distinto de la molécula. Esta
Luz Bibiana Tabares "acción a distancia" de la unión de un ligando que afecta a la unión de otro en un sitio claramente
Quinchia diferente es la esencia del concepto de alostería o alosterismo. La alostería juega un papel crucial en
muchos procesos biológicos fundamentales, entre los que se incluyen la señalización celular y la
regulación del metabolismo.
Mientras que las enzimas sin dominios o subunidades acoplados muestran una cinética de Michaelis-
Menten, la mayoría de las enzimas alostéricas tienen varios dominios o subunidades acoplados y
muestran una unión cooperativa. En general, la cooperatividad en las enzimas alostéricas conduce a
una dependencia sigmoidal con respecto a la concentración de sus sustratos en los sistemas
positivamente cooperativos. Esto permite que las enzimas más alostéricas varíen mucho su
actividad catalítica en respuesta a pequeños cambios en la concentración del efector
Estudiante 3 No exceda las 100 palabras

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El grupo realizara el siguiente ejercicio:

En experimentos de laboratorio, se utilizaron dos decarboxilasas (A y B)


obtenidas de diferente microorganismo (ver tabla). Decida cual enzima
demuestra un mayor coeficiente de especificidad, (Vmax/ Km), recuerde
que entre mayor sea el valor del coeficiente de especificidad más
específica es la enzima por el sustrato.

Enzima A Enzima A
[S] Vo [S] Vo
3000 1,70053 200 1,52398
2500 1,50116 200 1,49269
2400 1,40209 100 0,90211
2000 1,0674 200 1,42131
1500 0,80567 150 1,2038
1480 0,80351 130 1,09978
200 0,09402 88 0,81399
167 0,06543 52 0,61246
110 0,03772 40 0,39543
58 0,00819 20 0,34542

Para hallar los valores de Vmax y Km, se utiliza el método de


Lineweaver – Burk, Calcule los recíprocos de la actividad enzimática y
concentración de sustrato y grafique 1/v como función de 1/ [S].
De esta gráfica, determine los valores para Vmax y Km, determinando
los recíprocos de los interceptos en YyX de la gráfica.Consulte el
documento: Aplicación de las herramientas informáticas en el
tratamiento de la información científico de Mauricio Restrepo
Gallego: http://www.lasallista.edu.co/fxcul/media/pdf/Revista/vol2n1/herramientas_informaticas.pdf
Orientación: Es sencillo utilizar la representación doble recíproca (1/v
frente a 1/[S]), ya que es una línea recta. Esta representación doble
recíproca recibe el nombre de representación de Lineweaver-Burk. Es
una recta en la cual:
La pendiente es Km/Vmax
La abscisa en el origen (1/[S] = 0) es -1/Km (eje x)
La ordenada en el origen (1/v = 0) es 1/Vmax (eje Y)
De esta forma, a partir de los datos experimentales se puede calcular
gráficamente, los valores de Km y Vmax de un enzima para diversos
sustratos.

Estudiantes que participaron en la solución del problema


Nombre estudiante 1.
Nombre estudiante 2.
Nombre estudiante 3.
Nombre estudiante 4.
Nombre estudiante 5.
Solución

Espacio para las observaciones


del tutor
Cada Estudiante del grupo entregará aportes en relación a:

Analice: las principales características estructurales de las enzimas, sitio activo, la formación de
complejos y la cinética enzimática Modelo de Michaelis y Menten(Dependencia de la concentración de
sustrato).

Es decir: Explicar con sus propias palabras, cuales son las principales características estructurales de las
enzimas, sitio activo, la formación de complejos y la cinética enzimática desde el Modelo de Michaels y
Mentencuando hay una dependencia de la concentración de sustrato.

Estudiante 1 No exceda las 100 palabras

Estudiante 2 las principales características estructurales de las enzimas son


 La enzimas son catalizadores orgánicos, que no son afectados por la reacción que catalizan,
Luz Bibiana Tabares
además de ser muy potentes y eficaces. La actividad catalítica de una enzima facilita su
Quinchia identificación.
 Las enzimas catalizan la formación o rotura de enlaces covalentes
 Su elevada especificidad es su mayor característica.
 Actúan en baja concentración; No se necesita gran cantidad de ellas para realizar la acción de
manera eficiente, ya que son activas a concentraciones pequeñas.
 No sufren modificaciones durante la reacción; su composición y forma no son transformadas
en ninguna parte de la reacción, se recuperan intactas.
 No afectan el equilibrio de la reacción, pero si su velocidad, debido a que su trabajo es
catalizar la reacción.
 Son sumamente específicas; tienen un trabajo específico y solo son usadas para ello, su
actividad está regulada y actúan en el mismo lugar donde se segregan.
 Son moléculas estrictamente proteicas; Son Proteínas Globulares que regulan la mayor parte
de las reacciones metabólicas de los seres vivos, debido a esto las enzimas sufren desnaturalización,
no dializan y sufren saturación.
 Lo sintetizan tanto los seres Autótrofos como Heterótrofos.
 Pueden actuar a nivel intracelular o extracelular, dependiendo de la reacción.
 Son solubles en agua y tienen gran di fusibilidad en los líquidos orgánicos.
 Según su composición molecular, se distinguen en dos tipos de enzimas: una estrictamente
Proteica y otra constituida por la unión mediante enlaces.
 Pueden ser activadas o inactivadas de modo irreversible por otras enzimas.
 Las enzimas se clasifican por tipo de reacción y mecanismo
 La mayoría de las enzimas necesitan una coenzima, las cuales van a funcionar como
reactivos en la transferencia de grupos. Muchas coenzimas se derivan de vitaminas B y del
monofosfato de adenosina.

La cinética de Michaelis-Menten
Describe la velocidad de reacción de muchas reacciones enzimáticas. Por eso recibe este nombre en
Honor a Leonor Michaelis y Maude Menten. Este modelo sólo es válido cuando la concentración
del sustrato es mayor que la concentración de la enzima, y para condiciones de estado estacionario,
es decir, cuando la concentración del complejo enzima-sustrato es constante.

Estudiante 3 No exceda las 100 palabras

Estudiante 4 No exceda las 100 palabras

Estudiante 5 No exceda las 100 palabras

Consolidado grupal No exceda las 250 palabras

Espacio para las


observaciones del tutor
Analice Significado biológico de Km. En términos prácticos la Km, como una medida de la afinidad de la
enzima por su sustrato, más pequeño es su valor mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato.

Nota Aclaratoria: Explicar con sus propias palabras, que indica el valor de Km para una enzima en
relación con la afinidad de la enzima por el sustrato.

Estudiante 1 No exceda las 100 palabras

Estudiante 2 La Km nos da una idea la afinidad que tiene el enzima por su sustrato, cuanto mayor es Km menor es
la afinidad (predominan las formas E y S libres), cuanto menor es Km mayor es la afinidad (predomina
Luz Bibiana Tabares la forma ES)

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Estudiante 4 No exceda las 100 palabras

Estudiante 5 No exceda las 100 palabras

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observaciones del tutor
Analice Las enzimas con una Km muy baja (10-6-10-8M) son importantes en el metabolismo.

Nota Aclaratoria: Explicar con sus propias palabras, sílas enzimas con una Km muy bajo (10-6-10-8M)
representan una importancia en al reacciones metabólicas?

Estudiante 1 No exceda las 100 palabras

Estudiante 2
Luz Bibiana Tabares
Estudiante 3 No exceda las 100 palabras

Estudiante 4 No exceda las 100 palabras

Estudiante 5 No exceda las 100 palabras

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observaciones del tutor
REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS

ENTREGARLAS EN NORMA APA 6.0

 Lineweaver, H; Burk, D. (1934). «The Determination of Enzyme Dissociation


Constants». Journal of the American ChemicalSociety 56: 658—666.
 BOYER, Rodney. Conceptos de Bioquímica. México: Internacional Thomson Editores; 2000.
694 p.

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