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EVOLUCION, SISTEMATICA Y TAXONOMIA

MICROBIANAS

Qué interesa:
 Orígen de la diversidad microbiana
 Cómo puede determinarse la historia evolutiva
de los microorganismos actuales.
 Propiedades de la Tierra primitiva en la que
surgió la vida.

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Evolución de la Tierra y primeras formas de vida

Orígen de la Tierra
Edad aproximada de 4.600 millones de años.
A sido determinada por métodos radioactivos.
Las rocas más antiguas datan de 3.800
millones de años y son del tipo sedimentarias,
volcánicas y carbonatos.

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MICROBIANAS
Evolución de la Tierra y primeras formas de vida

Pruebas de la existencia de vida microbiana en


la Tierra primitiva.
- microfósiles de las rocas más antiguas
parecen bacterias sencillas, con forma de bacilo.
-Los estromatolitos son tapetes microbianos
fósiles constituidos por capas de procariotas,
principalmente filamentosos, que contienen
sedimiento atrapado. Los antiguos formados por
bacterias fototróficas filamentosas (bacterias
rojas y verdes). Los modernos por cianobacterias
filamentosas (O ) 2

-Los procariotas originaron una diversidad


morfológica impresionante mucho antes del
advenimiento de la célula eucariota moderna.
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Evolución de la Tierra y primeras formas de vida

Condiciones de la Tierra primitiva


La atmófera de la tierra primitiva no tenía grandes
cantidades de O2. Además de agua, había varios gases,
siendo los más abundantes CH4 , CO2 , N2 y NH3. También
había trazas de CO e H2, así como gran cantidad de sulfuro,
en una mezcla de H2S y FeS. También es probable que en
la Tierra se formase una gran cantidad de HCN.
Es probable que durante los primeros 500 millones de años,
la temperatura de la superficie de la Tierra superase los
100°C.
Las primeras formas de vida debían ser muy resistentes a
las altas temperaturas, pareciéndose a los procariotas
hipertermófilos que viven hoy en ambientes termales.

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Evolución de la Tierra y primeras formas de vida

El orígen de la vida.
Los primeros compuestos bioquímicos se formaron por
síntesis abiótica y a partir de ellos se originó la vida.
Hoy día está bien establecido que es posible sintetizar
moléculas de importancia biológica sometiendo a
intensas descargas de energía una mezcla de gases.
Fuentes de energía disponibles en la Tierra primitiva
tenemos UV, descargas eléctricas, radioactividad y
actividad volcánica.
Llegó a acumularse una rica mezcla de compuestos
orgánicos que persistieron por años y habrían
preparado la Tierra para la evolución biológica.
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Evolución de la Tierra y primeras formas de vida

El orígen de la vida.
Una de las principales dificultades que presentan la
mayoría de las hipótesis sobre la síntesis prebiótica
consiste en explicar cómo pueden haberse producido
las macromoléculas espontáneamente a partir de sus
monómeros constituyentes en un medio acuático.
Los ácidos nucléicos y proteínas se polimerizan
mediante reacciones de Deshidratación ; por lo tanto,
resulta difícil concebir que , sin la presencia de
enzimas, las macromoléculas se hubieran formado en
un ambiente acuático (hipótesis de superficies
anhidras como arcilla, pirita o cristales basálticos)

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Organismos primitivos y estrategias metabólicas

Los organismos muy primitivos tienen que haber


poseído:

1. Metabolismo, es decir, la capacidad de acumular,


convertir y transformar nutrientes y energía.
2. Mecanismo hereditario, la capacidad de replicarse
y transferir sus propiedades a la siguiente
generación.

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Organismos primitivos y estrategias metabólicas

Los primeros organismos tuvieron que


emplear una estrategia simple para obtener
energía. El metabolismo primitivo era
anaeróbico y probablemente quimiolitotrófico,
explotando los abundantes recursos de FeS y
H S existentes. La respiración y las
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fermentaciones anaeróbicas aparecieron


más tarde, junto con la fotosíntesis
anoxigénica, a la que siguió la oxigénica. Esta
última condujo al desarrollo de un ambiente
óxico y a grandes explosiones de evolución
biológica.
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Organismos primitivos y estrategias metabólicas

La oxigenación de la atmósfera debida al


metabolismo de las cianobacterias fue un
proceso gradual a lo largo de un período de
alrededor de 1.000 millones de años

cianobacterias
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Organismos primitivos y código molecular

Los organismos primitivos pueden haber


usado ARN tanto en su capacidad genética
como enzimática, pero debido a que el ARN
catalítico no es muy eficiente, la aparición de la
catálisis por proteínas pudo llevar a una
notable mejora de la eficiencia celular. El ADN
pudo haber surgido porque proporciona una
forma más estable de información genética que
el ARN y puede ser copiado con más precisión.

ADN ARN proteína


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Eucariotas y organelos

El núcleo eucariótico y el aparato mitótico


surgieron probablemente en respuesta a la necesidad
de asegurar la repartición ordenada del ADN en
organismos con un genoma de gran tamaño.
Las mitocondrias y los cloroplastos, es probable que
se originaran a partir de procariontes que se hicieron
simbiontes de células eucariotas (endosimbiosis)

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Secuencia del ARN ribosómico y evolución.

Las comparaciones de las secuencias de ARN


ribosómico son útiles para determinar las relaciones
entre organismos.
Actualmente se dispone de árboles filogenéticos
basados en el ARN ribosómico 16S de todos los
principales grupos procarióticos y eucarióticos.
Filogenia: historia evolutiva de los organismos

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Secuencia del ARN ribosómico y evolución.

La principal conclusión de los estudios


filogenéticos basados en las comparaciones de
secuencia de ARN ribosómico es que la vida en la
Tierra evolucionó a lo largo de tres líneas
principales, que llamamos dominios, procedentes
de un antepasado común.
Dos de estas líneas, Bacteria y Archaea, se
mantuvieron procarióticas, mientras que la tercera,
Eucarya, evolucionó a la moderna célula
eucariota.
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Filogenia microbiana a partir de la secuenciación del ARN
ribosómico.

Filogenia antigua basada en relaciones fenotípicas.


Cinco reinos.
Filogenia moderna basada en secuenciación
molecular. Solo tres lineas evolutivas o dominios.
2 líneas procarióticas: Bacteria y Archaea.
Eubacteria y Archibacterias son nominaciones de estos dominios

1 línea eucariótica: Eucarya


vegetales, hongos y protistas son reinos comprendidos en este dominio

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Filogenia microbiana a partir de la secuenciación del rARN

El arbol universal de la vida


1. El dominio Eucarya es tan antiguo como
cada una de las líneas procarióticas. Antes
de los aconteciminetos endosimbiontes en
la Tierra hubo especies de Eucarya sin
organelos (mitocondria, cloroplasto). Por
ejemplo: microsporidios y diplomonadales
(Giardia)
2. A partir del antepasado universal la
evolución inicial tomó dos direcciones, la
del dominio Bacteria y la opuesta de
Archaea y Eukarya.
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Filogenia microbiana a partir de la secuenciación del rARN

3. El dominio Archaea es el que se ramifica más cerca


de la raíz. En la actualidad es el grupo de
organismos más primitivos (menos evolucionados).
Ambientes extremos de altas temperaturas, bajos pH, alta
salinidad, etc.

4. El dominio Eucarya, es ahora el más alejado del


antepasado universal, es el menos primitivo, es
decir, el más evolucionado.
5. Hay que destacar que ninguno de los organismos
que viven actualmente es primitivo. Todas las
formas de vida que existen son organismos
modernos, bien adaptados y que han tenido exito en
sus nichos ecológicos. 16
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Filogenia microbiana a partir de la secuenciación del rARN

Las raices evolutivas de mitocondrias y


cloroplastos se encuentran en el dominio Bacteria.
La secuencia molecular indica que las
mitocondrias surgieron de un pequeño grupo de
organismos que incluye los modernos procariotas
Agrobacterium, Rhizobium y las rickettsias
(Proteobacterias).

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Características de los dominios primarios

PARED CELULAR
Peptidoglican es una molécula presente en la pared
celular de los miembros del dominio Bacteria y no
en los otros dominios.
Las únicas excepciones conocidas son los
miembros del grupo Planctomyces-Pirella cuya
pared celular está formada por proteínas, y los
grupos Chlamydia-Mycoplasma, que carecen de
pared celular.

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Características de los dominios primarios

LIPIDOS
La naturaleza química de los lípidos de las
membranas celulares es quizás el criterio no
genético más útil para diferencial los dominios
Archaea y bacteria.
Bacteria y Eucarya sintetizan los lípidos de la
membrana con union éster entre ácidos grasos y
glicerol y de forma D. En Archaea los lípidos
son moléculas con enlaces éter y forma L.

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Características de los dominios primarios

ARN POLIMERASA, diferentes tipos


MECANISMOS DE TRANSCRIPCION Y
SINTESIS DE PROTEINAS, ribosomas 70S en
Archaea y Bacteria, 80S en eucariotas. Efecto de
inhibidores de la síntesis de proteínas
OTRAS, por ejemplo, el número de nucleótidos
modificados que hay en el rARN 18S eucariótico
(el equivalente funcional del rARN 16S
procariótico)

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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Taxonomía: ciencia de la clasificación y está


constituída por dos subdisciplinas principales, la
identificación y la nomenclatura.
Taxonomía Bacteriana, hace referencia a cosas
distintas a la filogenia bacteriana, se ha basado
tradicionalmente en análisis fenotípicos para la
clasificación e identificación

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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Clasificación y el concepto de especie


Los microbiólogos necesitan identificar y clasificar las
bacterias por diferentes razones prácticas.
En microbiología, la unidad taxonómica básica es la especie.
Especie: de manera operativa, es una colección de cepas
similares que difieren lo suficiente de otros grupos de cepas
para asegurar su reconocimiento como unidad taxonómica
básica.
Cepas o clones: una población de células genéticamente
idénticas derivadas de una sola célula.

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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Clasificación y el concepto de especie


Los grupos de especies se reúnen en géneros.
Los géneros se agrupan en Familias, las familias en
órdenes, los órdenes en divisiones, etc., hasta alcanzar el
nivel taxonómico más alto, que es el dominio.
Familia es el taxon superior que se emplea de manera
rutinaria en estudios taxonómicos de procariotas.
Para identificar un organismo desconocido, es esencial
que dicho organismo satisfaga todos los criterios
taxonómicos de los rangos que están por encima de la
designación de especie.
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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Clasificación y el concepto de especie


Dominio.............Bacteria
División.............Gracilicutes
Orden.................Rhodospirillales
Familia...............Chromatiaceae
Género...............Chromatium
Especie...............warmingii

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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Ejercicio: Con las propiedades siguientes proceda


a jerarquizar taxonómicamente la bacteria roja
del azufre Chromatium warmingii.
1. Células de 3.5-4.0 um x 5-11 um; almacena azufre
principalmente en los polos de la célula
2. Bacterias Gram negativas
3. Células procarióticas; secuencia rARN típicas del linaje
de las bacterias rojas.
4. Bacterias rojas fototróficas
5. Bacterias rojas del azufre con forma bacilar
6. Bacterias rojas del azufre
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Clasificación y el concepto de especie


Dominio...Bacteria.... Células procarióticas; secuencia
rARN típicas del linaje de las bacterias rojas.
División..Gracilicutes.. Bacterias Gram negativas
Orden...Rhodospirillales... Bacterias rojas fototróficas
Familia..Chromatiaceae... Bacterias rojas del azufre
Género..Chromatium... Bacterias rojas del azufre con forma
bacilar
Especie....warmingii.... Células de 3.5-4.0 um x 5-11 um;
almacena azufre principalmente en los polos de la célula

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The International Code of Nomenclatuire of Bacteria


Sistema binomial de nomenclatura (Linneo)
Género especie
Bacillus cereus
Bacillus acidocaldarius
B. cereus
Bacillus sp.
Bacillus spp.
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American Type Culture Collection (ATCC).


Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und
Zellkulturen (DSM).
Colecciones de cultivos axénicos o puros que han
sido reconocidos como géneros o especies. La cepa
depositada sirve como cepa tipo de la nueva especie,
o género y especie, y se conserva como patrón de
comparación de otras cepas que se suponga
pertenecen a la misma especie o género.

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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB)


Revista oficial de registro para la taxonomía y
clasificación de los microrganismos, es decir, publica los
nombres aprobados y abre el camino para su inclusión en
el Bergey’s Manual, uno de los principales tratados de
taxonomía de procariotas.
Los cultivos de referencia se mantienen congelados o
liofilizados (las cepas se conservan vivas).

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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Taxonomía bacteriana convencional


Características de valor taxonómicos:
•Morfología
•Tinción de Gram
•Tipo de Nutrición (fototrofía, quimioorganotrofía y
quimiolitotrofía)
•Estructura química de la pared celular
•Presencia de inclusiones celulares y productos de reserva.
•Estructura química de la capsula
•Los pigmentos
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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Taxonomía bacteriana convencional Características de valor taxonómicos:


•Los requerimientos nutritivos
•La capacidad para usar compuestos de C, N y S
•Los productos de fermentación
•Los requerimientos y tolerancias a gases, temperatura y de pH.
•La sensibilidad a los antibióticos
•La patogenicidad
•Las relaciones simbióticas
•Las características inmunológicas
•El habitat
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Taxonomía, nomenclatura y el Bergey’s Manual

Agrobacterium radiobacter ST 84 se usa para control


del patógeno Agrobacterium tumefaciens

Streptomyces griseovirens se usa para control de hongos


Botrytis spp., Fusarium spp.
Bacillus subtilis se usa para control de hongos del suelo
Burkholderia cepacia (Pseudomonas spp.) se usa para
control de hongos de Dumping off y nemátodos.

Pseudomonas fluorescens st NCIB-122089 se usa para


control de Mancha bacteriana de los champiñones

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Erwinia carotovora pv. Carotovora pudrición blanda


de hortalizas

Pseudomonas syringae pv. tomato agente de


enfermedad conocida como Peca bacteriana

Clavibacter michiganensis pv. michiganensis


agente de la enfermedad Cancro bacteriano

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