Catabolismo de compuestos con un carbono

El catabolismo (del griego kato ‘hacia abajo’, y ballein ‘lanzar’) es la parte del
proceso metabólico que consiste en la transformación de biomoléculas complejas en
moléculas sencillas y en el almacenamiento adecuado de la energía química
desprendida en forma de enlaces de alta energía en moléculas de Adenosíntrifosfato.

Convergencia y diversidad en el catabolismo

El catabolismo es el proceso inverso del anabolismo, aunque no es simplemente la
inversa de las reacciones anabólicas. Las reacciones catabólicas son en su
mayoría reacciones de reducción-oxidación y el conjunto de reacciones catabólicas es
muy similar en la mayor parte de los seres vivos, que degradan biomoléculas para
obtener energía. Sin embargo, existen algunas excepciones, principalmente bacterias,
como la proteobacteria quimiolitótrofa Acidithiobacillus, que es capaz de metabolizar
el hierro y el azufre.

Catabolismo de biomoléculas
En el caso de los organismos que degradan biomoléculas, también existe diversidad
entre las reacciones catabólicas que se llevan a cabo en presencia de oxígeno
(aeróbicas) o en ausencia de él (anaeróbicas). A grandes rasgos, en primer lugar, las
grandes moléculas orgánicas nutrientes, como las proteínas, polisacáridos o lípidos son
degradados a sus monómeros constituyentes, aminoácidos, monosacáridos y ácidos
grasos, respectivamente, proceso que se lleva a cabo fuera de las células en la luz del
aparato digestivo; es el proceso conocido como digestión. Luego, estas moléculas
pequeñas son llevadas a las células y convertidas en moléculas aún más simples, como
grupos acetilos que se unen covalentemente a la coenzima A, para formar la acetil-
coenzima A cuyo grupo acetil es oxidado a agua y dióxido de carbono por
los organismos aerobios mediante el ciclo de Krebs, liberando energía que se retiene al
reducir la coenzima nicotinamida adenina dinucleótido (NAD+) a NADH+H. El NADH y
otras coenzimas son finalmente oxidadas en la cadena transportadora de electrones,
proceso acoplado a la síntesis de ATP.

El carbono
Es un no metal, tetravalente, dispone de cuatro electrones para formar enlaces
químicos covalentes. Tres isótopos del carbono se producen de forma natural, los
estables 12C y 13C y el isótopo radiactivo 14C, que decae con una vida media de unos
5730 años. El carbono es uno de los pocos elementos conocidos desde la antigüedad.
y es el pilar básico de la química orgánica. Está presente en la Tierra en el estado de
cuerpo simple (carbón y diamantes), de compuestos inorgánicos (CO2 y CH4) y
de compuestos orgánicos(biomasa, petróleo y gas natural). También se han sintetizado
muchas nuevas estructuras basadas en el carbono: carbón activado, negro de
humo, fibras, nanotubos, fullerenos y grafeno

Para definir el catabolismo de compuestos con un carbono es necesario conceptualizar

la diversidad de microorganismos necesarios para los fines necesarios.
Eubacterias quimioautotróficas y metófilas
Las Eubacterias quimioautotróficas y Metófilas son dos tipos de bacterias aeróbicas
Gram-negativas. Los quimioautotrofos, son organismos que obtienen energía de la
oxidacion de compuestos inorgánicos, y los mesofilos, son organismos que obtienen
energía y carbono a partir del metano y otros compuestos orgánicos. Aunque son
fácilmente distinguibles uno de otros por sus diferentes fuentes de energía, los dos
grupos muestran interesantes semejanzas.
Los quimioautotrofos y metófilos están, a su vez, constituidos por diversos subgrupos
fisiológicos que se distinguen por sus fuentes específicas de energía y, hasta cierto
punto, por su especialización para el modo de vida autótrofa (o metófila). Todos ellos
están profusamente distribuidos en suelos y aguas y desempeñan importantes
funciones en el ciclo de los elementos de la biosfera. El número total de especies
representados es pequeño pero ambos grupos presentan gran diversidad en los
aspectos estructurales y fisiológicos.
QuimioAutotrofos
Es un organismo que puede crecer en un medio estrictamente mineral en la oscuridad,
obteniendo carbono a partir del CO2 y su ATP y poder reductor de la respiración de un
sustrato inorgánico. Este modo de vida, que solo existe en los procariontes, fue
descubierto entre los años 1880-1890 por S. Winogradsky, cuyos estudios sobre
algunos de los principales subgrupos proporcionó una sólida base para los trabajos
posteriores sobre quimioautotrofia, mostrando dos notables características de los
quimioautotrofos:
- Elevada especificidad respecto a la fuente de energía inorgánica.
- Frecuente incapacidad para utilizar compuestos orgánicos como fuente de
carbono y energía; en ocasiones, la presencia de compuestos orgánicos afecta
negativamente a su crecimiento.

Sustratos utilizables
Los materiales inorgánicos que favorecen el crecimiento quimioautotrófico incluyen
H2S y otras formas reductoras de azufre, amoniaco, nitrito, hidrógeno molecular,
monóxido de carbono y hierro ferroso. En la biosfera estos substratos son en parte
producto de las actividades metabólicas de otros organismos y en parte tienen un
origen geoquímico. Cabe destacar que algunos de ellos son químicamente inestables
bajo condiciones aeróbicas; el H2S es oxidado rápidamente azufre elemental al
contacto con el aire, el hierro ferroso también sufre autooxidación en soluciones
neutras o alcalinas, aunque es estable en condiciones de acidez. La inestabilidad
química de H2S y Fe<3 ha dificultado seriamente el aislamiento y estudio de algunos
organismos que utilizan estos substratos.
La especialidad del substrato de los quimioautotrofos permite establecer cinco
subgrupos principales. Las bacterias nitrificantes utilizan compuestos reducidos de
nitrógeno inorgánicos como fuente de energía. La especialidad del substrato en este
subgrupo es muy elevada, sus miembros o bien oxidan amoniaco a nitrito, o nitrito a
nitrato, pero ninguno de ellos puede oxidar ambos a la vez. Las bacterias oxidadoras de
azufre emplean H2S, azufre elemental o sus óxidos parcialmente reducidos como
fuentes de energía. Todas estas sustancias son convertidas en sulfato. Uno de los
miembros de este grupo puede además utilizar hierro ferroso como fuente de energía.
Las bacterias del hierro oxidan hierro y magnesio reducidos, pero no compuestos
reducidos de azufre, sin embargo, se plantean dudas sobre su inclusión en el grupo de
los quimioautotrofos verdaderos. Las bacterias del hidrógeno utilizan hidrogeno
molecular como fuente de energía; y las carboxidobacterias, monóxido de carbono