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__________________________________
Dra. Josefina León Félix
Director de tesis
__________________________________
Dr. Cristóbal Chaidez Quiroz
Asesor
__________________________________
Dra. Nohelia Castro del Campo
Asesor
__________________________________
Dr. Bruno Gómez Gil Rodríguez Sala
Asesor
DECLARACIÓN INSTITUCIONAL
__________________________________
Director General
“El éxito consiste en obtener lo que se desea. La felicidad, en
A la Dra. Nohelia Castro del Campo y al Dr. Cristóbal Chaidez Quiroz, por
aceptar ser parte de mi Comité de Tesis, por brindarme sus aportaciones, su
invaluable tiempo y su apoyo en la realización del trabajo.
Al Dr. Bruno Gómez Gil Rodríguez Sala, por compartir sus conocimientos
y por la oportunidad de participar en este trabajo.
Al Dr. José Benigno Valdéz Torres por sus acertadas asesorías y por todo
su apoyo.
Al M.C. José Roberto Guzmán Uriarte, por darme ánimos, por su apoyo y
su amistad.
A la L.C.P.F. Mayra Ibarra I.B. Evelia Araiza y al Sr. Víctor Arana por su
disposición y amabilidad.
ÍNDICE DE CUADROS............................................................................................xii
ÍNDICE DE FIGURAS.............................................................................................xiii
ABREVIATURAS.....................................................................................................xiv
RESUMEN.............................................................................................................xviii
ABSTRACT..............................................................................................................xx
INTRODUCCIÓN.......................................................................................................1
REVISIÓN DE LITERATURA....................................................................................4
Producción de Ostión ..........................................................................................4
Generalidades del Ostión.....................................................................................4
Clasificación y Nomenclatura..........................................................................4
Fisiología..........................................................................................................5
Especies de Ostión..........................................................................................5
Bacterias Patógenas en Ostión............................................................................6
Indicadores de Contaminación Fecal en Ostión...................................................7
Género Vibrio........................................................................................................8
Especies de Vibrio................................................................................................9
Vibrio parahaemolyticus.....................................................................................10
Caracteristícas Principales............................................................................10
Antecedentes de Brotes Infecciosos.............................................................14
Vibrio cholerae....................................................................................................16
Características Principales............................................................................16
Antecedentes de Brotes Infecciosos.............................................................20
ix
x
Vibrio vulnificus...................................................................................................21
Características Principales............................................................................21
Antecedentes de Brotes Infecciosos.............................................................22
Detección de Patógenos por Métodos Microbiológicos y Moleculares..............23
Normativas para la Regulación de Coliformes Fecales y Vibrio spp. en
Moluscos Bivalvos................................................................................................24
PREGUNTAS DE INVESTIGACIÓN.......................................................................26
HIPÓTESIS..............................................................................................................28
PROBLEMA DE INVESTIGACIÓN..........................................................................30
OBJETIVOS.............................................................................................................31
Objetivo General.................................................................................................31
Objetivos Específicos.........................................................................................31
MATERIALES Y MÉTODOS....................................................................................33
Estrategia Experimental......................................................................................33
Estrategia de Muestreo.......................................................................................34
Toma de Muestra................................................................................................36
Procesamiento de la Muestra.............................................................................36
Detección y Cuantificación de Coliformes Fecales............................................36
Cultivo en Placa.............................................................................................37
Conteo de Coliformes Fecales......................................................................37
Detección y Cuantificación de Vibrio por NMP-PCR..........................................38
Número Más Probable Acoplado a la Reacción en Cadena de la
Polimerasa (NMP-PCR).......................................................................................38
Lisis Celular...................................................................................................38
Identificación de Especie por PCR................................................................39
Condiciones para PCR..................................................................................39
xi
Electroforesis.................................................................................................40
Detección de Genes de Toxicidad de V. pahaemolyticus y V. cholerae por
PCR......................................................................................................................44
Serotipificación....................................................................................................44
RESULTADOS.........................................................................................................47
Detección y Cuantificación de Coliformes Fecales............................................47
Detección y Cuantificación de Vibro parahaemolyticus por NMP-PCR.............49
Detección y Cuantificación de Vibrio cholerae por NMP-PCR...........................51
Detección y Cuantificación de Vibrio vulnificus por NMP-PCR..........................53
Identificación de Genes que Codifican para Toxinas en Vibrio spp...................56
Identificación del Serotipo O3:K6 de Vibrio parahaemolyticus..........................58
DISCUSIÓN.............................................................................................................59
CONCLUSIONES....................................................................................................65
LITERATURA CITADA.............................................................................................66
ANEXO I..................................................................................................................85
Preparación de Medios y Soluciones.................................................................85
Preparación de Medios de Cultivo.................................................................85
Preparación de Soluciones............................................................................86
Preparación de Soluciones para la Electroforesis de ADN...........................86
Contenido de los Estuches Comerciales.......................................................87
ANEXO II.................................................................................................................88
Análisis de Secuencia Nucleotídica....................................................................88
ANEXO III................................................................................................................90
Regiones de Origen de las Muestras de Ostión Analizadas..............................90
ÍNDICE DE CUADROS
xii
ÍNDICE DE FIGURAS
xiii
ABREVIATURAS
% Porciento
ºC Grados centígrados
Ca Calcio
CFSAN Center for Food Safety and Applied Nutrition (Centro para la
Seguridad Alimentaria y Nutrición Aplicada)
xiv
xv
et al y colaboradores
g Gramos
h Horas
H Antígeno Flagelar
K Antígeno Capsular
L Litros
mg Miligramos
min Minutos
mL Mililitro
mM Milimolar
Mn Manganeso
Na Sodio
ng Nanogramos
O Antígeno Somático
pb Pares de bases
spp Especies
UV Ultra Violeta
V Voltios
X g Gravedad
L Microlitro
RESUMEN
xviii
xix
xx
xxi
1
2
hombre (Volterra et al., 1980). En algunos países como Japón, Chile y EUA se
han registrado brotes de gastroenteritis por el consumo de ostión crudo (Miwa
et al., 1988; Leyton & Riquelme, 2008). La presencia de coliformes fecales en
ostiones representa un indicador importante para la evaluación de la calidad
sanitaria, debido a la relación directa de los coliformes fecales con bacterias
potencialmente patógenas (Rosas et al., 1985). Las especies del género Vibrio
son la principal causa de la perdida de la inocuidad de los ostiones; estas
incluyen Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus y Vibrio vulnificus (Quevedo,
2002), las cuales son reportadas comúnmente como la principal causa de
enfermedad debido al consumo de productos del mar contaminados (Young,
1998).
Clasificación y Nomenclatura
4
5
2002). El ostión está conformado de dos valvas de forma irregular con aspecto
áspero en el exterior y lisa en su interior. La valva inferior se fija al sustrato y
forma un hueco donde se aloja la masa del cuerpo, que es lo que se consume
(Cifuentes et al., 1997).
Fisiología
Especies de Ostión
como los ostiones, que se consumen crudos, son conocidos vectores de Vibrios
patógenos para el humano (Potasman et al., 2002).
Género Vibrio
Especies de Vibrio
Vibrio parahaemolyticus
Características Principales
Vibrio cholerae
Características Principales
(Hoshino et al., 1998). Cada molécula de CTX, está conformada por cinco
subunidades B (de enlace) y una subunidad A (activa). Las subunidades B se
unen a los receptores del gangliósido G M1 en las células epiteliales de la mucosa
intestinal. Después de la unión, se separan la subunidad A1 y el componente
A2, facilitando la entrada del componente A1 a la célula. El componente A1 de
la toxina colérica estimula la producción de la enzima adenilciclasa, involucrada
en la producción del adenosín monofosfato cíclico (AMPc). Concentraciones
intracelulares altas de AMPc alteran el transporte activo de los electrolitos a
través de la membrana de la célula, lo cual impide la adsorción de líquido y
conduce a su secreción en el intestino delgado (Fernández & Alonso, 2009).
Vibrio vulnificus
Características Principales
Parámetros
Microorganismo
FDA NOM242-SSA1-2011
230 NMP/100 g
Coliformes Fecales 230 NMP/100 g
0.36 log10
4. ¿Cuáles de los genes ctx y chx que codifican para la toxina colérica y
la toxina cholix se detectarán en las muestras positivas para V. cholerae en
muestras de ostión de placer obtenidas de los establecimientos de mariscos de
la ciudad de Culiacán, Sinaloa?
5. ¿Cuáles de los genes tdh y trh que codifican para la hemolisina directa
termoestable y la hemolisina relacionada con TDH se detectarán en las
muestras positivas para V. parahaemolyticus en muestras de ostión de placer
obtenidas de los establecimientos de mariscos de la ciudad de Culiacán,
Sinaloa?
26
27
28
29
30
OBJETIVOS
Objetivo General
Objetivos Específicos
31
32
Estrategia Experimental
33
34
Estrategia de Muestreo
O
Este
Francisco I. Madero Guadalupe Victoria 24º48’07.45”N 107º21’37.23”
O
Fco. I. Madero y Ejercito Nacional Miguel Hidalgo 24º48’14.00”N 107º22’29.49”
O
Oeste
Villa Castilla Villas del Río 24º48’27.89”N 107º27’02.86”
O
37
Toma de Muestra
Procesamiento de la Muestra
Cultivo en Placa
Lisis Celular
en vórtex (Vortex mixed Fisher scientific). Este proceso de lavado se repitió tres
veces y finalmente se decantó el sobrenadante. Después se agregaron 200 L
de agua nanopura y se agitó en vórtex hasta resuspender la pastilla que
formaban las células bacterianas. La suspensión bacteriana fue colocada a en
un baño de agua a 100 ºC durante 5 min para producir la lisis celular (Miwa et
al, 2003; Suzita et al., 2010).
Condiciones de PCR
Electroforesis
Vibrio cholerae
Vibrio parahaemolyticus
Vibrio vulnificus
Concentración
Componente Concentración Inicial Volumen(L)
Final
Índice MPN y el 95% límites de confianza para varias combinaciones de tubos positivos en
una serie de tres tubos de dilución utilizando cantidades de inoculo de 0,1, 0,01 y 0,001 g
(ml).
Límite 95% de Confianza
Combinación de Positivos Índice NMP por g (mL)
Inferior Superior
0-0-0 <3.0 --- 9.5
0-0-1 3 0.15 9.6
0-1-0 3 0.15 11
0-1-1 6.1 1.2 18
0-2-0 6.2 1.2 18
0-3-0 9.4 3.6 38
1-0-0 3.6 0.17 18
1-0-1 7.2 1.3 18
1-0-2 11 3.6 38
1-1-0 7.4 1.3 20. 7.4 1.3 20
1-1-1 11. 3.6 38. 11 3.6 38
1-2-0 11. 3.6 42. 11 3.6 42
1-2-1 15. 4.5 42. 15 4.5 42
1-3-0 16. 4.5 42. 16 4.5 42
2-0-0 9.2 1.4 38. 9.2 1.4 38
2-0-1 14. 3.6 42. 14 3.6 42
2-0-2 20. 4.5 42. 20 4.5 42
2-1-0 15. 3.7 42. 15 3.7 42
2-1-1 20. 4.5 42. 20 4.5 42
2-1-2 27. 8.7 94. 27 8.7 94
2-2-0 21. 4.5 42. 21 4.5 42
2-2-1 28. 8.7 94. 28 8.7 94
2-2-2 35. 8.7 94. 35 8.7 94
2-3-0 29. 8.7 94. 29 8.7 94
2-3-1 36. 8.7 94. 36 8.7 94
3-0-0 23. 4.6 94. 23 4.6 94
3-0-1 38. 8.7 110. 38 8.7 110
3-0-2 64. 17. 180. 64 17 180
3-1-0 43. 9.0 180. 43 9 180
3-1-1 75. 17. 200. 75 17 200
3-1-2 120. 37. 420. 120 37 420
3-1-3 160. 40. 420. 160 40 420
3-2-0 93. 18. 420. 93 18 420
3-2-1 150. 37. 420. 150 37 420
3-2-2 210. 40. 430. 210 40 430
3-2-3 290. 90. 1000. 290 90 1000
3-3-0 240. 42. 1000. 240 42 1000
3-3-1 460. 90. 2000. 460 90 2000
3-3-2 1100. 180. 1100 180 4100
3-3-3 >110 >1100 420 -
46
Serotipificación
Vibrio parahaemolyticus
49
50
Figura 10. PCR para identificar la especie cholerae de Vibrio. Electroforesis en gel de
agarosa al 1.2% teñido con bromuro de etidio: M- Marcador de tamaño molecular de
100 pb. CN- Control negativo, reacción sin ADN molde. CP- Control positivo (CAIM
1406). MP- Muestra de ostión positiva.
menor a 3.0 NMP g-1 y una máxima de 35.0 NMP g-1. Todas las muestras que se
detectó la presencia de V. cholerae no cumplieron con lo establecido por la
NOM-242-SSA1-2009 y la FDA. Los resultados se pueden apreciar en los
cuadros 15 y 16.
Figura 11. PCR para identificar la especie vulnificus de Vibrio. Electroforesis en gel de
agarosa al 1.2% teñido con bromuro de etidio: M- Marcador de tamaño molecular de
100 pb. CN- Control negativo, reacción sin ADN molde. CP- Control positivo (CAIM
610). MP- Muestra de ostión positiva.
máxima registrada fue de 28.0 NMP g -1, con una concentración promedio de 5.9
NMP g-1.
En la detección del gen que codifica para toxina TDH por PCR se
procedió a designar como positiva a una muestra, a aquellas en las que se
detectó la presencia de una banda de aproximadamente 269 pb (Fig. 12),
correspondiente al tamaño esperado para el gen tdh de V. paraharemolyticus en
el 35.08 % de las muestras positivas para V. parahemolyticus (20/57). Además,
se detectó la presencia de una banda de aproximadamente 500 pb (Fig. 13), el
cual corresponde al fragmento de tamaño esperado para el gen trh de V.
paraharemolyticus. Se logró identificar este gen en el 10.52 % (6/57) en las
mismas muestras (Fig. 14). Los resultados obtenidos se muestran en figura 14 ,
donde se observa que en el 7% (4/57) de las muestras de ostión de placer se
detectaron ambos genes de toxicidad.
Figura 12. PCR para identificar el gen tdh, que codifica para la toxina TDH de Vibrio
parahaemolyticus. Electroforesis en gel de agarosa al 1.2% teñido con bromuro de
etidio: M- Marcador de tamaño molecular de 100 pb. CN- Control negativo, reacción sin
ADN molde. CP- Control positivo (CAIM 1400). MP- Muestra de ostión positiva.
60
Figura 13. PCR para identificar el gen trh, que codifica para la toxina TRH de Vibrio
parahaemolyticus. Electroforesis en gel de agarosa al 1.2% teñido con bromuro de
etidio: M- Marcador de tamaño molecular de 100 pb. CN- Control negativo, reacción sin
ADN molde. CP- Control positivo (CAIM 1772). MP- Muestra de ostión positiva.
Figura 14. Muestras positivas con los genes tdh y/o trh que codifican para las toxinas
TDH y TRH respectivamente.
61
Las muestras en las que se detectó la presencia del gen tdh y negativas
para trh fueron analizadas por PCR para la detección del marco de lectura
abierta ORF8, el cual determina de manera molecular el serotipo Vibrio
parahemolyticus O3:K6. Solamente en una muestra se designó como positiva
ya que se detectó la presencia de una banda de aproximadamente 369 pb (Fig.
15). Esta muestra es correspondiente al periodo 1 (de octubre a diciembre de
2010).
62
63
Es probable que las muestras hayan resultado positivas debido a que los
ostiones se estén cosechando en aguas con una probable contaminación fecal.
Posiblemente se deba a que los ostiones provenían de zonas costeras
cercanas a poblaciones urbanas y rurales, así como a las bocas de los ríos
Culiacán y San Lorenzo. Anteriormente, Chaidez-Fernández (2006) reportó que
la Bahía de Altata recibe aportaciones de aguas residuales vertidas por 15
drenes, además es cuerpo receptor del río Culiacán, que fluye hacia el interior
de la bahía adoptando características estuarinas, esta zona también recibe
aguas de desecho de uso doméstico de la población y se encuentra cercana a
un área con actividad restaurantera y embarcaciones. Esta reportado que una
de las rutas de entrada de microorganismos patógenos de heces humanas y
animales en aguas costeras, es la descarga de desechos a los ríos y la
subsecuente descarga a éstos a los estuarios y por último a las zonas costeras,
otra ruta es la descarga directa en las zonas costeras de aguas residuales
tratadas o parcialmente tratadas y la descarga de agua de desecho de áreas
urbanas o rurales (González et al., 2009).
pudo deber a que los ostiones se contaminan en el mar de donde son extraídos,
sin embargo, el mal almacenamiento al que se someten los ostiones
exponiéndolos a temperaturas de almacenamiento arriba de los 30 ºC pudiera
dar las condiciones favorables para la proliferación de la bacteria dentro del
ostión. Gooch et al. (2002), demostraron que las poblaciones de V.
parahaemolyticus pueden aumentar de 50 a 700 veces más en ostiones sin
refrigerar expuestos a temperaturas mayores a los 26 ºC. En el primer periodo
(Otoño) se registraron temperaturas ambientales en un rango de 29 a 34ºC, en
el segundo periodo (Invierno) de 32 a 33ºC y en el tercer periodo (Primavera)
de 32 a 35ºC. Franco-Monsreal et al. (2003) reportaron la presencia de V.
vulnificus en el 29.49% (23 de 78) de muestras de alimentos marinos crudos
(ostión, camarón, calamar entre otros) de marisquerías de la ciudad de
Chetumal, Quintana Roo, y señalan que la probabilidad de aislamiento de este
microorganismo es mayor cuando el alimento no ha sido expuesto a la acción
del calor, es decir, que se encuentren en crudo. Pasa de la misma manera para
V. vulnificus, ya que se multiplica rápido cuando los ostiones se encuentran a
temperaturas de almacenamiento ambiental. Cook (1994) sugiere que existe la
necesidad de refrigerar los ostiones inmediatamente después de la cosecha
para así evitar el aumento en el número de V. vulnificus.
68
LITERATURA CITADA
69
70
http://www.fda.gov/Food/ScienceResearch/LaboratoryMethods/BacteriologicalA
nalyticalManualBAM/ucm109656.htm
Última visita: 26 de octubre de 2011.
Colwell R. 1996. Global climate and infectious disease: the cholera paradigm.
Science. 274: 2025-2031.
Fica A. 2007. Infecciones por Vibrio parahaemolyticus. Medwave, año VII, No.
9. Descargado desde www.medwave.cl 16 julio 2011.
Food and Drug Administration (FDA). 2000. Bad Bug Book: Foodborne
Pathogenic Microorganisms and Natural Toxins Handbook Vibrio
parahaemolyticus.
http://www.fda.gov/Food/FoodSafety/FoodborneIllness/FoodborneIllnessFoodbo
rnePathogensNaturalToxins/BadBugBook/ucm070452.htm
Última visita: 26 de octubre de 2011.
75
Lee W, Lee M, Kim J, Park S. 2001. Foodborne illness outbreaks in Korea and
Japan studied retrospectively. Journal of Food Protection. 64:899-902.
Tsai Y, Olson B. 1992. Detection of low numbers of bacterial cells in soils and
sediments by polymerase chain reaction. Applied and Environmental
Microbiology. 58:754-757.
Young M. 1998. Seafood smart: some caution should be taken when eating
seafood. The Journal of the American Medical Association. 280:760.
87
ANEXO I
Preparación de Soluciones
GCAGAGATCGTTGTTGCTGAGTGATTGGAGGGTAACGTGTGCTTCG
GCTTCAAACGGGGGATGATTCCAGTCTGTGCGAATACGTTGTTTCACGGTA
CTGCTGTTGGTTGACGAGCCCGCAGAACCATAAACTGAGAAGAGTGCTGAA
GGGATTACCGTACCAAAGCGTGCACGATAGTTGAGTTTCACGCCCATCTCG
AAATCCGTTACGCCGGTTTCAGACACAGGCGCTTCGTACAAAACGTCATAGT
TCGGTTTGAAGTTGGAATAAGAGATTGGGTTGAACTTCGTCTTATCAAATAC
CCAGCCACTGCCCCAGTGAGCGGCGTGAAATAGCATCCAAGCTCTTGGCG
GCGCAGTTCATCACACTCACCAAACTCACGCTCGAATGAAATATCAAAATCA
CTCAGTGATGAGCGGTTGTTGATGCGATAGTCTTTTGTATCAAACACCAAGG
TTTTCGAGTAGTTGTAAGTAAATGAGCCACTGCCCCAGTGAACGGCGGTGA
AATAACATCCAAGCTCTTGGCGGCGCAGTTCATCACACTCACCAAACTCAC
GCTCGAATGAAATATCAAAACCACTCA
91
92
Homología de la Secuencia Nucleotídica del gen vvhA con el gen que Codifica
para la Citolisina del Fragmento de 1353 pb de V. vulnificus
Vibrio Vulnificus Cytolysin Gene, Partial cds
GenBank: FJ222405.1
LOCUS:FJ222405
SIZE: 1353 bp
DNA: linear BCT 11-OCT-2008
DEFINITION: Vibrio vulnificus cytolysin gene, partial cds.
ACCESSION: FJ222405
VERSION: FJ222405.1 GI:208611726
REFERENCE:1 (bases 1 to 1353)
AUTHORS :Li,Y.T. and Liu,Z.S.
TITLE :Construction and expression of the poly-recombinant fusion toxin
gene of food poisoning Vibrio.
JOURNAL Unpublished
REFERENCE 2 (bases 1 to 1353)
AUTHORS Li,Y.T., Liu,Z.S. and Li,X.T.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (17-SEP-2008) Key Laboratory of Zoonosis, Jilin
University, Xian Road, 5333, Changchun, Jilin 86, China
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/208611726?
report=genbank&log$=nucltop&blast_rank=2&RID=3VBJ5683016
ANEXO III
Región 1 – Altata
93