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LABORATORIO DE BIOLOGIA
INFORME DE PRÁCTICAS
PRACTICA N°: 8, 9 y 10
INTEGRANTES:
HORARIO de PRÁCTICAS:
DIA : Martes
LIMA – PERU
ÍNDICE
PRESENTACION………………………………………………………………………..
INTRODUCCIÓN……………………………………………………………3
MARCO TEÓRICO…………………………………………………………
OBJETIVOS……………………………………………………………………4
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL………………………………………………..6
RESULTADOS……………………………………………………………………………….9
DISCUSIÓN DE RESULTADOS………………………………………………………..7
CONCLUSIONES……………………………………………………………………………12
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS…………………………………………………….14
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Este informe abarcará los siguientes temas: Extracción de ADN, Fundamentos de la
cuales se dará una explicación detallada en separado de cada uno de los temas
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EXTRACCIÓN DEL ADN
INTRODUCCIÓN:
La biología molecular es una de las herramientas más útiles de las que se vale la ciencia y la
medicina moderna, La extracción de ADN es un tipo de metodología que mediante la
manipulación del material genético ha permitido, entre otras cosas, el desarrollo de la clonación
de secuencias de ADN para el estudio de mutaciones que estén involucradas en las diferentes
patologías humanas, mapeo y secuenciación de genes con fines terapéuticos. Con este
conocimiento se logra el desarrollo de la terapia génica, el análisis de diversidad molecular de
especies, análisis forenses y de paternidad.
El ADN:
Está formado por desoxirribonucleotidos (A, G, C, T). Que a su vez están formados -D
desoxirribosa y un ion fosfato. La proporción y secuencia de las bases nitrogenadas diferencia a
los poli nucleótidos.
La calidad del ADN constituye un elemento crucial para esta técnica, la cual necesita un método
de extracción de ADN lo más estandarizado posible con el que se obtenga un ADN puro, no
degradado, libre de ARN y de inhibidores de la reacción en cadena de la polimerasa: porque
cambios en la pureza afectan los perfiles de amplificación y esto se manifiesta en la presencia de
bandas falsas y en la poca reproducibilidad del ensayo.
http://www.danagen.es/wp-content/uploads/2013/08/DANAGENE-SPIN-BL
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Objetivos:
• Extraer ADN a partir de muestras biológicas.
• Conocer las diferentes técnicas de aislamiento del ADN.
• Analizar cada proceso de la técnica de aislamiento del ADN.
MATERIALES:
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Micropipetas de 20-100, 100-1000
micro litros.
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Microcentrifuga 16000 rpm
Vortex
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Qubit Kit (Cuantificación de ADN)
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PROCEDIMIENTO:
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3. A la muestra, se le añade 20 μl de RNasa.
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2. Se centrifuga la columna a 1000 g por un minuto.
3. Luego, se suprime el collection tub y se coloca a un nuevo Pure Link Collection tube.
4. Se adiciona 500 μl del Wash Buffer 1 y se centrifuga a 10 000 g por un minuto, y se
suprime el collection tube.
5. Se coloca un nuevo Pure Link Collection, adicionando 500 μl del Wash Buffer 2.
6. Se centrifuga a velocidad máxima por 3 minutos
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7. Se descarta el Collection Tube y se coloca un tubo de eppendorf de microcentrifuga nuevo
(cortar la tapa).
8. Se añade 25-200 μl de la solución Genomic Elution Buffer (el volumen dependerá de cuán
concentrado se desea la muestra).
9. Se deja actuar durante 1 minuto a temperatura ambiente.
10. Se centrifuga a máxima velocidad por un minuto.
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2. Resuspender las células con toque de vortex por 3 min.
3. Al pellet celular obtenido se le adiciona 500 μl de una solución de resina Chelex- 100 al
10%. Se agite en un vortex por 3 min.
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7. Extraer el sobrenadante donde se encuentra el ADN (fase acuosa) y trasladarlo a otro tubo ependorf,
en la parte inferior se encontrará la resina Chelex-100, las proteínas desnaturalizadas y otros
elementos.
8. El tubo ependorf conteniendo el sobrenadante se guardará en un congelador a -20ºC.
RESULTADOS:
DISCUSIÓN Y ANALISIS:
Para determinar la calidad y cantidad del ADN extraído, las muestras fueron
evaluadas en un espectrofotómetro a 260 y 280 nm para determinar la
concentración de ADN y de proteínas, respectivamente; además, la relación a
260/280 fue calculada. Los análisis espectrofotométricos también permitieron
evaluar la cantidad de ADN en cada muestra.
Según Alejos L., Aragón M. y Cornejo A y estamos de acuerdo con él, cuando
menciona que: ”la aplicación de técnicas moleculares inicia con la extracción de
ADN y la obtención exitosa de datos confiables y reproducibles depende, en gran
medida, de la extracción de ADN íntegro y puro”, ya que nosotros en la práctica
también nos aseguramos de tener el ADN puro ya que los resultados podrían variar.
Al momento de pre etapas de tratamiento, en el cual agregamos la proteína
quinasa K, ahí vamos a obtener la degradación de histonas que se encuentran ahí.
Y al añadir el buffer lisis vamos a obtener la lisis de la célula dejando a la ARN
desnuda.
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Para la cuantificación del ADN se dio el análisis de la absorción UV, ya que los
nucleótidos poseen máximos de absorción alrededor de 260 nm (por ejemplo,
dATP: 259 nm; dCTP: 272 nm; dTTP: 247 nm). Este método nos proporcionó una
estimación simple y precisa de la concentración de una muestra, pero sólo si ésta
se encuentra pura, sin contaminación significativa de proteínas o solventes
orgánicos que absorben a longitudes de onda cercanas.
CONCLUSIÓN:
Es por eso que el PCR es una herramienta que se ha desarrollado para ofrecer una alternativa
para el estudio del ADN. Debido al impacto dentro de la comunidad científica porque ofrece las
siguientes cualidades:
Sensibilidad: Hace referencia a la mínima cantidad de ADN que es necesario para que se
produzca la amplificación.
Especificidad: solo se obtiene un solo producto amplificado.
Eficiencia: amplificación máxima que se puede obtener en un número determinado de
ciclos.
Fidelidad: se refiere a los errores que comete el ADN polimerasa durante la amplificación.
Objetivos: :
• Conocer los fundamentos en lo que se basa la técnica de PCR.
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• Conocer la importancia del uso de la técnica de PCR para el diagnóstico de enfermedades
en los seres humanos.
• Explicar cómo se genera un fragmento específico de ADN genómico humano utilizando la
técnica de PCR.
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• MATERIALES:
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Puntas de 10-100 micro litros y
de 100-1000 micro litros
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Termociclador
Agua estéril
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Tubos ependorf de 1,5 mL
Muestras de ADN
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Mix de Pcr (taq polimerasa,
dNTPs, primer, Mg, agua)
PROCEDIMIENTO:
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1. En un tubo de PCR, se coloca 25 μl de solución de reacción final (mix PCR).
3. Se coloca los ependorf con la solución de mix de PCR en el termociclador, el cual está
programado en las siguientes condiciones:
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4. Se finaliza el proceso de amplificación con el retiro de los ependorf del termociclador y el
almacén de las muestras a 4°C, si la amplificación se utilizó en un lapso de corto tiempo. Si
no fue el caso se mantiene a -20 C°.
RESULTADOS:
Algunos de los amplificadores avanzaron más que los otros, esto dependiendo de los pares de
bases que contenían, es decir, a mayor número de pares de bases que contendiera la muestra,
era mayor su avance por la cámara de electroforesis, esto debido a los pesos moleculares de
cada muestra y como ya sabemos las muestras de mayor peso molecular tendían a avanzar más
hacia el polo positivo de la cámara de electroforesis y las de menor tamaño se retendrán en el
polo negativo.
DISCUSIÓN Y ANALISIS:
En nuestro caso utilizamos la taq polimerasa en el cual tenemos que la temperatura más usada
es de 72ºc, aquí se da la extensión, en donde se produce la temperatura óptima para la ADN
polimerasa, donde incorpora nucleótidos complementarios a partir del extremo 3’ libre de la región
en que han hibridado los premiers.
Al momento de terminar los ciclos designados para el PCR, manteniendo la temperatura de 72ºc
por 5 minutos, la cual va a hacer que la polimerasa termine la extensión de los productos a los
cuales se encuentra unida.
En principio, con poca cantidad de DNA molde se obtendrá producto de amplificación, ya que la
PCR es muy sensible; dado que en cada ciclo se duplica la cantidad de DNA correspondiente al
fragmento a amplificar, aunque existió poco molde inicial, se generó la cantidad suficiente para
ser visualizada.
CONCLUSIÓN:
La reacción en cadena de la polimerasa o PCR es una técnica fundamental para la mayor parte
de las aplicaciones de la biología molecular. Se ha presentado la base teórica y práctica de la
PCR. Existen muchas variantes de la PCR convencional. Existe gran cantidad de información
referida tanto a la PCR convencional como a sus variantes.
El PCR es una técnica muy útil, ya que nos permite obtener un gran número de copias a partir de
ADN particular.
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En conclusión, la PCR es una nueva herramienta de investigación y diagnóstico de laboratorio muy
potente que abre todo un nuevo mundo de posibilidades. Su aplicación ha de ser limitada a aquellos casos
o estudios que lo permitan.
FUNDAMENTOS DE ELECTROFORESIS
INTRODUCCIÓN:
En biología molecular, una gran cantidad de técnicas que se realizan comúnmente requieren el
uso de la electroforesis, por lo que supone una parte importante del procedimiento sistemático del
análisis (separación, purificación, preparación) de los ácidos nucleicos y las proteínas. La mayoría
de las biomoléculas poseen una carga eléctrica cuya magnitud depende del pH del medio en el
que se encuentran; como consecuencia, pueden desplazarse cuando se ven sometidas a un
campo eléctrico hacia el polo de carga opuesta al de la molécula. A diferencia de las proteínas,
que pueden tener una carga positiva o negativa, los ácidos nucleicos sólo poseen carga negativa,
debido a su esqueleto de fosfatos. Por lo tanto, en una electroforesis, los ácidos nucleicos
migrarán hacia el polo positivo; es decir, el ánodo. En el caso de las proteínas se realiza
pretratamiento con detergentes, como el dodecilsulfato de sodio (SDS), que les confiere carga
negativa; con ello se homogenizan las proteínas de la muestra y todas migrarán hacia el polo
positivo, y sólo se separarán por tamaño.
El principio de la electroforesis consiste en la migración proporcional de las moléculas a través de
un gel u otro tipo de matriz porosa, según su peso molecular o tamaño; movimiento generado por
el campo eléctrico.
https://www.mindomo.com/es/mindmap/mapa-809101055f4b4309a4c52449d602b4ee
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Objetivos: :
• Apreciar la técnica de electroforesis en gel.
• Comprender los conceptos que están involucrados en la separación de ácidos nucleicos en
una corrida electroforética.
• Observas la muestra de ADN aislada de la práctica anterior
MATERIALES:
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Marcador de peso molecular
Cámara de electroforesis y
accesorios (peines, soporte,
tabla niveladora, etc.)
Fuente de poder.
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Gradillas para tubos de 1,5 micro
litros.
Guantes
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Agarosa al 2%
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Buffer carga para ADN
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Transiluminador de luz UV
PROCEDIMIENTO:
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5. Finalizada la colocación de las muestras ADN en los pocillos, se cubre el tanque con la
tapa y se conecta los cables de los electrodos en la fuente de poder.
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9. El xilenecianol en geles de agarosa al 2% migra de manera similar a un fragmento de
ADN de 160 pares de base (pb), mientras que el azul bromofenol es equivalente a un
fragmento de 45 pb
10. Luego, se procede al desmontaje del equipo con la desconexión de los electrodos de la
fuente de poder, removiendo el sistema que contiene el gel de agarosa.
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11. Se remueve el gel de soporte con mucho cuidado, ya que se puede romper.
Imagen Descripción
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4.
DISCUSIÓN Y ANALISIS:
La presencia de una banda fluorescente en el carril del gel correspondiente a la muestra nos
permite verificar la presencia de material genético en la muestra del grupo, además se obtuvo una
concentración de 13.019 de DNA en cuestión lo que refleja que hubo una buena extracción del
DNA.
Aunque hubo una buena extracción del DNA, el cociente 260/280 (A260) dio como resultado
1.750. Siendo el umbral de pureza mayor >1,8, se puede decir que la muestra no era DNA puro y
por consiguiente una buena parte de la concentración mencionada anteriormente está
determinada por proteínas externas al DNA.
El desplazamiento de los ácidos nucleicos se debe a la carga eléctrica tomada por estos según el
pH presente en la solución del gel. Los geles (poliacrilamida o la agarosa) se colocan en la cubeta
de electroforesis, sumergidos en un tampón de pH alrededor de 8. De esta forma, las moléculas
de ADN sometidas a electroforesis se desplazarán al polo positivo ya que a pH superiores a 5
poseen carga negativa. (Padilla C.)(14)
La utilización de colorantes fluorescentes actúan mediante inserción entre las pares de bases que
conforman el ácido nucleico. El bromuro de etidio es ampliamente utilizado para la visualización
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de ADN y es este un reactivo altamente toxico. Sin embrago en la actualidad existen colorantes
fluorescentes alternativos, como SYBR Safe, SYBR Gold, SYBR Green I, Vistra Green y Syto60,
desarrollados específicamente para reducir los riesgos. (Duque, 2009)(15).
Tenemos también, que según Berth M, en 2007, la electroforesis es uno de los métodos de
cuantificación más utilizados para la separación de moléculas según la movilidad de estas en un
campo eléctrico. Coincido con Berth M., ya que, utilizamos la electroforesis para cuantificar la
separación de moléculas de la muestra anterior obtenido por la extracción de ADN .
CONCLUSIÓN:
La electroforesis en gel de agarosa es una de las técnicas más adecuadas para la visualización
del DNA, ya que además de ser fácil su preparación, es fácil de visualizar el DNA ya que solo es
necesario colorearlo con un colorante fluorescente como el bromuro de etidio y el Sybergreen,
para posteriormente someterlo a una luz fluorescente y de esta manera visualizar el DNA.
Hemos llegado a la conclusión que el gel de agarosa permitió un tiempo de análisis más corto para la
rutina de electroforesis.
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CONCLUSIÓN FINAL:
A partir de todo lo antes expuesto podemos decir que todo este proceso es muy
eficaz para poder determinar , seleccionar un gen especifico del ADN el cual lleva la
información de cada ser vivo , el más profundo acerca de él nos abrirá las puertas a
lograr avances históricos Estos tres procesos se complementan entre si ya que al
final se obtiene la muestra del gen que queríamos identificar y ver si estaba
correctamente formado, es necesario que conozcamos estos procesos
especialmente en la ciencias de la salud ya que nos permiten descubrir nuevas
enfermedades o el mejor conocimiento de las que existen y en consecuencia un
mejor tratamiento.
REFERENCIAS
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