Professional Documents
Culture Documents
ACIZI NUCLEICI
1. Generalitati
2. Compozitia
- Bazele azotate
- Pentozele
- Acidul fosforic
- Nucleozidele
- Nucleotidele
3. Structura
1. Generalitati
Acizii nucleici sunt biomolecule de tip lant care au functia de a depozita si transfera informatia
genetica. Ei sunt componente majore in toate celulele, reprezentand 5-15% din masa uscata a
acestora.
Alaturi de proteine, ei reprezinta cei mai importanti biopolimeri care intra in alcatuirea celulei
vii. Elementele structurale de baza ale acizilor nucleici sunt nucleotidele. Asa cum aminoacizii sunt
elementele constitutive, unitatile monomere ale polipeptidelor, nucleotidele sunt unitatile
monomere ale acizilor nucleici. Ducand mai departe analogia dintre proteine si acizii nucleici se poate
spune ca asa cum un anumit tip de molecule proteice se deosebeste de altul prin secventa catenelor
secundare si a radicalilor R caracteristici aminoacizilor, tot asa fiecare tip de acid nucleic se
caracterizeaza prin secventa bazelor heterociclice ale nucleotidelor sale monomere.
Nucleotidele sunt unitatile structurale ale acizilor nucleici cu rol in metabolismul intermediar,
indeplinind functii coenzimatice.
Acizii nucleici sunt compusi macromoleculari cu masa foarte mare zeci de mii pana la milioane
de a.m.u. si contin 15% azot si 10% fosfor.
Acizii nucleici se impart in doua clase:
Faptul ca DNA a fost izolat initial din nucleii celulari a determinat nomenclatura acestora, insa
cercetarile ulterioare au demonstrat prezenta acizilor nucleici si in alte componente celulare
(mitocondrii, cloroplaste).
Acizii nucleici se gasesc in organisme inferioare, procariote (bacterii, virusi) sau inclusi in
componente nucleoproteice la organismele superioare, eucariote.
Acizii nucleici sunt substante solide, incolore sau slab colorate in galben, greu solubile in apa,
solubile in solutii bazice; sunt substante puternic acide, cu sarcina electrica negativa foarte mare.
2. Compozitia
Mononucleotidele reprezinta unitatea de baza a acizilor nucleici si sunt alcatuite din trei
componente principale:
- radical fosfat.
Bazele azotate
Bazele azotate care intra in structura nucleotidelor sunt de natura purinica si pirimidinica.
adenina guanina
Adenina se gaseste in constitutia unor nucleotide sau in stare libera in ceai, cafea, tutun;
guanina se gaseste in constitutia tuturor acizilor nucleici si in stare libera in guano al pasarilor de
mare.
Bazele pirimidinice
Prin analiza de difractie a razelor X s-a putut stabili precis structura tridimensionala a bazelor
azotate. Pirimidinele sunt molecule plane, iar purinele se abat usor de la planitate.
Bazele pirimidinice si purinice libere sunt aproape insolubile in apa si prezinta spectre de
absorbtie la 250-280 nm(UV) datorita dublelor legaturi conjugate. Aceasta proprietate prezinta
importanta pentru detectarea si analiza cantitativa a bazelor libere precum si a acizilor nucleici si
nucleotidelor. Bazele purinice si pirimidinice se pot separa prin metode cromatografice sau
electroforetice; ele formeaza precipitate cu sarurile de argint, cupru, magneziu, cu acidul picric sau
fosfowolframic.
Bazele azotate au caracter slab bazic si cele continand oxigen se gasesc in mai multe forme
tautomere in functie de pH: o forma cetonica si o forma enolica.
Esentiale pentru functia biologica a bazelor azotate sunt dimensiunile acestora, secventa lor in
nucleotide si capacitatea de a forma legaturi de hidrogen.
Legaturile de hidrogen se formeaza intre gruparile - NH2 din adenina, guanina, citozina,
gruparile -NH- din pozitia 1 a adeninei si guaninei sau pozitia 3 din ciclul pirimidinic (timina, citozina)
si respectiv atomii de oxigen din pozitia 2 a citozinei, 4 a timinei, uracilului si 6 a guaninei, contribuind
la stabilitatea moleculeui de ADN.
Pentozele
Pentozele care intra in constitutia acizilor nucleici sunt: D riboza si D dezoxiriboza, ambele
avand configuratii βfuranozice.
Pentozele sunt larg raspandite in regnul vegetal, mai putin in stare libera, mai mult sub forma
de poliglucide, glicozide, esteri. Au rol in constitutia peretilor celulari si a acizilor nucleici, intra in
structura unor coenzime si vitamine. In stare libera se gasesc in forma piranozica, iar in acizii nucleici
in stare furanozica
Riboza si dezoxiriboza se pot separa prin metode cromatografice. Ele dau numeroase reactii
caracteristice:
Acidul fosforic
Acidul fosforic reprezinta 8-14% din compozitia acizilor nucleici, acesta le imprima caracter
acid si capacitatea de a forma saruri cu bazele.
In structura acizilor nucleici, acidul fosforic este dublu esterificat cu molecule de riboza sau
dezoxiriboza, prin intermediul gruparilor hidroxilice de la 3' si 5' (2'). In acest fel acidul fosforic uneste
monocleotidele prin legaturi fosfodiesterice si lantul polinucleotidic apare ca o succesiune de resturi
de dezoxiriboza sau riboza unite prin intermediul acidului fosforic. Bazele azotate se leaga numai de
pentoze, prin legaturi N β glicozidice si nu de acidul fosforic.
1’ 2; 3’ 4’ 5’
C C C C C
OH
O = P
C C C C C
1’ 2’ 3’ 4’ 5’
Esterii fosforici rezultati au proprietati mai apropiate de ale eterilor decat de ale esterilor
minerali si reprezinta o clasa particulara de compusi cu o importanta biochimica exceptionala.
Acestia pot fi: mono, di si trifosforici si maresc cu mult reactivitatea pentozelor care, libere, sunt
foarte stabile.
Nucleozidele si nucleotidele
Nucleozidele sunt N-glicozide formate din o baza azotata si o pentoza unite prin legaturi
N bglicozidice. Legatura glicozidica se stabileste la atomul de azot (N-3 sau N-9 in functie de natura
bazei) si hidroxidul de la atomul C1’al pentozei.
Nucleotidele sunt unitati structurale de baza ale acizilor nucleici. Sunt formate dintr-o baza
azotata (purinica sau pirimidinica), o pentoza (riboza sau dezoxiriboza) si acidul fosforic. In acelasi
timp, nucleotidele sunt esteri fosforici ai nucleozidelor, formati prin esterificarea gruparilor OH ale
ribozei (3', 2', 5') sau dezoxiribozei (3', 5') cu acidul fosforic.
Denumirea nucleotidelor ce contin riboza se formeaza din numele bazei azotate, utilizand
sufixul ilic sau din denumirea nucleozidului la care se adauga termenul de monofosforic, astfel acidul
citidilic se denumeste si acidul citidin monofosforic, prescurtat CMP. In cazul nucleotidelor care
contin dezoxiriboza, se adauga prefixul dezoxiribozo, iar in fata numelor prescurtate litera d (dCMP).
Ele absorb puternic in UV la 250-280 mm, maximul de absorbtie depinzand de natura bazei
azotate.
Separarea lor se poate face prin cromatografie sau prin schimb ionic.
Cu toate ca ciclurile bazelor azotate si ale pentozelor sunt aproape plane, structura
rezultata nu este coplanara, cele doua cicluri fiind aranjate aproape perpendicular unul pe celalalt.
Aceasta conformatie se pastreaza si in macromolecula de acid nucleic.
Ribonucleotide
Dezoxiribonucleotide
Adenozin 5’
monofosfat Dezoxiadenozin5’monofosfat AMP
dAMP
In mod similar se formeaza GMP, CMP, UMP, dGMP, dCMP, TMP.
Unele mononucleotide pot contine mai mult decat un radical de acid fosforic, astfel apar acizi
nucleozid difosforici (NDP) sau nucleozidtrifosforici (NTP), respectiv dezoxinucleozid difosforic (dNDP)
si dezoxinucleozid trifosforic (dNTP). Legaturile formate cu a doua si a treia molecula de acid fosforic
inmagazineaza energie sub forma legaturilor macrologice, notate cu semnul ≈. Daca o legatura
fosfoesterica simpla elibereaza 2-3 kcal/mol fosfat, o legatura macroenergica elibereaza 7-12
kcal/mol fosfat. Aceste legaturi prezinta importanta in acumularea energiei chimice in celula.
Gruparile fosfat aflate in NDP si NTP formeaza complecsi cu cationi bivalenti ca Mg si Ca.
Dintre complecsii NTP, ATP/Mg2+ are functii importante in celula si anume de transportor de
grupari fosfat implicate in transferul enzimatic al energiei chimice. ADP-ul rezultat este refosforilat la
ATP in procesul respiratiei. Asemenea sistemului ADP - ATP si alti nucleozidtrifosfati (GTP, UTP, CTP)
au rol in canalizarea energiei chimice pe cai biosintetice specifice.
O alta functie importanta a NDP si NTP e cea de transportor macroergic al unor glucide in
biosinteza polizaharidelor (UDP) sau de donor al gruparii fosfat in biosinteza fosfogliceridelor (CDP).
O a treia functie majora a NTP si dNTP e aceea de precursori bogati in energie, utili in
biosinteza enzimatica a ADN si ARN. Prin eliberarea a doua grupari fosforice rezulta NMP, elemente
constitutive ale acizilor nucleici.
Un rol esential in procesele metabolice il au si alte nucleotide care intra in constitutia unor
coenzime. Asa sunt nicotinamid dinucleotidele (NAD, NADH + H+, NADP+) sau flavin adenin
dinucleotidele (FAD, FADH2) implicate in procesele de oxido-reducere ale respiratiei celulare.
DNA este format din lanturi de dezoxiribonucleotide legate covalent, iar RNA din lanturi de
ribonucleotide. DNA si RNA au o serie de proprietati comune rezultate din faptul ca, in ambele
molecule, nucleotidele succesive sunt legate covalent prin punti fosfodiesterice intre gruparea 5'
hidroxil a unei nucleotide si gruparea 3' hidroxil a urmatoarei nucleotide. Deci catena principala a
acizilor nucleici este formata din grupari fosforice alternand cu radicali de pentoza, legaturile
fosfodiesterice asigurand continuitatea covalenta. Bazele azotate nu fac parte din catena principala,
ele sunt legate la atomul C1' la resturile pentozice prin legaturi Nβ glicozidice.
In compozitia DNA pentoza este dezoxiriboza, iar bazele azotate sunt: adenina, guanina,
citozina, timina, iar in compozitia RNA pentoza este riboza, iar bazele azotate sunt: adenina, guanina,
citozina si uracilul.
Acidul dezoxiribonucleic
5’P
3’OH
Structura secundara
Macromolecula de DNA este alcatuita din 2 lanturi polinucleotidice antiparalele sub forma
helicoidala, rasucite unul cu altul. Lanturile au o axa comuna, in fiecare lant bazele azotate sunt
dispuse in interior, iar pentoza si acidul fosforic in exterior. Cele doua lanturi sunt legate intre ele prin
legaturi de hidrogen create intre gruparea - NH2 a adeninei si = 0 a timinei, de la gruparea- NH2 a
guaninei la gruparea = 0 a citozinei si de la gruparea - NH2 a citozinei la gruparea = 0 a guaninei. In
acelasi timp se formeaza legaturi de hidrogen si cu participarea gruparilor - NH existente in guanina si
timina. Asadar adenina unui lant se va uni cu timina celuilalt si guanina unui lant cu citozina celuilalt.
La baza organizarii acestei structuri stau urmatoarele reguli stabilite pe baza datelor
experimentale privind compozitia chimica a DNA:
2) Cantitatea de grupari 6 aminice care intra in compozitia bazelor azotate (adenina si citozina)
este egala cu cantitatea de grupari 6 cetonice. (guanina + timina).
(G+T)/(A+C) = 1
Rezulta ca in structura secundara a DNA, in cadrul dublului helix, in lungul axei, la fiecare 34
A se gaseste un mononucleotid, unghiul dintre 2 nucleotide alaturate este de 360, diferenta dintre
0
Secventa bazelor azotate in unul din cele doua lanturi poate fi oricare, dar succesiunea
distributiei bazelor azotate la celalalt lant trebuie sa fie complementar. Deci molecula DNA este
constituita din doua lanturi complementare observandu-se o deplina reflectare a celui de al doilea
lant in secventa primului.
Ambele lanturi sunt spirale la dreapta, diametrul helixului este de 2,0 nm, iar fiecare spira
contine zece baze azotate.
Structura secundara si tertiara a DNA este stabila nu numai datorita legaturilor de hidrogen
dintre catene ci si datorita gruparilor OH libere ale acidului fosforic care poate stabili interactiuni
electrostatice cu proteine bazice (histone) care contin aminoacizi incarcati pozitiv.
Se refera la modul superior de aranjare a dublului helix, fie in super helixuri circulare, in
molecule ciclice deschise sau in forme combinate.
In virusuri si bacterii DNA are structuri liniare sau ciclice dar in org. .are o structura mult mai
complexa dupa cum urmeaza:
La eucariote ADN-ul nucleal este impachetat cu proteine, compusii rezultati fiind cromatina
care in timpul diviziunii celulare poarta numele de cromozom.
Particularitatile functionale ale DNA sunt strans legate de localizarea lor. DNA reprezinta
materialul de baza al genelor care pastreaza informatia genetica a organismului care se traduce prin
biosinteza proteinelor. Dubla elice si complementaritatea lanturilor polinucleotidice constituie baza
moleculara a fenomenului de replicare adica formarea de DNA in momentul diviziunii celulare care
asigura transmiterea din generatie in generatie a informatiei genetice.
Structura primara
Monocatena ribonucleotidica este formata prin legaturi fosfodiesterice intre C3' al unei
ribonucleotide si C5' al alteia (in locul timinei se gaseste uracilul). Datorita OH al ribozei se pot face
esterificari cu acidul fosforic si la aceasta grupare dar mai rar.
Acidul ribonucleic este solubil datorita OH din 2' in saruri diluate, nu este stabil in mediul
alcalin, masa sa moleculara variaza de la 3.104 la 2.106 a.m.u.
Specificitatea de specie a RNA este mult mai mica si depinde de succesiunea nucleotidelor.
Rolul RNA depinde de localizarea lor, astfel ca esista trei tipuri de RNA: mesager, de transport
si ribozomal.
Structura primara si secundara a RNA depinde de tipul de ARN si acestea ii imprima: masa
moleculara, stabilitatea, coeficientii de sedimentare, rolul in biosinteza proteinelor.
Majoritatea celulelor contin de 2-8 ori mai mult RNA decat DNA, mai ales in citoplasm
RNA mesager reprezinta 2-4% din acizii ribonucleici celulari, contine doar bazele majore, el
copiaza enzimatic catena de DNA; RNA mesager transfera informatia in citoplasma si serveste ca
matrita pentru biosinteza proteinelor. Fiecare proteina sintetizata este codificata de RNA mesager;
acesata are o viata de cateva minute.
RNA ribozomal reprezinta 65% din masa ribozomilor si 80-90% din RNA total; este localizat in
citoplasma; in ribozomi are loc sinteza proteinelor. RNA reprezinta molecule monocatenare liniare,
dar se pot reprezenta helicoidal prin rasucirea lantului nucleotidic. Spiralarea este posibila numai in
regiuni limitate si anume acolo unde este posibila stabilirea de legaturi de hidrogen intre bazele
azotate ale aceleiasi catene. RNA ribozomal are si rol structural deoarece in combinatie cu proteinele
corespunzatoare formeaza structura ribozomilor.
RNA de transfer este localizat in citoplasma si are rolul de a transporta aminoacizii activati la
ribozomi, unde interactioneaza cu RNA mesager depunand aminoacizii potrivit codului copiat de la
matrita de RNA mesager; au masa moleculara mai mica (zeci de mii) si reprezinta 8-10% din RNA
total. Structura primara este asemanatoare la toate speciile. Dupa transportul aminoacidului specific
din citoplasma ARN t il fixeaza pe ribozom, unde are loc interactiunea cu RNA
mesager; structura sa secundara are portiuni mono si bicatenare de forma frunza de trifoi. Zona
monocatenara reactioneaza cu ARN mesager astfel incat fiecare RNA mesager are un RNA de transfer
specific care contine anticodonul cu baze complementare. Nr. de molecule RNA t este mult mai mare
decat al aminoacizilor; un aminoacid poate fi transportat de mai multi RNA t.