GLOSARIO la energía (ATP) derivado de luz o productos
químicos.
agar Una gelatina de verduras de diversos tipos
de algas o algas. Se utiliza como un agente
gelificante en medios de cultivo sólido para
aislar y cultivar microorgan-ismos.
placa de agar Una placa de agar es una placa
de Petri estéril que contiene agar más Medios
de cultivo, y se utiliza para cultivar
microorganismos.
algas, eucariotas plantas Principalmente
acuáticos unicelulares o multicelulares sin
verdadera tallos, raíces, o las hojas, que son
típicamente autótrofa, fotosintética, y
clorofila con-tain.
alóctono Transportados en de otra parte;
materiales que se encuentran en un lugar
distinto de donde ellos y sus constituyentes
se formaron.
ameba Cualquiera de los diversos protozoos
acuáticos o parasitarias unicelulares, que no
tiene forma definida y que consiste en una
masa de protoplasma que contiene uno o más
núcleos rodeados por una membrana exterior
flexible. Las amebas movimiento por medio
de seudópodos.
anabolismo reacciones metabólicas que
construyen constituyentes celulares, el
consumo de energía (ATP) en el proceso.
arqueas Uno de los tres troncos principales
(dominios) en el árbol de la vida basada en la
subunidad pequeña rRNA filogenia.
asimilación, asimilatorio Fisiología. La
conversión de los nutrientes en el tejido vivo
a través de reacciones metabólicas
biosintéticas.
autóctono Originario o formado en el lugar
donde se encontró.
ATP El trifosfato de adenosina, la moneda de
energía del metabolismo celular.
Catabolismo genera ATP, el anabolismo lo
consume.
autótrofo Un autotroph (o productor primario)
es un organismo que utiliza CO2 como fuente
de carbono. CO2 la fijación es accionado por
Las bacterias Uno de los tres troncos
principales (dominios) en el árbol de la vida
basada en la subunidad pequeña rRNA
filogenia.
bacterias Un término genérico que se refiere a
las formas de vida procariotas (bacterias y
arqueas). El uso del término “bacteria” es
bagaje histórico de la incapacidad primeros
microbiólogos para distinguir entre bacterias
y arqueas. En la biología contemporánea, el
término es inherentemente imprecisa y, a
menudo se considera obsoleta. Dado que las
bacterias y las arqueas son muy diferentes
(filogenéticamente y fenotípicamente), en
referencia a estos dos dominios con un solo
término puede causar pensamiento erróneo.
basalto El tipo más común de lava solidificada;
una densa, de color gris oscuro, de grano fino
roca ígnea que se compone principalmente
de plagioclasa, feldespato, piroxeno y
minerales.
biomarcador A las sustancias bioquímicas
cuya presencia y estructura sirve como una
señal de vida. Ejemplos de biomarcadores
incluyen 16S rRNA, lípidos de membrana, y
clorofila.
catabolismo La descomposición metabólica de
moléculas grandes en los organismos vivos,
la liberación de energía que acompaña,
capturado como ATP.
quimiosíntesis, quimiosintéticas Generación
de ATP por reacciones que oxidan sustancias
orgánicas y / o inorgánicas.
cromatina ADN cromosómico condensada.
cromosoma Major depósito de la información
genética en una célula; células haploides
tener una sola copia de su cromosoma,
mientras que las células diploides tienen dos
copias.
ciliados, protozoos ciliados Cualquiera de los
diversos protozoos de la clase Ciliatas, char-
terizado por un exterior cubierto con
numerosos apéndices cortos, como látigos,
llamados cilios (ver flagelo).
clado Un grupo de organismos, tales como un
género, cuyos miembros comparten
características homolo-Gous derivados de un
ancestro común. En un árbol filogenético, un
clado es un conjunto coherente de secuencias
relacionadas.
conjugación transferencia genética de ADN de
plásmido entre las células; Se requiere el
contacto célula a célula.
cultivables (Adj.) Capaz de ser cultivada. Un
microorganismo es cultivable si un líquido
adecuado o medio sólido, el apoyo de
propagación, se ha ideado. cultivaron (adj.)
Un microorganismo que puede ser y ha sido
cultivada bajo definida, condiciones
controladas. Domesticado.
cultivado Ver culto.
cianobacterias organismos procariotas de vida
libre sin cloro-plastos organizados pero tener
la clorofila a y la fotosíntesis evolución de
oxígeno; capaz de fijar nitrógeno en
heterocistos. Que ocurre en líquenes y otros
rela-tionships simbióticas. Comúnmente
llamado “algas azul-verde”.
detrito materia desintegrada o erosionados: los
restos de la vida antes “el detri-tus del
pasado”.
dissimilation, disimilatoria Fisiología. La
participación en procesos celulares sin
incorporación en biomasa. aceptores de
electrones finales son esenciales para las
reacciones fisiológicas pero sus formas
reducidas son productos de desecho (por
ejemplo, H2OH2S, CH4) Que no son
asimilados.
microscopio de electrones Cualquiera de una
clase de procedimientos microscópicos que
utilizan elec-trones en lugar de luz visible
para producir imágenes aumentadas.
enriquecimiento electiva Un método de
aislamiento de microorganismos capaces de
utilizar un sustrato específico mediante la
incubación de un inóculo en un medio que
contiene el sustrato. El medio puede contener
sustancias o tienen características que
inhiben el crecimiento de microorganismos
no deseados.
la vida endolíticas Literalmente, “dentro de la
roca”. Los microorganismos que han
colonizado y viven dentro del espacio poroso
de las formaciones geológicas, desde la
Antártida hasta el fondo del océano.
endospora Una pequeña espora asexual,
producido dentro de una célula, que sirve
como una etapa de resistir-ant reposo en
algunos procariotas.
cultivo de enriquecimiento Un medio de
composición conocida, proporcionando
condiciones específicas PHY-siological para
favorecer el crecimiento de un tipo particular
de microorganismo.
La microscopía de epifluorescencia Una
técnica microscópica en la que las que
inciden causas luz de onda corta se dirigen a
moléculas fluorescentes que emiten luz de
longitud de onda más larga de nuevo al
espectador.
Eukarya Uno de los tres troncos principales
(dominios) en el árbol de la vida basada en la
subunidad pequeña rRNA filogenia. Eukarya
incluyen formas de vida nucleadas complejos
tales como protozoos, plantas y animales.
eutróficas Un tipo fisiológico del
microorganismo que es adecuado para el
crecimiento en Nutri-entos a alta
concentración.
eutróficos (Adj.) Un hábitat con aguas ricas en
nutrientes minerales y orgánicos que
promueven una proliferación de
microorganismos. Si grandes floraciones de
algas photosyn-tético ocurren en agua
eutróficos, su decadencia por procariontes
heterotróficos puede agotar el oxígeno en el
agua.
facultativo Versátil; capaz de funcionar bajo
diferentes con-diciones ambientales. El
término se aplica a menudo a los
microorganismos que pueden vivir con o con
de salida de oxígeno (anaerobio facultativo).
protozoos flagelados Cualquiera de un gran
grupo de organismos unicelulares,
microscópico, eucariotas tienen uno o más
grandes apéndices de látigo, conocido como
flagelos (ver flagelo)

flagelo En procariotas, un apéndice de la
motilidad de látigo presente en el sur-cara de
algunas especies. Los flagelos están
compuestos de una proteína llamada
flagelina. Los procariotas pueden tener un
solo flagelo, un mechón en un polo o
múltiples flagelos que cubre toda la
superficie. En eucariotas, flagelos son
extensiones protoplásmicas filiformes
utilizados para propulsar flagelados. Los
flagelos tienen la misma estructura básica
que los cilios, pero son más largos en
proporción a la célula que lleva ellos y
presente en cantidades mucho más pequeñas.
hongos Major grupo de heterótrofa, eucariota,
unicelular, multinucleadas, o los organismos
multicelulares, incluyendo levaduras, mohos
y hongos.
genotipo Composición genética, a diferencia
de los rasgos físicos y bioquímicos, de un
organismo o un grupo de organismos. El
genotipo es un conjunto de características
genéticas fijos, mientras que el fenotipo es el
subconjunto de características expresadas.
(Contraste con el fenotipo).
granito Un, roca ígnea dura común, de grano
grueso, de color claro y consiste
principalmente de cuarzo, ortoclasa o
microclino, y mica, y se presentan como
formaciones geológicas masivas,
especialmente en las cordilleras.
genoma El conjunto completo de ADN llevado
por un organismo. En procariotas, esto
significa cromosómica más plásmido de
ADN.
heterótrofo Organismo que requiere una forma
orgánica de carbono como fuente de carbono.
Heterótrofos no fijan CO2.
transferencia horizontal de genes la
transferencia génica horizontal es cualquier
proceso en el que un organismo transfiere
material genético (es decir, ADN) a otra
célula que reside en otra rama del árbol
evolutivo (líneas de descendencia).
sustancias húmicas Una serie de peso
molecular relativamente alto, amarillo-a
sustancias orgánicas de color negro formadas
por reacciones de síntesis secundaria de
suelos. El término se utiliza en un sentido
genérico para describir el material coloreado
o sus frac-ciones obtenido sobre la base de
características de solubilidad. Estos
materiales son dis-distintivo a ambientes de
suelos en que son diferentes a los
biopolímeros de microorganismos y plantas
superiores (incluyendo lignina).
humus Una sustancia orgánica de color marrón
o negro que consiste de la materia vegetal o
animal en descomposición parcial o
totalmente que proporciona nutrientes para
las plantas y aumenta la capacidad del suelo
para retener el agua (ver sustancias húmicas).
hifa, hifas estructuras tubulares que
constituyen la unidad celular básica de la
mayoría de los hongos.
hipoxia Una condición ambiental que ofrece la
concentración de oxígeno reducida.
ígneo Geología. Como resultado de, o
producidos por la acción del fuego. Lavas y
basaltos son rocas ígneas.
biorremediación intrínseca Eliminación de
contaminantes en un sitio determinado por
las poblaciones microbianas de origen
natural que funcionan en los químicos, y las
condiciones geológicas biológicos de origen
natural. También conocido como attenu-
ación natural, cuando dominado por procesos
biológicos.
Los postulados de Koch Un conjunto de
criterios, ideado por Robert Koch en 1884, a
estab-lish causalidad entre un
microorganismo patógeno y su impacto en
un huésped enfermo.
la transferencia de genes lateral Ver
transferencia horizontal de genes.
ligando Un ión, una molécula, o un grupo
molecular que se une a otra entidad chem-
ical para formar un complejo más grande.
litótrofos Fisiología. Término utilizado en
referencia a la fuente de energía de un
organismo (donante de electrones); un
organismo que utiliza un sustrato inorgánico
(como munición-nia, de hidrógeno) como un
donador de electrones en el metabolismo
 energético. Literalmente, lithothroph
significa “comedor de la roca”.
lisis Para romper una célula.
lysogeny La condición de una bacteria huésped
que ha incorporado un virus en su propio
material genético. Cuando un virus infecta a
una bacteria que puede o bien destruir su host
(ciclo lítico) o ser incorporado en el genoma
del huésped en un estado de lysogeny.
metabolismo La integración de las reacciones
bioquímicas celulares; menudo subdividido
en catabolismo (generación de energía en
forma de ATP) y el anabolismo (REAC-
ciones biosintéticas que construyen y
mantienen células nuevas a expensas de
ATP).
metamórfica Geología. Perteneciente a,
producido por, o que exhiben ciertos cambios
que minerales o rocas pueden haber sido
sometidos ya que su original de depo-sición;
especialmente aplicados a la recristalización
de que las rocas sedimentarias se han
sometido a la influencia de calor y presión,
después de lo cual se les llama rocas
metamórficas.
micrones (𝝁) Una unidad de longitud igual a
una millonésima (10-6) De un metro.
Conversión de la mineralización de las
sustancias orgánicas a los inorgánicos. por
ejem-amplio, la producción de 𝐶𝑂2 o 𝑁𝑂− 3
de materia orgánica en descomposición.
ARNm: ARN mensajero, el intermediario
clave en la expresión genética. ARNm sirve
como plantilla para la traducción del código
genético en cadenas de aminoácidos que
constituyen las proteínas.
micelio, micelios biomasa fúngica, una red de
hifas.
atenuación natural Generalmente se refiere a
los procesos biológicos físicos, químicos, o
que, en condiciones favorables, conducen a
la reducción de la masa, la toxicidad, la
movilidad, el volumen o la concentración de
orgánico y / o inorgánicos contaminantes en
el suelo, sedimentos y / o aguas subterráneas.
La reducción tiene lugar como resultado de
procesos tales como la degradación biológica
o química, sorción, y otros.
obligar La capacidad de vivir en solamente un
parámetro conjunto de condiciones; por
ejemplo, un anaerobio obligado sólo puede
sobrevivir en ausencia de oxígeno.
oligocarbophile Capaz de crecer sólo en
sustratos de carbono altamente diluidas (ver
oligotróficas).
oligotróficas Un tipo fisiológico del
microorganismo (o fase en la vida de
microorganismos marinos) que es adecuado
para el crecimiento de los nutrientes a baja
concentración.
oligotróficas (Adj) Un bajo hábitat en
nutrientes minerales y orgánicos. Nutrición
organotrofia Nutrición microbiana depende de
los compuestos orgánicos.
osmotrofia Un organismo que obtiene
nutrientes a través de la captación activa de
materiales solubles a través de la membrana
celular. Esta clase de organismo, que incluye
los procariotas y los hongos, no se puede
utilizar directamente el material particulado
como nutrientes. (Contraste con fagótrofo.)
OTU unidad taxonómica Operacional; esto a
menudo se refiere a secuencias de 16S rRNA
genes distintivos recuperados de muestras
ambientales. OTU es la terminología segura
en microbiología ambiental debido a que
evita la utilización del término “especie”
(que es muy difícil de definir).
la fosforilación oxidativa El uso de transporte
de electrones para producir ATP, a través de
fuerza motriz de protones.
el estrés oxidativo Un estado de desequilibrio
metabólico causado por el aumento de los
niveles de radicales libres y otras moléculas
de oxidación promotoras que pueden resultar
en daño de la membrana celular, la muerte
celular, y el daño al material genético.
PCR Reacción en cadena de la polimerasa; una
técnica para la amplificación de ADN, por lo
que es EAS-IER para aislar, clonar y
secuencia.
placa de Petri Un vaso poco profundo o un
plato cilíndrico de plástico que
microbiólogos utilizan para los
microorganismos de cultivo. Se nombró por
el bacteriólogo alemán Julius Richard Petri
(1852-1921) que lo inventó en 1877 cuando
se trabaja como ayuda-ant a Robert Koch.
fago Los virus que infectan a los procariotas.
phagotroph Un organismo que envuelve a los
alimentos. (Contraste con osmotrofia.)
Fenotipo Las características físicas o
bioquímicas observables de un organismo,
como se determina por tanto la composición
genética y las influencias ambientales.
(Contraste con el genotipo.)
fotosíntesis Un proceso bioquímico en el cual
las plantas, algas y algunos procariotas
aprovechar la energía de la luz. Las
“reacciones de luz” generan ATP y el poder
reductor; las reacciones oscuras fijan CO2 en
biomasa.
filogenia Filogenia documenta la relación
evolutiva entre los órganos-ismos. La
filogenia de un organismo en particular
refleja su ascendencia, sus propios
desarrollos evolucionaros.
phylum, filos Se utiliza en la clasificación y
taxonomía. A phylum es un amplio grupo de
microorganismos relacionados y contiene
una o más clases. Un grupo de filos similares
forma un dominio.
planetisemal Astronomía. Cualquiera de
pequeños cuerpos innumerables cree que han
puesto en órbita el Sol durante la formación
de los planetas.
plásmido ADN extracromosómico que se
replica independientemente del cromosoma.
Las funciones metabólicas codificadas por
ADN de plásmido típicamente son
periféricos (Por ejemplo, el catabolismo de
compuestos de carbono inusuales), y no es
esencial para la función celular.
platos Microbiología. Las placas se refieren a
cajas de Petri que contienen un medio de
crecimiento microbiano, por lo general
solidificado con agar.
procariotas Un organismo unicelular que
carece de una membrana nuclear, un núcleo
discreto, y otros compartimentos
especializados dentro de la célula. Las
bacterias y arqueas son procariotas. El uso
del término “procariota” es bagaje histórico
de la incapacidad primeros microbiólogos
para distinguir entre bacterias y arqueas. En
la biología contemporánea, el término es
inherentemente imprecisa y, a menudo se
considera obsoleta. Dado que las bacterias y
las arqueas son muy diferentes (phylogen-
éticamente y fenotípicamente), en referencia
a estos dos dominios con un solo término
puede causar pensamiento erróneo.
fuerza motriz de protones Generados por el
transporte de electrones, esto es la separación
de H + y OH-iconos través de las membranas
biológicas; utilizado por la enzima ATP
sintasa para generar ATP.
la detección de quórum La capacidad de las
poblaciones de procariotas para comunicarse
y coordinar el comportamiento a través de
moléculas de señalización.
16S rRNA y 18S rRNA La designación “1S”
se refiere a “unidades Svedberg”, que son
coeficientes de sedimentación derivados de
los medios físicos de separación de los
componentes de los ribosomas uno del otro.
Los procariotas tienen 16S, mientras que los
eucariotas tienen 18S subunidades de ARN
ribosómico. (Ver ARNr; pequeña subunidad
rRNA).
ADNr secuencias de ADN que codifican el
rRNA.
ARNr El ARN ribosómico; principal
componente estructural de los ribosomas.
Los ribosomas son el sitio de la síntesis de
proteínas en la vida celular. (Véase la
pequeña subunidad rRNA).
gen regulador Una secuencia de ADN cuya
codificada proteína (después de la
transcripción y la traducción) controla la
expresión de otros genes. (Contraste con el
gen STRUC-tural.)
recurso Un activo metabólico, presente en el
hábitat de un microorganismo, que puede ser
utilizado en las reacciones bioquímicas para
 generar ATP y / o ser utilizados como transcripción y traducción) tiene un papel
bloques de construcción celular para crear catalítico o estructural definida en el
nuevas células. metabolismo celular. (Contraste con gen
regulador).
respiración acoplamiento basados en
membranas de flujo de electrones entre una Sulfatara Un área o abertura volcánica,
fuente de energía reducida (orgánico o caracterizado por la alta temperatura, los
inorgánico) y un terminal de electrones vapores de azufre, y vapor.
oxidado accep-tor (por ejemplo, oxígeno,
nitrato) para producir ATP. taxonomía La ciencia de la identificación,
clasificación y nomenclatura.
microscopía electrónica de barrido (SEM)
Cualquiera de una clase de procedimientos talo biomasa fúngica, una red de micelio.
microscópicos que utilizan electrones en
tomografía Cualquiera de varias técnicas para
lugar de luz visible para producir imágenes
hacer detalladas rayos X de un plano de
ampliadas, espe-cialmente de objetos que
sección prede-termined de un objeto sólido
tienen dimensiones menores que las
mientras difuminar las imágenes de otros
longitudes de onda de la luz visible, con un
planos. Múltiples imágenes planas pueden
aumento lineal de acercarse o superarun
ensamblarse.
millón (106).
transducción La transferencia de ADN
sedimentario Rocas forman a partir de
microbiano por virus de un microorganismo
material, incluyendo los residuos de origen
infectada a otra.
orgánico, depositado como sedimento por el
agua, el viento o hielo y luego comprimido y transformación Un proceso por el cual el
cementado juntos por la presión. material genético transportado por una célula
microbiana indi-viduo se ve alterado por la
senectud Rechazar o la degeneración de la
incorporación de ADN exógeno en su
función celular, como con la maduración, la
genoma. La fuente de ADN tomado por la
edad, o el estrés de la enfermedad.
célula receptora está libre de cualquier vector
moho de fango Cualquiera de los diversos (sin virus, sin plásmido).
eucariotas unicelulares que crecen en el
microscopía electrónica de transmisión
estiércol y la vegetación decaimiento-ing y
(TEM) Procedimiento que utiliza un haz de
tienen un ciclo de vida que se caracteriza por
electrones de alta energía para examinar
una etapa ameboide limo-como y una etapa
objetos muy de cerca, en una escala fina. El
reproductiva multicelular.
micro-alcance brilla un haz de electrones a
subunidad pequeña rRNA ARN ribosómico través de un objeto y el resultado transmitida
de la subunidad 30S ribosomal de procariotas se proyecta sobre una pantalla de fósforo.
o la subunidad 40S ribosomal de los
árbol de la vida Presentación gráfica de las
eucariotas. Subunidad pequeña rRNA celular
relaciones evolutivas entre las formas del
juega un papel crucial en la traducción de
pasado y presente de la vida. El paradigma
ARNm en una proteína. Se utiliza en la
dominante actual de la evolución se basa en
filogenia molecular para establecer los tres
el análisis filogenético de los genes que
dominios de la vida. (Ver ARNr).
codifican la subunidad pequeña rRNA.
espora Un cuerpo pequeño, normalmente
ARNt moléculas de ARN de cadena corta
unicelulares, reproductivo que es altamente
presentes en la célula (en al menos 20
resistente a la desecación y el calor y es capaz
variedades, cada variedad capaz de
de crecer en un nuevo organismo, producido
combinarse con un aminoácido específico)
especialmente por ciertos procariotas,
que sujetan el aminoácido correcto a la
hongos, algas y plantas sin flores.
cadena de proteína que se está sintetizado por
gen estructural Una secuencia de ADN cuya el ribo-algunos de la célula.
codificada proteína (después de la
la luz ultravioleta (UV) Las ondas de luz que
tienen una longitud de onda más corta que la
luz visible, pero de longitud de onda más
larga que los rayos X.

transferencia vertical de genes la

transferencia de genes Vertical se produce
cuando un organismo recibe material
genético de su antepasado (por ejemplo, su
controladora o una especie de la que se
desarrolló).

el conteo de placas viables Una manera de

contar microorganismos cultivables en
muestras ambientales, en medio de agar
sólido. El número de colonias microbianas
que crecen en placas de agar es inversamente
proporcional al grado se diluyó la muestra
ambiental.

virus Partícula pequeña, que contiene ADN o

ARN, que infecta las células. Los virus son
obligados parásitos intracelulares. Solo que
pueden reproducirse únicamente por
invadiendo y tomado control de otras células
que carecen de la maquinaria celular para la
auto-reproducción.

ÍNDICE

Los números de página en cursiva se refieren a

las cifras; números de página en negrita se
refieren a las tablas

Acanthamoeba 363

acetogénesis 93, 316

convivencia con la metanogénesis 93 anammoxysome 325

definición 93 anoxigénica fotosíntesis 25, 30,317

energética 90, 93 evolución temprana 42-43

drenaje ácido de minas 5, 248, 254, 374 Iron resistencia a los antibióticos 241
Mountain 446
evolución 428
acidez
fórmula para el desarrollo 432
extrema alta 142
difusión gen 429-31, 430 piscina gen 432
extremo bajo 142
amenaza importante para la salud pública
mecanismos de adaptación microbianas 141-145
431-433
aerosoles en la atmósfera 290, 319, 338
mecanismos 427
Alexander, M. 8, 9, 212 selectiva presión 429
Algas definición 173, 174 línea de tiempo 426
fósiles principios de 25, 38, 39 antibióticos

rasgos 173, 175, 176 descubrimiento 249, 423-424

amensalismo 348, 349 el crecimiento del uso y abuso 432-433, 434

amonificación, definida 299, 318, 320, 322 impacto en la salud pública 424-425

Anabaena 54, 359 modo de acción 426

anabolismo 95, 459 áfido-Buchnera endosimbiosis 357, 361-362

la oxidación de metano anaerobio (AMO) la hábitats acuáticos, características

comparativo 114
bioquímica 334
ver también lagos; océanos; ríos; hábitats
en el ciclo C, 317
subsuperficiales
descubrimiento 332-335
Archaea
ecología y la actividad in situ 263
definición 36, 169-173, 186-187
reacciones 100
filogenia 35, 36, 154, 189, 193
anaerobios principios fisiológicos 77, 78, 85-95, rasgos de 45, 46, 186, 187-189
99-101
diversidad no cultivada 189, 192-194
anammox (anaerobia de amonio oxidación) la
bioquímica 325, 334

descubrimiento de 329, 331, 332 arsénico

residuos de ingeniería industrial Biorremediación 389, 397

tratamiento 383, 384
biogeoquímica 5, 325-328
en el océano 266, 325 de reacción 5, 299
toxicidad humana 325-326
en el tratamiento de aguas residuales
383-385
Atlantis, Ciudad Perdida, hidrotermal
comunidad de ventilación 126-128
ATP sintasa 29, 78, 96, 459
ATP síntesis 1, 91, 95, 96, 97,324
la fosforilación nivel 324 sustrato 77-78
atrazina, evolución de la ruta catabólica
406, 407, 408
Atta, Hormiga-hongo simbiosis 352, 353
autotrofia
mecanismos bioquímicos de CO2 la fijación
316
definición 62, 62
tratamiento clave en simbiosis 350
categoría fisiológica 62-64
axila 369
Azolla simbiosis 355, 359
Azotobacter 321, 419
bacilo turingiensico (Bt) plantas de cultivo
resistentes 417
Bacterias
definición 36, 45, 46, 183-184, 459
medidas de diversidad 162-168
filogenia 35, 36, 164-173
rasgos de filos clave 183-186
diversidad no cultivada 189-191
Bacteriodetes 372
Bacteriófago 194
formaciones de hierro en bandas 43
Beijerinck, M. 6, 7
Manual de Bergey sistemática Bacteriología
154, 183, 186 beta-oxidación, la biodegradación
de alcanos 309
vías bioquímicas anaeróbico y metano
oxidación 333-335
anammox 331-332
determinación de 99, 251-255, 329, 331-335
influencia de la cinética 91
relevancia para la biogeoquímica 329-331
biodegradación 373-399
evolución de las vías catabólicas 403-409
glosario de términos 374-375
objetivos, definición 373-377
sistemas modelo 375-376
compuestos de origen natural 306
resistencia a la 306
estrategias para probar, en los sitios de campo
380
encuesta de compuestos orgánicos y su
susceptibilidad al ataque 385-395
biopelículas 399-403
ocurrencia y propiedades 400, el desarrollo 401
específico de la especie, los genes 402, 403
estructura 400, 402
modelos biogeoquímicos 286-293, 295 del
presupuesto
global de 336 C
presupuesto global de 339 N
presupuesto global de S 337
biogeoquímica y procesos biogeoquímicos 3, 4,
5, 6, 281, 282
complejidad de los procesos de paisaje 10-18,
210
definiciones 10, 11
elementos reaccionan para formar compuestos
313
global de 78-79, 82-85, 335-339
biomarcadores 151, 156, 162 BTEX 386, 387, 389

definición 27, 157, 158, 244, 228, 460 Definición 373

de la actividad metabólica 243-245,246 Buchnera 54, 357, 361, 362

ácidos nucleicos 157-158, 228,231-239, 244 explosión cámbrica de eucariota la diversidad

25, 30
ácidos grasos de fosfolípidos 228-230,244
Candida 368
utilizar en la caja de herramientas microbiología
ambiental 156 ciclo del carbono 315-316

biomas, terrestre, definido por vegetación tipo presupuesto de balance de masa anual global
107-109 336

biopolímeros, almidón, celulosa hemicelulosa, en sustratos, la producción y utilización 296

lignina, quitina, peptidoglicano 301
terrestre 293
biorremediación 373-399
fijación de carbono, bioquímica mecanismo 316
eficacia de petróleo del Exxon Valdez
derramarse 380 fuente de carbono, categoría fisiológica de tipos
nutricionales 62-65
ingeniería 377, 381
sulfuro de carbonilo, carbonilo, disulfuro, gases
tratamiento de aguas residuales de ingeniería atmosféricos 338
381
vías catabólicas para ambientales
ex situ 376, 386 contaminantes, evolución 403-409

glosario de términos 374, 375 catabolismo 95, 308, 460

metas, definiciones 373-377 enzimas celulasa 302-305 ausencia en vida

superior formas 352
in situ 376, 385, 386
celulosa bioquímica del hidrólisis de 302 a 304
intrínseca 376, 377, 380

atenuación natural 387

fracaso percibido 380

estrategias 377

encuesta de compuestos inorgánicos y su

susceptibilidad al tratamiento 388, 389, 395-399

biosfera, como mezclas complejas en 77-85

desequilibrio biotecnología, la definición y el

alcance 410-411

olor corporal y microorganismos 368, 369

efectos de botella 216

Brock, TD 8, 76, 262

182……………186 de grupos fisiológicos 64

cadenas de alimentación prorrateo de genes según

anaeróbico 87-89, 97-101 estilo de vida 63, 64

interacciones tróficas 313-314 contenido de genes y categorías 57-61,

registro fósil 25, 37-38, 39 58

hongos procedimientos para permitir el genoma

definición 172, 174, 175, 177 251–255, 443

roles en líquenes, micorrizas 354, isla genómica 161, 409, 447,

358 448

rasgos 175, 177, 178 humanos 367

Papeles en el ciclismo C 296, 301-305 listado de bacterias y archaeles

54–55

Gallionella 6 genoma modelo de Pseudomonas

tracto gastrointestinal (GI) putida KT244 57, 58,

anatomía humana 370 60, 61

habitantes microbianos 370-373 tamaños 53-56, 199, 200

metagenómica de la microflora humana Geobacterias, reducción in situ de uranio

371–373 265, 268

estudio de la biomasa microbiana en 134, genoma 54

367 geomicrobiología 6, 8

chips genéticos 254 enfriamiento global

ingeniería genética, antecedentes papel de los aerosoles 290, 319, 338

410 papel de la DMS y de la marina

genoma(s) 54 microorganismos 298, 319

como registros evolutivos 2, 53, 63, calentamiento global 198, 286-290

448 causas 288-292

plantilla bioinformática 60 cambio climático, mega-modelo 293,

grupo de grupos ortólogos 295

(COGs) 58 gluconeogénesis 316

Análisis COG glicólisis 96, 97

de la microflora intestinal 373 glifosato (herbicida), genéticamente

plantas de cultivo resistentes a la ingeniería 219

417 definición 215

gran anomalía de conteo de platos 151, hemicelulosa 301

153–155 heterotrofia

efecto invernadero definición 62, 62

definición 286-293 categoría fisiológica 62-64

incertidumbres en las causas 292 jerarquía de aceptación de electrones

gases de efecto invernadero procesos 83, 85-95

concentraciones, historia en historia de la microbiología ambiental

atmósfera 290 6–10, 202, 211, 212

Presupuesto de radiación de la Tierra 288, 290, Hobbie, J.E. 7, 212

291 transferencia horizontal de genes 45, 161, 461

aguas subterráneas fuerza en la resistencia a los antibióticos 429,

composición 131 430

definición 129-131 fuerza en evolución 199, 201

tasas de crecimiento de los microorganismos en microbioma humano 367

naturaleza 75-77, 76 tracto gastrointestinal 370-373

Piel 367-370

hábitats sustancias húmicas, ácido húmico

como mezclas complejas de materiales definición 306, 461

78 ocurrencia en el ciclo C 294, 296,

como sistemas abiertos complejos 213-214 306, 337

como presiones selectivas por el recurso origen, nuevo paradigma para el 306

explotación y evolución 53, estructura 306-307

106 Hutchinson, G.E. 449

diversidad en la biosfera 106-145 enzima 282 hidratasa

compuestos orgánicos halogenados gas hidrógeno

87–89, 387, 388, 393–395 ciclismo 300

Principio de incertidumbre de Heisenberg donador de electrones en la metanogénesis

aplicación al medio ambiente 5, 90, 316

microbiología 215-217, ingeniería genética del hidrógeno

producción a través de la fotosíntesis intestino (humano)

415, 416 función de los microorganismos 373

intermedio en alimentos anaeróbicos estructura 371

cadenas 88, 93, 98, 98, 98, 99 relación simbiótica con

la presión parcial indica un distintivo microbiota 373

procesos anaeróbicos 222, 223 biorremediación intrínseca 377-80, 462

producción por fermentación planchar

biotecnología 413-414 oxidación 300

hidrogenasa 91, 415, 416 reducción 90, 91, 94, 396

hidrología, ciclo hidrológico 128-131 biogeoquímica cíclica 300

sistemas de flujo 130-131 termodinámica 86, 90

en hábitats subterráneos 130, 131 de hierro/azufre, sitio reactivo en

vientos hidrotermales enzimas 282, 283

presencia mundial, mapa 122 mundo de hierro/azufre 33, 34, 283

características del hábitat 121-122 definición del fraccionamiento isotópico,

utilizado
Ciudad Perdida en la Atlántida masiva
como prueba de autotrofia 28
126–128
K-selección 68, 69
como lugar de evolución de los primeros años
de vida queratina, en la piel 368, 369

33–36 kerógeno 294, 296, 306, 336

hipodermis 368 cinética de las reacciones, influencia sobre

identificación de microorganismos bioquímica 91

responsable de la gestión Kluyver, A.J. 6, 7, 99

Procesos 255-270 Koch, R., los postulados de Koch son 255-261,

endosimbiontes de insectos (Buchnera) 357, 462

361, 362 Kuenenia stuttgartiensis, in situ

insulina, genéticamente modificada 412 oxidación del amoníaco 266, 331

integrones, resistencia a medicamentos móviles lagos

elementos genéticos 429, 430 composición del agua dulce 117

transferencia de hidrógeno interespecies 88, 92, biomasa microbiana 132

98, 99 encuesta de tamaños, volúmenes 113-117

Lago Vostok 76, 128, 260 microbiología marina 252-253, 499

último antepasado común universal ventajas, biología de sistemas

(LUCA) 35-36, 204 446–449

transferencia lateral de genes 36, 45, 161, historia 6, 7

199–201, 429, 430 Marte y la vida marciana 26, 29, 31, 32

ver también transferencia horizontal de genes microbiología médica

simbiosis del liquen 175, 354 comparación con el medio ambiente

lignina microbiología 258, 259, 451,

bioquímica de la degradación 305 452

biosíntesis 302 bases genéticas de la aptitud en patógenos

en el presupuesto global C 336 450, 451

metabolismo por hongos 175 melamina, evolución de los catabólicos

ocurrencia en el ciclo C 315 senda 406, 408

producción y consumo 296 mercurio

estructura 303 biorremediación 346, 389

ligninasa, ligninolisis, bioquímica ciclo 41, 300

ataque de lignina 305 genes de desintoxicación 207, 418

que relaciona la identidad de los desintoxicación vía planta

microorganismos con la
biotecnología 417-419
procesos ecológicos 255-270
metilación 300
línea de descenso 45, 179, 193, 194
microorganismos, que transforman 300
biomarcadores de lípidos, definición y uso
reducción del ión mercúrico 300
228–230
metabolismo, un equilibrio de anabolismo
reacciones litotróficas llevadas a cabo por
y catabolismo 95, 462
microorganismos 100-101, 462
metaboloma 17, 256, 443

metagenómica
categoría fisiológica 62-64
de drenaje ácido minero 248
lisogenia 196, 197, 462
definición 245-246
manganeso, oxidación/reducción
del intestino humano 371-373
reacciones 90, 91, 94, 396
métodos 247, 248
Zanja de las Marianas 117
virus oceánicos 248
de los océanos 248, 249, 440, 447, 449 263, 317

absorción de fosfonatos 255 anaeróbico, in situ por consorcio

proteorhodopsin 252-253 263, 317

cofactores metálicos para enzimas 283, 285 termodinámica 90, 93, 100

metales métodos en materia de medio ambiente

contaminación ambiental, microbiología

biorremediación 388, 389, efectos botella 216

395–399 muestreo de campo 217-223

cofactores enzimáticos 283 enfoques multidisciplinarios 16-18,

roles en los procesos de la vida 282-286 223–226, 255–270

toxicidad y desintoxicación 284, riesgos de los artefactos metodológicos

286, 287 215–217

metano caja de herramientas 156, 219

atmosférico 288, 290, 291 ver también incertidumbre de Heisenberg

hidratos (clatratos) en el océano principio; biología molecular

sedimentos 333, 336, 337 métodos; procedimientos de muestreo

producción microbiana 28 Metilomonas 263, 317

ver también metanogénesis análisis de microarrays 251, 253, 254

oxidación ver metano anaeróbico comunidades microbianas

oxidación; metanotrófica métodos de análisis

producción y consumo 297 ARISA 236-237

producción termogénica (geológica) DGGE 236, 237, 238, 242

28 TGGE 236, 237, 239, 242

metanogénesis 5, 72, 85, 88, 89, 90, T-RFLP 236, 237

91–95, 98, 99, 101 poblaciones complejas 156, 162-168,

mecanismo bioquímico 316 366

co-ocurrencia con la acetogénesis 93 ocurrencia en la naturaleza 211, 212,

Methanobrevibacter smithii 371 237, 239

Methanosarcina 126, 187 diversidad microbiana

metanotrofia 5 rango de tamaño de celda 201-203

aeróbico, in situ por Methylomonas métodos de estimación 158-168

rango de tamaño del genoma 53-56, 199, 295

200 métodos de biología molecular 233-237

analogía de la pila de aguja en el heno 269 análisis del ADN ambiental

recuento de taxones cultos 154 228–232, 245

celdas de combustible microbianas 412-413, expresión génica 450-453

414
ver también omics
rastreo de fuentes microbianas 240-243
cronómetro molecular 169, 170
micronutrientes, funciones fisiológicas
filogenia molecular 169-172
285
Morita, R.Y. 7, 67, 72, 77
microorganismos
Monte Everest 79
cultivados/no cultivados 151-153
análisis de ARNm, percepciones de
definición 48
genes expresados 450-453, 462
impacto ecológico en la biosfera 2-6
4. MTBE (metil-terc-butil éter) 5. MTBE
composición elemental 285 (metil-terc-butil éter)

biomasa mundial 131-135 386, 387, 393

métodos de estudio 48, 49 simbiosis micorrícica 35, 177, 351,

Micrococos 368 354, 358

rasgos 3, 47, 48, 172-189

microscopía atenuación natural 387, 462

detección de las celdas 152, 153, 156, ver también biorremediación intrínseca

226–228, 236, 237 neutralismo 348, 349

Tinción de ADN 151, 152 nitrato

imagen epifluorescente del suelo biorremediación 398

microbios 152 contaminación de las aguas subterráneas 398

superficies minerales, emplazamientos para la óxido nítrico

evolución 33, 34 consumo 299

minerales, papel en los procesos de la vida 33, producción 299

34,
papel en el cambio climático 322-324
282, 283, 284, 285, 286, 286, 282, 283,
nitrificación 224, 299, 322-324
293, 294, 295
bioquímica, ocurrencia,
mega-modelo de cambio climático 293,
producción de gases de efecto invernadero
299, 322–324 244

en N ciclo 320 nutricional

compuestos nitro aromáticos, flujos en los ecosistemas 64-69

biodegradación 388, 394, 395 limitaciones en los ecosistemas 65, 67,

Nitrobacter 55, 64, 261, 322 68, 69

nitrobenceno 406 ciclos de nutrientes 311, 313

ciclo del nitrógeno 318, 319, 320-325 carbono 4, 296, 297

oxidación anaeróbica de metano hierro 300

332–335 hidrógeno 300

anammox 320-335 mercurio 300

desnitrificación 299, 322-324 nitrógeno 4, 13, 292-293, 298, 299, 299

presupuesto global anual de balance de masas otros elementos 4

339 fósforo 299

desequilibrio en el presupuesto global 338 azufre 4, 297, 298

lista de procesos enzimáticos clave 330 ciclo de nutrientes 13, 281, 296-300,

terrestre 13, 292, 293 311–313

fijación del nitrógeno 5, 299 ver también cosas de la vida

bioquímica 320, 321 nutrición, categorías fundamentales de

en el presupuesto global N 338 cómo ganarse la vida 62-63

rasgo clave en la simbiosis 350 Oceanospirillales 356

nitrogenasa 320-321, 415, 416 océanos

Nitrosomonas 64, 322 características del hábitat 113, 114,

Nitrosopumilus maritimus 192 117–121

óxido de nitrógeno composición 119

consumo 299 corrientes 118, 119

roducción 299 zonas de profundidad 121

papel en el cambio climático 322-324 temperatura 117

procedimientos no basados en el cultivo 157 biomasa microbiana 132

análisis a base de ácido nucleico de producción primaria, mapa mundial 120

comunidades microbianas oligotrófico 463

157–158, 228, 231, 232–239, hábitats 66-69

forma de vida 66-69 enzimas oxigenasas 282, 307-308,

ómicos 406

definido 251-255, 443, 444 fotosíntesis oxigenada 38-43

en microbiología ambiental 17, bioquímica 41, 42

163, 251–255, 256, 443, 445, evolución 42

446, 447, 448, 454 impacto 43-45

optimismo 210 ozono

compuesto orgánico, definición 306 en la estratosfera

organomercurio liasa 418 destrucción 324, 338

Simbiosis del gusano de Osedax (caída de formación del escudo 25, 44, 30
ballenas)
clave para la evolución 36, 43
356, 360
en la troposfera
OTU (unidad taxonómica operativa)
formación a través de NO 322, 324
159, 463
288, 289, 290,
estado de oxidación de los elementos 80
291
predicción de reactividad 311-312
panspermia 26, 29
oxianiones, biorremediación 389, 398
parasitismo 348, 349
véase también la biorremediación con cloro;
islas de patogenicidad 161
nitrato; perclorato
PCB (bifenilos policlorados)
biorremediación
388, 394, 406
oxígeno, atmosférico
pE
como aceptador final de electrones 85, 86,
definición 84
89, 90, 91–97, 96
índice de estado redox de los hábitats 91
pruebas en el registro sedimentario
turba 294, 295, 306, 337
37–38
pedogénesis 128
evolución de la oxigenación
Pelagibacter 253, 319, 446
fotosíntesis 38-43
antibiótico de penicilina, introducción
impacto evolutivo 43-45
425
adaptaciones fisiológicas a reactivos
pentaclorofenol 394, 406
especies de oxígeno 43-45

fuente en la biosfera 36, 43