Marzec 2011

Tematy I-go sprawdzianu z biochemii dla studentw weterynarii Struktura i Funkcja Makroczsteczek
Typy wiza i oddziaywa chemicznych istotnych dla elementarnych struktur organizmw ywych (patrz podrczniki i wykady z chemii) wiazania mocne kowalencyjne, wizania sabe siy wan der Wasala, wizania wodorowe; wizania jonowe, wizania:hydrofobowe jako tzw. zcza entropowe. Udzia kadego z wymienionych typw wiza w elementarnych strukturach biologicznych. Biaka i peptydy Definicja i podzia aminokwasw. Wzory aminokwasw wchodzcych w skad biaek. Zasady pisania i nazewnictwa peptydw. Przykady naturalnych peptydw budowa, wystpowanie i funkcje biologiczne. Funkcje biologiczne biaek. I-rzdowa struktura biaek: definicja, rnice w jakociowym i ilociowym skadzie aminokwasowym biaek. Definicja struktury II-rzdowej. Rezonansowy charakter wizania peptydowego i jego wpyw na ksztat szkieletu kowalencyjnego biaek. Kolejno atomw aminokwasowych w szkielecie kowalencyjnym biaek, pojcie ktw walencyjnych poszczeglnych atomw oraz ktw torsyjnych wok osi wiza. Typy struktur drugorzdowych: -helisa, -struktura, zwrot . Ptle jako przykad struktury nieregularnej. Wpyw reszt aminokwasowych na IIrzdow struktur biaek. Znaczenie wiza wodorowych dla trwaoci struktur II-rzdowych biaek i peptydw. Przykady biaek fibrylarnych kolagen, -keratyny, fibroina. Pojcie motywu strukturalnego, poda przykady. Domeny jako fragmenty morfologiczne i funkcjonalne biaek III-rzdowa struktura acuchw polipeptydowych oraz wizania decydujce o jej powstawaniu, utrzymaniu i utrwaleniu. Reguy fadowania motyww II-gorzdowych poznanej strukturze III-rzdowej. w struktury III-go rzdu. Struktura i funkcja biologicvzna mioglobiny pierwszego biaka o

IV-rzdowa struktura biaek: definicja, rodzaje wiza chemicznych czcych podjednostki (protomery). Konsekwencje IV-rzdowej struktury biaek: efekt kooperacji i efekt allosteryczny oraz ich znaczenie. Czsteczka hemoglobiny jako przykad biaka o strukturze IV-rzdowej. Hb utlenowana i nieutlenowana, formy T i R .Tlen , H+ , CO2 oraz 2,3-bis-fosfo-glicerynian jako efektory allosteryczne Hb. Pokrewiestwa strukturalne pomidzy biakami. Pojcie rodziny biaek w sensie genetycznym (i ewolucyjnym). Kryteria klasyfikacji biaek. Denaturacja biaek definicja, fizyczne i chemiczne czynniki denaturujce. Sposoby zapobiegania denaturacji. Zdolno do powrotnego odtwarzania zniszczonych struktur biakowych. Biaka jako polielektrolity. Dysocjujce reszty aminokwasowe a pochodzenie adunkw elektrycznych biaek. Punkt izoelektryczny biaek. Fizykochemiczne i biologiczne wasnoci biaek wynikajce z ich adunkw elektrycznych: ruchliwo elektroforetyczna, wizanie wody, soli i niektrych zwizkw organicznych. Wasnoci moderatorowe (buforowe), rozpuszczalno, wysalanie. Koloidowy charakter roztworw biakowych, cinienie onkotyczne, jego wielko i jego znaczenie. Rwnowaga Donnana i jej znaczenie biologiczne (patrz podrcznik biofizyki). Sposoby rozdzielania mieszanin biakowych (izolacja biaek): elektroforeza, sczenie molekularne, chromatografia jonowymienna, Ultrawirowanie biaek: szybko i staa sedymentacji i jej zaleno od ciaru i ksztatu czsteczek. Metody wykrywania biaek w roztworach oraz najwaniejsze metody pomiaru stenia biaek (patrz skrypt do wicze). Najwaniejsze wasnoci optyczne roztworw biaek oraz inne waciwoci biaek wykorzystywane w rnych metodach pomiaru ich stenia. Kwasy nukleinowe (wiadomoci elementarne) Powtrzenie wiadomoci z chemii dotyczcych puryn i pirymidyn; nomenklatura ich pochodnych. Definicja nukleozydu i nukleotydu. Zasady azotowe wchodzce w skad kwasw nukleinowych wzory i wystpowanie. Wzory nukleotydw budujcych kwasy nukleinowe. Struktura polinukleotydu. Struktura RNA i DNA. Znaczenie biologiczne kwasw nukleinowych. Definicje poj replikacji, transkrypcji i translacji. Co to jest kod genetyczny? Mutacje: definicja, rodzaje i ich konsekwencje biologiczne. Pojecie choroby genetycznej. Hemoglobinopatie.