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Para transcribir un gen, el RNA polimerasa progresa una serie de pasos definidos: Iniciacin. Alargamiento. Terminacin.
Las secuencias denominadas terminadores desencadenan la disociacin de la polimerasa alargadora del RNA y la liberacin de la cadena de RNA que produjo.
En las bacterias los terminadores son dos: Independientes de Rho (): Hace que la polimerasa termine sin participacin de otros factores. Dependientes de : necesita una protena especial llamada para inducir la terminacin.
Esta compuesto por dos elementos de secuencia: 1 Una repeticin invertida corta de 20 nucletidos. 2 Seguida por 8 pares de bases de A:T. - Estos elementos no afectan a la polimerasa hasta despus de transcriptos es decir que funciona que funciona en el RNA y no en el DNA.
La estructura tallo-asa solo es eficaz cuando esta seguida por un segmento de pares de bases A:U. esto es as pues en el momento en que se forma el tallo-asa, la cadena de crecimiento se mantiene sobre la plantilla en el sitio activo solo por las pares de bases A:U.
Es una protena anular de 6 sub unidades idnticas, se une al RNA monocatenario conforme sale de la polimerasa. La protena tambin tiene una actividad de ATPasa .
como tiene una actividad ATPasa, que es RNA dependiente y requiere la presencia de un polirribonucletido de longitud > 50 bases.
El no se une a algn trascripto que este en proceso de traduccin. En las bacterias la trascripcin y traduccin estn muy acopladas.
El fenmeno final del procesamiento del RNA, la Poliadenilacin del extremo 3 del mRNA, esta vinculada estrechamente con la terminacin de la transcripcin. La CTD (sub unidad de la poli II posee un dominio C-terminal que se extiende como una cola)de la polimerasa participa en el reclutamiento de la enzima.
1 La trasferencia de las enzimas procesadoras 3 de la cola CTD de la polimerasa desencadena un cambio de conformacin de la polimerasa que reduce la procesividad de la enzima. 2 La falta de capuchn 5 en la segunda molcula de RNA es percibida por la polimerasa como consecuencia, reconoce al transcripto como inadecuado y termina.
La seal de terminacin de los rRNA es una secuencia de 18 pb duplicada que se encuentra triplicada. Las dos copias cerca del extremo 3 del gen 28 s (T1y T2) y la tercera a 200 pd del inicio de transcripcin del gen siguiente ( T3).
Tiene un mecanismo equivalente al de la terminacin intrnseca en procariotas Si es un promotor de tipo a, el TFIIIA atrae los factores de terminacin especficos que van a reconocer las T si van precedidas de un palndromo de GC. Si es un promotor de tipo b es TFIIIC el que atrae los factores de terminacin. Si es un promotor de tipo c, SNAPc es la que va a reclutar los factores de terminacin que van a reconocer las T dentro de una zona rica en A puesto que se ha visto que la presencia de G inhibe la terminacin en este caso.