AVIS DE PRESENTATION DE THESE

(Arrt du 7 Aot 2006)

Madame Vronique HILL

prsentera ses travaux en vue de lobtention du Doctorat

Spcialit : Recherche clinique, innovation technologique, sant publique

Sur le sujet : Phylogographie mondiale des bacilles tuberculeux : contribution des outils molculaires et bioinformatiques, et caractrisation des lignes gnotypiques pour des tudes pidmiologiques et phylogntiques.

La soutenance aura lieu : Le jeudi 07 juin 2012 10 heures Salle de la Bibliothque Institut Pasteur de la Guadeloupe Morne Jolivire - 97183 ABYMES devant le jury : M. CESAIRE Raymond, Professeur, Universit des Antilles et de la Guyane ; M. GROS Olivier, Professeur, Universit des Antilles et de la Guyane ; M. MARDASSI Helmi, Docteur HDR, Institut Pasteur de Tunis, Tunisie ; M. PERRONNE Christian, Professeur, Universit de Versailles St-Quentin en Yvelines ; M. RASTOGI Nalin, Docteur dEtat, Institut Pasteur de la Guadeloupe ; M. TALARMIN Antoine, Mdecin Biologiste, Institut Pasteur de la Guadeloupe.
Campus de Fouillole - BP 250 97157 POINTE--Pitre CEDEX Tl : 05 90 48 30 30 Fax : 05 90 91 06 57

RESUME DE LA THESE Pour lobtention du grade de Docteur de lUniversit des Antilles et de la Guyane, dans la discipline : Biologie Sante et prsente par Vronique HILL.

La tuberculose, maladie trs ancienne, est plus que jamais prsente sur la scne sanitaire mondiale avec 9 millions de nouveaux cas par an. Cette maladie, qui demeure une cause majeure de mortalit, est un des problmes les plus difficiles rsoudre en sant publique et chelle internationale. Les diverses programmes de lutte, lancs par lOrganisation Mondiale de la Sant (OMS), pour prvenir et garantir la gurison des patients tuberculeux, se heurtent des difficults qui hypothquent leur efficacit. En effet, l'expansion du virus de rinimunodficience humaine (VIII) et son influence nfaste sur la susceptibilit la tuberculose, l'accroissement rapide de la tuberculose multirsistante, la pauvret ainsi que la croissance dmographique, sont un ensemble de facteurs prjudiciables l'application des mesures prventives et curatives. Les contextes conomiques difficiles conduisant indubitablement au cumul de ces facteurs, ont fait une csure entre les pays riches et les pays pauvres quant l'incidence et la rvolution de la tuberculose chelle mondiale. Pour attnuer la disparit des rsultats des luttes antituberculeuses, les mthodologies employes en pidmiologie de la tuberculose doivent s'inscrire dans une dmarche d'efficacit. Les marqueurs molculaires, indispensables l'identification et la classification des souches appartenant au complexe Mycobacterium tuberculosis (MTC) ont chacun des potentialits qui leur sont propres dont il convient de cerner pour une utilisation adquate dans les tudes pidmiologiques et phylogntiques. Le but de cette thse consiste extraire des connaissances nouvelles des rsultats de gnotypage stockes dans les bases de donnes, connaissances relatives au polymorphisme du support gnomique pour estimer la contribution de chaque marqueur dans la classification de MTC. Le recours diffrentes mthodes de reconstruction phylogntique et de modlisation des donnes fut indispensable. A la lumire des rsultats obtenus, cette thse propose une nouvelle mthodologie de classification, pour rtablissement d'une phylogographie robuste de MTC en relation avec l'histoire des migrations humaines qui aurait dbute en Afrique subsaharienne Chaque mthode de gnotypage ayant une efficience et un cout propres, qu'il convient de mesurer par rapport aux moyens disponibles et aux rsultats escomptes, il est donc intressant de renforcer la connaissance des marqueurs et de proposer diffrentes alternatives menant la classification des mycobactries. Ainsi, les rsultats obtenus dans cette thse apportent plus de cohrence aux solutions proposes pour la caractrisation des clones de MTC circulant dans le monde.