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(ADN y ARN)
GC
AT
CG
TA
Minor
Groove
34 Å AT
GC
TA
DNA:
Major
Groove
TA
3.4 Å CG
AT
DOBEL HELICE
CG
GC
Composición en bases del DNA en algunas especies
A G C T
Hombre, H.sapiens 0.29 0.18 0.18 0.31
Bovino, Bos taurus 0.26 0.24 0.23 0.27
Levadura, S.cerevisiae 0.30 0.18 0.15 0.29
Mycobacterium sp. 0.12 0.28 0.26 0.11
Reglas de Chargaff
1. La relación purinas/pirimidinas es igual a 1
Es decir, A+G = C+T
2. En todos los DNA estudiados, la proporción molar
de A es igual a la de T, y la de G igual a la de C.
Es decir, A = T y G = C
Modelo de Watson-Crick
5’ 3’
3.4 nm
3’ 5’
2. Cada una de las dos hélices es un polinucleótido entrelazado con
el otro de manera que su polaridad es opuesta (es decir, corren en
sentido antiparalelo)
Modelo de Watson-Crick
0.34 nm
H
Modelo de Watson-Crick
Surco
estrecho 3.4
0.34
Surco
ancho
2.4
3’
5’ N
DNA
- H
O N O
O N O
H O-
N P
H 2C N N
O H O O-
N
-
O O N O
O
H H CH2
P N
-
bases complementarias
N P
H 2C H H
N O O O-
O
H N
N O
-
O O N
H CH2
P O
- N N
O H3C H O
O N O-
2. Interacciones hidrofóbicas H 2C
P
N O O-
entre planos de bases contiguos O H 3C O
3’ O 5’
Curvas de fusión: Estudio de estabilidad del DNA
5’-CGTTGCAATTGCGAT-3’
3’-GCAACGTTAACGCTA-5’
5’-CGTTGCAATTGCGAT-3’ 5’-CGTTGCAATTGCGAT-3’
3’-GCAACGTTAACGCTA-5’ 3’-GCAACGTTAACGCTA-5’
Implicaciones genéticas del modelo
3. La reactividad de las bases y la estructura general del DNA
explican perfectamente la acción de los mutágenos químicos
H
H3C O H O N
H3C O H N N
N H N N
N H N N
N N
N N
O H N
O
H
DNA circular, relajado DNA circular, con Se produce superhelicidad negativa cuando desenrollamos
superhélice negativa unas cuantas vueltas de doble hélice en un DNA circular.
Nucleosomas
DNA mide aproximadamente 2
metros de largo.
Estructura repetitiva de
cromatina.
Estructura “beads-on-string”.
Forma dada por la H1:
Zig-Zag
Lineal
Modelo del Solenoide.
Histonas: 2H2a, 2H2b, 2H3, 2H4
DNA: aprox. 196 pares de bases
Histonas
Hay 5 tipos diferentes: H1, H2A,
H2B, H3 y H4.
Poseen un alto grado de conservación
entre organismos.
La histona H3 es la mejor
conservada, también lo son la H2A y
H2B, no así la H1.
Hay dos fuentes de variabilidad:
Reiteración génica
Modificación post-traslacional
La principal modificación en las
histonas es la acetilación,
importante rol en la actividad génica.
Entre otras modificaciones se
encuentra la metilación y la
fosforilación de residuos como Ser,
Treonina, Lys, His.
5’
-
O O
P O
- H
O N
O N
OH
-
O O
2’-OH en la pentosa
P H H
-
N
O
O
N
H 2C
N O
O
-
O O OH
P O
-
O H
Uracilo en lugar de timina
O N
H 2C N O
O
-
O O OH H
H N
P
-Constituido por ribonucleótidos (nucleótidos
-
O N
O N
H 2C N N de ribosa)
-Los ribonucleótidos se unen entre sí, igual
O
3’ O OH
RNA
3’
H 2C
N
N
O
C
O
5’
-
O O OH
H H
P N
Extremo -
aceptor O
O N
Lazo TYC H 2C N O
C
O
OH
Lazo O
- H
O
H N
variable P
-
O N
Lazo H 2C
O N
N
A
anticodon O
N
H O OH
Unión del aminoácido al H 3N C C
extremo 3’ del tRNA R O
Secondary structure diagram Tertiary structure diagram
Sustitución de Bases
Pérdida de Bases
Inversión
Translocación
La Expresión del Mensaje Genético
Las instrucciones para construir las proteínas están codificadas
en el DNA y las células tienen que traducir dicha información a
las proteínas. El proceso consta de dos etapas:
Las bacterias contienen una sola molécula de DNA circular en su citoplasma, que
posee todos los genes necesarios para la vida de la bacteria. No está contenido en un
núcleo.
Plásmido o DNA
Genoma bacteriano o extracromosómico,
DNA cromosómico, que que es opcional según
es una sola molécula especie y cepa,
bicatenaria circular y confiere nuevas
propiedades a
la bacteria
La mayor parte del genoma bacteriano está constituido por genes que codifican proteínas
estructurales, enzimas metabólicas o factores de virulencia. Se encuentran habitualmente
en una sola copia, lo que hace que una mutación en los mismos condicione una función
bacteriana.
El genoma contiene, a su vez, múltiples copias de los genes que codifican el RNA ribosómico 16S,
que forma parte de la subunidad menor del ribosoma. Estos genes tienen secuencias muy
conservadas entre las distintas familias bacterianas, así como regiones muy divergentes,
incluso dentro de la misma especie bacteriana. Por ello, su estudio permite establecer relaciones
filogenéticas entre bacterias, y determinar la variabilidad genética de las distintas poblaciones
de una especie.
Organización básica del Genoma Humano
promotor E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7
I1 I2 I3 I4 I5 I6
El 25 % de todo el Genoma Humano está constituido por genes, cuyo número se estima que
se halla entre 30.000 y 40.000, la mayoría aún sin función conocida
Solo el 1 % de todo el Genoma Humano está constituido por DNA codificante, es decir, exones
Sin embargo,
el PROTEOMA HUMANO está constituido
por 50.000-60.000 proteínas
PROTEOMA HUMANO
transcripción y traducción
metabolismo
replicación y modificación del DNA
... Y la evolución ha permitido que el
ser humano se diferencie en ...
Sistema inmune
y nervioso
Organización básica del Genoma Humano
¿Qué aplicaciones tiene el análisis de ácidos
nucleicos en Microbiología?
DNA RNA
DNA RNA
DNA RNA