Son muchos los años así como los políticos e instituciones que, hablan de la

descontaminación de la bahía del lago Titicaca; lo cierto es que la contaminación de la

bahía interior del lago sigue avanzando (Aparicio, 2003).

Al este de la bahía interior, se desarrollan extensos totorales que restringen el flujo de

agua entre esta bahía y el resto del lago, de tal manera que se facilita la acumulación
de contaminantes y sedimentos, que provienen de la ciudad de Puno. El conjunto de
estos factores hace que la bahía interior de Puno sea muy susceptible a la
eutrofización. Algunas manifestaciones de eutrofización en la bahía interior son físicas,
como la marcada disminución en la transparencia de sus aguas, y la concentración de
nitratos y fosfatos en niveles muy altos.
Además existe sobresaturación de oxígeno en superficie y
ausencia total de éste a tan solo un metro de profundidad, lo
que conlleva episodios periódicos de mortandad de peces .
Otros síntomas de la progresiva eutrofización a que se está
viendo sometido el lago Titicaca, en la bahía interior de Puno,
son la proliferación de una planta foránea, la lenteja de agua (
Lemna gibba), y la prácticamente inexistente, durante gran
parte del año, de fauna bentónica en grandes áreas, siendo,
cuando aparece, escasa e indicadora del alto nivel de
contaminación de la bahía interior de Puno, que hace
intolerables las condiciones ambientales incluso paralos
organismos más tolerantes.
Las amenazas pueden generar impactos negativos en la
reserva son de diferente tipo y grado sobre las especies,
los ecosistemas, los procesos ecológicos y la población
humana, tales como:

- Conversión de hábitats (pérdida total del original).

- Degradación de hábitats o ecosistemas (pérdida de

especies que lo con forman o de procesos que lo
sustentan).

- Extracción de poblaciones de especies de fauna y/o

flora (pérdida de la viabilidad poblacional,
convirtiendo a las especies vulnerables o
arriesgándolas a su extinción.
- Pérdida de recursos para la población local (bajas
poblacionales o extinciones locales de especies de
importancia socio cultural y económico).

- Pérdida o sustitución de patrones culturales

asociados al adecuado manejo de especies.
hábitats o ecosistemas (pérdida de las relaciones
de reciprocidad entre el ser humano-naturaleza
por la ausencia del referente cultural).

- Deterioro de la salubridad de la población local

(contaminación de los cuerpos de agua y de
recursos y pérdida de fuentes alimenticias
obtenidas de especies de fauna y flora silvestre).
La quema de los totorales y pastizales
que se ocasionan por accidentes
antropogénicos o creencias ancestrales
atentan contra la biodiversidad existente
en ella, porque en esta se queman
huevos de aves y se produce la muerte
de polluelos, así como los huevos
desovados por los peces nativos.

Además ocasiona cambios en las

propiedades fisicoquímicas y biológicas
del suelo, teniendo efectos negativos
para especies de flora y fauna silvestre
sensible a los cambios de temperatura,
pH y elementos químicos del suelo.